MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Prochlorococcus marinus str. NATL2A chromosome

Total Repeats: 703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007335	TAGATA	2	12	2028	2039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72383166
2	NC_007335	TAAAAA	2	12	5675	5686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72383168
3	NC_007335	AATTAA	2	12	6353	6364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72383169
4	NC_007335	ATTTTA	2	12	6483	6494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72383169
5	NC_007335	TTTTAA	2	12	6575	6586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72383169
6	NC_007335	TTAGAC	2	12	9438	9449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72383170
7	NC_007335	CTTTTA	2	12	11396	11407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383173
8	NC_007335	GTCGTA	2	12	15114	15125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72383176
9	NC_007335	TGGCGG	2	12	16726	16737	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	72383177
10	NC_007335	TGGCGG	2	12	16750	16761	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	72383177
11	NC_007335	TGGCGG	2	12	16798	16809	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	72383177
12	NC_007335	GATGCT	2	12	19594	19605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72383181
13	NC_007335	AATAAA	2	12	20926	20937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72383182
14	NC_007335	TTTAAA	2	12	22208	22219	50 %	50 %	0 %	0 %	72383185
15	NC_007335	TCAATT	2	12	22846	22857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72383185
16	NC_007335	CAAATA	2	12	24804	24815	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72383187
17	NC_007335	GATTTT	2	12	31375	31386	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72383195
18	NC_007335	GAAATT	2	12	34974	34985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72383199
19	NC_007335	TTAAAA	2	12	36262	36273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72383200
20	NC_007335	TCCAGG	2	12	36413	36424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72383200
21	NC_007335	ACTTTT	2	12	38031	38042	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383201
22	NC_007335	TTTAAT	2	12	41348	41359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72383202
23	NC_007335	TTGTTT	2	12	45469	45480	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72383206
24	NC_007335	TAATGA	2	12	46678	46689	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72383208
25	NC_007335	TGGTTC	2	12	47978	47989	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	72383209
26	NC_007335	TTGCAA	2	12	48814	48825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72383210
27	NC_007335	TTGATA	2	12	57451	57462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72383214
28	NC_007335	GAAGGT	2	12	58118	58129	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	72383215
29	NC_007335	TAGAAG	2	12	59908	59919	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	72383217
30	NC_007335	TATCAG	2	12	62869	62880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72383219
31	NC_007335	GGATAG	2	12	62886	62897	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	72383219
32	NC_007335	ATCAAA	2	12	83304	83315	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72383239
33	NC_007335	ACTGAT	2	12	93833	93844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72383250
34	NC_007335	CATTTG	2	12	95433	95444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72383251
35	NC_007335	TAAAAT	2	12	96271	96282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72383252
36	NC_007335	AAGAGA	2	12	100667	100678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72383256
37	NC_007335	TAAGAA	2	12	104880	104891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72383259
38	NC_007335	TACTTA	2	12	108537	108548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72383264
39	NC_007335	ACTTTC	2	12	108856	108867	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72383264
40	NC_007335	TTGGTA	2	12	109490	109501	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	72383265
41	NC_007335	TGCCAT	2	12	109594	109605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	72383265
42	NC_007335	TCTTTT	2	12	111281	111292	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	72383268
43	NC_007335	TTTGAT	2	12	120692	120703	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72383276
44	NC_007335	GATGGG	2	12	120944	120955	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	72383276
45	NC_007335	GTTTTA	2	12	123326	123337	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72383277
46	NC_007335	TTCTGA	2	12	128679	128690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72383283
47	NC_007335	TGATGT	2	12	128736	128747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	72383283
48	NC_007335	ATCGCA	2	12	129226	129237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	72383283
49	NC_007335	ATTTTA	2	12	129439	129450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72383283
50	NC_007335	TTTGAT	2	12	129840	129851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	162958069
51	NC_007335	ATTTAG	2	12	135049	135060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72383291
52	NC_007335	GCTTTA	2	12	135837	135848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72383291
53	NC_007335	AAGAAA	2	12	136090	136101	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	72383291
54	NC_007335	TCCTTT	2	12	141944	141955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72383300
55	NC_007335	TTTTGA	2	12	143810	143821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72383301
56	NC_007335	GCAAAA	2	12	147288	147299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	72383304
57	NC_007335	GTAGAT	2	12	148668	148679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72383305
58	NC_007335	CTTTAT	2	12	149990	150001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383308
59	NC_007335	CTTTCT	2	12	150719	150730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72383309
60	NC_007335	TTCTTT	2	12	154788	154799	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	72383314
61	NC_007335	TAGTAA	2	12	157242	157253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72383317
62	NC_007335	TTTAAC	2	12	160848	160859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72383321
63	NC_007335	TAATTT	2	12	165054	165065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72383327
64	NC_007335	TTTACT	2	12	166896	166907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383329
65	NC_007335	TTATTT	2	12	169158	169169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72383331
66	NC_007335	AGTTCC	2	12	170257	170268	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	72383333
67	NC_007335	AAAGAA	2	12	172569	172580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	72383334
68	NC_007335	GTTTTT	2	12	176177	176188	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72383337
69	NC_007335	GGAGCA	2	12	177133	177144	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	72383338
70	NC_007335	TCCAAC	2	12	178356	178367	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	72383339
71	NC_007335	ATTTTG	2	12	179939	179950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72383341
72	NC_007335	AATTTT	2	12	185467	185478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72383348
73	NC_007335	CTCATT	2	12	193958	193969	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72383355
74	NC_007335	TCAATT	2	12	205640	205651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72383371
75	NC_007335	GTTCAT	2	12	206088	206099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72383371
76	NC_007335	CTAATA	2	12	208153	208164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72383374
77	NC_007335	ATTTAA	2	12	211662	211673	50 %	50 %	0 %	0 %	72383377
78	NC_007335	ATTTGT	2	12	214710	214721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72383380
79	NC_007335	CAAGAT	2	12	214771	214782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72383380
80	NC_007335	ATTTTC	2	12	215373	215384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383381
81	NC_007335	ATCTCT	2	12	216609	216620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72383382
82	NC_007335	TGCTGG	2	12	218103	218114	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	72383384
83	NC_007335	TCCCTC	2	12	221385	221396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72383389
84	NC_007335	ATTTTC	2	12	222305	222316	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383390
85	NC_007335	CTCCAT	2	12	222574	222585	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	72383390
86	NC_007335	AGGAAG	2	12	224306	224317	50 %	0 %	50 %	0 %	72383391
87	NC_007335	AATAAA	2	12	226623	226634	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72383393
88	NC_007335	GCACTT	2	12	230557	230568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	72383395
89	NC_007335	TTTCAA	2	12	234769	234780	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72383399
90	NC_007335	TCTACT	2	12	240324	240335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72383406
91	NC_007335	TGAAGT	2	12	243038	243049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72383410
92	NC_007335	AGCTCT	2	12	243469	243480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	72383410
93	NC_007335	ATCAAG	2	12	246640	246651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72383411
94	NC_007335	TGCTAT	2	12	247299	247310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72383412
95	NC_007335	ATTTGA	2	12	248619	248630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72383413
96	NC_007335	AAAGCA	2	12	249449	249460	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	72383414
97	NC_007335	ATAGCA	2	12	260026	260037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72383425
98	NC_007335	TTTGGC	2	12	261980	261991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	72383427
99	NC_007335	TTCAAC	2	12	263749	263760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72383428
100	NC_007335	GAACAA	2	12	268259	268270	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	72383432
101	NC_007335	TTTGAT	2	12	269091	269102	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72383433
102	NC_007335	TTGCAA	2	12	269585	269596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72383433
103	NC_007335	TATTTC	2	12	275432	275443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383440
104	NC_007335	ACCAAA	2	12	279289	279300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72383442
105	NC_007335	TAATGT	2	12	280074	280085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72383443
106	NC_007335	TTTATC	2	12	284691	284702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72383449
107	NC_007335	GATCAA	2	12	289762	289773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72383457
108	NC_007335	TGCTGA	2	12	294714	294725	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72383462
109	NC_007335	TAAAAA	2	12	295042	295053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72383463
110	NC_007335	ATCCAA	2	12	296047	296058	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	72383463
111	NC_007335	ATTTTT	2	12	302621	302632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72383468
112	NC_007335	TGAAAA	2	12	304476	304487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72383471
113	NC_007335	TCTTGC	2	12	304965	304976	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	72383471
114	NC_007335	TCATCT	2	12	306128	306139	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72383473
115	NC_007335	TTGTTT	2	12	307202	307213	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72383474
116	NC_007335	CAATTA	2	12	308210	308221	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72383475
117	NC_007335	GAAAAA	2	12	312848	312859	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	72383480
118	NC_007335	GATGGA	2	12	313626	313637	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	72383480
119	NC_007335	CTTTGA	2	12	315820	315831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72383482
120	NC_007335	TGATTC	2	12	320670	320681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72383487
121	NC_007335	AACAAT	2	12	322640	322651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72383490
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229	NC_007335	GAATTA	2	12	603901	603912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72381889
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232	NC_007335	TATAGG	2	12	612483	612494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72381897
233	NC_007335	TGCAAT	2	12	612540	612551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72381897
234	NC_007335	ATCTGA	2	12	624737	624748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72381910
235	NC_007335	TCTCTT	2	12	626078	626089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72381912
236	NC_007335	GATTAT	2	12	631351	631362	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72381918
237	NC_007335	TGGTCT	2	12	635468	635479	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	72381921
238	NC_007335	TTGCTT	2	12	637838	637849	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	72381923
239	NC_007335	TTTAAG	2	12	637935	637946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72381923
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242	NC_007335	AATAGA	2	12	646465	646476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72381930
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347	NC_007335	GACATG	2	12	929766	929777	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	72382222
348	NC_007335	ATAATT	2	12	931886	931897	50 %	50 %	0 %	0 %	72382224
349	NC_007335	AAGAGG	2	12	934145	934156	50 %	0 %	50 %	0 %	72382228
350	NC_007335	AAAACC	2	12	937537	937548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162958226
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352	NC_007335	ATCTAA	2	12	942116	942127	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72382235
353	NC_007335	ATAGCT	2	12	943886	943897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72382238
354	NC_007335	ATTGTG	2	12	944764	944775	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	72382240
355	NC_007335	AAGATA	2	12	944797	944808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72382240
356	NC_007335	TGAAGT	2	12	946061	946072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72382243
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359	NC_007335	AAAGCC	2	12	954723	954734	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	72382253
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452	NC_007335	GCCATT	2	12	1229485	1229496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	72382573
453	NC_007335	TTGATC	2	12	1229754	1229765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72382573
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455	NC_007335	TTGATC	2	12	1230234	1230245	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72382573
456	NC_007335	TTGATC	2	12	1230474	1230485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72382573
457	NC_007335	TTGATC	2	12	1230714	1230725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72382573
458	NC_007335	AGAAGG	2	12	1231413	1231424	50 %	0 %	50 %	0 %	72382573
459	NC_007335	TTCAAC	2	12	1233479	1233490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72382574
460	NC_007335	TGGCAT	2	12	1237561	1237572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72382575
461	NC_007335	ACCGCC	2	12	1238156	1238167	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	72382575
462	NC_007335	ACCGCC	2	12	1238219	1238230	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	72382575
463	NC_007335	ACCGCC	2	12	1238312	1238323	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	72382575
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