MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Photobacterium profundum SS9 plasmid pPBPR1

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005871	GAAAA	2	10	930	939	80 %	0 %	20 %	0 %	47104027
2	NC_005871	GGGGC	2	10	1702	1711	0 %	0 %	80 %	20 %	47104028
3	NC_005871	TCGAT	2	10	2468	2477	20 %	40 %	20 %	20 %	47104029
4	NC_005871	AATCC	2	10	6161	6170	40 %	20 %	0 %	40 %	47104033
5	NC_005871	TTGGA	2	10	8544	8553	20 %	40 %	40 %	0 %	47104035
6	NC_005871	AAAAC	2	10	8810	8819	80 %	0 %	0 %	20 %	47104035
7	NC_005871	AAAGA	2	10	12485	12494	80 %	0 %	20 %	0 %	47104038
8	NC_005871	GAAAA	2	10	13252	13261	80 %	0 %	20 %	0 %	47104039
9	NC_005871	CAGTA	2	10	15798	15807	40 %	20 %	20 %	20 %	47104041
10	NC_005871	GCAAA	2	10	18286	18295	60 %	0 %	20 %	20 %	47104042
11	NC_005871	CATGC	2	10	20698	20707	20 %	20 %	20 %	40 %	47104044
12	NC_005871	CAAAC	2	10	23240	23249	60 %	0 %	0 %	40 %	47104046
13	NC_005871	TTACC	2	10	23542	23551	20 %	40 %	0 %	40 %	47104047
14	NC_005871	GGCCA	2	10	26060	26069	20 %	0 %	40 %	40 %	47104047
15	NC_005871	TTGGC	2	10	26769	26778	0 %	40 %	40 %	20 %	47104047
16	NC_005871	GACCA	2	10	32177	32186	40 %	0 %	20 %	40 %	47104050
17	NC_005871	TTCTG	2	10	34962	34971	0 %	60 %	20 %	20 %	47104052
18	NC_005871	TTTGG	2	10	51580	51589	0 %	60 %	40 %	0 %	47104066
19	NC_005871	AATGA	2	10	54364	54373	60 %	20 %	20 %	0 %	47104068
20	NC_005871	TACAT	2	10	54530	54539	40 %	40 %	0 %	20 %	47104068
21	NC_005871	ACCAG	2	10	55221	55230	40 %	0 %	20 %	40 %	47104068
22	NC_005871	GTTTC	2	10	55379	55388	0 %	60 %	20 %	20 %	47104068
23	NC_005871	TATTT	2	10	56946	56955	20 %	80 %	0 %	0 %	47104069
24	NC_005871	TTTGC	2	10	58187	58196	0 %	60 %	20 %	20 %	47104070
25	NC_005871	GCTAG	2	10	59138	59147	20 %	20 %	40 %	20 %	47104071
26	NC_005871	AAGAA	2	10	64134	64143	80 %	0 %	20 %	0 %	47104077
27	NC_005871	AATGC	2	10	64217	64226	40 %	20 %	20 %	20 %	47104077
28	NC_005871	ATCAA	2	10	68880	68889	60 %	20 %	0 %	20 %	47104082
29	NC_005871	AAGTT	2	10	69736	69745	40 %	40 %	20 %	0 %	47104082
30	NC_005871	GTAAT	2	10	70474	70483	40 %	40 %	20 %	0 %	47104083
31	NC_005871	TATGC	2	10	73800	73809	20 %	40 %	20 %	20 %	47104086
32	NC_005871	TAATT	2	10	74002	74011	40 %	60 %	0 %	0 %	47104086
33	NC_005871	TCATG	2	10	74968	74977	20 %	40 %	20 %	20 %	47104087
34	NC_005871	GAGCA	2	10	76111	76120	40 %	0 %	40 %	20 %	47104089
35	NC_005871	CTGAA	2	10	76298	76307	40 %	20 %	20 %	20 %	47104089
36	NC_005871	TCAAT	2	10	77134	77143	40 %	40 %	0 %	20 %	47104090
37	NC_005871	TCATC	2	10	77279	77288	20 %	40 %	0 %	40 %	47104090
38	NC_005871	TCAGA	2	10	78190	78199	40 %	20 %	20 %	20 %	47104091
39	NC_005871	TTGAT	2	10	79614	79623	20 %	60 %	20 %	0 %	47104092

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.