MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 87258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004547	CAAA	2	8	203588	203595	75 %	0 %	0 %	25 %	50119142
3502	NC_004547	GCG	2	6	203596	203601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119142
3503	NC_004547	GCG	2	6	203733	203738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119142
3504	NC_004547	GA	4	8	203819	203826	50 %	0 %	50 %	0 %	50119142
3505	NC_004547	CGA	2	6	203840	203845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119142
3506	NC_004547	GAA	2	6	203892	203897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119142
3507	NC_004547	CAT	2	6	203939	203944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119142
3508	NC_004547	AGCC	2	8	203960	203967	25 %	0 %	25 %	50 %	50119142
3509	NC_004547	CGT	2	6	204130	204135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119142
3510	NC_004547	TGT	2	6	204970	204975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119143
3511	NC_004547	TCG	2	6	204976	204981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3512	NC_004547	T	6	6	204988	204993	0 %	100 %	0 %	0 %	50119143
3513	NC_004547	TAA	2	6	205070	205075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119143
3514	NC_004547	CTG	2	6	205197	205202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3515	NC_004547	AG	3	6	205211	205216	50 %	0 %	50 %	0 %	50119143
3516	NC_004547	ATC	2	6	205299	205304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119143
3517	NC_004547	GCG	2	6	205332	205337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119143
3518	NC_004547	GAG	2	6	205341	205346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50119143
3519	NC_004547	CAA	3	9	205349	205357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119143
3520	NC_004547	GAT	2	6	205416	205421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119143
3521	NC_004547	TTG	2	6	205479	205484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119143
3522	NC_004547	CAG	2	6	205560	205565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3523	NC_004547	CAGA	2	8	205579	205586	50 %	0 %	25 %	25 %	50119143
3524	NC_004547	CTG	2	6	205647	205652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3525	NC_004547	CGC	2	6	205745	205750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119143
3526	NC_004547	GAA	2	6	205800	205805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119143
3527	NC_004547	CCA	2	6	205834	205839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119143
3528	NC_004547	CGG	2	6	205849	205854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119143
3529	NC_004547	GCA	2	6	205862	205867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3530	NC_004547	GACA	2	8	205871	205878	50 %	0 %	25 %	25 %	50119143
3531	NC_004547	TGC	2	6	205898	205903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3532	NC_004547	GTG	2	6	205912	205917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119143
3533	NC_004547	GCATT	2	10	206002	206011	20 %	40 %	20 %	20 %	50119143
3534	NC_004547	CGG	2	6	206038	206043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119143
3535	NC_004547	GCG	2	6	206049	206054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119143
3536	NC_004547	CG	4	8	206053	206060	0 %	0 %	50 %	50 %	50119143
3537	NC_004547	CG	3	6	206132	206137	0 %	0 %	50 %	50 %	50119143
3538	NC_004547	CGA	2	6	206156	206161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3539	NC_004547	TGG	2	6	206194	206199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119143
3540	NC_004547	GAA	2	6	206208	206213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119143
3541	NC_004547	ATC	2	6	206256	206261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119143
3542	NC_004547	CAG	2	6	206346	206351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3543	NC_004547	GAA	2	6	206367	206372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119143
3544	NC_004547	ATGGCA	2	12	206452	206463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50119143
3545	NC_004547	CAG	2	6	206518	206523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3546	NC_004547	CAA	2	6	206540	206545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119143
3547	NC_004547	GAC	2	6	206555	206560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119143
3548	NC_004547	ACGCC	2	10	206659	206668	20 %	0 %	20 %	60 %	50119144
3549	NC_004547	TTC	2	6	206717	206722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119144
3550	NC_004547	AAT	2	6	206777	206782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119144
3551	NC_004547	GGC	2	6	206798	206803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119144
3552	NC_004547	GCG	2	6	206991	206996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119144
3553	NC_004547	CAA	2	6	207021	207026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119144
3554	NC_004547	CGC	2	6	207055	207060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119144
3555	NC_004547	TGA	2	6	207255	207260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119144
3556	NC_004547	CAC	2	6	207278	207283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119144
3557	NC_004547	AAT	2	6	207377	207382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119144
3558	NC_004547	CGT	2	6	207395	207400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119144
3559	NC_004547	ATG	2	6	207402	207407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119144
3560	NC_004547	CTG	2	6	207427	207432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119144
3561	NC_004547	GTC	2	6	207462	207467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119144
3562	NC_004547	TCA	2	6	207471	207476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119144
3563	NC_004547	TGGTC	2	10	207845	207854	0 %	40 %	40 %	20 %	50119145
3564	NC_004547	A	6	6	207913	207918	100 %	0 %	0 %	0 %	50119145
3565	NC_004547	CGTCAA	2	12	208033	208044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50119145
3566	NC_004547	AGA	2	6	208052	208057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119145
3567	NC_004547	CAC	2	6	208145	208150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119145
3568	NC_004547	CGC	2	6	208151	208156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119145
3569	NC_004547	TGG	2	6	208237	208242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119145
3570	NC_004547	CTT	2	6	208288	208293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119145
3571	NC_004547	GCT	2	6	208421	208426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119145
3572	NC_004547	TG	3	6	208432	208437	0 %	50 %	50 %	0 %	50119145
3573	NC_004547	ATT	2	6	208473	208478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119145
3574	NC_004547	CAG	2	6	208491	208496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119145
3575	NC_004547	TGC	2	6	208549	208554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119145
3576	NC_004547	TTA	2	6	208769	208774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119146
3577	NC_004547	CGG	2	6	208783	208788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119146
3578	NC_004547	GGT	2	6	208808	208813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119146
3579	NC_004547	GCT	2	6	208820	208825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119146
3580	NC_004547	GGC	2	6	208830	208835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119146
3581	NC_004547	CTG	2	6	208877	208882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119146
3582	NC_004547	AT	3	6	208971	208976	50 %	50 %	0 %	0 %	50119146
3583	NC_004547	GGC	2	6	209068	209073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119146
3584	NC_004547	CCG	2	6	209107	209112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119146
3585	NC_004547	AAT	2	6	209123	209128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119146
3586	NC_004547	TTA	2	6	209156	209161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119146
3587	NC_004547	GGGC	2	8	209173	209180	0 %	0 %	75 %	25 %	50119146
3588	NC_004547	GACAC	2	10	209291	209300	40 %	0 %	20 %	40 %	50119146
3589	NC_004547	CAG	2	6	209315	209320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119146
3590	NC_004547	AGG	2	6	209391	209396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50119146
3591	NC_004547	ACGA	2	8	209427	209434	50 %	0 %	25 %	25 %	50119146
3592	NC_004547	GATC	2	8	209439	209446	25 %	25 %	25 %	25 %	50119146
3593	NC_004547	ATT	2	6	209493	209498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119146
3594	NC_004547	CTG	2	6	209629	209634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3595	NC_004547	GTT	2	6	209683	209688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119147
3596	NC_004547	GCA	2	6	209707	209712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3597	NC_004547	GCA	2	6	209722	209727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3598	NC_004547	CGG	2	6	209836	209841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119147
3599	NC_004547	TCT	2	6	209883	209888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119147
3600	NC_004547	GCCA	2	8	209913	209920	25 %	0 %	25 %	50 %	50119147
3601	NC_004547	GAA	2	6	209969	209974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119147
3602	NC_004547	TTC	2	6	209993	209998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119147
3603	NC_004547	CG	3	6	210107	210112	0 %	0 %	50 %	50 %	50119147
3604	NC_004547	CGC	2	6	210124	210129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119147
3605	NC_004547	CAGCTC	2	12	210176	210187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	50119147
3606	NC_004547	CATC	2	8	210274	210281	25 %	25 %	0 %	50 %	50119147
3607	NC_004547	GGT	2	6	210309	210314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119147
3608	NC_004547	GCA	2	6	210316	210321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3609	NC_004547	CTG	2	6	210360	210365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3610	NC_004547	ATC	2	6	210399	210404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119147
3611	NC_004547	GCC	2	6	210428	210433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119147
3612	NC_004547	CGG	2	6	210446	210451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119147
3613	NC_004547	ACA	2	6	210457	210462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119147
3614	NC_004547	GCG	2	6	210465	210470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119147
3615	NC_004547	ACC	2	6	210500	210505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119147
3616	NC_004547	CAT	2	6	210700	210705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119147
3617	NC_004547	GTT	2	6	210710	210715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119147
3618	NC_004547	GTC	2	6	210719	210724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3619	NC_004547	GCG	2	6	210739	210744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119147
3620	NC_004547	CAGC	2	8	210765	210772	25 %	0 %	25 %	50 %	50119147
3621	NC_004547	AGC	2	6	210780	210785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3622	NC_004547	CTT	2	6	210889	210894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119147
3623	NC_004547	GCA	2	6	210925	210930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119147
3624	NC_004547	CCCAGA	2	12	211002	211013	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	50119147
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3635	NC_004547	TCGA	2	8	211854	211861	25 %	25 %	25 %	25 %	50119147
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3637	NC_004547	CTTT	2	8	211908	211915	0 %	75 %	0 %	25 %	50119147
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3643	NC_004547	AAAG	2	8	212809	212816	75 %	0 %	25 %	0 %	50119148
3644	NC_004547	T	6	6	212979	212984	0 %	100 %	0 %	0 %	50119148
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3745	NC_004547	TTAAT	2	10	218780	218789	40 %	60 %	0 %	0 %	50119152
3746	NC_004547	GAA	2	6	218871	218876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119153
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3749	NC_004547	TGG	2	6	218962	218967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119153
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3780	NC_004547	TCG	2	6	220457	220462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119154
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3851	NC_004547	CCCG	2	8	224600	224607	0 %	0 %	25 %	75 %	50119158
3852	NC_004547	TGA	2	6	224720	224725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119158
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3854	NC_004547	TGA	2	6	224860	224865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119158
3855	NC_004547	CTGG	3	12	224871	224882	0 %	25 %	50 %	25 %	50119158
3856	NC_004547	CGC	2	6	224907	224912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119158
3857	NC_004547	CG	3	6	224920	224925	0 %	0 %	50 %	50 %	50119158
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3859	NC_004547	A	6	6	224944	224949	100 %	0 %	0 %	0 %	50119158
3860	NC_004547	TGA	2	6	224957	224962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119158
3861	NC_004547	TGC	2	6	224971	224976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119158
3862	NC_004547	ATT	2	6	225055	225060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119158
3863	NC_004547	TTC	2	6	225177	225182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119158
3864	NC_004547	TTC	2	6	225204	225209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119158
3865	NC_004547	TTA	2	6	225238	225243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119158
3866	NC_004547	GATT	2	8	225278	225285	25 %	50 %	25 %	0 %	50119158
3867	NC_004547	TCG	2	6	225292	225297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119158
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3870	NC_004547	TTCG	2	8	225488	225495	0 %	50 %	25 %	25 %	50119158
3871	NC_004547	TAT	2	6	225502	225507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119158
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3883	NC_004547	A	6	6	226195	226200	100 %	0 %	0 %	0 %	50119159
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3977	NC_004547	GGCGT	2	10	231341	231350	0 %	20 %	60 %	20 %	50119165
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3983	NC_004547	TCTGG	2	10	231677	231686	0 %	40 %	40 %	20 %	50119165
3984	NC_004547	CCA	2	6	231708	231713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119165
3985	NC_004547	AAGA	2	8	231758	231765	75 %	0 %	25 %	0 %	50119165
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3987	NC_004547	AG	3	6	231824	231829	50 %	0 %	50 %	0 %	50119165
3988	NC_004547	ACA	2	6	231894	231899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119166
3989	NC_004547	CGTT	2	8	231950	231957	0 %	50 %	25 %	25 %	50119166
3990	NC_004547	TGG	2	6	232003	232008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119166
3991	NC_004547	A	7	7	232141	232147	100 %	0 %	0 %	0 %	50119166
3992	NC_004547	AG	3	6	232190	232195	50 %	0 %	50 %	0 %	50119166
3993	NC_004547	CTG	2	6	232254	232259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119166
3994	NC_004547	GCA	2	6	232271	232276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119166
3995	NC_004547	AGT	2	6	232379	232384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119166
3996	NC_004547	TGT	2	6	232388	232393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119166
3997	NC_004547	AGA	2	6	232403	232408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119166
3998	NC_004547	GGATG	2	10	232410	232419	20 %	20 %	60 %	0 %	50119166
3999	NC_004547	TTTA	2	8	232584	232591	25 %	75 %	0 %	0 %	50119166
4000	NC_004547	TCG	2	6	232736	232741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119167

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