MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus horikoshii OT3 chromosome

Total Repeats: 31244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000961	CCT	2	6	292773	292778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14590240
5002	NC_000961	GTG	2	6	292843	292848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14590240
5003	NC_000961	TGA	2	6	292908	292913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590240
5004	NC_000961	A	6	6	292923	292928	100 %	0 %	0 %	0 %	14590240
5005	NC_000961	GCA	2	6	292951	292956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14590240
5006	NC_000961	GGA	2	6	293022	293027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590240
5007	NC_000961	AGGA	2	8	293083	293090	50 %	0 %	50 %	0 %	14590240
5008	NC_000961	TGAT	2	8	293184	293191	25 %	50 %	25 %	0 %	14590241
5009	NC_000961	TTA	2	6	293409	293414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14590241
5010	NC_000961	ATA	2	6	293435	293440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590241
5011	NC_000961	AGG	2	6	293448	293453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590241
5012	NC_000961	TAA	2	6	293457	293462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590241
5013	NC_000961	TGT	2	6	293497	293502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14590241
5014	NC_000961	GAG	2	6	293576	293581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590241
5015	NC_000961	AGG	2	6	293582	293587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590241
5016	NC_000961	GAA	2	6	293588	293593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590241
5017	NC_000961	TAC	2	6	293600	293605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14590241
5018	NC_000961	GGA	2	6	293653	293658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590241
5019	NC_000961	GAT	2	6	293663	293668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590241
5020	NC_000961	AGA	2	6	293703	293708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590241
5021	NC_000961	GA	3	6	293714	293719	50 %	0 %	50 %	0 %	14590241
5022	NC_000961	TTC	2	6	293723	293728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590241
5023	NC_000961	TAA	2	6	293772	293777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590241
5024	NC_000961	CTT	2	6	293857	293862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590241
5025	NC_000961	GAG	2	6	293879	293884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590241
5026	NC_000961	TGGA	2	8	293925	293932	25 %	25 %	50 %	0 %	14590241
5027	NC_000961	CAA	2	6	293954	293959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14590241
5028	NC_000961	AG	4	8	294026	294033	50 %	0 %	50 %	0 %	14590241
5029	NC_000961	CTT	2	6	294035	294040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590241
5030	NC_000961	CTA	2	6	294078	294083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14590241
5031	NC_000961	G	6	6	294181	294186	0 %	0 %	100 %	0 %	14590241
5032	NC_000961	GGA	2	6	294237	294242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590241
5033	NC_000961	GAG	2	6	294259	294264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590241
5034	NC_000961	TAACC	2	10	294318	294327	40 %	20 %	0 %	40 %	14590241
5035	NC_000961	AGT	2	6	294395	294400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590242
5036	NC_000961	ATG	2	6	294429	294434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590242
5037	NC_000961	A	7	7	294477	294483	100 %	0 %	0 %	0 %	14590242
5038	NC_000961	AGA	2	6	294496	294501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590242
5039	NC_000961	GAG	2	6	294562	294567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590242
5040	NC_000961	A	6	6	294596	294601	100 %	0 %	0 %	0 %	14590242
5041	NC_000961	T	6	6	294608	294613	0 %	100 %	0 %	0 %	14590242
5042	NC_000961	TAA	2	6	294765	294770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590242
5043	NC_000961	AG	4	8	295031	295038	50 %	0 %	50 %	0 %	14590242
5044	NC_000961	AGG	2	6	295077	295082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590242
5045	NC_000961	GAGG	2	8	295103	295110	25 %	0 %	75 %	0 %	14590242
5046	NC_000961	GAG	2	6	295118	295123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590242
5047	NC_000961	ATA	2	6	295169	295174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590242
5048	NC_000961	GAA	3	9	295193	295201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590242
5049	NC_000961	GCC	2	6	295214	295219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14590242
5050	NC_000961	GAA	2	6	295384	295389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590242
5051	NC_000961	TAC	2	6	295405	295410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14590242
5052	NC_000961	GGC	2	6	295420	295425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14590242
5053	NC_000961	TA	3	6	295436	295441	50 %	50 %	0 %	0 %	14590242
5054	NC_000961	AAT	2	6	295494	295499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590243
5055	NC_000961	ATA	2	6	295504	295509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590243
5056	NC_000961	TCG	2	6	295520	295525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14590243
5057	NC_000961	TCAC	2	8	295531	295538	25 %	25 %	0 %	50 %	14590243
5058	NC_000961	TCT	2	6	295543	295548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590243
5059	NC_000961	CTC	2	6	295639	295644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14590243
5060	NC_000961	AAC	2	6	295645	295650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14590243
5061	NC_000961	G	6	6	295726	295731	0 %	0 %	100 %	0 %	14590243
5062	NC_000961	GAA	2	6	295763	295768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590243
5063	NC_000961	ACG	2	6	295873	295878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14590243
5064	NC_000961	TACTAT	2	12	295894	295905	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	14590243
5065	NC_000961	GTT	2	6	295963	295968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14590243
5066	NC_000961	TCC	2	6	296169	296174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14590243
5067	NC_000961	GATC	2	8	296307	296314	25 %	25 %	25 %	25 %	14590243
5068	NC_000961	CAAG	2	8	296343	296350	50 %	0 %	25 %	25 %	14590243
5069	NC_000961	CATG	2	8	296353	296360	25 %	25 %	25 %	25 %	14590243
5070	NC_000961	TGGA	2	8	296385	296392	25 %	25 %	50 %	0 %	14590243
5071	NC_000961	AGG	2	6	296444	296449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590243
5072	NC_000961	TTC	2	6	296474	296479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590243
5073	NC_000961	AT	3	6	296597	296602	50 %	50 %	0 %	0 %	14590243
5074	NC_000961	AAT	2	6	296635	296640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590243
5075	NC_000961	AAT	2	6	296652	296657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590243
5076	NC_000961	TGT	2	6	296673	296678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14590243
5077	NC_000961	TAACCA	2	12	296696	296707	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	14590243
5078	NC_000961	AGG	2	6	296709	296714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590243
5079	NC_000961	GGA	2	6	296820	296825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590243
5080	NC_000961	AGT	2	6	296964	296969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590243
5081	NC_000961	GA	3	6	296984	296989	50 %	0 %	50 %	0 %	14590243
5082	NC_000961	GGGA	2	8	297056	297063	25 %	0 %	75 %	0 %	14590243
5083	NC_000961	TAA	2	6	297102	297107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590243
5084	NC_000961	TTG	2	6	297125	297130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14590243
5085	NC_000961	CTT	2	6	297150	297155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590243
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5087	NC_000961	CAA	2	6	297213	297218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14590243
5088	NC_000961	TA	3	6	297411	297416	50 %	50 %	0 %	0 %	14590243
5089	NC_000961	GGA	2	6	297510	297515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590243
5090	NC_000961	AGG	2	6	297634	297639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590243
5091	NC_000961	CTT	2	6	297666	297671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590243
5092	NC_000961	CT	3	6	297787	297792	0 %	50 %	0 %	50 %	14590243
5093	NC_000961	GAA	2	6	297799	297804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590243
5094	NC_000961	GTAA	2	8	297844	297851	50 %	25 %	25 %	0 %	14590243
5095	NC_000961	AAG	2	6	297901	297906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14590243
5096	NC_000961	TCT	2	6	297927	297932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14590243
5097	NC_000961	TCC	2	6	298098	298103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14590243
5098	NC_000961	ATT	2	6	298132	298137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14590243
5099	NC_000961	TAAG	2	8	298139	298146	50 %	25 %	25 %	0 %	14590243
5100	NC_000961	GAAAA	2	10	298261	298270	80 %	0 %	20 %	0 %	14590243
5101	NC_000961	ATG	2	6	298292	298297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590243
5102	NC_000961	GTG	2	6	298300	298305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14590243
5103	NC_000961	ATG	2	6	298325	298330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590243
5104	NC_000961	AATAA	2	10	298490	298499	80 %	20 %	0 %	0 %	14590243
5105	NC_000961	AAT	2	6	298621	298626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14590244
5106	NC_000961	TC	3	6	298662	298667	0 %	50 %	0 %	50 %	14590244
5107	NC_000961	TTA	2	6	298687	298692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14590244
5108	NC_000961	ATT	2	6	298808	298813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14590244
5109	NC_000961	GGTA	2	8	298934	298941	25 %	25 %	50 %	0 %	14590244
5110	NC_000961	GAT	2	6	298963	298968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590244
5111	NC_000961	CAT	2	6	298969	298974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14590244
5112	NC_000961	TTCCA	2	10	299086	299095	20 %	40 %	0 %	40 %	14590244
5113	NC_000961	TTG	2	6	299121	299126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14590244
5114	NC_000961	GAC	2	6	299198	299203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14590244
5115	NC_000961	TCC	2	6	299208	299213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14590244
5116	NC_000961	GAAA	2	8	299217	299224	75 %	0 %	25 %	0 %	14590244
5117	NC_000961	TAC	2	6	299249	299254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14590244
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5119	NC_000961	AGAA	2	8	299373	299380	75 %	0 %	25 %	0 %	14590244
5120	NC_000961	GAAA	2	8	299391	299398	75 %	0 %	25 %	0 %	14590244
5121	NC_000961	AGG	2	6	299417	299422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14590244
5122	NC_000961	AT	3	6	299471	299476	50 %	50 %	0 %	0 %	14590245
5123	NC_000961	AAGG	2	8	299499	299506	50 %	0 %	50 %	0 %	14590245
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5125	NC_000961	CTC	2	6	299753	299758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14590245
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5142	NC_000961	GTTAT	2	10	300227	300236	20 %	60 %	20 %	0 %	14590245
5143	NC_000961	TGA	2	6	300240	300245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14590245
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