MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000868	TTG	2	6	219563	219568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520429
3502	NC_000868	GGA	2	6	219747	219752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520429
3503	NC_000868	AAG	2	6	219766	219771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520429
3504	NC_000868	ATA	2	6	219832	219837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520429
3505	NC_000868	GAT	2	6	219897	219902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520429
3506	NC_000868	ATG	2	6	219946	219951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520429
3507	NC_000868	AGG	2	6	220012	220017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520429
3508	NC_000868	TAA	3	9	220049	220057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520429
3509	NC_000868	TGG	2	6	220130	220135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520430
3510	NC_000868	TAT	2	6	220137	220142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520430
3511	NC_000868	TGG	2	6	220149	220154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520430
3512	NC_000868	AGG	2	6	220172	220177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520430
3513	NC_000868	AG	3	6	220207	220212	50 %	0 %	50 %	0 %	14520430
3514	NC_000868	AAAG	2	8	220239	220246	75 %	0 %	25 %	0 %	14520430
3515	NC_000868	GATG	2	8	220350	220357	25 %	25 %	50 %	0 %	14520430
3516	NC_000868	AAT	2	6	220362	220367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520430
3517	NC_000868	G	6	6	220409	220414	0 %	0 %	100 %	0 %	14520430
3518	NC_000868	TTC	2	6	220466	220471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520430
3519	NC_000868	CAA	2	6	220529	220534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520430
3520	NC_000868	GAA	2	6	220537	220542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520430
3521	NC_000868	GAAG	2	8	220544	220551	50 %	0 %	50 %	0 %	14520430
3522	NC_000868	GTC	2	6	220684	220689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520430
3523	NC_000868	GAG	2	6	220706	220711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520430
3524	NC_000868	ATA	2	6	220750	220755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520430
3525	NC_000868	GGCTT	2	10	220859	220868	0 %	40 %	40 %	20 %	14520430
3526	NC_000868	GGC	2	6	220878	220883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520430
3527	NC_000868	ATA	2	6	220939	220944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520430
3528	NC_000868	GAA	2	6	220977	220982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520430
3529	NC_000868	AGG	2	6	221012	221017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520430
3530	NC_000868	A	6	6	221051	221056	100 %	0 %	0 %	0 %	14520431
3531	NC_000868	TTC	4	12	221082	221093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520431
3532	NC_000868	GTA	2	6	221169	221174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520431
3533	NC_000868	CGG	2	6	221216	221221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520431
3534	NC_000868	CCATG	2	10	221249	221258	20 %	20 %	20 %	40 %	14520431
3535	NC_000868	TTTAC	2	10	221291	221300	20 %	60 %	0 %	20 %	14520431
3536	NC_000868	TAGG	2	8	221341	221348	25 %	25 %	50 %	0 %	14520431
3537	NC_000868	TTC	2	6	221376	221381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520431
3538	NC_000868	TCA	2	6	221394	221399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520431
3539	NC_000868	AGGGT	2	10	221419	221428	20 %	20 %	60 %	0 %	14520431
3540	NC_000868	GAT	2	6	221453	221458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520431
3541	NC_000868	GGT	2	6	221493	221498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520431
3542	NC_000868	CTT	2	6	221531	221536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520431
3543	NC_000868	GAG	2	6	221622	221627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520431
3544	NC_000868	T	6	6	221657	221662	0 %	100 %	0 %	0 %	14520431
3545	NC_000868	TTC	2	6	221685	221690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520431
3546	NC_000868	TTCC	2	8	221721	221728	0 %	50 %	0 %	50 %	14520431
3547	NC_000868	ATG	2	6	221778	221783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520431
3548	NC_000868	CTT	2	6	221801	221806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520431
3549	NC_000868	CTA	2	6	221898	221903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520431
3550	NC_000868	AT	3	6	221987	221992	50 %	50 %	0 %	0 %	14520431
3551	NC_000868	TTC	2	6	222051	222056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520431
3552	NC_000868	TGG	2	6	222094	222099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520431
3553	NC_000868	TTC	2	6	222142	222147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520431
3554	NC_000868	TTG	2	6	222180	222185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520431
3555	NC_000868	ATG	2	6	222196	222201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520431
3556	NC_000868	TAG	2	6	222345	222350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520432
3557	NC_000868	GCCT	2	8	222384	222391	0 %	25 %	25 %	50 %	14520432
3558	NC_000868	GAA	2	6	222411	222416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520432
3559	NC_000868	GGA	2	6	222498	222503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520432
3560	NC_000868	AGCG	2	8	222615	222622	25 %	0 %	50 %	25 %	14520432
3561	NC_000868	TTC	2	6	222679	222684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520432
3562	NC_000868	TC	3	6	222693	222698	0 %	50 %	0 %	50 %	14520432
3563	NC_000868	AAGGG	2	10	222709	222718	40 %	0 %	60 %	0 %	14520432
3564	NC_000868	TC	3	6	222854	222859	0 %	50 %	0 %	50 %	14520432
3565	NC_000868	TTA	2	6	223035	223040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520432
3566	NC_000868	CTT	2	6	223113	223118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520433
3567	NC_000868	TCC	2	6	223124	223129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520433
3568	NC_000868	TAT	2	6	223246	223251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520433
3569	NC_000868	CCCT	2	8	223329	223336	0 %	25 %	0 %	75 %	14520433
3570	NC_000868	TCTT	2	8	223362	223369	0 %	75 %	0 %	25 %	14520433
3571	NC_000868	CT	3	6	223475	223480	0 %	50 %	0 %	50 %	14520433
3572	NC_000868	ATCT	2	8	223486	223493	25 %	50 %	0 %	25 %	14520433
3573	NC_000868	T	6	6	223493	223498	0 %	100 %	0 %	0 %	14520433
3574	NC_000868	CATC	2	8	223539	223546	25 %	25 %	0 %	50 %	14520433
3575	NC_000868	CTT	2	6	223566	223571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520433
3576	NC_000868	GGA	2	6	223600	223605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520433
3577	NC_000868	ATC	2	6	223619	223624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520433
3578	NC_000868	TGA	2	6	223627	223632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520433
3579	NC_000868	CT	3	6	223675	223680	0 %	50 %	0 %	50 %	14520433
3580	NC_000868	CAC	2	6	223688	223693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520434
3581	NC_000868	C	6	6	223702	223707	0 %	0 %	0 %	100 %	14520434
3582	NC_000868	GTTG	2	8	223847	223854	0 %	50 %	50 %	0 %	14520434
3583	NC_000868	TTC	2	6	223876	223881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520434
3584	NC_000868	CCTA	2	8	223913	223920	25 %	25 %	0 %	50 %	14520434
3585	NC_000868	TTA	2	6	223951	223956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520434
3586	NC_000868	CCT	2	6	224065	224070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520434
3587	NC_000868	CT	3	6	224130	224135	0 %	50 %	0 %	50 %	14520434
3588	NC_000868	CTT	2	6	224278	224283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520434
3589	NC_000868	ATA	2	6	224373	224378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520435
3590	NC_000868	GAG	2	6	224416	224421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520435
3591	NC_000868	GAG	2	6	224429	224434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520435
3592	NC_000868	TTC	2	6	224482	224487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520435
3593	NC_000868	GAG	2	6	224495	224500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520435
3594	NC_000868	AGA	2	6	224513	224518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520435
3595	NC_000868	ATC	2	6	224585	224590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520435
3596	NC_000868	G	6	6	224609	224614	0 %	0 %	100 %	0 %	14520435
3597	NC_000868	TTC	2	6	224636	224641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520435
3598	NC_000868	AAG	2	6	224686	224691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520435
3599	NC_000868	AGG	2	6	224766	224771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520435
3600	NC_000868	GGAAA	2	10	224776	224785	60 %	0 %	40 %	0 %	14520435
3601	NC_000868	CGA	2	6	224812	224817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520435
3602	NC_000868	AGGC	2	8	224866	224873	25 %	0 %	50 %	25 %	14520435
3603	NC_000868	CT	3	6	224892	224897	0 %	50 %	0 %	50 %	14520435
3604	NC_000868	GAG	2	6	224999	225004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520435
3605	NC_000868	AATG	2	8	225035	225042	50 %	25 %	25 %	0 %	14520435
3606	NC_000868	AGG	2	6	225129	225134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520436
3607	NC_000868	GAT	2	6	225261	225266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520436
3608	NC_000868	TTGAAG	2	12	225370	225381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520436
3609	NC_000868	TTC	2	6	225459	225464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520436
3610	NC_000868	GAG	2	6	225549	225554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520436
3611	NC_000868	AGG	2	6	225633	225638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520436
3612	NC_000868	TGA	2	6	225661	225666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520436
3613	NC_000868	GGA	2	6	225734	225739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520436
3614	NC_000868	CTA	2	6	225800	225805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520436
3615	NC_000868	CT	3	6	226005	226010	0 %	50 %	0 %	50 %	14520437
3616	NC_000868	TCT	2	6	226024	226029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520437
3617	NC_000868	CCTTT	2	10	226063	226072	0 %	60 %	0 %	40 %	14520437
3618	NC_000868	AAG	2	6	226083	226088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520437
3619	NC_000868	CT	3	6	226094	226099	0 %	50 %	0 %	50 %	14520437
3620	NC_000868	TCC	3	9	226115	226123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520437
3621	NC_000868	CAC	2	6	226168	226173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520437
3622	NC_000868	ATG	2	6	226209	226214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520437
3623	NC_000868	GAA	2	6	226271	226276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520437
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3625	NC_000868	CCTCTC	2	12	226393	226404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520437
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3999	NC_000868	TGT	2	6	246975	246980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520457
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