MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_000868	TCA	2	6	121694	121699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520340
2002	NC_000868	CAT	2	6	121762	121767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520340
2003	NC_000868	TCT	2	6	121779	121784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520340
2004	NC_000868	CCT	2	6	121956	121961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520340
2005	NC_000868	TAC	2	6	122014	122019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520340
2006	NC_000868	TTC	2	6	122020	122025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520340
2007	NC_000868	CAC	2	6	122157	122162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520340
2008	NC_000868	TCT	2	6	122163	122168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520340
2009	NC_000868	TCG	2	6	122186	122191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520340
2010	NC_000868	TAT	2	6	122197	122202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520340
2011	NC_000868	CTTT	2	8	122210	122217	0 %	75 %	0 %	25 %	14520340
2012	NC_000868	TA	3	6	122363	122368	50 %	50 %	0 %	0 %	14520340
2013	NC_000868	TGT	2	6	122382	122387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520340
2014	NC_000868	CTC	2	6	122410	122415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520340
2015	NC_000868	TC	3	6	122484	122489	0 %	50 %	0 %	50 %	14520340
2016	NC_000868	AGT	2	6	122612	122617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520340
2017	NC_000868	TCCTC	2	10	123541	123550	0 %	40 %	0 %	60 %	14520341
2018	NC_000868	AGT	2	6	123576	123581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520341
2019	NC_000868	TCC	2	6	123868	123873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520341
2020	NC_000868	CTT	2	6	123947	123952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520341
2021	NC_000868	TAT	2	6	124034	124039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520341
2022	NC_000868	GAAT	2	8	124129	124136	50 %	25 %	25 %	0 %	14520341
2023	NC_000868	GT	4	8	124195	124202	0 %	50 %	50 %	0 %	14520341
2024	NC_000868	CTTC	2	8	124213	124220	0 %	50 %	0 %	50 %	14520341
2025	NC_000868	TCC	2	6	124247	124252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520341
2026	NC_000868	GCT	2	6	124463	124468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520342
2027	NC_000868	GAT	2	6	124498	124503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520342
2028	NC_000868	TAA	2	6	124596	124601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520342
2029	NC_000868	AAC	2	6	124679	124684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520342
2030	NC_000868	TGG	2	6	124705	124710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520342
2031	NC_000868	GGGATA	2	12	124715	124726	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	14520342
2032	NC_000868	GGA	3	9	124765	124773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520342
2033	NC_000868	AAC	2	6	124775	124780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520342
2034	NC_000868	CTT	2	6	124805	124810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520342
2035	NC_000868	GGC	2	6	124924	124929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520342
2036	NC_000868	CCT	2	6	124987	124992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520342
2037	NC_000868	GAT	2	6	125005	125010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520342
2038	NC_000868	GAG	3	9	125053	125061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520342
2039	NC_000868	TCCTC	2	10	125113	125122	0 %	40 %	0 %	60 %	14520343
2040	NC_000868	TC	3	6	125150	125155	0 %	50 %	0 %	50 %	14520343
2041	NC_000868	ATT	2	6	125199	125204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520343
2042	NC_000868	ATA	2	6	125288	125293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520343
2043	NC_000868	GGA	2	6	125338	125343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520343
2044	NC_000868	CGA	2	6	125347	125352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520343
2045	NC_000868	GAA	2	6	125400	125405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520343
2046	NC_000868	AGG	2	6	125424	125429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520343
2047	NC_000868	GAT	2	6	125455	125460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520343
2048	NC_000868	CAC	2	6	125462	125467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520343
2049	NC_000868	GAA	2	6	125484	125489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520343
2050	NC_000868	CTT	2	6	125526	125531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520344
2051	NC_000868	AGTG	2	8	125592	125599	25 %	25 %	50 %	0 %	14520344
2052	NC_000868	TTC	2	6	125637	125642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520344
2053	NC_000868	TCC	2	6	125696	125701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520344
2054	NC_000868	CTC	2	6	125802	125807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520344
2055	NC_000868	AGATT	2	10	125828	125837	40 %	40 %	20 %	0 %	14520344
2056	NC_000868	AAG	2	6	125890	125895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520344
2057	NC_000868	ACG	2	6	125896	125901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520344
2058	NC_000868	ATT	2	6	125962	125967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520344
2059	NC_000868	AGG	2	6	125997	126002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520344
2060	NC_000868	TC	3	6	126019	126024	0 %	50 %	0 %	50 %	14520344
2061	NC_000868	AAG	2	6	126043	126048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520344
2062	NC_000868	ATT	2	6	126067	126072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520344
2063	NC_000868	GCTC	2	8	126092	126099	0 %	25 %	25 %	50 %	14520344
2064	NC_000868	TGCCC	2	10	126102	126111	0 %	20 %	20 %	60 %	14520344
2065	NC_000868	TCC	2	6	126190	126195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520344
2066	NC_000868	TCA	2	6	126292	126297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520345
2067	NC_000868	AGT	2	6	126361	126366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520345
2068	NC_000868	TGA	2	6	126439	126444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520345
2069	NC_000868	AAACC	2	10	126521	126530	60 %	0 %	0 %	40 %	14520345
2070	NC_000868	TTC	2	6	126554	126559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520345
2071	NC_000868	TTC	2	6	126566	126571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520345
2072	NC_000868	CT	3	6	126585	126590	0 %	50 %	0 %	50 %	14520345
2073	NC_000868	AAGCTT	2	12	126602	126613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14520345
2074	NC_000868	CCT	2	6	126667	126672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520345
2075	NC_000868	TAT	2	6	126673	126678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520345
2076	NC_000868	ACT	2	6	126804	126809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520345
2077	NC_000868	TTA	2	6	126907	126912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520345
2078	NC_000868	TAT	2	6	126944	126949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520345
2079	NC_000868	ATT	2	6	126987	126992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520345
2080	NC_000868	AT	4	8	127004	127011	50 %	50 %	0 %	0 %	14520345
2081	NC_000868	ATG	2	6	127072	127077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520345
2082	NC_000868	TGA	2	6	127099	127104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520346
2083	NC_000868	ATA	2	6	127218	127223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520346
2084	NC_000868	TCC	2	6	127288	127293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520346
2085	NC_000868	TAC	2	6	127326	127331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520346
2086	NC_000868	ATG	2	6	127423	127428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520346
2087	NC_000868	TCT	2	6	127429	127434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520346
2088	NC_000868	TC	3	6	127461	127466	0 %	50 %	0 %	50 %	14520346
2089	NC_000868	TCT	2	6	127487	127492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520346
2090	NC_000868	TTG	2	6	127564	127569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520346
2091	NC_000868	GGA	2	6	127657	127662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520346
2092	NC_000868	TCACCG	2	12	127690	127701	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14520346
2093	NC_000868	ACC	2	6	127811	127816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520347
2094	NC_000868	GT	3	6	127861	127866	0 %	50 %	50 %	0 %	14520347
2095	NC_000868	ATC	2	6	127964	127969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520347
2096	NC_000868	CTC	2	6	127976	127981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520347
2097	NC_000868	TCGAGC	2	12	128000	128011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14520347
2098	NC_000868	AAGG	2	8	128106	128113	50 %	0 %	50 %	0 %	14520347
2099	NC_000868	TCA	2	6	128157	128162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520347
2100	NC_000868	TAG	2	6	128335	128340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520347
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2103	NC_000868	TC	3	6	128645	128650	0 %	50 %	0 %	50 %	14520348
2104	NC_000868	TCC	2	6	128731	128736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520348
2105	NC_000868	TCG	2	6	128800	128805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520348
2106	NC_000868	TC	3	6	128861	128866	0 %	50 %	0 %	50 %	14520348
2107	NC_000868	GCTCA	2	10	128871	128880	20 %	20 %	20 %	40 %	14520348
2108	NC_000868	CT	3	6	128936	128941	0 %	50 %	0 %	50 %	14520348
2109	NC_000868	CTT	3	9	128948	128956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520348
2110	NC_000868	CTT	2	6	129114	129119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520348
2111	NC_000868	TCA	2	6	129137	129142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520348
2112	NC_000868	CAT	2	6	129239	129244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520348
2113	NC_000868	ATC	2	6	129274	129279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520348
2114	NC_000868	TGAAG	2	10	129585	129594	40 %	20 %	40 %	0 %	14520349
2115	NC_000868	AAG	2	6	129664	129669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520349
2116	NC_000868	AAAT	2	8	129680	129687	75 %	25 %	0 %	0 %	14520349
2117	NC_000868	AGG	2	6	129710	129715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520349
2118	NC_000868	GAG	2	6	129787	129792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520349
2119	NC_000868	AT	3	6	129833	129838	50 %	50 %	0 %	0 %	14520349
2120	NC_000868	CAG	2	6	129904	129909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520349
2121	NC_000868	AG	3	6	129912	129917	50 %	0 %	50 %	0 %	14520349
2122	NC_000868	AGAA	2	8	129943	129950	75 %	0 %	25 %	0 %	14520349
2123	NC_000868	AAG	2	6	129964	129969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520349
2124	NC_000868	GAT	2	6	130035	130040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520349
2125	NC_000868	TGA	2	6	130059	130064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520349
2126	NC_000868	GAA	2	6	130068	130073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520349
2127	NC_000868	TGA	2	6	130080	130085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520349
2128	NC_000868	ATC	2	6	130088	130093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520349
2129	NC_000868	AGA	2	6	130132	130137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520349
2130	NC_000868	TACG	2	8	130293	130300	25 %	25 %	25 %	25 %	14520349
2131	NC_000868	GTA	2	6	130356	130361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520350
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2145	NC_000868	AAG	2	6	131220	131225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520350
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2154	NC_000868	CGGC	2	8	131893	131900	0 %	0 %	50 %	50 %	14520350
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2197	NC_000868	CTTAT	2	10	134160	134169	20 %	60 %	0 %	20 %	14520352
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2223	NC_000868	ATA	2	6	135811	135816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520353
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2228	NC_000868	A	7	7	136049	136055	100 %	0 %	0 %	0 %	14520354
2229	NC_000868	TAC	2	6	136122	136127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520354
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2232	NC_000868	AAG	2	6	136437	136442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520354
2233	NC_000868	ATA	2	6	136449	136454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520354
2234	NC_000868	GAA	2	6	136655	136660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520354
2235	NC_000868	ATA	2	6	136692	136697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520354
2236	NC_000868	ACC	2	6	136733	136738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520354
2237	NC_000868	TGA	2	6	136796	136801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520354
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2239	NC_000868	GTG	2	6	136835	136840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520354
2240	NC_000868	GTT	2	6	136860	136865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520354
2241	NC_000868	TCT	2	6	136871	136876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520354
2242	NC_000868	GAG	2	6	136897	136902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520354
2243	NC_000868	GTT	2	6	136920	136925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520354
2244	NC_000868	TCAC	2	8	136972	136979	25 %	25 %	0 %	50 %	14520354
2245	NC_000868	GCA	2	6	137004	137009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520354
2246	NC_000868	AG	3	6	137091	137096	50 %	0 %	50 %	0 %	14520354
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2248	NC_000868	AG	3	6	137190	137195	50 %	0 %	50 %	0 %	14520354
2249	NC_000868	AGA	2	6	137203	137208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520354
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2360	NC_000868	CGT	2	6	143986	143991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520360
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2369	NC_000868	TAACTG	2	12	144375	144386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14520361
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2372	NC_000868	TAC	2	6	144555	144560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520361
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2497	NC_000868	ACT	2	6	154684	154689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520369
2498	NC_000868	CTTC	2	8	154749	154756	0 %	50 %	0 %	50 %	14520369
2499	NC_000868	TC	3	6	154771	154776	0 %	50 %	0 %	50 %	14520369
2500	NC_000868	ATT	2	6	154781	154786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520369

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