MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000868	CTA	2	6	30877	30882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520250
502	NC_000868	CTC	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520250
503	NC_000868	ACC	2	6	30985	30990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520250
504	NC_000868	ACC	2	6	31026	31031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520250
505	NC_000868	TTC	2	6	31230	31235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520250
506	NC_000868	CCCT	2	8	31238	31245	0 %	25 %	0 %	75 %	14520250
507	NC_000868	CAC	2	6	31298	31303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520250
508	NC_000868	CTTA	2	8	31335	31342	25 %	50 %	0 %	25 %	14520250
509	NC_000868	GTA	2	6	31458	31463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520250
510	NC_000868	TTG	2	6	31671	31676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520251
511	NC_000868	ACG	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520251
512	NC_000868	TCC	2	6	31704	31709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520251
513	NC_000868	TCCC	2	8	31832	31839	0 %	25 %	0 %	75 %	14520251
514	NC_000868	TTA	2	6	31987	31992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520251
515	NC_000868	CTC	2	6	32009	32014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520251
516	NC_000868	CTC	2	6	32030	32035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520251
517	NC_000868	TTC	2	6	32040	32045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520251
518	NC_000868	TA	3	6	32081	32086	50 %	50 %	0 %	0 %	14520251
519	NC_000868	CTAGCC	2	12	32106	32117	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14520251
520	NC_000868	T	6	6	32120	32125	0 %	100 %	0 %	0 %	14520251
521	NC_000868	TTC	2	6	32216	32221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520251
522	NC_000868	CGG	2	6	32245	32250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520251
523	NC_000868	TATC	2	8	32251	32258	25 %	50 %	0 %	25 %	14520251
524	NC_000868	CCA	2	6	32337	32342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520251
525	NC_000868	ATC	2	6	32378	32383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520251
526	NC_000868	CCT	2	6	33022	33027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520252
527	NC_000868	TTC	2	6	33033	33038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520252
528	NC_000868	TTGCT	2	10	33068	33077	0 %	60 %	20 %	20 %	14520252
529	NC_000868	GTA	2	6	33080	33085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520252
530	NC_000868	CTT	2	6	33086	33091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520252
531	NC_000868	GCCT	2	8	33137	33144	0 %	25 %	25 %	50 %	14520252
532	NC_000868	GTAG	2	8	33163	33170	25 %	25 %	50 %	0 %	14520252
533	NC_000868	GT	3	6	33429	33434	0 %	50 %	50 %	0 %	14520253
534	NC_000868	TAC	2	6	33489	33494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520253
535	NC_000868	CATC	2	8	33495	33502	25 %	25 %	0 %	50 %	14520253
536	NC_000868	ATTAGC	2	12	33725	33736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14520253
537	NC_000868	GCTC	2	8	33756	33763	0 %	25 %	25 %	50 %	14520253
538	NC_000868	TAG	2	6	33890	33895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520253
539	NC_000868	GAGCTA	2	12	33903	33914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	14520253
540	NC_000868	ACTAA	2	10	33962	33971	60 %	20 %	0 %	20 %	14520253
541	NC_000868	CAA	2	6	33985	33990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520253
542	NC_000868	AT	3	6	34206	34211	50 %	50 %	0 %	0 %	14520254
543	NC_000868	TAG	2	6	34270	34275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520254
544	NC_000868	A	6	6	34300	34305	100 %	0 %	0 %	0 %	14520254
545	NC_000868	AGG	2	6	34429	34434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520254
546	NC_000868	GAT	2	6	34445	34450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520254
547	NC_000868	GA	3	6	34452	34457	50 %	0 %	50 %	0 %	14520254
548	NC_000868	TTC	2	6	34519	34524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520254
549	NC_000868	AC	3	6	34535	34540	50 %	0 %	0 %	50 %	14520254
550	NC_000868	GTT	2	6	34599	34604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520254
551	NC_000868	TCA	2	6	34634	34639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520254
552	NC_000868	AAT	2	6	34673	34678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520254
553	NC_000868	AAT	2	6	34730	34735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520254
554	NC_000868	AGGAAA	2	12	34736	34747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520254
555	NC_000868	AG	3	6	34758	34763	50 %	0 %	50 %	0 %	14520254
556	NC_000868	GCCA	2	8	34870	34877	25 %	0 %	25 %	50 %	14520255
557	NC_000868	CCT	2	6	34901	34906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520255
558	NC_000868	CCG	2	6	34967	34972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520255
559	NC_000868	TTA	2	6	34979	34984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520255
560	NC_000868	AACG	2	8	35007	35014	50 %	0 %	25 %	25 %	14520255
561	NC_000868	TAG	2	6	35042	35047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520255
562	NC_000868	TCC	2	6	35118	35123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520255
563	NC_000868	ATC	2	6	35176	35181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520255
564	NC_000868	ATT	2	6	35263	35268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520255
565	NC_000868	TCC	2	6	35364	35369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520255
566	NC_000868	CTC	2	6	35418	35423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520255
567	NC_000868	TAT	2	6	35445	35450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520255
568	NC_000868	TCCT	2	8	35476	35483	0 %	50 %	0 %	50 %	14520255
569	NC_000868	ACA	2	6	35497	35502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520255
570	NC_000868	TCC	2	6	35544	35549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520255
571	NC_000868	TAA	2	6	35552	35557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520255
572	NC_000868	TAT	2	6	35559	35564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520255
573	NC_000868	AGC	2	6	35586	35591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520255
574	NC_000868	TTAG	2	8	35701	35708	25 %	50 %	25 %	0 %	14520255
575	NC_000868	CTT	2	6	36150	36155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33356661
576	NC_000868	CTTAAG	2	12	36224	36235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33356661
577	NC_000868	ATC	2	6	36301	36306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33356661
578	NC_000868	TCA	2	6	36308	36313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33356661
579	NC_000868	CTA	2	6	36342	36347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33356661
580	NC_000868	TCCT	2	8	36403	36410	0 %	50 %	0 %	50 %	33356661
581	NC_000868	TAA	2	6	36487	36492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33356661
582	NC_000868	TTA	2	6	36495	36500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33356661
583	NC_000868	GGC	2	6	36532	36537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33356661
584	NC_000868	CTT	2	6	36588	36593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33356661
585	NC_000868	TCT	2	6	36631	36636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520257
586	NC_000868	GCC	2	6	36658	36663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520257
587	NC_000868	CTTC	2	8	36680	36687	0 %	50 %	0 %	50 %	14520257
588	NC_000868	CT	3	6	36729	36734	0 %	50 %	0 %	50 %	14520257
589	NC_000868	CAT	2	6	36744	36749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520257
590	NC_000868	TGA	2	6	36782	36787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520257
591	NC_000868	ATG	2	6	36841	36846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520257
592	NC_000868	CTC	2	6	37063	37068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520258
593	NC_000868	GT	3	6	37071	37076	0 %	50 %	50 %	0 %	14520258
594	NC_000868	A	6	6	37111	37116	100 %	0 %	0 %	0 %	14520258
595	NC_000868	CTA	2	6	37149	37154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520258
596	NC_000868	GAA	2	6	37209	37214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520258
597	NC_000868	AT	3	6	37258	37263	50 %	50 %	0 %	0 %	14520258
598	NC_000868	CGG	2	6	37290	37295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520258
599	NC_000868	CCTT	2	8	37382	37389	0 %	50 %	0 %	50 %	14520258
600	NC_000868	ACA	2	6	37433	37438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520258
601	NC_000868	CTTTT	2	10	37510	37519	0 %	80 %	0 %	20 %	14520258
602	NC_000868	GCCA	2	8	37540	37547	25 %	0 %	25 %	50 %	14520258
603	NC_000868	TGA	2	6	37657	37662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520259
604	NC_000868	CTC	2	6	37669	37674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520259
605	NC_000868	TAA	2	6	37690	37695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520259
606	NC_000868	GGA	2	6	37757	37762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520259
607	NC_000868	TAA	2	6	37766	37771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520259
608	NC_000868	CAT	2	6	37808	37813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520259
609	NC_000868	AG	4	8	37841	37848	50 %	0 %	50 %	0 %	14520259
610	NC_000868	TTC	2	6	37869	37874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520259
611	NC_000868	TAT	2	6	37887	37892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520259
612	NC_000868	GCATT	2	10	37897	37906	20 %	40 %	20 %	20 %	14520259
613	NC_000868	ATCAGA	2	12	37908	37919	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	14520259
614	NC_000868	TCT	2	6	37937	37942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520259
615	NC_000868	TTCGTT	2	12	37965	37976	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	14520259
616	NC_000868	CTC	2	6	38356	38361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520260
617	NC_000868	AAT	2	6	38481	38486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520260
618	NC_000868	CAG	2	6	38514	38519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520260
619	NC_000868	TCT	2	6	38542	38547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520260
620	NC_000868	C	6	6	38605	38610	0 %	0 %	0 %	100 %	14520260
621	NC_000868	CTA	2	6	38637	38642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520260
622	NC_000868	TCT	2	6	38646	38651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520260
623	NC_000868	A	6	6	38704	38709	100 %	0 %	0 %	0 %	14520260
624	NC_000868	CTT	3	9	38767	38775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520260
625	NC_000868	GTT	2	6	38783	38788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520260
626	NC_000868	AATA	2	8	38791	38798	75 %	25 %	0 %	0 %	14520260
627	NC_000868	ATA	2	6	38827	38832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520260
628	NC_000868	GT	3	6	38901	38906	0 %	50 %	50 %	0 %	14520260
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