MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Pseudomonas sp. VLB120 plasmid pSTY

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022739	CT	3	6	3023	3028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022739	GC	3	6	3377	3382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022739	CT	3	6	5437	5442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022739	AG	4	8	5596	5603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022739	TC	3	6	5868	5873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022739	GA	3	6	7250	7255	50 %	0 %	50 %	0 %	557225842
7	NC_022739	AC	3	6	7304	7309	50 %	0 %	0 %	50 %	557225842
8	NC_022739	GA	3	6	7618	7623	50 %	0 %	50 %	0 %	557225842
9	NC_022739	GA	3	6	8649	8654	50 %	0 %	50 %	0 %	557225843
10	NC_022739	GA	3	6	9127	9132	50 %	0 %	50 %	0 %	557225843
11	NC_022739	AG	3	6	9371	9376	50 %	0 %	50 %	0 %	557225843
12	NC_022739	TC	3	6	10193	10198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022739	AC	3	6	10225	10230	50 %	0 %	0 %	50 %	557225845
14	NC_022739	GA	3	6	10258	10263	50 %	0 %	50 %	0 %	557225845
15	NC_022739	AC	3	6	11241	11246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022739	GC	3	6	11658	11663	0 %	0 %	50 %	50 %	557225846
17	NC_022739	GC	3	6	12011	12016	0 %	0 %	50 %	50 %	557225847
18	NC_022739	TC	3	6	13112	13117	0 %	50 %	0 %	50 %	557225849
19	NC_022739	GC	3	6	15906	15911	0 %	0 %	50 %	50 %	557225851
20	NC_022739	GA	3	6	15991	15996	50 %	0 %	50 %	0 %	557225851
21	NC_022739	CA	3	6	16744	16749	50 %	0 %	0 %	50 %	557225852
22	NC_022739	AC	3	6	17046	17051	50 %	0 %	0 %	50 %	557225852
23	NC_022739	GC	3	6	17660	17665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022739	GT	3	6	18565	18570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022739	CT	3	6	18668	18673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022739	TA	3	6	19045	19050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022739	GC	3	6	19217	19222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022739	AT	3	6	20198	20203	50 %	50 %	0 %	0 %	557225853
29	NC_022739	GC	3	6	20284	20289	0 %	0 %	50 %	50 %	557225853
30	NC_022739	GT	3	6	21656	21661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022739	GT	3	6	22958	22963	0 %	50 %	50 %	0 %	557225855
32	NC_022739	GC	3	6	24173	24178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022739	CA	3	6	25954	25959	50 %	0 %	0 %	50 %	557225859
34	NC_022739	GA	3	6	26813	26818	50 %	0 %	50 %	0 %	557225859
35	NC_022739	AC	3	6	26871	26876	50 %	0 %	0 %	50 %	557225859
36	NC_022739	GC	3	6	27459	27464	0 %	0 %	50 %	50 %	557225860
37	NC_022739	CA	3	6	27772	27777	50 %	0 %	0 %	50 %	557225861
38	NC_022739	TG	3	6	28904	28909	0 %	50 %	50 %	0 %	557225862
39	NC_022739	CA	3	6	29708	29713	50 %	0 %	0 %	50 %	557225863
40	NC_022739	GC	3	6	30055	30060	0 %	0 %	50 %	50 %	557225863
41	NC_022739	GA	3	6	30350	30355	50 %	0 %	50 %	0 %	557225863
42	NC_022739	GT	3	6	30377	30382	0 %	50 %	50 %	0 %	557225863
43	NC_022739	AG	3	6	30608	30613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022739	CT	3	6	31067	31072	0 %	50 %	0 %	50 %	557225864
45	NC_022739	TC	3	6	31967	31972	0 %	50 %	0 %	50 %	557225864
46	NC_022739	GA	3	6	33026	33031	50 %	0 %	50 %	0 %	557225865
47	NC_022739	GC	3	6	33444	33449	0 %	0 %	50 %	50 %	557225866
48	NC_022739	GC	3	6	36078	36083	0 %	0 %	50 %	50 %	557225867
49	NC_022739	AG	3	6	36531	36536	50 %	0 %	50 %	0 %	557225867
50	NC_022739	GC	3	6	36635	36640	0 %	0 %	50 %	50 %	557225867
51	NC_022739	AG	3	6	39011	39016	50 %	0 %	50 %	0 %	557225869
52	NC_022739	CG	3	6	39283	39288	0 %	0 %	50 %	50 %	557225870
53	NC_022739	GC	3	6	39296	39301	0 %	0 %	50 %	50 %	557225870
54	NC_022739	TC	3	6	40046	40051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022739	AT	3	6	41661	41666	50 %	50 %	0 %	0 %	557225872
56	NC_022739	TC	3	6	44010	44015	0 %	50 %	0 %	50 %	557225872
57	NC_022739	TC	3	6	47032	47037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022739	AG	3	6	48160	48165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022739	GT	3	6	48295	48300	0 %	50 %	50 %	0 %	557225877
60	NC_022739	GA	3	6	50007	50012	50 %	0 %	50 %	0 %	557225878
61	NC_022739	CT	3	6	50108	50113	0 %	50 %	0 %	50 %	557225878
62	NC_022739	CA	3	6	53244	53249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022739	AC	4	8	54051	54058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022739	AC	3	6	54063	54068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022739	CG	3	6	54696	54701	0 %	0 %	50 %	50 %	557225884
66	NC_022739	AC	5	10	55003	55012	50 %	0 %	0 %	50 %	557225884
67	NC_022739	CA	3	6	55882	55887	50 %	0 %	0 %	50 %	557225885
68	NC_022739	GC	3	6	57368	57373	0 %	0 %	50 %	50 %	557225887
69	NC_022739	AG	3	6	57528	57533	50 %	0 %	50 %	0 %	557225887
70	NC_022739	AG	3	6	57657	57662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022739	AG	3	6	58670	58675	50 %	0 %	50 %	0 %	557225889
72	NC_022739	TG	3	6	58705	58710	0 %	50 %	50 %	0 %	557225889
73	NC_022739	TG	3	6	61537	61542	0 %	50 %	50 %	0 %	557225893
74	NC_022739	TC	3	6	61698	61703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022739	AT	3	6	62433	62438	50 %	50 %	0 %	0 %	557225894
76	NC_022739	TA	3	6	63045	63050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022739	AG	3	6	63541	63546	50 %	0 %	50 %	0 %	557225895
78	NC_022739	GA	3	6	63763	63768	50 %	0 %	50 %	0 %	557225895
79	NC_022739	TG	3	6	63935	63940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022739	TC	3	6	64439	64444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022739	GA	3	6	64825	64830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022739	TC	3	6	65422	65427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022739	GC	3	6	66962	66967	0 %	0 %	50 %	50 %	557225897
84	NC_022739	CT	3	6	67013	67018	0 %	50 %	0 %	50 %	557225897
85	NC_022739	TC	3	6	68192	68197	0 %	50 %	0 %	50 %	557225898
86	NC_022739	TG	3	6	68270	68275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022739	GC	3	6	68289	68294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022739	GA	3	6	68337	68342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022739	GA	3	6	72867	72872	50 %	0 %	50 %	0 %	557225905
90	NC_022739	GT	3	6	73362	73367	0 %	50 %	50 %	0 %	557225905
91	NC_022739	TC	3	6	73383	73388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022739	TG	5	10	73545	73554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022739	AC	3	6	73565	73570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022739	TG	3	6	74512	74517	0 %	50 %	50 %	0 %	557225906
95	NC_022739	AG	3	6	76127	76132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022739	AT	3	6	77150	77155	50 %	50 %	0 %	0 %	557225909
97	NC_022739	GT	3	6	78427	78432	0 %	50 %	50 %	0 %	557225911
98	NC_022739	GC	3	6	78868	78873	0 %	0 %	50 %	50 %	557225912
99	NC_022739	GT	3	6	79076	79081	0 %	50 %	50 %	0 %	557225912
100	NC_022739	TC	4	8	79516	79523	0 %	50 %	0 %	50 %	557225913
101	NC_022739	AC	3	6	81571	81576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022739	CA	3	6	81728	81733	50 %	0 %	0 %	50 %	557225916
103	NC_022739	GC	3	6	81895	81900	0 %	0 %	50 %	50 %	557225917
104	NC_022739	CA	3	6	82709	82714	50 %	0 %	0 %	50 %	557225918
105	NC_022739	GT	3	6	82732	82737	0 %	50 %	50 %	0 %	557225918
106	NC_022739	GC	3	6	83300	83305	0 %	0 %	50 %	50 %	557225918
107	NC_022739	GC	3	6	83409	83414	0 %	0 %	50 %	50 %	557225918
108	NC_022739	CG	3	6	83849	83854	0 %	0 %	50 %	50 %	557225918
109	NC_022739	GC	3	6	85200	85205	0 %	0 %	50 %	50 %	557225918
110	NC_022739	CT	3	6	87358	87363	0 %	50 %	0 %	50 %	557225922
111	NC_022739	CG	3	6	89393	89398	0 %	0 %	50 %	50 %	557225923
112	NC_022739	CG	3	6	89602	89607	0 %	0 %	50 %	50 %	557225923
113	NC_022739	CG	4	8	90090	90097	0 %	0 %	50 %	50 %	557225924
114	NC_022739	GC	3	6	90333	90338	0 %	0 %	50 %	50 %	557225924
115	NC_022739	CG	3	6	90534	90539	0 %	0 %	50 %	50 %	557225924
116	NC_022739	GC	3	6	91644	91649	0 %	0 %	50 %	50 %	557225925
117	NC_022739	CG	3	6	91760	91765	0 %	0 %	50 %	50 %	557225925
118	NC_022739	GC	3	6	91983	91988	0 %	0 %	50 %	50 %	557225925
119	NC_022739	AC	3	6	92333	92338	50 %	0 %	0 %	50 %	557225926
120	NC_022739	CG	5	10	92566	92575	0 %	0 %	50 %	50 %	557225926
121	NC_022739	GC	3	6	92992	92997	0 %	0 %	50 %	50 %	557225927
122	NC_022739	GT	3	6	93673	93678	0 %	50 %	50 %	0 %	557225929
123	NC_022739	GC	3	6	94062	94067	0 %	0 %	50 %	50 %	557225929
124	NC_022739	CA	3	6	94697	94702	50 %	0 %	0 %	50 %	557225929
125	NC_022739	GC	3	6	94963	94968	0 %	0 %	50 %	50 %	557225929
126	NC_022739	CG	3	6	95423	95428	0 %	0 %	50 %	50 %	557225931
127	NC_022739	GC	3	6	95939	95944	0 %	0 %	50 %	50 %	557225932
128	NC_022739	GC	3	6	96350	96355	0 %	0 %	50 %	50 %	557225933
129	NC_022739	GC	3	6	96950	96955	0 %	0 %	50 %	50 %	557225934
130	NC_022739	CT	3	6	97972	97977	0 %	50 %	0 %	50 %	557225935
131	NC_022739	GC	3	6	98521	98526	0 %	0 %	50 %	50 %	557225935
132	NC_022739	GC	3	6	98694	98699	0 %	0 %	50 %	50 %	557225935
133	NC_022739	GC	3	6	99965	99970	0 %	0 %	50 %	50 %	557225935
134	NC_022739	TG	3	6	100477	100482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022739	GC	3	6	101417	101422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022739	TC	3	6	101572	101577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022739	TC	4	8	102180	102187	0 %	50 %	0 %	50 %	557225936
138	NC_022739	GA	3	6	102254	102259	50 %	0 %	50 %	0 %	557225936
139	NC_022739	TC	3	6	102455	102460	0 %	50 %	0 %	50 %	557225936
140	NC_022739	AT	3	6	102655	102660	50 %	50 %	0 %	0 %	557225936
141	NC_022739	CT	3	6	103244	103249	0 %	50 %	0 %	50 %	557225937
142	NC_022739	AG	3	6	103374	103379	50 %	0 %	50 %	0 %	557225937
143	NC_022739	AG	3	6	103524	103529	50 %	0 %	50 %	0 %	557225937
144	NC_022739	CG	3	6	104458	104463	0 %	0 %	50 %	50 %	557225938
145	NC_022739	CT	3	6	105739	105744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022739	CG	3	6	105758	105763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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429	NC_022739	TC	3	6	318802	318807	0 %	50 %	0 %	50 %	557226200
430	NC_022739	CA	3	6	319696	319701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.