MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI6

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022044	GCCCT	2	10	524	533	0 %	20 %	20 %	60 %	530320753
2	NC_022044	ACCGC	2	10	1142	1151	20 %	0 %	20 %	60 %	530320753
3	NC_022044	GCCCT	2	10	1196	1205	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_022044	GCGGG	2	10	2063	2072	0 %	0 %	80 %	20 %	530320754
5	NC_022044	TCGAC	2	10	2682	2691	20 %	20 %	20 %	40 %	530320754
6	NC_022044	GCCGC	2	10	3990	3999	0 %	0 %	40 %	60 %	530320755
7	NC_022044	CGGGG	2	10	4006	4015	0 %	0 %	80 %	20 %	530320755
8	NC_022044	TGCGG	2	10	4944	4953	0 %	20 %	60 %	20 %	530320756
9	NC_022044	CATGA	2	10	5429	5438	40 %	20 %	20 %	20 %	530320757
10	NC_022044	GACCG	2	10	6338	6347	20 %	0 %	40 %	40 %	530320759
11	NC_022044	AGGGC	2	10	6661	6670	20 %	0 %	60 %	20 %	530320759
12	NC_022044	CTGGG	2	10	6736	6745	0 %	20 %	60 %	20 %	530320759
13	NC_022044	AGCCG	2	10	7110	7119	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022044	CCGGT	2	10	8231	8240	0 %	20 %	40 %	40 %	530320761
15	NC_022044	TCGGC	2	10	8894	8903	0 %	20 %	40 %	40 %	530320762
16	NC_022044	AGCCG	2	10	9272	9281	20 %	0 %	40 %	40 %	530320762
17	NC_022044	GATCG	2	10	12219	12228	20 %	20 %	40 %	20 %	530320765
18	NC_022044	CGGCC	2	10	13487	13496	0 %	0 %	40 %	60 %	530320767
19	NC_022044	CGCGC	2	10	14147	14156	0 %	0 %	40 %	60 %	530320767
20	NC_022044	GGGAG	2	10	14806	14815	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022044	TCAGA	2	10	14837	14846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022044	TCAGA	2	10	14853	14862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022044	GCAGT	2	10	15942	15951	20 %	20 %	40 %	20 %	530320768
24	NC_022044	CGGCG	2	10	15975	15984	0 %	0 %	60 %	40 %	530320768
25	NC_022044	CCAAT	2	10	16255	16264	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022044	CCGTG	2	10	16823	16832	0 %	20 %	40 %	40 %	530320769
27	NC_022044	ACCGG	2	10	17237	17246	20 %	0 %	40 %	40 %	530320770
28	NC_022044	TCGGT	2	10	17567	17576	0 %	40 %	40 %	20 %	530320770
29	NC_022044	ACATG	2	10	19025	19034	40 %	20 %	20 %	20 %	530320771
30	NC_022044	CGTGC	2	10	20591	20600	0 %	20 %	40 %	40 %	530320773
31	NC_022044	GCCGC	3	15	23037	23051	0 %	0 %	40 %	60 %	530320773
32	NC_022044	GGGGC	2	10	23647	23656	0 %	0 %	80 %	20 %	530320774
33	NC_022044	GGCGA	2	10	23761	23770	20 %	0 %	60 %	20 %	530320774
34	NC_022044	GCGCG	2	10	24264	24273	0 %	0 %	60 %	40 %	530320775
35	NC_022044	GCGCG	2	10	25459	25468	0 %	0 %	60 %	40 %	530320776
36	NC_022044	CGCGC	3	15	26615	26629	0 %	0 %	40 %	60 %	530320777
37	NC_022044	GCTTT	2	10	27989	27998	0 %	60 %	20 %	20 %	530320779
38	NC_022044	CCGGA	2	10	29851	29860	20 %	0 %	40 %	40 %	530320780
39	NC_022044	GCCGG	2	10	33005	33014	0 %	0 %	60 %	40 %	530320782
40	NC_022044	GCAAG	2	10	34437	34446	40 %	0 %	40 %	20 %	530320782
41	NC_022044	CAGCT	2	10	36385	36394	20 %	20 %	20 %	40 %	530320783
42	NC_022044	CATCA	2	10	36729	36738	40 %	20 %	0 %	40 %	530320783
43	NC_022044	GGCGC	2	10	37563	37572	0 %	0 %	60 %	40 %	530320785
44	NC_022044	GGGCA	2	10	37829	37838	20 %	0 %	60 %	20 %	530320785
45	NC_022044	GCCGG	2	10	38318	38327	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_022044	GGCGC	2	10	39717	39726	0 %	0 %	60 %	40 %	530320787
47	NC_022044	ATGGG	2	10	39871	39880	20 %	20 %	60 %	0 %	530320787
48	NC_022044	ATCGG	2	10	41058	41067	20 %	20 %	40 %	20 %	530320789
49	NC_022044	GGCCG	2	10	41524	41533	0 %	0 %	60 %	40 %	530320789
50	NC_022044	GCGCG	2	10	41566	41575	0 %	0 %	60 %	40 %	530320789
51	NC_022044	GCGCC	2	10	42640	42649	0 %	0 %	40 %	60 %	530320790
52	NC_022044	GCGTG	2	10	42803	42812	0 %	20 %	60 %	20 %	530320790
53	NC_022044	GCGCC	2	10	44120	44129	0 %	0 %	40 %	60 %	530320791
54	NC_022044	GCGAT	2	10	45283	45292	20 %	20 %	40 %	20 %	530320792
55	NC_022044	GCCGG	2	10	45509	45518	0 %	0 %	60 %	40 %	530320792
56	NC_022044	GATCT	2	10	46406	46415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022044	GCCGG	2	10	46801	46810	0 %	0 %	60 %	40 %	530320793
58	NC_022044	GGACG	2	10	46842	46851	20 %	0 %	60 %	20 %	530320793
59	NC_022044	GCGCC	2	10	47043	47052	0 %	0 %	40 %	60 %	530320793
60	NC_022044	CCGAT	2	10	47054	47063	20 %	20 %	20 %	40 %	530320793
61	NC_022044	TCGTC	2	10	53854	53863	0 %	40 %	20 %	40 %	530320795
62	NC_022044	ATGCG	2	10	54898	54907	20 %	20 %	40 %	20 %	530320796
63	NC_022044	CAAGC	2	10	55844	55853	40 %	0 %	20 %	40 %	530320796
64	NC_022044	GCGAT	2	10	56842	56851	20 %	20 %	40 %	20 %	530320796
65	NC_022044	TCGGC	2	10	60981	60990	0 %	20 %	40 %	40 %	530320800
66	NC_022044	CGCGC	2	10	61380	61389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_022044	GCAGG	2	10	62106	62115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022044	GCAAC	2	10	66119	66128	40 %	0 %	20 %	40 %	530320805
69	NC_022044	GCGCC	2	10	69322	69331	0 %	0 %	40 %	60 %	530320807
70	NC_022044	CGCGC	2	10	70737	70746	0 %	0 %	40 %	60 %	530320809
71	NC_022044	TCGCC	2	10	71914	71923	0 %	20 %	20 %	60 %	530320809
72	NC_022044	GGCGC	2	10	73498	73507	0 %	0 %	60 %	40 %	530320811
73	NC_022044	GCCGG	2	10	74750	74759	0 %	0 %	60 %	40 %	530320813
74	NC_022044	GCGCG	2	10	77625	77634	0 %	0 %	60 %	40 %	530320817
75	NC_022044	GCCTC	2	10	78152	78161	0 %	20 %	20 %	60 %	530320818
76	NC_022044	CGATC	2	10	78189	78198	20 %	20 %	20 %	40 %	530320818
77	NC_022044	CGGCG	2	10	80234	80243	0 %	0 %	60 %	40 %	530320819
78	NC_022044	CGGCG	2	10	80495	80504	0 %	0 %	60 %	40 %	530320819
79	NC_022044	GCGCG	2	10	80930	80939	0 %	0 %	60 %	40 %	530320820
80	NC_022044	GGTCG	2	10	81421	81430	0 %	20 %	60 %	20 %	530320821
81	NC_022044	TGACG	2	10	83967	83976	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022044	GCAGC	2	10	85742	85751	20 %	0 %	40 %	40 %	530320823
83	NC_022044	CCGGC	2	10	85841	85850	0 %	0 %	40 %	60 %	530320823
84	NC_022044	GAAAG	2	10	85901	85910	60 %	0 %	40 %	0 %	530320823
85	NC_022044	ATCGG	2	10	87087	87096	20 %	20 %	40 %	20 %	530320825
86	NC_022044	CGCGC	2	10	87333	87342	0 %	0 %	40 %	60 %	530320825
87	NC_022044	CGAGC	2	10	88677	88686	20 %	0 %	40 %	40 %	530320826
88	NC_022044	GGGCG	2	10	88900	88909	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_022044	ATCGC	2	10	90198	90207	20 %	20 %	20 %	40 %	530320827
90	NC_022044	CCAGA	2	10	90554	90563	40 %	0 %	20 %	40 %	530320827
91	NC_022044	TAAAT	2	10	90885	90894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022044	GCCAG	2	10	92514	92523	20 %	0 %	40 %	40 %	530320828
93	NC_022044	CGGCG	2	10	92934	92943	0 %	0 %	60 %	40 %	530320829
94	NC_022044	CGGAC	2	10	98085	98094	20 %	0 %	40 %	40 %	530320834
95	NC_022044	CGGCG	2	10	98332	98341	0 %	0 %	60 %	40 %	530320834
96	NC_022044	GGAAT	2	10	98994	99003	40 %	20 %	40 %	0 %	530320834
97	NC_022044	ATCGC	2	10	99922	99931	20 %	20 %	20 %	40 %	530320835
98	NC_022044	GCGAC	2	10	100315	100324	20 %	0 %	40 %	40 %	530320835
99	NC_022044	CCGGC	2	10	104547	104556	0 %	0 %	40 %	60 %	530320839
100	NC_022044	GCACC	2	10	104675	104684	20 %	0 %	20 %	60 %	530320839
101	NC_022044	GCATG	2	10	106162	106171	20 %	20 %	40 %	20 %	530320841
102	NC_022044	CGCGC	2	10	106559	106568	0 %	0 %	40 %	60 %	530320841
103	NC_022044	TCCTT	2	10	109725	109734	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_022044	CGGGC	2	10	112141	112150	0 %	0 %	60 %	40 %	530320848
105	NC_022044	AGCCC	2	10	112426	112435	20 %	0 %	20 %	60 %	530320849
106	NC_022044	CTGAC	2	10	114120	114129	20 %	20 %	20 %	40 %	530320849
107	NC_022044	GCGGT	2	10	114225	114234	0 %	20 %	60 %	20 %	530320849
108	NC_022044	GACCA	2	10	115196	115205	40 %	0 %	20 %	40 %	530320849
109	NC_022044	GCCAT	2	10	115418	115427	20 %	20 %	20 %	40 %	530320850
110	NC_022044	AGACC	2	10	115898	115907	40 %	0 %	20 %	40 %	530320851
111	NC_022044	CGGCG	2	10	117442	117451	0 %	0 %	60 %	40 %	530320852
112	NC_022044	CATTG	2	10	118436	118445	20 %	40 %	20 %	20 %	530320853
113	NC_022044	TTGGC	2	10	123063	123072	0 %	40 %	40 %	20 %	530320855
114	NC_022044	GATGA	2	10	123350	123359	40 %	20 %	40 %	0 %	530320856
115	NC_022044	GCATC	2	10	123457	123466	20 %	20 %	20 %	40 %	530320856
116	NC_022044	CATTC	2	10	124046	124055	20 %	40 %	0 %	40 %	530320857
117	NC_022044	GGTCA	2	10	125127	125136	20 %	20 %	40 %	20 %	530320857
118	NC_022044	CGAAC	2	10	125220	125229	40 %	0 %	20 %	40 %	530320857
119	NC_022044	CGGGG	2	10	125330	125339	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022044	CCGAG	2	10	126860	126869	20 %	0 %	40 %	40 %	530320859
121	NC_022044	GCCCG	2	10	127152	127161	0 %	0 %	40 %	60 %	530320859
122	NC_022044	CGCGC	2	10	133098	133107	0 %	0 %	40 %	60 %	530320868
123	NC_022044	CGGAT	2	10	134497	134506	20 %	20 %	40 %	20 %	530320870
124	NC_022044	GCGGG	2	10	137426	137435	0 %	0 %	80 %	20 %	530320872
125	NC_022044	GCTCG	2	10	137683	137692	0 %	20 %	40 %	40 %	530320872
126	NC_022044	ATCAG	2	10	138516	138525	40 %	20 %	20 %	20 %	530320872
127	NC_022044	ATCCG	2	10	139989	139998	20 %	20 %	20 %	40 %	530320873
128	NC_022044	GCCGT	2	10	141324	141333	0 %	20 %	40 %	40 %	530320874
129	NC_022044	GCCGC	2	10	143492	143501	0 %	0 %	40 %	60 %	530320877
130	NC_022044	ATGCC	2	10	143551	143560	20 %	20 %	20 %	40 %	530320877
131	NC_022044	GCGCG	2	10	144892	144901	0 %	0 %	60 %	40 %	530320879
132	NC_022044	GGCGC	2	10	145558	145567	0 %	0 %	60 %	40 %	530320879
133	NC_022044	GGTCG	2	10	145892	145901	0 %	20 %	60 %	20 %	530320879
134	NC_022044	GCGAC	2	10	148435	148444	20 %	0 %	40 %	40 %	530320882
135	NC_022044	GCAGG	2	10	149192	149201	20 %	0 %	60 %	20 %	530320882
136	NC_022044	ACGCC	2	10	150039	150048	20 %	0 %	20 %	60 %	530320883
137	NC_022044	CAGAT	2	10	150113	150122	40 %	20 %	20 %	20 %	530320884
138	NC_022044	GCGCC	2	10	150975	150984	0 %	0 %	40 %	60 %	530320884
139	NC_022044	GTGCT	2	10	153036	153045	0 %	40 %	40 %	20 %	530320886
140	NC_022044	GGCGC	2	10	153122	153131	0 %	0 %	60 %	40 %	530320886
141	NC_022044	GCCGC	2	10	153641	153650	0 %	0 %	40 %	60 %	530320886
142	NC_022044	TCGCG	2	10	155936	155945	0 %	20 %	40 %	40 %	530320889
143	NC_022044	CCGCC	2	10	156320	156329	0 %	0 %	20 %	80 %	530320889
144	NC_022044	CGAGC	2	10	156335	156344	20 %	0 %	40 %	40 %	530320889
145	NC_022044	CGAGC	2	10	157016	157025	20 %	0 %	40 %	40 %	530320889
146	NC_022044	GCGCG	2	10	157592	157601	0 %	0 %	60 %	40 %	530320890
147	NC_022044	CCGCG	2	10	158654	158663	0 %	0 %	40 %	60 %	530320891
148	NC_022044	GCGCC	2	10	158794	158803	0 %	0 %	40 %	60 %	530320891
149	NC_022044	GCCGC	2	10	159109	159118	0 %	0 %	40 %	60 %	530320891
150	NC_022044	GCCAG	2	10	160928	160937	20 %	0 %	40 %	40 %	530320893
151	NC_022044	AGCCA	2	10	161465	161474	40 %	0 %	20 %	40 %	530320893
152	NC_022044	ACCGG	2	10	161563	161572	20 %	0 %	40 %	40 %	530320893
153	NC_022044	CGGCG	2	10	162746	162755	0 %	0 %	60 %	40 %	530320894
154	NC_022044	GCGCG	2	10	163294	163303	0 %	0 %	60 %	40 %	530320894
155	NC_022044	TGGTC	2	10	163318	163327	0 %	40 %	40 %	20 %	530320894
156	NC_022044	GCGCG	2	10	163798	163807	0 %	0 %	60 %	40 %	530320894
157	NC_022044	CCGCC	2	10	166982	166991	0 %	0 %	20 %	80 %	530320895
158	NC_022044	CGAGG	2	10	170718	170727	20 %	0 %	60 %	20 %	530320897
159	NC_022044	TGCCC	2	10	171851	171860	0 %	20 %	20 %	60 %	530320897
160	NC_022044	TGTCC	2	10	172874	172883	0 %	40 %	20 %	40 %	530320897
161	NC_022044	TCGGC	2	10	174867	174876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_022044	GCCCC	2	10	175700	175709	0 %	0 %	20 %	80 %	530320898
163	NC_022044	CGCCC	2	10	175731	175740	0 %	0 %	20 %	80 %	530320898
164	NC_022044	TCGCC	2	10	176225	176234	0 %	20 %	20 %	60 %	530320898
165	NC_022044	AGCGC	2	10	176477	176486	20 %	0 %	40 %	40 %	530320898
166	NC_022044	ACCGG	2	10	178330	178339	20 %	0 %	40 %	40 %	530320899
167	NC_022044	CCCTC	2	10	179099	179108	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
168	NC_022044	CCGGC	2	10	179877	179886	0 %	0 %	40 %	60 %	530320902
169	NC_022044	CCCGC	3	15	181251	181265	0 %	0 %	20 %	80 %	530320905
170	NC_022044	TGCCC	2	10	181693	181702	0 %	20 %	20 %	60 %	530320905
171	NC_022044	GCGCG	2	10	181929	181938	0 %	0 %	60 %	40 %	530320905
172	NC_022044	ATCGC	2	10	183669	183678	20 %	20 %	20 %	40 %	530320906
173	NC_022044	GCCGC	2	10	184056	184065	0 %	0 %	40 %	60 %	530320906
174	NC_022044	TGCGC	2	10	186769	186778	0 %	20 %	40 %	40 %	530320908
175	NC_022044	ATCGC	2	10	189059	189068	20 %	20 %	20 %	40 %	530320910
176	NC_022044	CATGG	2	10	189804	189813	20 %	20 %	40 %	20 %	530320911
177	NC_022044	GCCGC	2	10	192267	192276	0 %	0 %	40 %	60 %	530320913
178	NC_022044	GCTGC	2	10	192376	192385	0 %	20 %	40 %	40 %	530320913
179	NC_022044	AGGCG	2	10	193378	193387	20 %	0 %	60 %	20 %	530320914
180	NC_022044	GGCGG	2	10	193412	193421	0 %	0 %	80 %	20 %	530320914
181	NC_022044	GGCCG	2	10	193921	193930	0 %	0 %	60 %	40 %	530320914
182	NC_022044	CCCGT	2	10	195459	195468	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
183	NC_022044	TTTCA	2	10	195525	195534	20 %	60 %	0 %	20 %	530320917
184	NC_022044	GCCGG	2	10	195683	195692	0 %	0 %	60 %	40 %	530320917
185	NC_022044	GCGCC	2	10	196190	196199	0 %	0 %	40 %	60 %	530320917
186	NC_022044	GGTCA	2	10	196329	196338	20 %	20 %	40 %	20 %	530320917
187	NC_022044	GGCGA	2	10	197951	197960	20 %	0 %	60 %	20 %	530320918
188	NC_022044	CGAAC	2	10	200632	200641	40 %	0 %	20 %	40 %	530320919
189	NC_022044	GGCCA	2	10	202304	202313	20 %	0 %	40 %	40 %	530320920
190	NC_022044	GGCGA	2	10	202764	202773	20 %	0 %	60 %	20 %	530320920
191	NC_022044	TCGGC	2	10	206328	206337	0 %	20 %	40 %	40 %	530320923
192	NC_022044	CGCGT	2	10	206400	206409	0 %	20 %	40 %	40 %	530320923

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.