MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Pseudomonas resinovorans NBRC 106553 plasmid pCAR1.3 DNA

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021506	CA	3	6	782	787	50 %	0 %	0 %	50 %	512689976
2	NC_021506	GC	3	6	815	820	0 %	0 %	50 %	50 %	512689976
3	NC_021506	GC	3	6	2089	2094	0 %	0 %	50 %	50 %	512689978
4	NC_021506	GC	4	8	3009	3016	0 %	0 %	50 %	50 %	512689978
5	NC_021506	CG	3	6	3106	3111	0 %	0 %	50 %	50 %	512689978
6	NC_021506	GC	3	6	3443	3448	0 %	0 %	50 %	50 %	512689979
7	NC_021506	GC	3	6	3573	3578	0 %	0 %	50 %	50 %	512689979
8	NC_021506	CG	3	6	5230	5235	0 %	0 %	50 %	50 %	512689980
9	NC_021506	GC	3	6	7032	7037	0 %	0 %	50 %	50 %	512689982
10	NC_021506	GC	3	6	7270	7275	0 %	0 %	50 %	50 %	512689982
11	NC_021506	AT	3	6	7385	7390	50 %	50 %	0 %	0 %	512689982
12	NC_021506	GC	3	6	7865	7870	0 %	0 %	50 %	50 %	512689983
13	NC_021506	GC	3	6	8027	8032	0 %	0 %	50 %	50 %	512689983
14	NC_021506	AG	3	6	8874	8879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021506	AG	3	6	9044	9049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021506	GC	3	6	10052	10057	0 %	0 %	50 %	50 %	512689984
17	NC_021506	TG	3	6	10420	10425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021506	TG	3	6	10443	10448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021506	GC	3	6	10700	10705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021506	CG	3	6	11035	11040	0 %	0 %	50 %	50 %	512689985
21	NC_021506	GC	3	6	11152	11157	0 %	0 %	50 %	50 %	512689985
22	NC_021506	GC	3	6	11512	11517	0 %	0 %	50 %	50 %	512689985
23	NC_021506	GC	3	6	11784	11789	0 %	0 %	50 %	50 %	512689986
24	NC_021506	CG	3	6	11815	11820	0 %	0 %	50 %	50 %	512689986
25	NC_021506	GC	3	6	11925	11930	0 %	0 %	50 %	50 %	512689986
26	NC_021506	CG	4	8	12053	12060	0 %	0 %	50 %	50 %	512689986
27	NC_021506	CG	3	6	13787	13792	0 %	0 %	50 %	50 %	512689987
28	NC_021506	GC	3	6	15525	15530	0 %	0 %	50 %	50 %	512689989
29	NC_021506	GC	3	6	15569	15574	0 %	0 %	50 %	50 %	512689989
30	NC_021506	GC	3	6	16224	16229	0 %	0 %	50 %	50 %	512689990
31	NC_021506	GC	3	6	16611	16616	0 %	0 %	50 %	50 %	512689991
32	NC_021506	GC	3	6	16877	16882	0 %	0 %	50 %	50 %	512689991
33	NC_021506	GC	3	6	17734	17739	0 %	0 %	50 %	50 %	512689992
34	NC_021506	CG	3	6	17774	17779	0 %	0 %	50 %	50 %	512689992
35	NC_021506	CA	3	6	18079	18084	50 %	0 %	0 %	50 %	512689992
36	NC_021506	GC	3	6	18490	18495	0 %	0 %	50 %	50 %	512689992
37	NC_021506	GC	3	6	18710	18715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021506	GC	3	6	18766	18771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021506	GC	3	6	18988	18993	0 %	0 %	50 %	50 %	512689993
40	NC_021506	GC	3	6	19076	19081	0 %	0 %	50 %	50 %	512689993
41	NC_021506	CG	3	6	19353	19358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021506	GC	3	6	19599	19604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021506	GC	3	6	20341	20346	0 %	0 %	50 %	50 %	512689994
44	NC_021506	GC	3	6	21111	21116	0 %	0 %	50 %	50 %	512689995
45	NC_021506	GC	3	6	21595	21600	0 %	0 %	50 %	50 %	512689995
46	NC_021506	GC	3	6	21783	21788	0 %	0 %	50 %	50 %	512689995
47	NC_021506	GC	3	6	22089	22094	0 %	0 %	50 %	50 %	512689995
48	NC_021506	GT	4	8	22397	22404	0 %	50 %	50 %	0 %	512689995
49	NC_021506	CA	3	6	23832	23837	50 %	0 %	0 %	50 %	512689997
50	NC_021506	TA	3	6	24100	24105	50 %	50 %	0 %	0 %	512689998
51	NC_021506	CG	3	6	26126	26131	0 %	0 %	50 %	50 %	512690001
52	NC_021506	GC	3	6	26289	26294	0 %	0 %	50 %	50 %	512690001
53	NC_021506	GC	3	6	26721	26726	0 %	0 %	50 %	50 %	512690002
54	NC_021506	GC	3	6	26959	26964	0 %	0 %	50 %	50 %	512690002
55	NC_021506	CG	3	6	27394	27399	0 %	0 %	50 %	50 %	512690002
56	NC_021506	TG	3	6	28014	28019	0 %	50 %	50 %	0 %	512690002
57	NC_021506	AC	4	8	29361	29368	50 %	0 %	0 %	50 %	512690003
58	NC_021506	AC	3	6	29772	29777	50 %	0 %	0 %	50 %	512690004
59	NC_021506	GC	3	6	30249	30254	0 %	0 %	50 %	50 %	512690005
60	NC_021506	GT	3	6	31134	31139	0 %	50 %	50 %	0 %	512690006
61	NC_021506	GA	3	6	32066	32071	50 %	0 %	50 %	0 %	512690008
62	NC_021506	CG	3	6	33094	33099	0 %	0 %	50 %	50 %	512690009
63	NC_021506	TC	3	6	34063	34068	0 %	50 %	0 %	50 %	512690010
64	NC_021506	CG	3	6	35354	35359	0 %	0 %	50 %	50 %	512690012
65	NC_021506	GC	3	6	35940	35945	0 %	0 %	50 %	50 %	512690013
66	NC_021506	GC	3	6	36047	36052	0 %	0 %	50 %	50 %	512690013
67	NC_021506	CG	3	6	36299	36304	0 %	0 %	50 %	50 %	512690013
68	NC_021506	GC	3	6	37062	37067	0 %	0 %	50 %	50 %	512690014
69	NC_021506	GT	3	6	39162	39167	0 %	50 %	50 %	0 %	512690017
70	NC_021506	AG	3	6	39512	39517	50 %	0 %	50 %	0 %	512690018
71	NC_021506	GC	3	6	39578	39583	0 %	0 %	50 %	50 %	512690018
72	NC_021506	GA	3	6	39598	39603	50 %	0 %	50 %	0 %	512690018
73	NC_021506	CG	3	6	41039	41044	0 %	0 %	50 %	50 %	512690020
74	NC_021506	GC	3	6	41202	41207	0 %	0 %	50 %	50 %	512690020
75	NC_021506	AT	3	6	42542	42547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021506	AT	3	6	42641	42646	50 %	50 %	0 %	0 %	512690022
77	NC_021506	GA	3	6	42884	42889	50 %	0 %	50 %	0 %	512690022
78	NC_021506	GC	3	6	43840	43845	0 %	0 %	50 %	50 %	512690025
79	NC_021506	GC	3	6	47289	47294	0 %	0 %	50 %	50 %	512690029
80	NC_021506	GT	3	6	47666	47671	0 %	50 %	50 %	0 %	512690029
81	NC_021506	GC	3	6	47864	47869	0 %	0 %	50 %	50 %	512690030
82	NC_021506	GC	3	6	47882	47887	0 %	0 %	50 %	50 %	512690030
83	NC_021506	GC	3	6	48139	48144	0 %	0 %	50 %	50 %	512690030
84	NC_021506	GC	3	6	48591	48596	0 %	0 %	50 %	50 %	512690030
85	NC_021506	GA	3	6	49177	49182	50 %	0 %	50 %	0 %	512690030
86	NC_021506	AG	3	6	50993	50998	50 %	0 %	50 %	0 %	512690032
87	NC_021506	GC	3	6	51132	51137	0 %	0 %	50 %	50 %	512690032
88	NC_021506	TG	3	6	51155	51160	0 %	50 %	50 %	0 %	512690032
89	NC_021506	GC	3	6	53344	53349	0 %	0 %	50 %	50 %	512690034
90	NC_021506	CG	3	6	53461	53466	0 %	0 %	50 %	50 %	512690034
91	NC_021506	GC	3	6	53733	53738	0 %	0 %	50 %	50 %	512690035
92	NC_021506	GC	3	6	55496	55501	0 %	0 %	50 %	50 %	512690038
93	NC_021506	GA	3	6	58241	58246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021506	CG	3	6	58321	58326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021506	GA	3	6	59603	59608	50 %	0 %	50 %	0 %	512690042
96	NC_021506	AC	3	6	59640	59645	50 %	0 %	0 %	50 %	512690042
97	NC_021506	AC	3	6	59947	59952	50 %	0 %	0 %	50 %	512690043
98	NC_021506	GC	3	6	60060	60065	0 %	0 %	50 %	50 %	512690043
99	NC_021506	AG	3	6	61897	61902	50 %	0 %	50 %	0 %	512690044
100	NC_021506	CG	3	6	62607	62612	0 %	0 %	50 %	50 %	512690045
101	NC_021506	GC	3	6	64042	64047	0 %	0 %	50 %	50 %	512690047
102	NC_021506	GC	3	6	64521	64526	0 %	0 %	50 %	50 %	512690047
103	NC_021506	CG	3	6	65516	65521	0 %	0 %	50 %	50 %	512690049
104	NC_021506	GC	3	6	67811	67816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021506	CT	3	6	68265	68270	0 %	50 %	0 %	50 %	512690051
106	NC_021506	AG	3	6	68874	68879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021506	CT	3	6	69642	69647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021506	TC	3	6	70017	70022	0 %	50 %	0 %	50 %	512690052
109	NC_021506	GA	3	6	71207	71212	50 %	0 %	50 %	0 %	512690053
110	NC_021506	AG	3	6	73682	73687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021506	GT	3	6	73822	73827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021506	GA	3	6	75285	75290	50 %	0 %	50 %	0 %	512690058
113	NC_021506	GC	3	6	76324	76329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021506	GT	3	6	77090	77095	0 %	50 %	50 %	0 %	512690061
115	NC_021506	CT	3	6	78291	78296	0 %	50 %	0 %	50 %	512690062
116	NC_021506	CG	3	6	79900	79905	0 %	0 %	50 %	50 %	512690063
117	NC_021506	AC	3	6	80003	80008	50 %	0 %	0 %	50 %	512690063
118	NC_021506	GA	3	6	80147	80152	50 %	0 %	50 %	0 %	512690064
119	NC_021506	AT	3	6	80891	80896	50 %	50 %	0 %	0 %	512690065
120	NC_021506	AC	3	6	81269	81274	50 %	0 %	0 %	50 %	512690065
121	NC_021506	GT	3	6	82835	82840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021506	GC	3	6	83007	83012	0 %	0 %	50 %	50 %	512690068
123	NC_021506	GC	3	6	83563	83568	0 %	0 %	50 %	50 %	512690068
124	NC_021506	TC	3	6	83789	83794	0 %	50 %	0 %	50 %	512690069
125	NC_021506	GA	3	6	84617	84622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021506	GC	3	6	85063	85068	0 %	0 %	50 %	50 %	512690071
127	NC_021506	AC	3	6	87592	87597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021506	CT	3	6	89621	89626	0 %	50 %	0 %	50 %	512690081
129	NC_021506	TC	3	6	90160	90165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021506	GC	3	6	90560	90565	0 %	0 %	50 %	50 %	512690082
131	NC_021506	GC	3	6	91019	91024	0 %	0 %	50 %	50 %	512690082
132	NC_021506	AC	3	6	91443	91448	50 %	0 %	0 %	50 %	512690083
133	NC_021506	TC	3	6	92021	92026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021506	CA	3	6	96241	96246	50 %	0 %	0 %	50 %	512690088
135	NC_021506	GC	3	6	97168	97173	0 %	0 %	50 %	50 %	512690090
136	NC_021506	GC	3	6	98845	98850	0 %	0 %	50 %	50 %	512690091
137	NC_021506	TC	3	6	99177	99182	0 %	50 %	0 %	50 %	512690092
138	NC_021506	TG	3	6	100348	100353	0 %	50 %	50 %	0 %	512690095
139	NC_021506	GC	3	6	101253	101258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021506	TG	3	6	101738	101743	0 %	50 %	50 %	0 %	512690096
141	NC_021506	CT	3	6	103481	103486	0 %	50 %	0 %	50 %	512690098
142	NC_021506	CA	3	6	103594	103599	50 %	0 %	0 %	50 %	512690098
143	NC_021506	CT	3	6	103772	103777	0 %	50 %	0 %	50 %	512690098
144	NC_021506	CG	3	6	104196	104201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.