MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 97528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021505	GAA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021505	TGC	2	6	112	117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021505	CAG	2	6	168	173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021505	CGA	2	6	248	253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021505	GCA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683058
6	NC_021505	CGA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683058
7	NC_021505	TTA	2	6	610	615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512683058
8	NC_021505	GGC	2	6	678	683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683058
9	NC_021505	AGC	2	6	762	767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683058
10	NC_021505	CGT	2	6	803	808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683058
11	NC_021505	CGC	2	6	845	850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683058
12	NC_021505	AAC	2	6	859	864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683058
13	NC_021505	GGC	2	6	1039	1044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683058
14	NC_021505	CTG	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683058
15	NC_021505	AAG	2	6	1096	1101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683058
16	NC_021505	TCG	2	6	1142	1147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683058
17	NC_021505	CGA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683058
18	NC_021505	CAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683058
19	NC_021505	CCA	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683058
20	NC_021505	TGA	2	6	1442	1447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683058
21	NC_021505	ATG	2	6	1481	1486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683058
22	NC_021505	CTT	2	6	1491	1496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683058
23	NC_021505	TAC	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683058
24	NC_021505	TGT	2	6	1706	1711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683058
25	NC_021505	CGT	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683058
26	NC_021505	GGT	2	6	1813	1818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683058
27	NC_021505	CTG	2	6	1906	1911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683058
28	NC_021505	GAC	2	6	1920	1925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683058
29	NC_021505	ACG	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683059
30	NC_021505	CGA	2	6	2245	2250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683059
31	NC_021505	GAA	2	6	2327	2332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683059
32	NC_021505	CAG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683059
33	NC_021505	CTA	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683059
34	NC_021505	TGC	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683059
35	NC_021505	CTG	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683059
36	NC_021505	CAC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683059
37	NC_021505	GCG	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683059
38	NC_021505	TGG	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683059
39	NC_021505	GCT	2	6	2828	2833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683059
40	NC_021505	CAA	2	6	2854	2859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683059
41	NC_021505	GAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683059
42	NC_021505	GAA	2	6	2879	2884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683059
43	NC_021505	CTG	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683059
44	NC_021505	CAG	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683059
45	NC_021505	GCT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683059
46	NC_021505	TTC	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683059
47	NC_021505	GCA	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683060
48	NC_021505	GCC	2	6	3404	3409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683060
49	NC_021505	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683060
50	NC_021505	CGC	2	6	3485	3490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683060
51	NC_021505	GCC	2	6	3617	3622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683060
52	NC_021505	CTA	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683060
53	NC_021505	AAG	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683060
54	NC_021505	CAG	2	6	3818	3823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683060
55	NC_021505	TGG	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683060
56	NC_021505	TCG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683060
57	NC_021505	GAC	2	6	4019	4024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683060
58	NC_021505	CGC	2	6	4031	4036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683060
59	NC_021505	GAA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683060
60	NC_021505	TCA	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683060
61	NC_021505	CTC	2	6	4220	4225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683061
62	NC_021505	GAT	2	6	4293	4298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683061
63	NC_021505	CAC	2	6	4311	4316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683061
64	NC_021505	GGT	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683061
65	NC_021505	TCA	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683061
66	NC_021505	AGA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683061
67	NC_021505	TCA	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683061
68	NC_021505	CGG	2	6	4502	4507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683061
69	NC_021505	GAT	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683061
70	NC_021505	GGC	2	6	4539	4544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683061
71	NC_021505	TGT	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683061
72	NC_021505	TGT	2	6	4667	4672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683061
73	NC_021505	ACC	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683061
74	NC_021505	CTG	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
75	NC_021505	TTC	2	6	4842	4847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683061
76	NC_021505	GGC	2	6	4857	4862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683061
77	NC_021505	TCG	2	6	4873	4878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
78	NC_021505	CAA	2	6	4892	4897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683061
79	NC_021505	CTG	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
80	NC_021505	CAA	2	6	5012	5017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683061
81	NC_021505	TGG	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683061
82	NC_021505	TTC	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683061
83	NC_021505	GAA	3	9	5111	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683061
84	NC_021505	GAC	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683061
85	NC_021505	ATC	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683061
86	NC_021505	CCG	2	6	5242	5247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683061
87	NC_021505	CTG	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
88	NC_021505	CGT	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
89	NC_021505	GAT	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683061
90	NC_021505	AGC	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683061
91	NC_021505	CGC	2	6	5379	5384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683061
92	NC_021505	TGG	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683061
93	NC_021505	CGT	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
94	NC_021505	GAT	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683061
95	NC_021505	ACA	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683061
96	NC_021505	CAT	4	12	5678	5689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683061
97	NC_021505	CTG	3	9	5727	5735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
98	NC_021505	CTT	3	9	5738	5746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683061
99	NC_021505	GCC	2	6	5795	5800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683061
100	NC_021505	GAC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683061
101	NC_021505	GAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683061
102	NC_021505	CTT	2	6	6242	6247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683061
103	NC_021505	GCA	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683061
104	NC_021505	CGT	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
105	NC_021505	GTG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683061
106	NC_021505	TGA	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683061
107	NC_021505	ACC	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683061
108	NC_021505	ACC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683061
109	NC_021505	GCT	2	6	6516	6521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
110	NC_021505	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683061
111	NC_021505	ATG	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021505	CGG	2	6	6835	6840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021505	AGC	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021505	TGG	2	6	6960	6965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021505	GGT	2	6	7468	7473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683062
116	NC_021505	CGG	2	6	7478	7483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683062
117	NC_021505	CTT	2	6	7571	7576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683062
118	NC_021505	GTG	2	6	7696	7701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683062
119	NC_021505	GGA	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683062
120	NC_021505	GCC	2	6	7930	7935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683062
121	NC_021505	GTG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683062
122	NC_021505	GTC	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683063
123	NC_021505	GCT	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683063
124	NC_021505	GAC	2	6	8361	8366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683063
125	NC_021505	GTA	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683063
126	NC_021505	TAA	2	6	8597	8602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512683063
127	NC_021505	GCA	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683063
128	NC_021505	AAG	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683063
129	NC_021505	GCG	2	6	8814	8819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683063
130	NC_021505	TTG	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683063
131	NC_021505	TGG	2	6	9081	9086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683063
132	NC_021505	TCA	2	6	9148	9153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683063
133	NC_021505	ACC	2	6	9276	9281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683063
134	NC_021505	CAG	2	6	9294	9299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683063
135	NC_021505	GAA	2	6	9320	9325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683063
136	NC_021505	GGT	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683063
137	NC_021505	TCG	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683063
138	NC_021505	ACC	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683063
139	NC_021505	CTC	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683063
140	NC_021505	ACA	2	6	9412	9417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683063
141	NC_021505	TCA	2	6	9460	9465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683063
142	NC_021505	TTC	2	6	9678	9683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683063
143	NC_021505	AGC	2	6	9772	9777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683063
144	NC_021505	CCG	2	6	9836	9841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683063
145	NC_021505	ACG	2	6	9860	9865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683063
146	NC_021505	AGG	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683063
147	NC_021505	CAG	2	6	9979	9984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683063
148	NC_021505	TCG	2	6	10001	10006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683063
149	NC_021505	CTG	2	6	10009	10014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683063
150	NC_021505	GGA	2	6	10246	10251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683064
151	NC_021505	TCG	2	6	10290	10295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683064
152	NC_021505	GCA	2	6	10328	10333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683064
153	NC_021505	AGT	2	6	10405	10410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683064
154	NC_021505	CTG	3	9	10412	10420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683064
155	NC_021505	GCA	2	6	10459	10464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683064
156	NC_021505	TCG	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683064
157	NC_021505	GCA	2	6	10499	10504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683064
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159	NC_021505	TGT	2	6	10674	10679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683064
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162	NC_021505	CGA	2	6	11185	11190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_021505	GAT	2	6	11215	11220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021505	CTG	2	6	11250	11255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_021505	GAC	2	6	11293	11298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021505	TCA	2	6	11299	11304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_021505	ACG	2	6	11375	11380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_021505	GGC	2	6	11596	11601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021505	CGG	2	6	11730	11735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_021505	CTG	2	6	11774	11779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_021505	CAG	2	6	11824	11829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_021505	TCG	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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200	NC_021505	GGA	2	6	14029	14034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_021505	GCT	2	6	16485	16490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_021505	GTT	2	6	16595	16600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_021505	TGC	2	6	17822	17827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_021505	CGC	2	6	17842	17847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_021505	TGT	2	6	17886	17891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683071
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256	NC_021505	TCG	2	6	18305	18310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683072
257	NC_021505	ACG	2	6	18376	18381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_021505	GCT	2	6	18452	18457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_021505	GTT	2	6	18616	18621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021505	GAT	2	6	18691	18696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021505	TCA	2	6	18801	18806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683074
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263	NC_021505	GCC	2	6	19049	19054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683074
264	NC_021505	ACC	2	6	19118	19123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683074
265	NC_021505	TCC	2	6	19124	19129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683074
266	NC_021505	GTA	2	6	19201	19206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683074
267	NC_021505	TGA	2	6	19266	19271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683074
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270	NC_021505	GTT	2	6	19393	19398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683074
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272	NC_021505	CAG	2	6	19657	19662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683074
273	NC_021505	TTG	2	6	19811	19816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683074
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275	NC_021505	AGG	2	6	19824	19829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683074
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277	NC_021505	CAG	2	6	20005	20010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683074
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279	NC_021505	GCT	2	6	20428	20433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_021505	ATT	2	6	20605	20610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_021505	CTG	2	6	20671	20676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_021505	TAC	2	6	20719	20724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_021505	CCA	2	6	20725	20730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_021505	CAC	2	6	20966	20971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_021505	GCA	2	6	21013	21018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_021505	CGG	2	6	21028	21033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_021505	CGG	2	6	21049	21054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_021505	GCT	2	6	21187	21192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_021505	AGA	2	6	21345	21350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683075
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291	NC_021505	GCC	2	6	21467	21472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683075
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294	NC_021505	CTT	2	6	21628	21633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683075
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299	NC_021505	ATC	2	6	21815	21820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683075
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315	NC_021505	TGA	2	6	22733	22738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_021505	CTT	2	6	23601	23606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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378	NC_021505	CAA	2	6	26512	26517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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382	NC_021505	CTG	3	9	26792	26800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683081
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497	NC_021505	TAA	2	6	36526	36531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_021505	TAC	2	6	36590	36595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683090
499	NC_021505	TTG	3	9	36596	36604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683090
500	NC_021505	TCA	2	6	36666	36671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683090

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