MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Pseudomonas fluorescens A506 plasmid pA506

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021361	TC	3	6	330	335	0 %	50 %	0 %	50 %	510414888
2	NC_021361	CG	3	6	934	939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021361	GC	3	6	1445	1450	0 %	0 %	50 %	50 %	510414865
4	NC_021361	CG	3	6	2576	2581	0 %	0 %	50 %	50 %	510414877
5	NC_021361	GT	3	6	2720	2725	0 %	50 %	50 %	0 %	510414877
6	NC_021361	GC	3	6	3040	3045	0 %	0 %	50 %	50 %	510414866
7	NC_021361	CA	4	8	3966	3973	50 %	0 %	0 %	50 %	510414866
8	NC_021361	GC	3	6	4043	4048	0 %	0 %	50 %	50 %	510414866
9	NC_021361	CT	3	6	4793	4798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021361	AG	3	6	4832	4837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021361	GC	3	6	5049	5054	0 %	0 %	50 %	50 %	510414857
12	NC_021361	CT	3	6	5161	5166	0 %	50 %	0 %	50 %	510414857
13	NC_021361	AC	3	6	5215	5220	50 %	0 %	0 %	50 %	510414857
14	NC_021361	TG	3	6	6058	6063	0 %	50 %	50 %	0 %	510414850
15	NC_021361	GC	3	6	6677	6682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021361	CA	3	6	6781	6786	50 %	0 %	0 %	50 %	510414870
17	NC_021361	AC	3	6	7815	7820	50 %	0 %	0 %	50 %	510414869
18	NC_021361	AC	3	6	8075	8080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021361	AT	3	6	9762	9767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021361	CG	3	6	10752	10757	0 %	0 %	50 %	50 %	510414894
21	NC_021361	CG	3	6	11044	11049	0 %	0 %	50 %	50 %	510414894
22	NC_021361	GC	3	6	11335	11340	0 %	0 %	50 %	50 %	510414894
23	NC_021361	GC	3	6	11354	11359	0 %	0 %	50 %	50 %	510414894
24	NC_021361	GC	3	6	11513	11518	0 %	0 %	50 %	50 %	510414894
25	NC_021361	GA	3	6	13685	13690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021361	AG	3	6	13925	13930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021361	TG	3	6	14942	14947	0 %	50 %	50 %	0 %	510414864
28	NC_021361	GC	3	6	15065	15070	0 %	0 %	50 %	50 %	510414880
29	NC_021361	GC	3	6	15226	15231	0 %	0 %	50 %	50 %	510414880
30	NC_021361	GC	3	6	15285	15290	0 %	0 %	50 %	50 %	510414880
31	NC_021361	GC	3	6	15942	15947	0 %	0 %	50 %	50 %	510414875
32	NC_021361	GC	3	6	16971	16976	0 %	0 %	50 %	50 %	510414875
33	NC_021361	CG	3	6	17473	17478	0 %	0 %	50 %	50 %	510414846
34	NC_021361	CG	3	6	17483	17488	0 %	0 %	50 %	50 %	510414846
35	NC_021361	GC	3	6	17679	17684	0 %	0 %	50 %	50 %	510414846
36	NC_021361	GC	3	6	17898	17903	0 %	0 %	50 %	50 %	510414862
37	NC_021361	GC	3	6	18145	18150	0 %	0 %	50 %	50 %	510414859
38	NC_021361	GC	4	8	18482	18489	0 %	0 %	50 %	50 %	510414853
39	NC_021361	GC	3	6	18680	18685	0 %	0 %	50 %	50 %	510414844
40	NC_021361	CA	3	6	18987	18992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021361	TG	3	6	19882	19887	0 %	50 %	50 %	0 %	510414829
42	NC_021361	AC	3	6	20412	20417	50 %	0 %	0 %	50 %	510414892
43	NC_021361	AT	3	6	21302	21307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021361	GT	3	6	24558	24563	0 %	50 %	50 %	0 %	510414836
45	NC_021361	AT	3	6	24928	24933	50 %	50 %	0 %	0 %	510414835
46	NC_021361	GC	3	6	25247	25252	0 %	0 %	50 %	50 %	510414835
47	NC_021361	GA	3	6	25583	25588	50 %	0 %	50 %	0 %	510414884
48	NC_021361	TA	3	6	26112	26117	50 %	50 %	0 %	0 %	510414847
49	NC_021361	AC	3	6	30396	30401	50 %	0 %	0 %	50 %	510414873
50	NC_021361	CG	3	6	30641	30646	0 %	0 %	50 %	50 %	510414889
51	NC_021361	CA	3	6	32765	32770	50 %	0 %	0 %	50 %	510414886
52	NC_021361	CT	3	6	32817	32822	0 %	50 %	0 %	50 %	510414886
53	NC_021361	AT	3	6	35373	35378	50 %	50 %	0 %	0 %	510414879
54	NC_021361	TC	3	6	35782	35787	0 %	50 %	0 %	50 %	510414879
55	NC_021361	CA	3	6	38806	38811	50 %	0 %	0 %	50 %	510414878
56	NC_021361	GC	3	6	40020	40025	0 %	0 %	50 %	50 %	510414843
57	NC_021361	CT	3	6	40083	40088	0 %	50 %	0 %	50 %	510414843
58	NC_021361	AG	3	6	40549	40554	50 %	0 %	50 %	0 %	510414843
59	NC_021361	AC	3	6	40851	40856	50 %	0 %	0 %	50 %	510414831
60	NC_021361	TG	3	6	41440	41445	0 %	50 %	50 %	0 %	510414831
61	NC_021361	CG	3	6	43084	43089	0 %	0 %	50 %	50 %	510414845
62	NC_021361	AC	3	6	44569	44574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021361	GC	3	6	44788	44793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021361	AC	3	6	46572	46577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021361	CG	3	6	46965	46970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021361	GA	3	6	48592	48597	50 %	0 %	50 %	0 %	510414848
67	NC_021361	TG	3	6	48925	48930	0 %	50 %	50 %	0 %	510414848
68	NC_021361	AC	3	6	50031	50036	50 %	0 %	0 %	50 %	510414832
69	NC_021361	AT	3	6	50332	50337	50 %	50 %	0 %	0 %	510414832
70	NC_021361	GT	3	6	50707	50712	0 %	50 %	50 %	0 %	510414832
71	NC_021361	GC	3	6	51206	51211	0 %	0 %	50 %	50 %	510414842
72	NC_021361	CT	3	6	51716	51721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021361	AG	3	6	51970	51975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021361	AG	3	6	52230	52235	50 %	0 %	50 %	0 %	510414868
75	NC_021361	AT	3	6	52929	52934	50 %	50 %	0 %	0 %	510414871

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.