MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018028	CCAG	2	8	252265	252272	25 %	0 %	25 %	50 %	392419321
6002	NC_018028	GCG	2	6	252277	252282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419321
6003	NC_018028	GTG	2	6	252285	252290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419321
6004	NC_018028	GC	4	8	252338	252345	0 %	0 %	50 %	50 %	392419321
6005	NC_018028	CGG	2	6	252362	252367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419321
6006	NC_018028	CAG	3	9	252371	252379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6007	NC_018028	GCG	2	6	252396	252401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419321
6008	NC_018028	GC	3	6	252476	252481	0 %	0 %	50 %	50 %	392419321
6009	NC_018028	CGG	2	6	252482	252487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419321
6010	NC_018028	TCG	2	6	252531	252536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6011	NC_018028	CCA	2	6	252607	252612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419321
6012	NC_018028	GGGC	2	8	252667	252674	0 %	0 %	75 %	25 %	392419321
6013	NC_018028	GCGCCA	2	12	252779	252790	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392419321
6014	NC_018028	CAG	2	6	252806	252811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6015	NC_018028	GCA	2	6	252820	252825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6016	NC_018028	CAG	2	6	252836	252841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6017	NC_018028	CCAG	2	8	252850	252857	25 %	0 %	25 %	50 %	392419321
6018	NC_018028	CCG	2	6	252891	252896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419321
6019	NC_018028	GC	3	6	252958	252963	0 %	0 %	50 %	50 %	392419321
6020	NC_018028	CGA	2	6	252982	252987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6021	NC_018028	TGG	2	6	253006	253011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419321
6022	NC_018028	CAG	2	6	253061	253066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6023	NC_018028	CAG	2	6	253082	253087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6024	NC_018028	CAGC	2	8	253115	253122	25 %	0 %	25 %	50 %	392419321
6025	NC_018028	CAG	2	6	253151	253156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6026	NC_018028	GCGCG	2	10	253171	253180	0 %	0 %	60 %	40 %	392419321
6027	NC_018028	CCG	2	6	253233	253238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419321
6028	NC_018028	AGC	2	6	253263	253268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6029	NC_018028	CAG	2	6	253283	253288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6030	NC_018028	AGGCC	2	10	253360	253369	20 %	0 %	40 %	40 %	392419321
6031	NC_018028	AGC	2	6	253389	253394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6032	NC_018028	ACCC	2	8	253405	253412	25 %	0 %	0 %	75 %	392419321
6033	NC_018028	GC	3	6	253463	253468	0 %	0 %	50 %	50 %	392419321
6034	NC_018028	GCT	2	6	253483	253488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6035	NC_018028	GAG	2	6	253499	253504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419321
6036	NC_018028	TCG	4	12	253539	253550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419321
6037	NC_018028	TTC	2	6	253565	253570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419321
6038	NC_018028	GGGC	2	8	253629	253636	0 %	0 %	75 %	25 %	392419321
6039	NC_018028	CGC	2	6	253833	253838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_018028	GCT	2	6	253855	253860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_018028	CG	3	6	253891	253896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_018028	GCG	3	9	253934	253942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_018028	GAT	2	6	253987	253992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_018028	CGG	2	6	254016	254021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_018028	CGGC	2	8	254046	254053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_018028	TGC	2	6	254079	254084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_018028	CTG	2	6	254092	254097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_018028	GGC	2	6	254148	254153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_018028	GCC	2	6	254205	254210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_018028	GCT	2	6	254268	254273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_018028	CTGA	2	8	254323	254330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_018028	GAT	2	6	254353	254358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_018028	CG	3	6	254394	254399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_018028	CGGA	2	8	254407	254414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6055	NC_018028	GC	3	6	254434	254439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_018028	CTG	2	6	254505	254510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_018028	GGT	2	6	254553	254558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_018028	TGTCG	2	10	254573	254582	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6059	NC_018028	CGA	2	6	254585	254590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_018028	TCA	2	6	254606	254611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_018028	GGC	2	6	254661	254666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_018028	CG	4	8	254732	254739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_018028	CCG	2	6	254765	254770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_018028	AGC	2	6	254791	254796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_018028	GCG	2	6	254817	254822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_018028	GGT	2	6	254832	254837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_018028	GCG	2	6	254913	254918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419322
6068	NC_018028	CGA	2	6	254945	254950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419322
6069	NC_018028	CGC	2	6	254991	254996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419322
6070	NC_018028	CGC	2	6	255030	255035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419322
6071	NC_018028	CCG	2	6	255089	255094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419322
6072	NC_018028	ATC	2	6	255133	255138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419322
6073	NC_018028	GGC	2	6	255182	255187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419322
6074	NC_018028	TGG	2	6	255194	255199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419322
6075	NC_018028	GTGC	2	8	255265	255272	0 %	25 %	50 %	25 %	392419322
6076	NC_018028	CGA	2	6	255300	255305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419322
6077	NC_018028	GCTGAT	2	12	255306	255317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392419322
6078	NC_018028	CGG	2	6	255318	255323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419322
6079	NC_018028	CGA	2	6	255420	255425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419322
6080	NC_018028	AGCC	2	8	255448	255455	25 %	0 %	25 %	50 %	392419322
6081	NC_018028	GGA	2	6	255675	255680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419323
6082	NC_018028	GCT	2	6	255690	255695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419323
6083	NC_018028	GCT	2	6	255747	255752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419323
6084	NC_018028	CGG	2	6	255756	255761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419323
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6087	NC_018028	CGG	2	6	255984	255989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419323
6088	NC_018028	CATCGG	2	12	255996	256007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419323
6089	NC_018028	CTG	2	6	256009	256014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419323
6090	NC_018028	TGG	2	6	256041	256046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419323
6091	NC_018028	GC	3	6	256089	256094	0 %	0 %	50 %	50 %	392419323
6092	NC_018028	TCG	2	6	256145	256150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419323
6093	NC_018028	CGG	2	6	256154	256159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419323
6094	NC_018028	TGC	2	6	256166	256171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419323
6095	NC_018028	ATCA	2	8	256213	256220	50 %	25 %	0 %	25 %	392419323
6096	NC_018028	CGT	2	6	256279	256284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419324
6097	NC_018028	CAG	2	6	256292	256297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419324
6098	NC_018028	CGC	2	6	256368	256373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419324
6099	NC_018028	CAC	2	6	256406	256411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419324
6100	NC_018028	AGCG	2	8	256424	256431	25 %	0 %	50 %	25 %	392419324
6101	NC_018028	GCT	2	6	256444	256449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419324
6102	NC_018028	GCG	2	6	256558	256563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419324
6103	NC_018028	GAG	2	6	256787	256792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_018028	GTG	3	9	256817	256825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419325
6105	NC_018028	GGT	2	6	256834	256839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419325
6106	NC_018028	GC	3	6	256853	256858	0 %	0 %	50 %	50 %	392419325
6107	NC_018028	GGCC	2	8	256870	256877	0 %	0 %	50 %	50 %	392419325
6108	NC_018028	GGC	2	6	256903	256908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419325
6109	NC_018028	GC	4	8	256926	256933	0 %	0 %	50 %	50 %	392419325
6110	NC_018028	CTA	2	6	256960	256965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419325
6111	NC_018028	GCTC	2	8	256974	256981	0 %	25 %	25 %	50 %	392419325
6112	NC_018028	CGC	2	6	257051	257056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419325
6113	NC_018028	CGA	2	6	257080	257085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419325
6114	NC_018028	CGCTG	2	10	257095	257104	0 %	20 %	40 %	40 %	392419325
6115	NC_018028	CGA	2	6	257140	257145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419325
6116	NC_018028	GCTG	2	8	257200	257207	0 %	25 %	50 %	25 %	392419325
6117	NC_018028	GCT	2	6	257209	257214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419325
6118	NC_018028	CAT	2	6	257230	257235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419325
6119	NC_018028	CTG	2	6	257261	257266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419325
6120	NC_018028	GCG	2	6	257358	257363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419325
6121	NC_018028	GCT	2	6	257377	257382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419325
6122	NC_018028	GTG	2	6	257393	257398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419325
6123	NC_018028	CGC	2	6	257428	257433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419325
6124	NC_018028	AC	3	6	257434	257439	50 %	0 %	0 %	50 %	392419325
6125	NC_018028	CGG	2	6	257454	257459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419325
6126	NC_018028	CGCGGC	2	12	257460	257471	0 %	0 %	50 %	50 %	392419325
6127	NC_018028	TTC	2	6	257474	257479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419325
6128	NC_018028	GGC	2	6	257552	257557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419325
6129	NC_018028	GC	3	6	257594	257599	0 %	0 %	50 %	50 %	392419325
6130	NC_018028	CGC	2	6	257671	257676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419325
6131	NC_018028	GGC	2	6	257764	257769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419325
6132	NC_018028	GCA	2	6	257797	257802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419325
6133	NC_018028	CTGC	2	8	257853	257860	0 %	25 %	25 %	50 %	392419325
6134	NC_018028	GCT	2	6	257887	257892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419325
6135	NC_018028	CGC	2	6	257974	257979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6136	NC_018028	CAGG	2	8	258022	258029	25 %	0 %	50 %	25 %	392419326
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6139	NC_018028	CTG	2	6	258145	258150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419326
6140	NC_018028	GGC	2	6	258166	258171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419326
6141	NC_018028	GCAGCT	2	12	258174	258185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419326
6142	NC_018028	GC	3	6	258201	258206	0 %	0 %	50 %	50 %	392419326
6143	NC_018028	GCCG	2	8	258246	258253	0 %	0 %	50 %	50 %	392419326
6144	NC_018028	GGCG	2	8	258258	258265	0 %	0 %	75 %	25 %	392419326
6145	NC_018028	GCT	3	9	258324	258332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419326
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6152	NC_018028	GGCC	2	8	258507	258514	0 %	0 %	50 %	50 %	392419326
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6156	NC_018028	TGC	2	6	258656	258661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419326
6157	NC_018028	CTG	2	6	258679	258684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419326
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6160	NC_018028	CTG	2	6	258778	258783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419326
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6162	NC_018028	TGCC	2	8	258892	258899	0 %	25 %	25 %	50 %	392419326
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6175	NC_018028	GCAG	2	8	259317	259324	25 %	0 %	50 %	25 %	392419326
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6178	NC_018028	TGC	3	9	259526	259534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419326
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6182	NC_018028	CTG	2	6	259751	259756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6185	NC_018028	TGG	2	6	259864	259869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419327
6186	NC_018028	CGT	2	6	259895	259900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419327
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6221	NC_018028	TGGCGA	2	12	261535	261546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392419327
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6225	NC_018028	CGTG	2	8	261622	261629	0 %	25 %	50 %	25 %	392419327
6226	NC_018028	GGA	2	6	261726	261731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6227	NC_018028	CCG	2	6	261797	261802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6228	NC_018028	CGG	2	6	261936	261941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6229	NC_018028	CCG	2	6	261959	261964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6230	NC_018028	TCGC	2	8	261990	261997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6231	NC_018028	TCTTG	2	10	262034	262043	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6232	NC_018028	AGCG	2	8	262053	262060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6233	NC_018028	TCGCC	2	10	262062	262071	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6234	NC_018028	GAT	2	6	262105	262110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6235	NC_018028	GCT	2	6	262187	262192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419328
6236	NC_018028	TGG	2	6	262194	262199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419328
6237	NC_018028	CCG	4	12	262212	262223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419328
6238	NC_018028	C	6	6	262224	262229	0 %	0 %	0 %	100 %	392419328
6239	NC_018028	AC	3	6	262236	262241	50 %	0 %	0 %	50 %	392419328
6240	NC_018028	CACG	2	8	262338	262345	25 %	0 %	25 %	50 %	392419328
6241	NC_018028	CGA	2	6	262407	262412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419328
6242	NC_018028	GCT	2	6	262423	262428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419328
6243	NC_018028	GCCA	2	8	262439	262446	25 %	0 %	25 %	50 %	392419328
6244	NC_018028	GTG	2	6	262454	262459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419328
6245	NC_018028	CGG	2	6	262464	262469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419328
6246	NC_018028	GCCT	2	8	262505	262512	0 %	25 %	25 %	50 %	392419328
6247	NC_018028	GAT	2	6	262634	262639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419328
6248	NC_018028	TCG	3	9	262694	262702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419328
6249	NC_018028	TCT	2	6	262809	262814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419328
6250	NC_018028	G	6	6	262815	262820	0 %	0 %	100 %	0 %	392419328
6251	NC_018028	GTCA	2	8	262832	262839	25 %	25 %	25 %	25 %	392419328
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6253	NC_018028	CGA	2	6	262878	262883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419328
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6352	NC_018028	CGGG	2	8	266682	266689	0 %	0 %	75 %	25 %	392419332
6353	NC_018028	GCG	2	6	266711	266716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419332
6354	NC_018028	GC	3	6	266745	266750	0 %	0 %	50 %	50 %	392419332
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6356	NC_018028	GCT	2	6	266921	266926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419333
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6361	NC_018028	GCT	2	6	267067	267072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419333
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6368	NC_018028	CGC	2	6	267325	267330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6369	NC_018028	CCT	2	6	267338	267343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419334
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6371	NC_018028	CTG	2	6	267385	267390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419334
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6486	NC_018028	TGG	2	6	271928	271933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419338
6487	NC_018028	CGT	2	6	271946	271951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419338
6488	NC_018028	GCCG	2	8	271979	271986	0 %	0 %	50 %	50 %	392419338
6489	NC_018028	TCA	2	6	272014	272019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419338
6490	NC_018028	GCG	2	6	272104	272109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419338
6491	NC_018028	GC	4	8	272155	272162	0 %	0 %	50 %	50 %	392419338
6492	NC_018028	CGG	2	6	272165	272170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419338
6493	NC_018028	GCG	2	6	272202	272207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419338
6494	NC_018028	TGA	2	6	272296	272301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419338
6495	NC_018028	ATC	2	6	272323	272328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419338
6496	NC_018028	TGCGC	2	10	272354	272363	0 %	20 %	40 %	40 %	392419338
6497	NC_018028	GATG	2	8	272408	272415	25 %	25 %	50 %	0 %	392419338
6498	NC_018028	CCGGC	2	10	272441	272450	0 %	0 %	40 %	60 %	392419338
6499	NC_018028	GC	3	6	272495	272500	0 %	0 %	50 %	50 %	392419338
6500	NC_018028	TCG	2	6	272521	272526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419338

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