MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018028	TGGC	2	8	232399	232406	0 %	25 %	50 %	25 %	392419306
5502	NC_018028	CCGG	2	8	232421	232428	0 %	0 %	50 %	50 %	392419306
5503	NC_018028	GCC	2	6	232449	232454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419306
5504	NC_018028	CCA	2	6	232472	232477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419306
5505	NC_018028	CTG	2	6	232493	232498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419306
5506	NC_018028	CGCC	2	8	232548	232555	0 %	0 %	25 %	75 %	392419306
5507	NC_018028	GCT	2	6	232594	232599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419306
5508	NC_018028	CTGG	2	8	232606	232613	0 %	25 %	50 %	25 %	392419306
5509	NC_018028	GTT	2	6	232648	232653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419306
5510	NC_018028	AGC	2	6	232661	232666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419306
5511	NC_018028	GCC	2	6	232775	232780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419306
5512	NC_018028	CGGCC	2	10	232867	232876	0 %	0 %	40 %	60 %	392419306
5513	NC_018028	GAG	2	6	232895	232900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419306
5514	NC_018028	GAA	2	6	232904	232909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419306
5515	NC_018028	CCT	2	6	232920	232925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419307
5516	NC_018028	CGCT	2	8	232945	232952	0 %	25 %	25 %	50 %	392419307
5517	NC_018028	CCGGCA	2	12	232967	232978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392419307
5518	NC_018028	CGCC	2	8	233004	233011	0 %	0 %	25 %	75 %	392419307
5519	NC_018028	TGC	2	6	233012	233017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5520	NC_018028	ACC	2	6	233062	233067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419307
5521	NC_018028	GCC	2	6	233068	233073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5522	NC_018028	CTG	2	6	233075	233080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5523	NC_018028	CGA	2	6	233145	233150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5524	NC_018028	CGA	2	6	233184	233189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5525	NC_018028	CGG	2	6	233197	233202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419307
5526	NC_018028	CGA	2	6	233229	233234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
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5528	NC_018028	GC	3	6	233268	233273	0 %	0 %	50 %	50 %	392419307
5529	NC_018028	CGC	2	6	233283	233288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5530	NC_018028	CCG	2	6	233324	233329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5531	NC_018028	GAT	2	6	233340	233345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419307
5532	NC_018028	GCT	2	6	233352	233357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5533	NC_018028	GC	3	6	233404	233409	0 %	0 %	50 %	50 %	392419307
5534	NC_018028	GCC	2	6	233512	233517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5535	NC_018028	GCC	2	6	233536	233541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5536	NC_018028	CGC	2	6	233550	233555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5537	NC_018028	GA	3	6	233565	233570	50 %	0 %	50 %	0 %	392419307
5538	NC_018028	GAGC	2	8	233658	233665	25 %	0 %	50 %	25 %	392419307
5539	NC_018028	GC	3	6	233733	233738	0 %	0 %	50 %	50 %	392419307
5540	NC_018028	AAG	2	6	233755	233760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419307
5541	NC_018028	GCAA	2	8	233840	233847	50 %	0 %	25 %	25 %	392419307
5542	NC_018028	GCT	2	6	233871	233876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5543	NC_018028	GGC	2	6	233910	233915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419307
5544	NC_018028	GAT	2	6	233935	233940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419307
5545	NC_018028	GGC	2	6	233991	233996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419307
5546	NC_018028	GC	3	6	234003	234008	0 %	0 %	50 %	50 %	392419307
5547	NC_018028	CGA	2	6	234030	234035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5548	NC_018028	GGCG	2	8	234090	234097	0 %	0 %	75 %	25 %	392419307
5549	NC_018028	AGC	2	6	234182	234187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5550	NC_018028	CGCTG	2	10	234246	234255	0 %	20 %	40 %	40 %	392419307
5551	NC_018028	ATC	2	6	234269	234274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419307
5552	NC_018028	CAG	2	6	234308	234313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5553	NC_018028	TGG	2	6	234350	234355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419307
5554	NC_018028	AGG	2	6	234356	234361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419307
5555	NC_018028	GGC	2	6	234366	234371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419307
5556	NC_018028	CTGG	2	8	234387	234394	0 %	25 %	50 %	25 %	392419307
5557	NC_018028	GGCG	2	8	234471	234478	0 %	0 %	75 %	25 %	392419307
5558	NC_018028	CCG	2	6	234479	234484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5559	NC_018028	GAT	2	6	234576	234581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419307
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5562	NC_018028	CGC	2	6	234666	234671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
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5564	NC_018028	CTG	2	6	234709	234714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5565	NC_018028	GCC	2	6	234751	234756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5566	NC_018028	CAG	3	9	234781	234789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5567	NC_018028	GCC	2	6	234808	234813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
5568	NC_018028	GCA	3	9	234834	234842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5569	NC_018028	CGA	2	6	234873	234878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5570	NC_018028	GCT	2	6	234897	234902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5571	NC_018028	CCT	2	6	234936	234941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419307
5572	NC_018028	GCT	2	6	234996	235001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
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5575	NC_018028	GCT	2	6	235158	235163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
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5579	NC_018028	AGC	2	6	235280	235285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5580	NC_018028	CG	5	10	235312	235321	0 %	0 %	50 %	50 %	392419307
5581	NC_018028	A	6	6	235365	235370	100 %	0 %	0 %	0 %	392419307
5582	NC_018028	CAG	2	6	235401	235406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5583	NC_018028	CTGGC	2	10	235411	235420	0 %	20 %	40 %	40 %	392419307
5584	NC_018028	TAC	2	6	235421	235426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419307
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5587	NC_018028	GCCT	2	8	235549	235556	0 %	25 %	25 %	50 %	392419307
5588	NC_018028	CG	3	6	235568	235573	0 %	0 %	50 %	50 %	392419307
5589	NC_018028	GCCGC	3	15	235595	235609	0 %	0 %	40 %	60 %	392419307
5590	NC_018028	GCAT	2	8	235685	235692	25 %	25 %	25 %	25 %	392419307
5591	NC_018028	CTT	2	6	235752	235757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419307
5592	NC_018028	CCTG	2	8	235787	235794	0 %	25 %	25 %	50 %	392419307
5593	NC_018028	GGAA	2	8	235886	235893	50 %	0 %	50 %	0 %	392419307
5594	NC_018028	ATGG	2	8	235933	235940	25 %	25 %	50 %	0 %	392419307
5595	NC_018028	CGC	2	6	235956	235961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419307
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5598	NC_018028	ACG	2	6	236156	236161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5599	NC_018028	TAC	2	6	236215	236220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419307
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5601	NC_018028	GCT	2	6	236232	236237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5602	NC_018028	TAC	2	6	236260	236265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419307
5603	NC_018028	AGC	2	6	236336	236341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419307
5604	NC_018028	CGG	2	6	236343	236348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419307
5605	NC_018028	CCGG	2	8	236400	236407	0 %	0 %	50 %	50 %	392419307
5606	NC_018028	GTT	2	6	236436	236441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419307
5607	NC_018028	GAG	2	6	236443	236448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419307
5608	NC_018028	TGA	2	6	236455	236460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419307
5609	NC_018028	GCG	2	6	236497	236502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_018028	GC	3	6	236563	236568	0 %	0 %	50 %	50 %	392419308
5611	NC_018028	TGC	2	6	236616	236621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419308
5612	NC_018028	CGC	3	9	236623	236631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419308
5613	NC_018028	GCTGT	2	10	236632	236641	0 %	40 %	40 %	20 %	392419308
5614	NC_018028	GTCCT	2	10	236645	236654	0 %	40 %	20 %	40 %	392419308
5615	NC_018028	CTGC	2	8	236665	236672	0 %	25 %	25 %	50 %	392419308
5616	NC_018028	GCC	2	6	236725	236730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419308
5617	NC_018028	CAG	2	6	236849	236854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419308
5618	NC_018028	GCT	2	6	236866	236871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419308
5619	NC_018028	CGA	2	6	236899	236904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419308
5620	NC_018028	GC	3	6	236927	236932	0 %	0 %	50 %	50 %	392419308
5621	NC_018028	CGC	2	6	236974	236979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419308
5622	NC_018028	CGG	2	6	237016	237021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419308
5623	NC_018028	ACC	2	6	237038	237043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419308
5624	NC_018028	CTG	2	6	237056	237061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419308
5625	NC_018028	GCG	2	6	237062	237067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419308
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5629	NC_018028	GC	3	6	237134	237139	0 %	0 %	50 %	50 %	392419308
5630	NC_018028	GC	3	6	237215	237220	0 %	0 %	50 %	50 %	392419308
5631	NC_018028	GCT	2	6	237232	237237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419308
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5634	NC_018028	CGCTG	2	10	237355	237364	0 %	20 %	40 %	40 %	392419308
5635	NC_018028	GCC	2	6	237410	237415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419308
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5642	NC_018028	CCG	2	6	237696	237701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419308
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5645	NC_018028	TGCC	2	8	237885	237892	0 %	25 %	25 %	50 %	392419308
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5651	NC_018028	GCT	2	6	238150	238155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419308
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5653	NC_018028	GGCT	2	8	238227	238234	0 %	25 %	50 %	25 %	392419308
5654	NC_018028	GC	3	6	238258	238263	0 %	0 %	50 %	50 %	392419308
5655	NC_018028	TCC	2	6	238287	238292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419308
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5657	NC_018028	CGG	2	6	238326	238331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419308
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5659	NC_018028	TCAGC	2	10	238357	238366	20 %	20 %	20 %	40 %	392419308
5660	NC_018028	GC	3	6	238381	238386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5661	NC_018028	GCT	2	6	238408	238413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5662	NC_018028	CGC	2	6	238417	238422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5663	NC_018028	CTT	2	6	238514	238519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419309
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5703	NC_018028	CGA	2	6	239810	239815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419310
5704	NC_018028	TGC	2	6	239895	239900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419310
5705	NC_018028	TGGCG	2	10	239931	239940	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5706	NC_018028	GTCG	2	8	239954	239961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5707	NC_018028	TGT	2	6	239965	239970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5708	NC_018028	ATC	2	6	239994	239999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5710	NC_018028	CTG	2	6	240105	240110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419311
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5720	NC_018028	TGC	2	6	240376	240381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419311
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5728	NC_018028	CTA	2	6	240614	240619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419311
5729	NC_018028	CTG	2	6	240621	240626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419311
5730	NC_018028	ATC	2	6	240633	240638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419311
5731	NC_018028	CTG	2	6	240699	240704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419311
5732	NC_018028	ACG	2	6	240721	240726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419311
5733	NC_018028	CG	3	6	240762	240767	0 %	0 %	50 %	50 %	392419311
5734	NC_018028	CCG	2	6	240791	240796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419311
5735	NC_018028	CTG	2	6	240819	240824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419311
5736	NC_018028	GAT	2	6	240834	240839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419311
5737	NC_018028	CCGG	2	8	240870	240877	0 %	0 %	50 %	50 %	392419311
5738	NC_018028	GCG	2	6	240923	240928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419311
5739	NC_018028	GGC	2	6	240941	240946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419311
5740	NC_018028	GGC	2	6	240954	240959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419311
5741	NC_018028	GAG	2	6	240960	240965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419311
5742	NC_018028	GCT	3	9	240971	240979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419311
5743	NC_018028	CGC	2	6	240995	241000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419311
5744	NC_018028	CGG	2	6	241069	241074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419311
5745	NC_018028	GCATCG	2	12	241090	241101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419311
5746	NC_018028	CAG	2	6	241119	241124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419311
5747	NC_018028	GTG	2	6	241174	241179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419311
5748	NC_018028	GCG	2	6	241250	241255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419312
5749	NC_018028	CGA	2	6	241294	241299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419312
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5751	NC_018028	GC	3	6	241423	241428	0 %	0 %	50 %	50 %	392419312
5752	NC_018028	CGAT	2	8	241458	241465	25 %	25 %	25 %	25 %	392419312
5753	NC_018028	CCG	2	6	241545	241550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419312
5754	NC_018028	TCGG	2	8	241649	241656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5755	NC_018028	GTT	3	9	241668	241676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5756	NC_018028	AC	3	6	241838	241843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5757	NC_018028	CA	3	6	241849	241854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5758	NC_018028	GGC	2	6	241892	241897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419313
5759	NC_018028	GCT	2	6	241941	241946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419313
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5762	NC_018028	TGA	2	6	242032	242037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419313
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5772	NC_018028	GC	3	6	242661	242666	0 %	0 %	50 %	50 %	392419313
5773	NC_018028	TTC	2	6	242667	242672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419313
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5778	NC_018028	GC	3	6	242863	242868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5779	NC_018028	TCG	2	6	242913	242918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5781	NC_018028	ATTAG	2	10	242955	242964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5782	NC_018028	CG	3	6	243089	243094	0 %	0 %	50 %	50 %	392419314
5783	NC_018028	CGG	2	6	243130	243135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419314
5784	NC_018028	CG	3	6	243224	243229	0 %	0 %	50 %	50 %	392419314
5785	NC_018028	GCA	2	6	243232	243237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419314
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5833	NC_018028	TGA	2	6	245217	245222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419314
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5845	NC_018028	GAAG	2	8	245749	245756	50 %	0 %	50 %	0 %	392419315
5846	NC_018028	GC	3	6	245968	245973	0 %	0 %	50 %	50 %	392419315
5847	NC_018028	GAA	2	6	246002	246007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419315
5848	NC_018028	GCA	3	9	246022	246030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419315
5849	NC_018028	GGT	2	6	246097	246102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419315
5850	NC_018028	CGC	2	6	246132	246137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419315
5851	NC_018028	CGA	2	6	246181	246186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419315
5852	NC_018028	CG	3	6	246189	246194	0 %	0 %	50 %	50 %	392419315
5853	NC_018028	GCG	2	6	246210	246215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419315
5854	NC_018028	TGA	2	6	246243	246248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419315
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5860	NC_018028	GCACCG	2	12	246461	246472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392419315
5861	NC_018028	GGT	2	6	246532	246537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419315
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5863	NC_018028	GAT	2	6	246577	246582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419315
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5986	NC_018028	GCG	2	6	251543	251548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419320
5987	NC_018028	AGC	2	6	251558	251563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419320
5988	NC_018028	GC	3	6	251593	251598	0 %	0 %	50 %	50 %	392419320
5989	NC_018028	CAG	3	9	251656	251664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419320
5990	NC_018028	GGC	2	6	251682	251687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419320
5991	NC_018028	CGG	2	6	251701	251706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419320
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5994	NC_018028	ATCA	2	8	251884	251891	50 %	25 %	0 %	25 %	392419320
5995	NC_018028	AGC	2	6	251915	251920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419320
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5997	NC_018028	GC	3	6	251956	251961	0 %	0 %	50 %	50 %	392419320
5998	NC_018028	AGC	2	6	252089	252094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419320
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