MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pantoea ananatis PA13 chromosome

Total Repeats: 63592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017554	CCG	2	6	95	100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077237
2	NC_017554	ACT	2	6	282	287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077237
3	NC_017554	CAA	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386077237
4	NC_017554	TAA	2	6	498	503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386077237
5	NC_017554	TTG	2	6	524	529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386077237
6	NC_017554	GGC	2	6	586	591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077237
7	NC_017554	ATT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386077237
8	NC_017554	AAT	2	6	748	753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386077237
9	NC_017554	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077237
10	NC_017554	CAA	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386077237
11	NC_017554	CAG	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077237
12	NC_017554	ATC	2	6	892	897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077237
13	NC_017554	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077237
14	NC_017554	TGA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077237
15	NC_017554	CTG	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077237
16	NC_017554	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386077237
17	NC_017554	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077237
18	NC_017554	TAC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077237
19	NC_017554	TGG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386077237
20	NC_017554	GAA	2	6	1447	1452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077237
21	NC_017554	AGA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077237
22	NC_017554	TCA	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077237
23	NC_017554	TTG	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386077238
24	NC_017554	GCA	2	6	1552	1557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077238
25	NC_017554	CTG	2	6	1607	1612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077238
26	NC_017554	GTT	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386077238
27	NC_017554	CGA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077238
28	NC_017554	CTA	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077238
29	NC_017554	ATG	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077238
30	NC_017554	CTG	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077238
31	NC_017554	CGG	2	6	2134	2139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077238
32	NC_017554	GCA	3	9	2166	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077238
33	NC_017554	TGG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386077238
34	NC_017554	TCG	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077238
35	NC_017554	TGC	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077238
36	NC_017554	GCG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077238
37	NC_017554	TAA	2	6	2392	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386077238
38	NC_017554	GAA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077238
39	NC_017554	CTG	3	9	2522	2530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077238
40	NC_017554	GTC	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077238
41	NC_017554	CTG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077239
42	NC_017554	GCA	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077239
43	NC_017554	TGC	2	6	2962	2967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077239
44	NC_017554	TGC	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077239
45	NC_017554	CGG	2	6	3134	3139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077239
46	NC_017554	GCT	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077239
47	NC_017554	GCG	2	6	3243	3248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077239
48	NC_017554	CTG	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077239
49	NC_017554	CGC	2	6	3639	3644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077239
50	NC_017554	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077239
51	NC_017554	CGC	2	6	3693	3698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077239
52	NC_017554	CTG	2	6	3699	3704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077239
53	NC_017554	CGA	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077240
54	NC_017554	GAA	3	9	4109	4117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077240
55	NC_017554	CGG	2	6	4125	4130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077240
56	NC_017554	TGC	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
57	NC_017554	GAC	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077240
58	NC_017554	GGC	2	6	4196	4201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077240
59	NC_017554	TCG	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
60	NC_017554	CAG	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077240
61	NC_017554	GGT	2	6	4517	4522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386077240
62	NC_017554	TTG	2	6	4533	4538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386077240
63	NC_017554	CGG	2	6	4690	4695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077240
64	NC_017554	AAG	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077240
65	NC_017554	TTC	2	6	4882	4887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386077240
66	NC_017554	AGC	2	6	4908	4913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077240
67	NC_017554	CTG	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
68	NC_017554	CTG	2	6	4940	4945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
69	NC_017554	ATT	2	6	4982	4987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386077240
70	NC_017554	CGC	2	6	4990	4995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077240
71	NC_017554	CCG	2	6	5035	5040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077240
72	NC_017554	TGG	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386077240
73	NC_017554	CAT	4	12	5335	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077240
74	NC_017554	CTG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
75	NC_017554	CTT	2	6	5395	5400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386077240
76	NC_017554	GCC	2	6	5452	5457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077240
77	NC_017554	TGC	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
78	NC_017554	ACC	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386077240
79	NC_017554	GGC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077240
80	NC_017554	AGA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077240
81	NC_017554	CGT	2	6	5654	5659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
82	NC_017554	TGC	2	6	5673	5678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
83	NC_017554	GGC	2	6	5933	5938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077240
84	NC_017554	GAA	2	6	5957	5962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077240
85	NC_017554	CGT	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077240
86	NC_017554	CAG	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077240
87	NC_017554	AGC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077240
88	NC_017554	ACC	2	6	6110	6115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386077240
89	NC_017554	GCC	2	6	6129	6134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077240
90	NC_017554	GCC	2	6	6167	6172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386077240
91	NC_017554	CAC	2	6	6184	6189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386077240
92	NC_017554	GCT	2	6	6497	6502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077241
93	NC_017554	GCA	2	6	6509	6514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077241
94	NC_017554	AAT	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386077241
95	NC_017554	ATT	2	6	6733	6738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386077241
96	NC_017554	AGA	2	6	6884	6889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077241
97	NC_017554	TGA	3	9	6919	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077241
98	NC_017554	GCG	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077241
99	NC_017554	TAC	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077241
100	NC_017554	GAA	2	6	7190	7195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077241
101	NC_017554	TTA	2	6	7207	7212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386077241
102	NC_017554	CAT	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077242
103	NC_017554	TCA	2	6	7665	7670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077242
104	NC_017554	GGC	2	6	7759	7764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077242
105	NC_017554	AGC	2	6	7904	7909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077242
106	NC_017554	AGC	2	6	8188	8193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077242
107	NC_017554	GCA	2	6	8297	8302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077242
108	NC_017554	ACC	2	6	8327	8332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386077242
109	NC_017554	GGC	2	6	8365	8370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077242
110	NC_017554	ACA	2	6	8459	8464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386077242
111	NC_017554	GTC	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077242
112	NC_017554	GTT	2	6	8607	8612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386077242
113	NC_017554	TTC	2	6	8660	8665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386077243
114	NC_017554	GCA	2	6	8689	8694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077243
115	NC_017554	TAG	2	6	8739	8744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077243
116	NC_017554	ATA	2	6	8867	8872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386077243
117	NC_017554	GCA	2	6	8930	8935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077243
118	NC_017554	TCA	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386077243
119	NC_017554	TGT	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017554	GCC	2	6	9172	9177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017554	TGG	2	6	9213	9218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017554	TCC	2	6	9358	9363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386077244
123	NC_017554	TGA	2	6	9382	9387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077244
124	NC_017554	TCG	2	6	9570	9575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077244
125	NC_017554	GAA	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386077244
126	NC_017554	TTC	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386077245
127	NC_017554	GCT	2	6	10027	10032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077245
128	NC_017554	TGA	3	9	10154	10162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077245
129	NC_017554	CAG	2	6	10175	10180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077245
130	NC_017554	ATA	2	6	10794	10799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_017554	CGG	2	6	10899	10904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017554	ATT	2	6	10918	10923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_017554	CTG	2	6	18690	18695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077252
256	NC_017554	TGA	2	6	18742	18747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077252
257	NC_017554	CGG	2	6	18755	18760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386077252
258	NC_017554	ACG	2	6	18763	18768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077252
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261	NC_017554	TGA	2	6	19230	19235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386077253
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270	NC_017554	CAG	2	6	20080	20085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386077254
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280	NC_017554	CTG	2	6	20587	20592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386077254
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