MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 14469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017530	GCAG	2	8	385	392	25 %	0 %	50 %	25 %	386009640
2	NC_017530	CCAG	2	8	509	516	25 %	0 %	25 %	50 %	386009640
3	NC_017530	GAAT	2	8	606	613	50 %	25 %	25 %	0 %	386009640
4	NC_017530	CGGC	2	8	1145	1152	0 %	0 %	50 %	50 %	386009642
5	NC_017530	GGCC	2	8	1214	1221	0 %	0 %	50 %	50 %	386009642
6	NC_017530	CGGC	2	8	1667	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	386009642
7	NC_017530	CAGC	2	8	3125	3132	25 %	0 %	25 %	50 %	386009644
8	NC_017530	CATC	2	8	3902	3909	25 %	25 %	0 %	50 %	386009645
9	NC_017530	GCTT	2	8	6056	6063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017530	GGCC	2	8	6679	6686	0 %	0 %	50 %	50 %	386009647
11	NC_017530	GAGC	2	8	6861	6868	25 %	0 %	50 %	25 %	386009647
12	NC_017530	CGAC	2	8	7657	7664	25 %	0 %	25 %	50 %	386009648
13	NC_017530	GGCC	2	8	7780	7787	0 %	0 %	50 %	50 %	386009648
14	NC_017530	CCAG	2	8	8531	8538	25 %	0 %	25 %	50 %	386009648
15	NC_017530	GCAG	2	8	9286	9293	25 %	0 %	50 %	25 %	386009649
16	NC_017530	AAGG	2	8	9347	9354	50 %	0 %	50 %	0 %	386009649
17	NC_017530	CGAC	2	8	9501	9508	25 %	0 %	25 %	50 %	386009649
18	NC_017530	CCCG	2	8	10193	10200	0 %	0 %	25 %	75 %	386009650
19	NC_017530	AGTC	2	8	10374	10381	25 %	25 %	25 %	25 %	386009650
20	NC_017530	TTCA	2	8	10425	10432	25 %	50 %	0 %	25 %	386009650
21	NC_017530	CCGC	2	8	10453	10460	0 %	0 %	25 %	75 %	386009650
22	NC_017530	GCCT	2	8	11265	11272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017530	CAAG	2	8	11574	11581	50 %	0 %	25 %	25 %	386009651
24	NC_017530	GACC	2	8	11692	11699	25 %	0 %	25 %	50 %	386009651
25	NC_017530	CAGG	2	8	11842	11849	25 %	0 %	50 %	25 %	386009651
26	NC_017530	CAAC	2	8	11899	11906	50 %	0 %	0 %	50 %	386009651
27	NC_017530	GCTG	2	8	12597	12604	0 %	25 %	50 %	25 %	386009653
28	NC_017530	ATGG	2	8	13247	13254	25 %	25 %	50 %	0 %	386009654
29	NC_017530	GGCC	2	8	13327	13334	0 %	0 %	50 %	50 %	386009654
30	NC_017530	CCTT	2	8	13347	13354	0 %	50 %	0 %	50 %	386009654
31	NC_017530	GTCG	2	8	13406	13413	0 %	25 %	50 %	25 %	386009654
32	NC_017530	CTTG	2	8	13414	13421	0 %	50 %	25 %	25 %	386009654
33	NC_017530	TCGA	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	386009654
34	NC_017530	TCGG	2	8	13584	13591	0 %	25 %	50 %	25 %	386009654
35	NC_017530	TGAA	2	8	14388	14395	50 %	25 %	25 %	0 %	386009654
36	NC_017530	ACGA	2	8	15502	15509	50 %	0 %	25 %	25 %	386009655
37	NC_017530	CGCA	2	8	15643	15650	25 %	0 %	25 %	50 %	386009655
38	NC_017530	GCAC	2	8	16367	16374	25 %	0 %	25 %	50 %	386009655
39	NC_017530	GCCA	2	8	16766	16773	25 %	0 %	25 %	50 %	386009656
40	NC_017530	CTGG	2	8	18178	18185	0 %	25 %	50 %	25 %	386009657
41	NC_017530	AACG	2	8	18895	18902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017530	GATG	2	8	19174	19181	25 %	25 %	50 %	0 %	386009658
43	NC_017530	GGGC	2	8	19890	19897	0 %	0 %	75 %	25 %	386009658
44	NC_017530	GGCA	2	8	20339	20346	25 %	0 %	50 %	25 %	386009658
45	NC_017530	CAGC	2	8	20459	20466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017530	GGCA	2	8	20828	20835	25 %	0 %	50 %	25 %	386009659
47	NC_017530	CAGC	2	8	21878	21885	25 %	0 %	25 %	50 %	386009659
48	NC_017530	CCTT	2	8	22180	22187	0 %	50 %	0 %	50 %	386009659
49	NC_017530	CGTG	2	8	22478	22485	0 %	25 %	50 %	25 %	386009659
50	NC_017530	GGCC	2	8	23107	23114	0 %	0 %	50 %	50 %	386009660
51	NC_017530	CTAC	2	8	23544	23551	25 %	25 %	0 %	50 %	386009660
52	NC_017530	ACCT	2	8	24064	24071	25 %	25 %	0 %	50 %	386009661
53	NC_017530	GGCG	2	8	25004	25011	0 %	0 %	75 %	25 %	386009662
54	NC_017530	CAGA	2	8	25968	25975	50 %	0 %	25 %	25 %	386009662
55	NC_017530	GCAT	2	8	26179	26186	25 %	25 %	25 %	25 %	386009662
56	NC_017530	GAGC	2	8	26254	26261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017530	ATGC	2	8	26641	26648	25 %	25 %	25 %	25 %	386009663
58	NC_017530	GTCG	2	8	26684	26691	0 %	25 %	50 %	25 %	386009663
59	NC_017530	CCTT	2	8	26737	26744	0 %	50 %	0 %	50 %	386009663
60	NC_017530	ACCC	2	8	27209	27216	25 %	0 %	0 %	75 %	386009664
61	NC_017530	GCCC	2	8	27306	27313	0 %	0 %	25 %	75 %	386009664
62	NC_017530	TCGC	2	8	27598	27605	0 %	25 %	25 %	50 %	386009664
63	NC_017530	GCCA	2	8	28642	28649	25 %	0 %	25 %	50 %	386009666
64	NC_017530	TGGG	2	8	29343	29350	0 %	25 %	75 %	0 %	386009666
65	NC_017530	GCCA	2	8	29410	29417	25 %	0 %	25 %	50 %	386009667
66	NC_017530	AACG	2	8	29766	29773	50 %	0 %	25 %	25 %	386009667
67	NC_017530	GCAT	2	8	30122	30129	25 %	25 %	25 %	25 %	386009668
68	NC_017530	GCCA	2	8	30287	30294	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
69	NC_017530	CAGC	2	8	30518	30525	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
70	NC_017530	AATA	2	8	30948	30955	75 %	25 %	0 %	0 %	386009668
71	NC_017530	GACG	2	8	31323	31330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017530	TGCC	2	8	31391	31398	0 %	25 %	25 %	50 %	386009669
73	NC_017530	TGGG	2	8	31624	31631	0 %	25 %	75 %	0 %	386009669
74	NC_017530	GCCT	2	8	31803	31810	0 %	25 %	25 %	50 %	386009670
75	NC_017530	CGGT	2	8	32199	32206	0 %	25 %	50 %	25 %	386009671
76	NC_017530	CCGC	2	8	32943	32950	0 %	0 %	25 %	75 %	386009672
77	NC_017530	GCCT	2	8	33461	33468	0 %	25 %	25 %	50 %	386009672
78	NC_017530	ATTC	2	8	33626	33633	25 %	50 %	0 %	25 %	386009672
79	NC_017530	CGAT	2	8	34510	34517	25 %	25 %	25 %	25 %	386009673
80	NC_017530	GCCC	2	8	34850	34857	0 %	0 %	25 %	75 %	386009673
81	NC_017530	TGGG	2	8	35217	35224	0 %	25 %	75 %	0 %	386009673
82	NC_017530	AGCA	2	8	35358	35365	50 %	0 %	25 %	25 %	386009673
83	NC_017530	CCTG	2	8	35695	35702	0 %	25 %	25 %	50 %	386009674
84	NC_017530	CAAG	2	8	36251	36258	50 %	0 %	25 %	25 %	386009674
85	NC_017530	CCCG	2	8	36631	36638	0 %	0 %	25 %	75 %	386009674
86	NC_017530	ATCA	2	8	36738	36745	50 %	25 %	0 %	25 %	386009674
87	NC_017530	GGCT	2	8	37019	37026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017530	AGCG	2	8	37367	37374	25 %	0 %	50 %	25 %	386009675
89	NC_017530	TGCG	2	8	38207	38214	0 %	25 %	50 %	25 %	386009676
90	NC_017530	CAGG	2	8	38490	38497	25 %	0 %	50 %	25 %	386009676
91	NC_017530	ACCG	2	8	38499	38506	25 %	0 %	25 %	50 %	386009676
92	NC_017530	AGGC	2	8	39339	39346	25 %	0 %	50 %	25 %	386009677
93	NC_017530	GCCC	2	8	39669	39676	0 %	0 %	25 %	75 %	386009677
94	NC_017530	AGGT	2	8	40331	40338	25 %	25 %	50 %	0 %	386009678
95	NC_017530	TGAA	2	8	41180	41187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017530	GCGA	2	8	41211	41218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017530	GTCA	2	8	41355	41362	25 %	25 %	25 %	25 %	386009679
98	NC_017530	GGCC	2	8	41845	41852	0 %	0 %	50 %	50 %	386009679
99	NC_017530	CGCC	2	8	41873	41880	0 %	0 %	25 %	75 %	386009679
100	NC_017530	TGGA	2	8	42108	42115	25 %	25 %	50 %	0 %	386009679
101	NC_017530	GGTT	2	8	42253	42260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017530	GCGT	2	8	42547	42554	0 %	25 %	50 %	25 %	386009680
103	NC_017530	GGCT	2	8	43332	43339	0 %	25 %	50 %	25 %	386009680
104	NC_017530	CAAG	2	8	43390	43397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017530	CGCC	2	8	43775	43782	0 %	0 %	25 %	75 %	386009681
106	NC_017530	CGCT	2	8	44899	44906	0 %	25 %	25 %	50 %	386009682
107	NC_017530	GGGC	2	8	45448	45455	0 %	0 %	75 %	25 %	386009683
108	NC_017530	GCTC	2	8	45834	45841	0 %	25 %	25 %	50 %	386009683
109	NC_017530	AAAC	2	8	47906	47913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017530	TGCG	2	8	48010	48017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017530	GCCT	2	8	48791	48798	0 %	25 %	25 %	50 %	386009685
112	NC_017530	CAGC	2	8	50373	50380	25 %	0 %	25 %	50 %	386009686
113	NC_017530	CAAA	2	8	50891	50898	75 %	0 %	0 %	25 %	386009687
114	NC_017530	ATAC	2	8	50945	50952	50 %	25 %	0 %	25 %	386009687
115	NC_017530	AGCG	2	8	51415	51422	25 %	0 %	50 %	25 %	386009687
116	NC_017530	CCAA	2	8	51587	51594	50 %	0 %	0 %	50 %	386009687
117	NC_017530	AGCC	2	8	51958	51965	25 %	0 %	25 %	50 %	386009687
118	NC_017530	TCTT	2	8	52699	52706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017530	TGGT	2	8	52948	52955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017530	CAGA	2	8	53322	53329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017530	GCTG	2	8	54079	54086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017530	AGCC	2	8	54556	54563	25 %	0 %	25 %	50 %	386009689
123	NC_017530	TTCA	2	8	55153	55160	25 %	50 %	0 %	25 %	386009689
124	NC_017530	CAAT	2	8	56287	56294	50 %	25 %	0 %	25 %	386009690
125	NC_017530	TTCC	2	8	56302	56309	0 %	50 %	0 %	50 %	386009690
126	NC_017530	CAAG	2	8	56608	56615	50 %	0 %	25 %	25 %	386009690
127	NC_017530	GGCA	2	8	57173	57180	25 %	0 %	50 %	25 %	386009691
128	NC_017530	TGCG	2	8	57294	57301	0 %	25 %	50 %	25 %	386009691
129	NC_017530	ATGT	2	8	57513	57520	25 %	50 %	25 %	0 %	386009691
130	NC_017530	AAGC	2	8	58255	58262	50 %	0 %	25 %	25 %	386009692
131	NC_017530	GAAG	2	8	58620	58627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017530	AGCG	2	8	58687	58694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017530	GCAC	2	8	58992	58999	25 %	0 %	25 %	50 %	386009693
134	NC_017530	CCAG	2	8	59665	59672	25 %	0 %	25 %	50 %	386009693
135	NC_017530	TGCG	2	8	60088	60095	0 %	25 %	50 %	25 %	386009693
136	NC_017530	CTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	50 %	25 %	386009694
137	NC_017530	TCGA	2	8	61566	61573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017530	AGGT	2	8	61867	61874	25 %	25 %	50 %	0 %	386009695
139	NC_017530	GGTG	2	8	61904	61911	0 %	25 %	75 %	0 %	386009695
140	NC_017530	GTCA	2	8	62367	62374	25 %	25 %	25 %	25 %	386009695
141	NC_017530	CCTT	2	8	62464	62471	0 %	50 %	0 %	50 %	386009695
142	NC_017530	CACG	2	8	62537	62544	25 %	0 %	25 %	50 %	386009695
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