MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-8

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017019	AGG	2	6	146	151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017019	TAA	2	6	342	347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017019	CAA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017019	AGC	2	6	521	526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017019	TTC	2	6	540	545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280287
6	NC_017019	CAC	2	6	579	584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280287
7	NC_017019	CGT	2	6	730	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
8	NC_017019	AGC	2	6	871	876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280287
9	NC_017019	GCT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
10	NC_017019	GTC	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
11	NC_017019	TCA	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
12	NC_017019	AGC	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280287
13	NC_017019	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280287
14	NC_017019	TCA	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
15	NC_017019	ATT	2	6	1459	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280287
16	NC_017019	GTT	2	6	1491	1496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381280287
17	NC_017019	CTT	2	6	1561	1566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280287
18	NC_017019	GTA	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280287
19	NC_017019	ATC	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
20	NC_017019	CTG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
21	NC_017019	CTT	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280287
22	NC_017019	ACT	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
23	NC_017019	CCT	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017019	AGT	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017019	CAC	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017019	TCT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017019	GTG	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017019	ATG	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017019	CTA	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017019	AGT	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280288
31	NC_017019	CTT	2	6	2680	2685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280288
32	NC_017019	TAC	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280288
33	NC_017019	AAT	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280288
34	NC_017019	AAG	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280288
35	NC_017019	GAA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280288
36	NC_017019	AAG	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280288
37	NC_017019	TAT	2	6	3282	3287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280288
38	NC_017019	AGA	2	6	3550	3555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280289
39	NC_017019	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280289
40	NC_017019	TCC	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	381280289
41	NC_017019	TTG	2	6	3848	3853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017019	AGA	2	6	3979	3984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017019	TTA	2	6	4008	4013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017019	CTA	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017019	TAA	2	6	4158	4163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280290
46	NC_017019	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280290
47	NC_017019	TAA	2	6	4302	4307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280290
48	NC_017019	TCT	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280291
49	NC_017019	GCG	2	6	4636	4641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381280291
50	NC_017019	CGT	2	6	4877	4882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280291
51	NC_017019	ACT	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280291
52	NC_017019	CGC	2	6	4950	4955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381280291
53	NC_017019	TTC	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280291
54	NC_017019	TCA	2	6	5093	5098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280291
55	NC_017019	TCC	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017019	TTC	2	6	5218	5223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017019	TGT	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017019	GTC	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280292
59	NC_017019	GCA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280292
60	NC_017019	TTG	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381280292
61	NC_017019	GTA	3	9	5668	5676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280292
62	NC_017019	TCA	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280292
63	NC_017019	CAG	2	6	5929	5934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280292
64	NC_017019	TCA	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280292
65	NC_017019	AAG	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280292
66	NC_017019	TGC	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280292
67	NC_017019	TAA	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280293
68	NC_017019	TTC	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280293
69	NC_017019	CTT	2	6	6368	6373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280293
70	NC_017019	GCT	2	6	6392	6397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280293
71	NC_017019	CAT	3	9	6461	6469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280293
72	NC_017019	GTG	2	6	6529	6534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381280293
73	NC_017019	ATA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280293
74	NC_017019	TCA	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280293
75	NC_017019	ACA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280293
76	NC_017019	AAT	2	6	6829	6834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280293
77	NC_017019	ACC	2	6	6853	6858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280293
78	NC_017019	GCC	2	6	7046	7051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381280293
79	NC_017019	ATC	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280293
80	NC_017019	GTT	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381280294
81	NC_017019	ACC	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280294
82	NC_017019	CAC	2	6	7612	7617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280294
83	NC_017019	GAC	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280294
84	NC_017019	CGA	2	6	7636	7641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280294
85	NC_017019	ACA	2	6	7836	7841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280294
86	NC_017019	GAC	2	6	7856	7861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280294
87	NC_017019	TGG	2	6	7918	7923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381280294
88	NC_017019	TCA	3	9	7950	7958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280294
89	NC_017019	TTC	2	6	8015	8020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017019	ATT	2	6	8067	8072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017019	ATG	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017019	CAT	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017019	CTG	2	6	8310	8315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280295
94	NC_017019	ATC	2	6	8382	8387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280295
95	NC_017019	ATT	2	6	8457	8462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280295
96	NC_017019	CTT	2	6	8489	8494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280295
97	NC_017019	CGT	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280295
98	NC_017019	AAC	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280295
99	NC_017019	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280295
100	NC_017019	AAG	2	6	8947	8952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280295
101	NC_017019	ATG	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280295
102	NC_017019	ATT	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280295
103	NC_017019	GAA	2	6	9195	9200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280295
104	NC_017019	CGG	2	6	9350	9355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381280295
105	NC_017019	GCA	2	6	9409	9414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280295
106	NC_017019	AGA	2	6	9607	9612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280295
107	NC_017019	ATG	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280295
108	NC_017019	AAC	2	6	9806	9811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280295
109	NC_017019	CGA	2	6	9851	9856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280295
110	NC_017019	CCA	2	6	9899	9904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280295
111	NC_017019	CGA	2	6	9958	9963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280295
112	NC_017019	TTC	2	6	10122	10127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017019	AAT	2	6	10192	10197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017019	ATC	2	6	10312	10317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280296
115	NC_017019	CTG	2	6	10447	10452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280296
116	NC_017019	ATC	2	6	10523	10528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280296
117	NC_017019	GCA	2	6	10540	10545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280296
118	NC_017019	TCA	2	6	10593	10598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280296
119	NC_017019	TGA	2	6	10637	10642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280296
120	NC_017019	GAA	2	6	10645	10650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280296
121	NC_017019	CAA	2	6	10677	10682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280296
122	NC_017019	TGA	2	6	10964	10969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280296
123	NC_017019	AAT	2	6	11044	11049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280296
124	NC_017019	TCA	2	6	11121	11126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017019	GCA	2	6	11210	11215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017019	ATT	2	6	11360	11365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017019	TAA	2	6	11446	11451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017019	ATA	2	6	11466	11471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017019	TCG	2	6	11472	11477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017019	AAC	2	6	11721	11726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017019	CGT	2	6	11740	11745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017019	GTG	2	6	11763	11768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017019	TCA	2	6	11847	11852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017019	TCA	2	6	11902	11907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017019	ATC	2	6	11997	12002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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388	NC_017019	GAG	2	6	33085	33090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
389	NC_017019	CCA	2	6	33237	33242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.