MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Pyrobaculum oguniense TE7 chromosome

Total Repeats: 1582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016885	GCGCC	2	10	1535	1544	0 %	0 %	40 %	60 %	379002966
2	NC_016885	CGGCG	2	10	2927	2936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016885	GGCCA	2	10	3933	3942	20 %	0 %	40 %	40 %	379002967
4	NC_016885	CCGCG	2	10	4289	4298	0 %	0 %	40 %	60 %	379002968
5	NC_016885	TGAGC	2	10	4659	4668	20 %	20 %	40 %	20 %	379002968
6	NC_016885	CCCCA	2	10	5718	5727	20 %	0 %	0 %	80 %	379002969
7	NC_016885	ACGCC	2	10	6123	6132	20 %	0 %	20 %	60 %	379002970
8	NC_016885	ATAGT	2	10	8289	8298	40 %	40 %	20 %	0 %	379002972
9	NC_016885	GGGCT	2	10	8916	8925	0 %	20 %	60 %	20 %	379002972
10	NC_016885	GGAGG	2	10	9769	9778	20 %	0 %	80 %	0 %	379002974
11	NC_016885	GAGGC	2	10	11204	11213	20 %	0 %	60 %	20 %	379002974
12	NC_016885	TCGGC	2	10	14683	14692	0 %	20 %	40 %	40 %	379002976
13	NC_016885	CATAT	2	10	15498	15507	40 %	40 %	0 %	20 %	379002976
14	NC_016885	GGCGA	2	10	16952	16961	20 %	0 %	60 %	20 %	379002979
15	NC_016885	AGAAA	2	10	16997	17006	80 %	0 %	20 %	0 %	379002979
16	NC_016885	AGGAG	2	10	17283	17292	40 %	0 %	60 %	0 %	379002979
17	NC_016885	CTACC	2	10	19635	19644	20 %	20 %	0 %	60 %	379002980
18	NC_016885	ACACC	2	10	20673	20682	40 %	0 %	0 %	60 %	379002982
19	NC_016885	ATCAA	2	10	22996	23005	60 %	20 %	0 %	20 %	379002985
20	NC_016885	TTCAC	2	10	23919	23928	20 %	40 %	0 %	40 %	379002986
21	NC_016885	CCACT	2	10	26288	26297	20 %	20 %	0 %	60 %	379002989
22	NC_016885	CGGGG	2	10	26706	26715	0 %	0 %	80 %	20 %	379002989
23	NC_016885	ACCCA	2	10	28145	28154	40 %	0 %	0 %	60 %	379002991
24	NC_016885	CTACG	2	10	29275	29284	20 %	20 %	20 %	40 %	379002993
25	NC_016885	GCCCC	2	10	31154	31163	0 %	0 %	20 %	80 %	379002994
26	NC_016885	CCCTC	2	10	32277	32286	0 %	20 %	0 %	80 %	379002995
27	NC_016885	TAACG	2	10	35102	35111	40 %	20 %	20 %	20 %	379002998
28	NC_016885	GGGGC	2	10	36544	36553	0 %	0 %	80 %	20 %	379003000
29	NC_016885	GCAGT	2	10	36670	36679	20 %	20 %	40 %	20 %	379003000
30	NC_016885	CCCAC	2	10	41605	41614	20 %	0 %	0 %	80 %	379003008
31	NC_016885	GAGGG	2	10	42991	43000	20 %	0 %	80 %	0 %	379003011
32	NC_016885	CAAAC	2	10	43776	43785	60 %	0 %	0 %	40 %	379003012
33	NC_016885	AGAGT	2	10	44173	44182	40 %	20 %	40 %	0 %	379003013
34	NC_016885	TAATA	2	10	44374	44383	60 %	40 %	0 %	0 %	379003013
35	NC_016885	TCCAG	2	10	44408	44417	20 %	20 %	20 %	40 %	379003013
36	NC_016885	TAGTA	2	10	44566	44575	40 %	40 %	20 %	0 %	379003013
37	NC_016885	CAAAA	2	10	45963	45972	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016885	CTGGG	2	10	47931	47940	0 %	20 %	60 %	20 %	379003016
39	NC_016885	GTACA	2	10	47974	47983	40 %	20 %	20 %	20 %	379003016
40	NC_016885	CTGAG	2	10	51168	51177	20 %	20 %	40 %	20 %	379003019
41	NC_016885	ACGCC	2	10	52277	52286	20 %	0 %	20 %	60 %	379003021
42	NC_016885	ATAGT	2	10	53313	53322	40 %	40 %	20 %	0 %	379003022
43	NC_016885	TTCCC	2	10	53340	53349	0 %	40 %	0 %	60 %	379003022
44	NC_016885	CTGCG	2	10	53443	53452	0 %	20 %	40 %	40 %	379003022
45	NC_016885	ACGTC	2	10	53886	53895	20 %	20 %	20 %	40 %	379003022
46	NC_016885	TCTGC	2	10	56168	56177	0 %	40 %	20 %	40 %	379003025
47	NC_016885	CCTCT	2	10	57620	57629	0 %	40 %	0 %	60 %	379003026
48	NC_016885	CCTCC	2	10	57635	57644	0 %	20 %	0 %	80 %	379003026
49	NC_016885	GCTGG	2	10	60218	60227	0 %	20 %	60 %	20 %	379003028
50	NC_016885	GATAG	2	10	60868	60877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016885	TTACG	2	10	63464	63473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016885	CCTGG	2	10	65391	65400	0 %	20 %	40 %	40 %	379003034
53	NC_016885	TCCCC	2	10	65681	65690	0 %	20 %	0 %	80 %	379003034
54	NC_016885	CTGTC	2	10	68743	68752	0 %	40 %	20 %	40 %	379003039
55	NC_016885	GGGGC	2	10	70575	70584	0 %	0 %	80 %	20 %	379003041
56	NC_016885	CGCGG	2	10	70788	70797	0 %	0 %	60 %	40 %	379003041
57	NC_016885	GGCGG	2	10	71385	71394	0 %	0 %	80 %	20 %	379003043
58	NC_016885	CGGCG	2	10	73225	73234	0 %	0 %	60 %	40 %	379003043
59	NC_016885	GCCGC	2	10	75983	75992	0 %	0 %	40 %	60 %	379003046
60	NC_016885	CGAGG	2	10	76727	76736	20 %	0 %	60 %	20 %	379003047
61	NC_016885	CGGGT	2	10	76834	76843	0 %	20 %	60 %	20 %	379003047
62	NC_016885	GGCGG	2	10	77143	77152	0 %	0 %	80 %	20 %	379003048
63	NC_016885	AGGGC	2	10	77257	77266	20 %	0 %	60 %	20 %	379003048
64	NC_016885	CTGGA	2	10	77634	77643	20 %	20 %	40 %	20 %	379003048
65	NC_016885	CGAGG	2	10	80275	80284	20 %	0 %	60 %	20 %	379003053
66	NC_016885	GGCGC	2	10	80490	80499	0 %	0 %	60 %	40 %	379003054
67	NC_016885	ACACC	2	10	80866	80875	40 %	0 %	0 %	60 %	379003054
68	NC_016885	GAGGG	2	10	82040	82049	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016885	ACGGG	2	10	85654	85663	20 %	0 %	60 %	20 %	379003059
70	NC_016885	AGGAG	2	10	86559	86568	40 %	0 %	60 %	0 %	379003060
71	NC_016885	CGGCG	2	10	87412	87421	0 %	0 %	60 %	40 %	379003061
72	NC_016885	GGAGG	2	10	87890	87899	20 %	0 %	80 %	0 %	379003062
73	NC_016885	AGGCG	2	10	89325	89334	20 %	0 %	60 %	20 %	379003064
74	NC_016885	GGAGG	2	10	89553	89562	20 %	0 %	80 %	0 %	379003064
75	NC_016885	TGAGG	2	10	91247	91256	20 %	20 %	60 %	0 %	379003064
76	NC_016885	AACTC	2	10	96898	96907	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016885	ACCTA	2	10	99427	99436	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016885	AATGT	2	10	103131	103140	40 %	40 %	20 %	0 %	379003079
79	NC_016885	GCTTC	2	10	104757	104766	0 %	40 %	20 %	40 %	379003081
80	NC_016885	GGATA	2	10	107189	107198	40 %	20 %	40 %	0 %	379003084
81	NC_016885	TTGTT	2	10	107230	107239	0 %	80 %	20 %	0 %	379003084
82	NC_016885	GATAA	2	10	112564	112573	60 %	20 %	20 %	0 %	379003090
83	NC_016885	ACGAG	2	10	113649	113658	40 %	0 %	40 %	20 %	379003091
84	NC_016885	CACAT	2	10	118586	118595	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016885	TAGAC	2	10	119018	119027	40 %	20 %	20 %	20 %	379003094
86	NC_016885	GACAA	2	10	120083	120092	60 %	0 %	20 %	20 %	379003096
87	NC_016885	AGGAG	2	10	120363	120372	40 %	0 %	60 %	0 %	379003096
88	NC_016885	ATTTC	2	10	124832	124841	20 %	60 %	0 %	20 %	379003102
89	NC_016885	GTTAT	2	10	125330	125339	20 %	60 %	20 %	0 %	379003102
90	NC_016885	GGCGA	2	10	125582	125591	20 %	0 %	60 %	20 %	379003103
91	NC_016885	CTTCT	2	10	128106	128115	0 %	60 %	0 %	40 %	379003108
92	NC_016885	AGCTG	2	10	129319	129328	20 %	20 %	40 %	20 %	379003109
93	NC_016885	CACGC	2	10	130801	130810	20 %	0 %	20 %	60 %	379003111
94	NC_016885	CTCGG	2	10	131727	131736	0 %	20 %	40 %	40 %	379003113
95	NC_016885	ACATC	2	10	133258	133267	40 %	20 %	0 %	40 %	379003115
96	NC_016885	GGTTA	2	10	133994	134003	20 %	40 %	40 %	0 %	379003115
97	NC_016885	TCTTT	2	10	134110	134119	0 %	80 %	0 %	20 %	379003115
98	NC_016885	CTCTG	2	10	138347	138356	0 %	40 %	20 %	40 %	379003122
99	NC_016885	GGTGA	2	10	138803	138812	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016885	TGTGG	2	10	141417	141426	0 %	40 %	60 %	0 %	379003125
101	NC_016885	TGCCC	2	10	143130	143139	0 %	20 %	20 %	60 %	379003128
102	NC_016885	CTACA	2	10	143560	143569	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016885	AGGAG	2	10	144423	144432	40 %	0 %	60 %	0 %	379003129
104	NC_016885	CGTGG	2	10	144634	144643	0 %	20 %	60 %	20 %	379003129
105	NC_016885	ACGTC	2	10	146375	146384	20 %	20 %	20 %	40 %	379003131
106	NC_016885	TGTGG	2	10	147819	147828	0 %	40 %	60 %	0 %	379003133
107	NC_016885	TGGCG	2	10	152014	152023	0 %	20 %	60 %	20 %	379003137
108	NC_016885	AATGC	2	10	153260	153269	40 %	20 %	20 %	20 %	379003140
109	NC_016885	TCCAC	2	10	159649	159658	20 %	20 %	0 %	60 %	379003150
110	NC_016885	CCTCC	2	10	162259	162268	0 %	20 %	0 %	80 %	379003154
111	NC_016885	GCCTC	2	10	162357	162366	0 %	20 %	20 %	60 %	379003154
112	NC_016885	CTGTA	2	10	162644	162653	20 %	40 %	20 %	20 %	379003155
113	NC_016885	GGCAC	2	10	164143	164152	20 %	0 %	40 %	40 %	379003157
114	NC_016885	ACAGA	2	10	171287	171296	60 %	0 %	20 %	20 %	379003167
115	NC_016885	AAGCG	2	10	175798	175807	40 %	0 %	40 %	20 %	379003173
116	NC_016885	CCGCG	2	10	176656	176665	0 %	0 %	40 %	60 %	379003174
117	NC_016885	CAAAG	2	10	177932	177941	60 %	0 %	20 %	20 %	379003175
118	NC_016885	GCTCA	2	10	179892	179901	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016885	CTGAC	2	10	180820	180829	20 %	20 %	20 %	40 %	379003178
120	NC_016885	TGTGG	2	10	185402	185411	0 %	40 %	60 %	0 %	379003182
121	NC_016885	GTGGC	2	10	187643	187652	0 %	20 %	60 %	20 %	379003185
122	NC_016885	CAAGC	2	10	190423	190432	40 %	0 %	20 %	40 %	379003189
123	NC_016885	ATATC	2	10	191795	191804	40 %	40 %	0 %	20 %	379003190
124	NC_016885	TGGCG	2	10	193413	193422	0 %	20 %	60 %	20 %	379003190
125	NC_016885	AGGAG	2	10	195543	195552	40 %	0 %	60 %	0 %	379003192
126	NC_016885	GCAGG	2	10	197983	197992	20 %	0 %	60 %	20 %	379003195
127	NC_016885	TCCAC	2	10	200929	200938	20 %	20 %	0 %	60 %	379003200
128	NC_016885	CCCAC	2	10	202530	202539	20 %	0 %	0 %	80 %	379003202
129	NC_016885	GTGAA	2	10	202631	202640	40 %	20 %	40 %	0 %	379003202
130	NC_016885	TCCAC	2	10	202890	202899	20 %	20 %	0 %	60 %	379003202
131	NC_016885	CGGGG	2	10	203638	203647	0 %	0 %	80 %	20 %	379003204
132	NC_016885	AGGGC	2	10	204827	204836	20 %	0 %	60 %	20 %	379003205
133	NC_016885	AGGCA	2	10	208435	208444	40 %	0 %	40 %	20 %	379003208
134	NC_016885	AGATG	2	10	210008	210017	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016885	GTGCA	2	10	210499	210508	20 %	20 %	40 %	20 %	379003210
136	NC_016885	TGCCT	2	10	214681	214690	0 %	40 %	20 %	40 %	379003212
137	NC_016885	GCCTG	2	10	215448	215457	0 %	20 %	40 %	40 %	379003213
138	NC_016885	CTCTT	2	10	221745	221754	0 %	60 %	0 %	40 %	379003219
139	NC_016885	TCGCC	2	10	222412	222421	0 %	20 %	20 %	60 %	379003220
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141	NC_016885	TGGCG	2	10	223821	223830	0 %	20 %	60 %	20 %	379003221
142	NC_016885	AGGCT	2	10	224030	224039	20 %	20 %	40 %	20 %	379003221
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144	NC_016885	GCCTT	2	10	227022	227031	0 %	40 %	20 %	40 %	379003225
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149	NC_016885	TGGTG	2	10	237889	237898	0 %	40 %	60 %	0 %	379003234
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151	NC_016885	GCGTT	2	10	248938	248947	0 %	40 %	40 %	20 %	379003248
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161	NC_016885	ACGCC	2	10	275731	275740	20 %	0 %	20 %	60 %	379003283
162	NC_016885	TGAGT	2	10	276820	276829	20 %	40 %	40 %	0 %	379003285
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168	NC_016885	AGTTT	2	10	290623	290632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016885	CGGTT	2	10	290863	290872	0 %	40 %	40 %	20 %	379003305
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172	NC_016885	GTGCT	2	10	295859	295868	0 %	40 %	40 %	20 %	379003312
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197	NC_016885	GCAAC	2	10	328876	328885	40 %	0 %	20 %	40 %	379003352
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213	NC_016885	CCATA	2	10	365775	365784	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
214	NC_016885	AGGGG	2	10	368093	368102	20 %	0 %	80 %	0 %	379003404
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218	NC_016885	AGGCG	2	10	374095	374104	20 %	0 %	60 %	20 %	379003410
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222	NC_016885	AATCT	2	10	378643	378652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
223	NC_016885	CGGAT	2	10	382856	382865	20 %	20 %	40 %	20 %	379003421
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249	NC_016885	GCAAG	2	10	425080	425089	40 %	0 %	40 %	20 %	379003471
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251	NC_016885	GAGGG	2	10	427321	427330	20 %	0 %	80 %	0 %	379003472
252	NC_016885	AGCTC	2	10	428244	428253	20 %	20 %	20 %	40 %	379003472
253	NC_016885	TTTAC	2	10	428316	428325	20 %	60 %	0 %	20 %	379003472
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258	NC_016885	CTTTT	2	10	436831	436840	0 %	80 %	0 %	20 %	379003482
259	NC_016885	GGGCT	2	10	439756	439765	0 %	20 %	60 %	20 %	379003489
260	NC_016885	CCTCG	2	10	441393	441402	0 %	20 %	20 %	60 %	379003490
261	NC_016885	ACACC	2	10	441935	441944	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
262	NC_016885	AAGAA	2	10	442978	442987	80 %	0 %	20 %	0 %	379003493
263	NC_016885	CTACG	2	10	444406	444415	20 %	20 %	20 %	40 %	379003494
264	NC_016885	TGAGT	2	10	450086	450095	20 %	40 %	40 %	0 %	379003499
265	NC_016885	AAGGA	2	10	450204	450213	60 %	0 %	40 %	0 %	379003499
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399	NC_016885	CCTCG	2	10	657228	657237	0 %	20 %	20 %	60 %	379003738
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401	NC_016885	GCCCC	2	10	659190	659199	0 %	0 %	20 %	80 %	379003740
402	NC_016885	CTGCG	2	10	659683	659692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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433	NC_016885	ACCGT	2	10	696988	696997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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442	NC_016885	CAGCC	2	10	706956	706965	20 %	0 %	20 %	60 %	379003794
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