MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pyrobaculum sp. 1860 chromosome

Total Repeats: 42248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016645	CGG	2	6	19	24	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016645	CGC	2	6	83	88	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016645	GGA	2	6	194	199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016645	AAG	2	6	349	354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374325526
5	NC_016645	CAG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325526
6	NC_016645	GCG	3	9	443	451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325526
7	NC_016645	GCG	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325526
8	NC_016645	GCC	2	6	508	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325526
9	NC_016645	GTG	2	6	543	548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325526
10	NC_016645	CTA	2	6	573	578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325526
11	NC_016645	CTA	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325526
12	NC_016645	GTG	2	6	700	705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325526
13	NC_016645	GCC	2	6	721	726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325526
14	NC_016645	ACT	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325526
15	NC_016645	AAT	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374325527
16	NC_016645	CCT	2	6	894	899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374325527
17	NC_016645	CAT	2	6	901	906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325527
18	NC_016645	CGC	2	6	1015	1020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325527
19	NC_016645	TGG	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325527
20	NC_016645	GGC	3	9	1081	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325527
21	NC_016645	CCT	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374325527
22	NC_016645	CGC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325527
23	NC_016645	CGC	2	6	1299	1304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325527
24	NC_016645	CGC	2	6	1384	1389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325527
25	NC_016645	CCT	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374325527
26	NC_016645	CGC	2	6	1429	1434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325527
27	NC_016645	CCT	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374325527
28	NC_016645	GCC	3	9	1616	1624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325527
29	NC_016645	CCG	2	6	1659	1664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325527
30	NC_016645	GAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
31	NC_016645	GTG	2	6	1840	1845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
32	NC_016645	TGG	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
33	NC_016645	ACG	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325528
34	NC_016645	AGG	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
35	NC_016645	GCC	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
36	NC_016645	GCC	2	6	2026	2031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
37	NC_016645	CGC	2	6	2034	2039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
38	NC_016645	GTT	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374325528
39	NC_016645	CGG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
40	NC_016645	GCC	3	9	2098	2106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
41	NC_016645	GCG	2	6	2146	2151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
42	NC_016645	ATG	2	6	2179	2184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374325528
43	NC_016645	CAT	2	6	2193	2198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325528
44	NC_016645	TTC	2	6	2242	2247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374325528
45	NC_016645	CTC	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374325528
46	NC_016645	TAC	2	6	2267	2272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325528
47	NC_016645	GTT	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374325528
48	NC_016645	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374325528
49	NC_016645	CTT	2	6	2592	2597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374325528
50	NC_016645	GAA	2	6	2610	2615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374325528
51	NC_016645	GGC	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
52	NC_016645	GTG	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
53	NC_016645	TGG	2	6	2657	2662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
54	NC_016645	ACT	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325528
55	NC_016645	TAC	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325528
56	NC_016645	AAG	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374325528
57	NC_016645	ACA	3	9	2963	2971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374325528
58	NC_016645	CTC	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374325528
59	NC_016645	GCC	2	6	3027	3032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
60	NC_016645	GGC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
61	NC_016645	ACG	2	6	3089	3094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325528
62	NC_016645	CGA	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325528
63	NC_016645	CGG	2	6	3137	3142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
64	NC_016645	TCA	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325528
65	NC_016645	GTG	2	6	3231	3236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
66	NC_016645	GTG	2	6	3282	3287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
67	NC_016645	GAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
68	NC_016645	GAG	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
69	NC_016645	GAG	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
70	NC_016645	GCC	2	6	3486	3491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
71	NC_016645	GCG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
72	NC_016645	CGG	2	6	3594	3599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
73	NC_016645	ACG	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325528
74	NC_016645	CTG	2	6	3691	3696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374325528
75	NC_016645	CTT	2	6	3810	3815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374325528
76	NC_016645	CTG	2	6	3820	3825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374325528
77	NC_016645	CGG	2	6	3899	3904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
78	NC_016645	CTA	3	9	3918	3926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325528
79	NC_016645	ACA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374325528
80	NC_016645	AGG	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
81	NC_016645	TGA	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374325528
82	NC_016645	CCG	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
83	NC_016645	GGC	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
84	NC_016645	CCG	2	6	4265	4270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
85	NC_016645	TCG	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374325528
86	NC_016645	GGT	3	9	4410	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
87	NC_016645	CGT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374325528
88	NC_016645	CTG	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374325528
89	NC_016645	GAG	2	6	4605	4610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
90	NC_016645	GAG	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
91	NC_016645	GAG	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
92	NC_016645	GAG	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
93	NC_016645	GAG	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
94	NC_016645	GCG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
95	NC_016645	GCC	2	6	4801	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
96	NC_016645	GGC	2	6	4812	4817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
97	NC_016645	GGA	2	6	4886	4891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
98	NC_016645	GGA	2	6	4929	4934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
99	NC_016645	CTA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374325528
100	NC_016645	GAC	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325528
101	NC_016645	AGG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
102	NC_016645	GCG	3	9	5113	5121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
103	NC_016645	AGA	2	6	5168	5173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374325528
104	NC_016645	GGC	2	6	5316	5321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
105	NC_016645	GAG	2	6	5322	5327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
106	NC_016645	GGT	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
107	NC_016645	CTC	2	6	5386	5391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374325528
108	NC_016645	CGC	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
109	NC_016645	CTT	2	6	5427	5432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374325528
110	NC_016645	GGC	2	6	5472	5477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
111	NC_016645	TGG	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
112	NC_016645	GAG	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
113	NC_016645	ACG	2	6	5612	5617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325528
114	NC_016645	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
115	NC_016645	GAG	2	6	5779	5784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
116	NC_016645	CGT	2	6	5916	5921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374325528
117	NC_016645	CGA	2	6	6000	6005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374325528
118	NC_016645	AGG	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
119	NC_016645	GAG	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
120	NC_016645	CGC	2	6	6231	6236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
121	NC_016645	GGC	2	6	6450	6455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
122	NC_016645	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374325528
123	NC_016645	TGG	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
124	NC_016645	GGA	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
125	NC_016645	GCC	3	9	6502	6510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374325528
126	NC_016645	GTG	2	6	6523	6528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374325528
127	NC_016645	CGG	2	6	6611	6616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
128	NC_016645	GAG	3	9	6663	6671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
129	NC_016645	GAG	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374325528
130	NC_016645	GCG	3	9	6796	6804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
131	NC_016645	GCG	2	6	6889	6894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
132	NC_016645	AGA	2	6	6901	6906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374325528
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281	NC_016645	CGG	2	6	14199	14204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374325528
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500	NC_016645	GTT	2	6	26593	26598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374325539

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