MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 4462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016641	TTCTC	2	10	1993	2002	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016641	CAGCC	2	10	2108	2117	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016641	TTTCG	2	10	3811	3820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016641	CACGA	2	10	4499	4508	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016641	TAGGT	2	10	5487	5496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016641	TAACC	2	10	5511	5520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016641	AAAAG	2	10	6021	6030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016641	TTTTA	2	10	6063	6072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016641	TCGCC	2	10	7419	7428	0 %	20 %	20 %	60 %	374319881
10	NC_016641	GATTT	2	10	8351	8360	20 %	60 %	20 %	0 %	374319882
11	NC_016641	TTCAT	2	10	11264	11273	20 %	60 %	0 %	20 %	374319885
12	NC_016641	TCGGA	2	10	11424	11433	20 %	20 %	40 %	20 %	374319885
13	NC_016641	TCCTC	2	10	12490	12499	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_016641	GGTCC	2	10	16121	16130	0 %	20 %	40 %	40 %	374319892
15	NC_016641	GGCAA	2	10	17466	17475	40 %	0 %	40 %	20 %	374319893
16	NC_016641	ATTCC	2	10	20396	20405	20 %	40 %	0 %	40 %	374319896
17	NC_016641	TACCG	2	10	21696	21705	20 %	20 %	20 %	40 %	374319898
18	NC_016641	TGATC	2	10	21749	21758	20 %	40 %	20 %	20 %	374319898
19	NC_016641	TCTGC	2	10	22169	22178	0 %	40 %	20 %	40 %	374319898
20	NC_016641	TATAT	2	10	23593	23602	40 %	60 %	0 %	0 %	374319900
21	NC_016641	GGCTT	2	10	23722	23731	0 %	40 %	40 %	20 %	374319900
22	NC_016641	GAAAG	2	10	25074	25083	60 %	0 %	40 %	0 %	374319902
23	NC_016641	AGTAA	2	10	35091	35100	60 %	20 %	20 %	0 %	374319909
24	NC_016641	GGACT	2	10	36167	36176	20 %	20 %	40 %	20 %	374319909
25	NC_016641	TAAAA	2	10	37332	37341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016641	CTGCC	2	10	37744	37753	0 %	20 %	20 %	60 %	374319911
27	NC_016641	CCTTG	2	10	37899	37908	0 %	40 %	20 %	40 %	374319911
28	NC_016641	GATAC	2	10	39964	39973	40 %	20 %	20 %	20 %	374319913
29	NC_016641	TGTTC	2	10	44608	44617	0 %	60 %	20 %	20 %	374319917
30	NC_016641	CTGCG	2	10	47688	47697	0 %	20 %	40 %	40 %	374319918
31	NC_016641	ACATC	2	10	49373	49382	40 %	20 %	0 %	40 %	374319920
32	NC_016641	ATTTT	2	10	50203	50212	20 %	80 %	0 %	0 %	374319920
33	NC_016641	CACTT	2	10	51900	51909	20 %	40 %	0 %	40 %	374319922
34	NC_016641	CTTTG	2	10	52509	52518	0 %	60 %	20 %	20 %	374319922
35	NC_016641	CGTAC	2	10	53191	53200	20 %	20 %	20 %	40 %	374319923
36	NC_016641	ACAAT	2	10	53859	53868	60 %	20 %	0 %	20 %	374319923
37	NC_016641	TCCCA	2	10	55704	55713	20 %	20 %	0 %	60 %	374319925
38	NC_016641	GGCCA	2	10	56436	56445	20 %	0 %	40 %	40 %	374319925
39	NC_016641	CAACA	2	10	59894	59903	60 %	0 %	0 %	40 %	374319928
40	NC_016641	CACTT	2	10	62616	62625	20 %	40 %	0 %	40 %	374319930
41	NC_016641	CCCCA	2	10	63759	63768	20 %	0 %	0 %	80 %	374319931
42	NC_016641	GAAAG	2	10	64202	64211	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016641	TGGCC	2	10	64528	64537	0 %	20 %	40 %	40 %	374319932
44	NC_016641	CTTTT	2	10	65305	65314	0 %	80 %	0 %	20 %	374319932
45	NC_016641	CGGTA	2	10	65710	65719	20 %	20 %	40 %	20 %	374319932
46	NC_016641	ATTGA	2	10	66179	66188	40 %	40 %	20 %	0 %	374319933
47	NC_016641	GAATG	2	10	66755	66764	40 %	20 %	40 %	0 %	374319933
48	NC_016641	CAAGC	2	10	69316	69325	40 %	0 %	20 %	40 %	374319936
49	NC_016641	TCGGC	2	10	72230	72239	0 %	20 %	40 %	40 %	374319937
50	NC_016641	TTACC	2	10	72377	72386	20 %	40 %	0 %	40 %	374319937
51	NC_016641	GCCCC	2	10	72535	72544	0 %	0 %	20 %	80 %	374319937
52	NC_016641	GAAAA	2	10	73568	73577	80 %	0 %	20 %	0 %	374319939
53	NC_016641	TCGTG	2	10	73654	73663	0 %	40 %	40 %	20 %	374319939
54	NC_016641	TAAAT	2	10	75647	75656	60 %	40 %	0 %	0 %	374319941
55	NC_016641	TATTT	2	10	76018	76027	20 %	80 %	0 %	0 %	374319941
56	NC_016641	AGAAA	2	10	76931	76940	80 %	0 %	20 %	0 %	374319941
57	NC_016641	TCCGG	2	10	78715	78724	0 %	20 %	40 %	40 %	374319943
58	NC_016641	AAATC	2	10	83040	83049	60 %	20 %	0 %	20 %	374319945
59	NC_016641	CGAAT	2	10	87097	87106	40 %	20 %	20 %	20 %	374319947
60	NC_016641	TCTGC	2	10	88278	88287	0 %	40 %	20 %	40 %	374319949
61	NC_016641	GAGAA	2	10	88784	88793	60 %	0 %	40 %	0 %	374319949
62	NC_016641	GTATT	2	10	89983	89992	20 %	60 %	20 %	0 %	374319950
63	NC_016641	CAGCC	2	10	90674	90683	20 %	0 %	20 %	60 %	374319951
64	NC_016641	CCCTG	2	10	90827	90836	0 %	20 %	20 %	60 %	374319951
65	NC_016641	CAATT	2	10	101204	101213	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016641	TGAAT	2	10	101324	101333	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016641	AAGCG	2	10	104978	104987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016641	CATCT	2	10	105167	105176	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016641	GGCGC	2	10	105790	105799	0 %	0 %	60 %	40 %	374319969
70	NC_016641	AAATA	2	10	106044	106053	80 %	20 %	0 %	0 %	374319969
71	NC_016641	TGTTT	2	10	106554	106563	0 %	80 %	20 %	0 %	374319970
72	NC_016641	GATAA	2	10	107287	107296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016641	TGCTT	2	10	107560	107569	0 %	60 %	20 %	20 %	374319971
74	NC_016641	AAGAG	2	10	109191	109200	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016641	CTCTT	2	10	109235	109244	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016641	ATGGA	2	10	112157	112166	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016641	CTTTT	2	10	112364	112373	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016641	AACGA	2	10	112383	112392	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016641	AATAA	2	10	112540	112549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016641	ATTCA	2	10	113080	113089	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016641	AAAAT	2	10	113119	113128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016641	ACCTT	2	10	115863	115872	20 %	40 %	0 %	40 %	374319982
83	NC_016641	CACAA	2	10	116232	116241	60 %	0 %	0 %	40 %	374319983
84	NC_016641	AATTA	2	10	120457	120466	60 %	40 %	0 %	0 %	374319987
85	NC_016641	AAAAT	2	10	120467	120476	80 %	20 %	0 %	0 %	374319987
86	NC_016641	TATAT	2	10	122188	122197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016641	CACTC	2	10	122807	122816	20 %	20 %	0 %	60 %	374319990
88	NC_016641	ATACA	2	10	131374	131383	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016641	TGTTT	2	10	132342	132351	0 %	80 %	20 %	0 %	374319999
90	NC_016641	GTCCA	2	10	133420	133429	20 %	20 %	20 %	40 %	374320001
91	NC_016641	TAATG	2	10	133563	133572	40 %	40 %	20 %	0 %	374320001
92	NC_016641	GAAAA	2	10	136060	136069	80 %	0 %	20 %	0 %	374320004
93	NC_016641	AAGGA	2	10	137106	137115	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016641	CCTTC	2	10	139857	139866	0 %	40 %	0 %	60 %	374320008
95	NC_016641	TCGGA	2	10	141221	141230	20 %	20 %	40 %	20 %	374320009
96	NC_016641	GCGTA	2	10	142965	142974	20 %	20 %	40 %	20 %	374320011
97	NC_016641	GAAGT	2	10	143756	143765	40 %	20 %	40 %	0 %	374320012
98	NC_016641	GCAAA	2	10	143994	144003	60 %	0 %	20 %	20 %	374320012
99	NC_016641	AAGAA	2	10	145209	145218	80 %	0 %	20 %	0 %	374320013
100	NC_016641	CAAAC	2	10	145840	145849	60 %	0 %	0 %	40 %	374320014
101	NC_016641	GCCAG	2	10	148166	148175	20 %	0 %	40 %	40 %	374320016
102	NC_016641	CGTTT	2	10	150288	150297	0 %	60 %	20 %	20 %	374320018
103	NC_016641	TTGAC	2	10	151116	151125	20 %	40 %	20 %	20 %	374320020
104	NC_016641	ATCCA	2	10	151145	151154	40 %	20 %	0 %	40 %	374320020
105	NC_016641	CTCCA	2	10	152007	152016	20 %	20 %	0 %	60 %	374320021
106	NC_016641	CCTGC	2	10	152667	152676	0 %	20 %	20 %	60 %	374320021
107	NC_016641	CAAAC	2	10	152771	152780	60 %	0 %	0 %	40 %	374320021
108	NC_016641	TCCCT	2	10	154908	154917	0 %	40 %	0 %	60 %	374320024
109	NC_016641	CGATC	2	10	156846	156855	20 %	20 %	20 %	40 %	374320026
110	NC_016641	AAGCA	2	10	157522	157531	60 %	0 %	20 %	20 %	374320027
111	NC_016641	GCCTT	2	10	158570	158579	0 %	40 %	20 %	40 %	374320028
112	NC_016641	CAAAA	2	10	162056	162065	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016641	TTACG	2	10	162673	162682	20 %	40 %	20 %	20 %	374320032
114	NC_016641	CCCGG	2	10	165359	165368	0 %	0 %	40 %	60 %	374320034
115	NC_016641	GACTG	2	10	165437	165446	20 %	20 %	40 %	20 %	374320034
116	NC_016641	AAATG	2	10	165874	165883	60 %	20 %	20 %	0 %	374320034
117	NC_016641	GACTG	2	10	166222	166231	20 %	20 %	40 %	20 %	374320034
118	NC_016641	ATATA	2	10	166792	166801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016641	TCTGC	2	10	167424	167433	0 %	40 %	20 %	40 %	374320035
120	NC_016641	GCCCG	2	10	167908	167917	0 %	0 %	40 %	60 %	374320035
121	NC_016641	GTAAC	2	10	169151	169160	40 %	20 %	20 %	20 %	374320036
122	NC_016641	GAGTG	2	10	169497	169506	20 %	20 %	60 %	0 %	374320037
123	NC_016641	GACAT	2	10	169563	169572	40 %	20 %	20 %	20 %	374320037
124	NC_016641	CCGGC	2	10	169598	169607	0 %	0 %	40 %	60 %	374320037
125	NC_016641	TCACC	2	10	169634	169643	20 %	20 %	0 %	60 %	374320037
126	NC_016641	ATCCA	2	10	174061	174070	40 %	20 %	0 %	40 %	374320041
127	NC_016641	GCCGG	2	10	175274	175283	0 %	0 %	60 %	40 %	374320042
128	NC_016641	CATGG	2	10	175296	175305	20 %	20 %	40 %	20 %	374320042
129	NC_016641	AGTCC	2	10	175358	175367	20 %	20 %	20 %	40 %	374320042
130	NC_016641	TTGAA	2	10	181200	181209	40 %	40 %	20 %	0 %	374320048
131	NC_016641	CGTAC	2	10	182918	182927	20 %	20 %	20 %	40 %	374320050
132	NC_016641	GTGGA	2	10	184089	184098	20 %	20 %	60 %	0 %	374320051
133	NC_016641	TGGAT	2	10	184725	184734	20 %	40 %	40 %	0 %	374320051
134	NC_016641	CTTTT	2	10	185350	185359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016641	GTCCA	2	10	189025	189034	20 %	20 %	20 %	40 %	374320057
136	NC_016641	TTGCT	2	10	189435	189444	0 %	60 %	20 %	20 %	374320058
137	NC_016641	GCTTT	2	10	192598	192607	0 %	60 %	20 %	20 %	374320060
138	NC_016641	CACTC	2	10	195190	195199	20 %	20 %	0 %	60 %	374320061
139	NC_016641	AACTA	2	10	195356	195365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016641	TAGTT	2	10	195468	195477	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016641	TAAAC	2	10	195485	195494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016641	ATTAT	2	10	198988	198997	40 %	60 %	0 %	0 %	374320064
143	NC_016641	TATAC	2	10	201911	201920	40 %	40 %	0 %	20 %	374320066
144	NC_016641	AAAGA	2	10	202668	202677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016641	CTTCC	2	10	203681	203690	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_016641	TACAT	2	10	204689	204698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016641	TCCAG	2	10	204761	204770	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_016641	ACAAA	2	10	205225	205234	80 %	0 %	0 %	20 %	374320072
149	NC_016641	TTTTC	2	10	207727	207736	0 %	80 %	0 %	20 %	374320075
150	NC_016641	TTGGA	2	10	207895	207904	20 %	40 %	40 %	0 %	374320075
151	NC_016641	ATTCC	2	10	208037	208046	20 %	40 %	0 %	40 %	374320076
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153	NC_016641	CTGAG	2	10	209669	209678	20 %	20 %	40 %	20 %	374320077
154	NC_016641	GCGCA	2	10	210557	210566	20 %	0 %	40 %	40 %	374320078
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156	NC_016641	GCCCC	2	10	215151	215160	0 %	0 %	20 %	80 %	374320082
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160	NC_016641	TGCTT	2	10	223941	223950	0 %	60 %	20 %	20 %	374320093
161	NC_016641	AGCTG	2	10	225809	225818	20 %	20 %	40 %	20 %	374320094
162	NC_016641	ACCCT	2	10	226543	226552	20 %	20 %	0 %	60 %	374320094
163	NC_016641	AAAAC	2	10	227364	227373	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_016641	GCTAT	2	10	227453	227462	20 %	40 %	20 %	20 %	374320095
165	NC_016641	CTGAA	2	10	230328	230337	40 %	20 %	20 %	20 %	374320096
166	NC_016641	CATGG	2	10	230834	230843	20 %	20 %	40 %	20 %	374320096
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170	NC_016641	TATAA	2	10	237086	237095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016641	CTAAT	2	10	238513	238522	40 %	40 %	0 %	20 %	374320102
172	NC_016641	ATAAC	2	10	239590	239599	60 %	20 %	0 %	20 %	374320103
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174	NC_016641	CCACG	2	10	241267	241276	20 %	0 %	20 %	60 %	374320105
175	NC_016641	CCCTG	2	10	241590	241599	0 %	20 %	20 %	60 %	374320106
176	NC_016641	TGTGC	2	10	244026	244035	0 %	40 %	40 %	20 %	374320108
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178	NC_016641	CCAAA	2	10	248018	248027	60 %	0 %	0 %	40 %	374320112
179	NC_016641	CTTTC	2	10	249218	249227	0 %	60 %	0 %	40 %	374320114
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189	NC_016641	TCCGG	2	10	270974	270983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
190	NC_016641	CTTAT	2	10	271184	271193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_016641	AAGAA	2	10	272995	273004	80 %	0 %	20 %	0 %	374320140
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193	NC_016641	CCTTC	2	10	275119	275128	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
194	NC_016641	GCGCA	2	10	276536	276545	20 %	0 %	40 %	40 %	374320143
195	NC_016641	ACGCT	2	10	276795	276804	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_016641	TCCGC	2	10	276822	276831	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
197	NC_016641	ATATT	2	10	277389	277398	40 %	60 %	0 %	0 %	374320144
198	NC_016641	TCTAT	2	10	278480	278489	20 %	60 %	0 %	20 %	374320145
199	NC_016641	TGTTA	2	10	279027	279036	20 %	60 %	20 %	0 %	374320146
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201	NC_016641	TTCAA	2	10	279434	279443	40 %	40 %	0 %	20 %	374320146
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215	NC_016641	GCCAT	2	10	295965	295974	20 %	20 %	20 %	40 %	374320164
216	NC_016641	CTATA	2	10	297236	297245	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
217	NC_016641	AAGCG	2	10	298646	298655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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219	NC_016641	TGAGG	2	10	300716	300725	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
220	NC_016641	TTTAT	2	10	301119	301128	20 %	80 %	0 %	0 %	374320173
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223	NC_016641	TAATA	2	10	303811	303820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_016641	GCTTC	2	10	305283	305292	0 %	40 %	20 %	40 %	374320178
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235	NC_016641	ATACA	2	10	326305	326314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
236	NC_016641	ACTGG	2	10	326787	326796	20 %	20 %	40 %	20 %	374320196
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239	NC_016641	CTCTG	2	10	336682	336691	0 %	40 %	20 %	40 %	374320209
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241	NC_016641	AAGAA	2	10	337050	337059	80 %	0 %	20 %	0 %	374320210
242	NC_016641	AAAGC	2	10	339943	339952	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
243	NC_016641	GATCA	2	10	341680	341689	40 %	20 %	20 %	20 %	374320214
244	NC_016641	AAAGC	2	10	343042	343051	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
245	NC_016641	GGACG	2	10	345426	345435	20 %	0 %	60 %	20 %	374320219
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250	NC_016641	GTGTA	2	10	352213	352222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
251	NC_016641	AGCAA	2	10	354322	354331	60 %	0 %	20 %	20 %	374320226
252	NC_016641	GGAAT	2	10	355073	355082	40 %	20 %	40 %	0 %	374320227
253	NC_016641	CTTTC	2	10	360669	360678	0 %	60 %	0 %	40 %	374320232
254	NC_016641	AGCCC	2	10	364291	364300	20 %	0 %	20 %	60 %	374320237
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256	NC_016641	CCATA	2	10	372203	372212	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
257	NC_016641	ATTTT	2	10	373470	373479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_016641	GAACC	2	10	374821	374830	40 %	0 %	20 %	40 %	374320243
259	NC_016641	TTCCG	2	10	375813	375822	0 %	40 %	20 %	40 %	374320244
260	NC_016641	TATTT	2	10	376638	376647	20 %	80 %	0 %	0 %	374320245
261	NC_016641	TGGAT	2	10	376992	377001	20 %	40 %	40 %	0 %	374320245
262	NC_016641	ATTTG	2	10	382221	382230	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016641	TGCCA	2	10	382770	382779	20 %	20 %	20 %	40 %	374320250
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265	NC_016641	TTTTA	2	10	387286	387295	20 %	80 %	0 %	0 %	374320254
266	NC_016641	AAACG	2	10	387649	387658	60 %	0 %	20 %	20 %	374320254
267	NC_016641	ATGGA	2	10	389349	389358	40 %	20 %	40 %	0 %	374320256
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269	NC_016641	CAGTA	2	10	391110	391119	40 %	20 %	20 %	20 %	374320257
270	NC_016641	GCCCA	2	10	394492	394501	20 %	0 %	20 %	60 %	374320260
271	NC_016641	ATACA	2	10	395392	395401	60 %	20 %	0 %	20 %	374320261
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273	NC_016641	AACCC	2	10	396063	396072	40 %	0 %	0 %	60 %	374320262
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283	NC_016641	CAATC	2	10	404508	404517	40 %	20 %	0 %	40 %	374320269
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291	NC_016641	TGACT	2	10	413471	413480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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396	NC_016641	ACTGG	2	10	558785	558794	20 %	20 %	40 %	20 %	374320435
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400	NC_016641	CGCTG	2	10	560158	560167	0 %	20 %	40 %	40 %	374320436
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