MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016641	A	7	7	80417	80423	100 %	0 %	0 %	0 %	374319944
1502	NC_016641	CAT	2	6	80522	80527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016641	CTTC	2	8	80533	80540	0 %	50 %	0 %	50 %	374319945
1504	NC_016641	T	6	6	80555	80560	0 %	100 %	0 %	0 %	374319945
1505	NC_016641	GAA	2	6	80575	80580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319945
1506	NC_016641	CCA	2	6	80592	80597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319945
1507	NC_016641	ATG	2	6	80607	80612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319945
1508	NC_016641	AAT	2	6	80648	80653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319945
1509	NC_016641	GAC	2	6	80654	80659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1510	NC_016641	GGT	2	6	80693	80698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374319945
1511	NC_016641	CTG	2	6	80792	80797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1512	NC_016641	A	6	6	80882	80887	100 %	0 %	0 %	0 %	374319945
1513	NC_016641	ATC	2	6	80934	80939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319945
1514	NC_016641	AAT	2	6	80959	80964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319945
1515	NC_016641	CTT	2	6	80990	80995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319945
1516	NC_016641	ATGGGC	2	12	80996	81007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374319945
1517	NC_016641	CTC	2	6	81089	81094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319945
1518	NC_016641	GGA	2	6	81118	81123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374319945
1519	NC_016641	A	7	7	81141	81147	100 %	0 %	0 %	0 %	374319945
1520	NC_016641	TCT	2	6	81229	81234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319945
1521	NC_016641	AT	4	8	81242	81249	50 %	50 %	0 %	0 %	374319945
1522	NC_016641	TGA	2	6	81302	81307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319945
1523	NC_016641	CAT	2	6	81349	81354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319945
1524	NC_016641	CAG	2	6	81530	81535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1525	NC_016641	TTTG	2	8	81553	81560	0 %	75 %	25 %	0 %	374319945
1526	NC_016641	ATTG	2	8	81973	81980	25 %	50 %	25 %	0 %	374319945
1527	NC_016641	GCCT	2	8	82136	82143	0 %	25 %	25 %	50 %	374319945
1528	NC_016641	CCA	2	6	82262	82267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319945
1529	NC_016641	TGC	2	6	82278	82283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1530	NC_016641	CGG	2	6	82328	82333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319945
1531	NC_016641	AT	3	6	82543	82548	50 %	50 %	0 %	0 %	374319945
1532	NC_016641	CAT	2	6	82591	82596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319945
1533	NC_016641	AAC	2	6	82629	82634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319945
1534	NC_016641	GCA	2	6	82669	82674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1535	NC_016641	CTT	2	6	82739	82744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319945
1536	NC_016641	ACA	2	6	82930	82935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319945
1537	NC_016641	AGG	2	6	82948	82953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374319945
1538	NC_016641	TTG	2	6	82974	82979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319945
1539	NC_016641	AAATC	2	10	83040	83049	60 %	20 %	0 %	20 %	374319945
1540	NC_016641	A	6	6	83155	83160	100 %	0 %	0 %	0 %	374319945
1541	NC_016641	AGCC	2	8	83289	83296	25 %	0 %	25 %	50 %	374319945
1542	NC_016641	ATG	2	6	83375	83380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319945
1543	NC_016641	TGA	2	6	83699	83704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319945
1544	NC_016641	CAG	2	6	83741	83746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1545	NC_016641	TTG	2	6	83781	83786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319945
1546	NC_016641	GGC	2	6	83873	83878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319945
1547	NC_016641	AGC	2	6	83898	83903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1548	NC_016641	TG	3	6	83929	83934	0 %	50 %	50 %	0 %	374319945
1549	NC_016641	GCAG	2	8	83997	84004	25 %	0 %	50 %	25 %	374319945
1550	NC_016641	GAG	2	6	84006	84011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374319945
1551	NC_016641	CCA	2	6	84026	84031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319945
1552	NC_016641	GCT	2	6	84062	84067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1553	NC_016641	CGA	2	6	84094	84099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1554	NC_016641	CATC	2	8	84127	84134	25 %	25 %	0 %	50 %	374319945
1555	NC_016641	GAA	2	6	84182	84187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319945
1556	NC_016641	A	6	6	84213	84218	100 %	0 %	0 %	0 %	374319945
1557	NC_016641	GTAG	2	8	84235	84242	25 %	25 %	50 %	0 %	374319945
1558	NC_016641	CAG	2	6	84281	84286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1559	NC_016641	GTG	2	6	84291	84296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374319945
1560	NC_016641	AAAT	2	8	84306	84313	75 %	25 %	0 %	0 %	374319945
1561	NC_016641	GAA	2	6	84320	84325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319945
1562	NC_016641	A	6	6	84324	84329	100 %	0 %	0 %	0 %	374319945
1563	NC_016641	AATG	2	8	84331	84338	50 %	25 %	25 %	0 %	374319945
1564	NC_016641	GCG	2	6	84342	84347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319945
1565	NC_016641	GCA	2	6	84472	84477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319945
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1567	NC_016641	AAT	2	6	84607	84612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319945
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1569	NC_016641	GGTAGA	2	12	84773	84784	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374319945
1570	NC_016641	CGTT	2	8	84789	84796	0 %	50 %	25 %	25 %	374319945
1571	NC_016641	TCC	2	6	84813	84818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319945
1572	NC_016641	ATAG	2	8	84878	84885	50 %	25 %	25 %	0 %	374319945
1573	NC_016641	CAGC	2	8	84907	84914	25 %	0 %	25 %	50 %	374319945
1574	NC_016641	TGC	2	6	84926	84931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319945
1575	NC_016641	C	7	7	84977	84983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1576	NC_016641	TCT	2	6	85004	85009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319946
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1578	NC_016641	CCG	2	6	85173	85178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319946
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1581	NC_016641	GATCCT	2	12	85279	85290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374319946
1582	NC_016641	AACG	2	8	85431	85438	50 %	0 %	25 %	25 %	374319946
1583	NC_016641	ACA	2	6	85462	85467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319946
1584	NC_016641	TTCA	2	8	85469	85476	25 %	50 %	0 %	25 %	374319946
1585	NC_016641	TCT	2	6	85510	85515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319946
1586	NC_016641	CAG	2	6	85550	85555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319946
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1588	NC_016641	TTCA	2	8	85601	85608	25 %	50 %	0 %	25 %	374319946
1589	NC_016641	GCT	2	6	85762	85767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319946
1590	NC_016641	CTG	3	9	85802	85810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319946
1591	NC_016641	CGT	2	6	85827	85832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319946
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1593	NC_016641	CAG	2	6	86081	86086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319946
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1595	NC_016641	GT	3	6	86128	86133	0 %	50 %	50 %	0 %	374319946
1596	NC_016641	TGA	2	6	86203	86208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319946
1597	NC_016641	GCC	2	6	86210	86215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319946
1598	NC_016641	GCG	2	6	86325	86330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319946
1599	NC_016641	GCA	2	6	86341	86346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319946
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1601	NC_016641	CAA	2	6	86714	86719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319946
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1604	NC_016641	CAG	2	6	86896	86901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319947
1605	NC_016641	AT	3	6	86921	86926	50 %	50 %	0 %	0 %	374319947
1606	NC_016641	CTT	2	6	86940	86945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319947
1607	NC_016641	AAT	2	6	86965	86970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319947
1608	NC_016641	GCA	2	6	87041	87046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319947
1609	NC_016641	CGAAT	2	10	87097	87106	40 %	20 %	20 %	20 %	374319947
1610	NC_016641	GAC	2	6	87253	87258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319948
1611	NC_016641	GAA	2	6	87298	87303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319948
1612	NC_016641	ACC	2	6	87328	87333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319948
1613	NC_016641	AAG	2	6	87335	87340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319948
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1620	NC_016641	TGC	2	6	87698	87703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319948
1621	NC_016641	CACT	2	8	87811	87818	25 %	25 %	0 %	50 %	374319948
1622	NC_016641	TA	3	6	87820	87825	50 %	50 %	0 %	0 %	374319948
1623	NC_016641	ATG	2	6	87830	87835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319948
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1626	NC_016641	GCAT	2	8	87979	87986	25 %	25 %	25 %	25 %	374319949
1627	NC_016641	AGC	2	6	88010	88015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319949
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1649	NC_016641	CTC	2	6	88596	88601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319949
1650	NC_016641	TCC	2	6	88682	88687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319949
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1735	NC_016641	AAG	2	6	92755	92760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1751	NC_016641	GAA	2	6	93856	93861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319953
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1877	NC_016641	GA	3	6	100376	100381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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