MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016641	AGC	2	6	308806	308811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320181
6002	NC_016641	CCT	2	6	308830	308835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_016641	GTT	2	6	308855	308860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_016641	GCA	2	6	308932	308937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6005	NC_016641	GC	3	6	308963	308968	0 %	0 %	50 %	50 %	374320182
6006	NC_016641	CCA	2	6	308971	308976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320182
6007	NC_016641	ATG	2	6	308999	309004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320182
6008	NC_016641	CATA	2	8	309025	309032	50 %	25 %	0 %	25 %	374320182
6009	NC_016641	ATG	2	6	309073	309078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320182
6010	NC_016641	CAT	2	6	309103	309108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320182
6011	NC_016641	CGC	2	6	309167	309172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320182
6012	NC_016641	ACG	2	6	309207	309212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6013	NC_016641	CCT	2	6	309261	309266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320182
6014	NC_016641	TC	3	6	309410	309415	0 %	50 %	0 %	50 %	374320182
6015	NC_016641	CAG	3	9	309428	309436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6016	NC_016641	TGTCCC	2	12	309498	309509	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374320182
6017	NC_016641	CACG	2	8	309553	309560	25 %	0 %	25 %	50 %	374320182
6018	NC_016641	GCT	2	6	309564	309569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6019	NC_016641	AGGC	2	8	309637	309644	25 %	0 %	50 %	25 %	374320182
6020	NC_016641	CAG	2	6	309647	309652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6021	NC_016641	TCC	2	6	309681	309686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320182
6022	NC_016641	GGT	2	6	309733	309738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320182
6023	NC_016641	AGT	2	6	309781	309786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320182
6024	NC_016641	GGC	2	6	309831	309836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320182
6025	NC_016641	GCC	2	6	309914	309919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320182
6026	NC_016641	AGC	3	9	309936	309944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6027	NC_016641	TGG	2	6	309992	309997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320182
6028	NC_016641	ATA	2	6	310005	310010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320182
6029	NC_016641	CAGCT	2	10	310037	310046	20 %	20 %	20 %	40 %	374320182
6030	NC_016641	GCC	3	9	310061	310069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320182
6031	NC_016641	GTC	2	6	310095	310100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6032	NC_016641	ATC	2	6	310103	310108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320182
6033	NC_016641	TA	3	6	310168	310173	50 %	50 %	0 %	0 %	374320182
6034	NC_016641	C	6	6	310196	310201	0 %	0 %	0 %	100 %	374320182
6035	NC_016641	GTC	2	6	310202	310207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6036	NC_016641	TGGGTG	2	12	310351	310362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320182
6037	NC_016641	CATC	2	8	310393	310400	25 %	25 %	0 %	50 %	374320182
6038	NC_016641	GTT	2	6	310402	310407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320182
6039	NC_016641	ACG	2	6	310436	310441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320182
6040	NC_016641	ATT	2	6	310589	310594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320182
6041	NC_016641	TCC	2	6	310652	310657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_016641	GTTT	2	8	310694	310701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016641	TAT	2	6	310711	310716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016641	AAC	2	6	310858	310863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320183
6045	NC_016641	AGT	2	6	311024	311029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320183
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6047	NC_016641	AGC	2	6	311080	311085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320183
6048	NC_016641	TCG	2	6	311177	311182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320183
6049	NC_016641	TCA	2	6	311279	311284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320183
6050	NC_016641	ATG	2	6	311386	311391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320183
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6052	NC_016641	CAA	2	6	311459	311464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320183
6053	NC_016641	AGAA	2	8	311475	311482	75 %	0 %	25 %	0 %	374320183
6054	NC_016641	GA	3	6	311510	311515	50 %	0 %	50 %	0 %	374320183
6055	NC_016641	TCCG	2	8	311599	311606	0 %	25 %	25 %	50 %	374320183
6056	NC_016641	CCA	2	6	311620	311625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320183
6057	NC_016641	GCCA	2	8	311662	311669	25 %	0 %	25 %	50 %	374320183
6058	NC_016641	TAA	2	6	311673	311678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320183
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6060	NC_016641	TGT	2	6	311743	311748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_016641	AT	3	6	311778	311783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016641	TTG	2	6	311804	311809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016641	GCC	2	6	311837	311842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_016641	GGAA	2	8	311849	311856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016641	TGA	2	6	311875	311880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6069	NC_016641	TGC	2	6	312133	312138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320184
6070	NC_016641	TTA	2	6	312232	312237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320184
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6074	NC_016641	CT	3	6	312310	312315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_016641	TAT	2	6	312353	312358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_016641	ATC	2	6	312365	312370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6091	NC_016641	CT	3	6	313143	313148	0 %	50 %	0 %	50 %	374320185
6092	NC_016641	ATT	2	6	313165	313170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320185
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6095	NC_016641	GCGCT	2	10	313498	313507	0 %	20 %	40 %	40 %	374320185
6096	NC_016641	AG	3	6	313515	313520	50 %	0 %	50 %	0 %	374320185
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6100	NC_016641	A	6	6	313772	313777	100 %	0 %	0 %	0 %	374320185
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6111	NC_016641	CAG	2	6	314198	314203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320186
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6119	NC_016641	AGA	2	6	314684	314689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320186
6120	NC_016641	CAT	2	6	314735	314740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320186
6121	NC_016641	TCC	2	6	314757	314762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320186
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6123	NC_016641	ATA	2	6	314910	314915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320186
6124	NC_016641	CAT	2	6	315014	315019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320186
6125	NC_016641	CAG	2	6	315035	315040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320186
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6128	NC_016641	CGC	2	6	315170	315175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320186
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6130	NC_016641	GTT	2	6	315290	315295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320186
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6134	NC_016641	CATG	2	8	315466	315473	25 %	25 %	25 %	25 %	374320186
6135	NC_016641	TCA	2	6	315622	315627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320187
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6142	NC_016641	AAAT	2	8	315951	315958	75 %	25 %	0 %	0 %	374320187
6143	NC_016641	CAA	2	6	316003	316008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320187
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6145	NC_016641	CTCC	2	8	316052	316059	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6146	NC_016641	ATT	3	9	316070	316078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_016641	TCA	2	6	316088	316093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6153	NC_016641	TCA	2	6	316509	316514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320188
6154	NC_016641	AAGGC	2	10	316681	316690	40 %	0 %	40 %	20 %	374320188
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6157	NC_016641	TCC	2	6	316862	316867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6241	NC_016641	CAGT	2	8	322298	322305	25 %	25 %	25 %	25 %	374320191
6242	NC_016641	CGC	2	6	322357	322362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320191
6243	NC_016641	CCAG	2	8	322436	322443	25 %	0 %	25 %	50 %	374320191
6244	NC_016641	TCA	2	6	322451	322456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320191
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6246	NC_016641	TGT	2	6	322490	322495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320192
6247	NC_016641	AT	3	6	322523	322528	50 %	50 %	0 %	0 %	374320192
6248	NC_016641	T	6	6	322528	322533	0 %	100 %	0 %	0 %	374320192
6249	NC_016641	ATC	2	6	322691	322696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320192
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6254	NC_016641	CA	3	6	323124	323129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6255	NC_016641	GCA	2	6	323130	323135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6257	NC_016641	T	7	7	323211	323217	0 %	100 %	0 %	0 %	374320193
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6372	NC_016641	AAT	2	6	328611	328616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320200
6373	NC_016641	TGC	2	6	328667	328672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320200
6374	NC_016641	CTG	2	6	328911	328916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320200
6375	NC_016641	AATA	2	8	328918	328925	75 %	25 %	0 %	0 %	374320200
6376	NC_016641	GCC	2	6	328928	328933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320200
6377	NC_016641	GAT	2	6	329016	329021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320200
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6379	NC_016641	TCC	2	6	329125	329130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6380	NC_016641	ATTT	2	8	329135	329142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6381	NC_016641	ACC	2	6	329196	329201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6382	NC_016641	GCT	2	6	329249	329254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6384	NC_016641	ACC	2	6	329374	329379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6385	NC_016641	TCA	2	6	329417	329422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6386	NC_016641	GAT	2	6	329648	329653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320201
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6397	NC_016641	CTG	2	6	330295	330300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320201
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6401	NC_016641	TCCT	2	8	330557	330564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6402	NC_016641	ATA	2	6	330593	330598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6414	NC_016641	GCC	2	6	330962	330967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6425	NC_016641	ACA	2	6	331486	331491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6429	NC_016641	C	6	6	331619	331624	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6458	NC_016641	GGA	2	6	333527	333532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6486	NC_016641	TAT	2	6	335207	335212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6487	NC_016641	A	6	6	335216	335221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6488	NC_016641	A	6	6	335223	335228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6489	NC_016641	ACAG	2	8	335268	335275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6490	NC_016641	GAC	2	6	335280	335285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6491	NC_016641	TAA	2	6	335319	335324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6492	NC_016641	GA	3	6	335354	335359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_016641	CA	3	6	335383	335388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6494	NC_016641	GTT	2	6	335445	335450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6495	NC_016641	T	7	7	335449	335455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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