MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015733	GCGCCG	2	12	188523	188534	0 %	0 %	50 %	50 %	339485099
4002	NC_015733	ACC	2	6	188536	188541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485099
4003	NC_015733	ATG	2	6	188786	188791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485099
4004	NC_015733	GC	3	6	188831	188836	0 %	0 %	50 %	50 %	339485099
4005	NC_015733	CGG	2	6	188856	188861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485099
4006	NC_015733	TTG	2	6	188897	188902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485099
4007	NC_015733	TCA	2	6	188922	188927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485099
4008	NC_015733	CAG	2	6	188932	188937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
4009	NC_015733	AC	3	6	188955	188960	50 %	0 %	0 %	50 %	339485099
4010	NC_015733	CAGG	2	8	189042	189049	25 %	0 %	50 %	25 %	339485099
4011	NC_015733	GAACTG	2	12	189055	189066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339485099
4012	NC_015733	CAT	2	6	189112	189117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485099
4013	NC_015733	GCC	2	6	189128	189133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485099
4014	NC_015733	CAG	2	6	189205	189210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
4015	NC_015733	GGT	2	6	189241	189246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485099
4016	NC_015733	GCG	2	6	189257	189262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485099
4017	NC_015733	CAG	2	6	189343	189348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
4018	NC_015733	GTG	2	6	189349	189354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485099
4019	NC_015733	ATG	2	6	189401	189406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485099
4020	NC_015733	CAG	2	6	189433	189438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
4021	NC_015733	CTG	2	6	189442	189447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485099
4022	NC_015733	TCG	2	6	189482	189487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485099
4023	NC_015733	CTT	2	6	189547	189552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485099
4024	NC_015733	CGGT	2	8	189569	189576	0 %	25 %	50 %	25 %	339485099
4025	NC_015733	GAT	2	6	189673	189678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485099
4026	NC_015733	TGG	2	6	189723	189728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485099
4027	NC_015733	ATG	2	6	189746	189751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485099
4028	NC_015733	CGA	2	6	189801	189806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
4029	NC_015733	GCC	2	6	189832	189837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485099
4030	NC_015733	GAT	2	6	189907	189912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015733	GCTG	2	8	189924	189931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_015733	GA	3	6	189948	189953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015733	AGA	2	6	190027	190032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015733	GCCG	2	8	190047	190054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_015733	TGA	2	6	190181	190186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485100
4036	NC_015733	GCT	2	6	190217	190222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485100
4037	NC_015733	CCA	2	6	190261	190266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485100
4038	NC_015733	CTG	2	6	190317	190322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485100
4039	NC_015733	CCG	2	6	190386	190391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485100
4040	NC_015733	CGA	2	6	190412	190417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485100
4041	NC_015733	GGC	2	6	190535	190540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485100
4042	NC_015733	CGGC	2	8	190548	190555	0 %	0 %	50 %	50 %	339485100
4043	NC_015733	GGC	2	6	190566	190571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485100
4044	NC_015733	TGC	2	6	190690	190695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485100
4045	NC_015733	CGA	2	6	190697	190702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485100
4046	NC_015733	GAT	2	6	190889	190894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485100
4047	NC_015733	ATC	2	6	191069	191074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015733	GGC	2	6	191075	191080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_015733	GCT	2	6	191244	191249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485101
4050	NC_015733	CGC	2	6	191255	191260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485101
4051	NC_015733	CGG	2	6	191271	191276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485101
4052	NC_015733	CTG	2	6	191311	191316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485101
4053	NC_015733	CG	3	6	191414	191419	0 %	0 %	50 %	50 %	339485101
4054	NC_015733	GCCG	2	8	191460	191467	0 %	0 %	50 %	50 %	339485101
4055	NC_015733	TCG	2	6	191474	191479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485101
4056	NC_015733	GCC	2	6	191495	191500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485101
4057	NC_015733	GCT	2	6	191508	191513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485101
4058	NC_015733	GC	3	6	191515	191520	0 %	0 %	50 %	50 %	339485101
4059	NC_015733	ACG	2	6	191594	191599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485101
4060	NC_015733	CAT	2	6	191601	191606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485101
4061	NC_015733	GCC	3	9	191611	191619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485101
4062	NC_015733	CCA	2	6	191657	191662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485101
4063	NC_015733	GGC	2	6	191689	191694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485101
4064	NC_015733	CTG	2	6	191746	191751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485101
4065	NC_015733	CCG	2	6	191774	191779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485101
4066	NC_015733	GTG	2	6	191785	191790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485101
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4068	NC_015733	CCAGC	2	10	191895	191904	20 %	0 %	20 %	60 %	339485101
4069	NC_015733	GC	4	8	191929	191936	0 %	0 %	50 %	50 %	339485101
4070	NC_015733	C	6	6	191936	191941	0 %	0 %	0 %	100 %	339485101
4071	NC_015733	GGCC	2	8	192030	192037	0 %	0 %	50 %	50 %	339485101
4072	NC_015733	CTG	3	9	192057	192065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485102
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4077	NC_015733	GCCT	2	8	192196	192203	0 %	25 %	25 %	50 %	339485102
4078	NC_015733	ATC	2	6	192216	192221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485102
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4081	NC_015733	TGC	2	6	192328	192333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485102
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4085	NC_015733	CTG	2	6	192471	192476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485102
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4091	NC_015733	GCC	2	6	192717	192722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485102
4092	NC_015733	GCAGC	2	10	192782	192791	20 %	0 %	40 %	40 %	339485102
4093	NC_015733	GGAT	2	8	192845	192852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015733	CAA	2	6	192875	192880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_015733	CTG	2	6	192966	192971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485103
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4099	NC_015733	GC	3	6	193114	193119	0 %	0 %	50 %	50 %	339485103
4100	NC_015733	CCG	3	9	193157	193165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485103
4101	NC_015733	TGG	2	6	193168	193173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485103
4102	NC_015733	CAGC	2	8	193202	193209	25 %	0 %	25 %	50 %	339485103
4103	NC_015733	CTG	2	6	193269	193274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485103
4104	NC_015733	CGA	2	6	193343	193348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485103
4105	NC_015733	GC	3	6	193401	193406	0 %	0 %	50 %	50 %	339485103
4106	NC_015733	CAG	2	6	193421	193426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485103
4107	NC_015733	GCA	2	6	193487	193492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485103
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4109	NC_015733	GCC	2	6	193570	193575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485103
4110	NC_015733	GTG	2	6	193583	193588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485103
4111	NC_015733	GCA	2	6	193658	193663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485103
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4115	NC_015733	GCA	2	6	193890	193895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485103
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4117	NC_015733	CTG	2	6	193967	193972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
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4120	NC_015733	GGC	2	6	194080	194085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485104
4121	NC_015733	TCG	2	6	194106	194111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4122	NC_015733	TGC	2	6	194112	194117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4123	NC_015733	GCC	2	6	194282	194287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485104
4124	NC_015733	GCT	2	6	194305	194310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4125	NC_015733	TAC	2	6	194312	194317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485104
4126	NC_015733	CG	3	6	194326	194331	0 %	0 %	50 %	50 %	339485104
4127	NC_015733	GCC	2	6	194333	194338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485104
4128	NC_015733	CTG	2	6	194372	194377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4129	NC_015733	CTG	2	6	194480	194485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4130	NC_015733	CAG	2	6	194509	194514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4131	NC_015733	TGC	2	6	194520	194525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4132	NC_015733	CTG	2	6	194579	194584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4133	NC_015733	GCAAGG	2	12	194595	194606	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339485104
4134	NC_015733	TGC	2	6	194607	194612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4135	NC_015733	GCC	2	6	194627	194632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485104
4136	NC_015733	CG	3	6	194698	194703	0 %	0 %	50 %	50 %	339485104
4137	NC_015733	GC	3	6	194716	194721	0 %	0 %	50 %	50 %	339485104
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4140	NC_015733	GC	3	6	194900	194905	0 %	0 %	50 %	50 %	339485104
4141	NC_015733	GCC	2	6	194915	194920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485104
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4144	NC_015733	GCC	2	6	194973	194978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485104
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4148	NC_015733	CTG	2	6	195137	195142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4149	NC_015733	CTG	2	6	195152	195157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485104
4150	NC_015733	CG	3	6	195205	195210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4151	NC_015733	TATC	2	8	195239	195246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4152	NC_015733	TTC	2	6	195272	195277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4153	NC_015733	TCA	2	6	195386	195391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_015733	TGC	2	6	195414	195419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485105
4155	NC_015733	T	6	6	195437	195442	0 %	100 %	0 %	0 %	339485105
4156	NC_015733	CCTG	3	12	195446	195457	0 %	25 %	25 %	50 %	339485105
4157	NC_015733	GTGCC	2	10	195512	195521	0 %	20 %	40 %	40 %	339485105
4158	NC_015733	CAGC	2	8	195532	195539	25 %	0 %	25 %	50 %	339485105
4159	NC_015733	GCT	3	9	195541	195549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485105
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4170	NC_015733	AAT	2	6	196027	196032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4171	NC_015733	CTG	2	6	196075	196080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4172	NC_015733	CG	3	6	196096	196101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4173	NC_015733	GTG	2	6	196105	196110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4174	NC_015733	TGGGG	2	10	196184	196193	0 %	20 %	80 %	0 %	339485106
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4191	NC_015733	TG	3	6	197323	197328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4192	NC_015733	GC	3	6	197457	197462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4193	NC_015733	AAC	2	6	197534	197539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485108
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4206	NC_015733	ACC	2	6	198056	198061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485109
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4221	NC_015733	GCT	2	6	198455	198460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485109
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4224	NC_015733	CTG	2	6	198558	198563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485109
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4228	NC_015733	GCCA	2	8	198737	198744	25 %	0 %	25 %	50 %	339485110
4229	NC_015733	GTC	2	6	198745	198750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485110
4230	NC_015733	CGC	2	6	198856	198861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485110
4231	NC_015733	GC	3	6	198968	198973	0 %	0 %	50 %	50 %	339485110
4232	NC_015733	CAG	3	9	199018	199026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485110
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4234	NC_015733	CAGGGC	2	12	199090	199101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339485110
4235	NC_015733	CAT	2	6	199172	199177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4236	NC_015733	GGCC	2	8	199262	199269	0 %	0 %	50 %	50 %	339485111
4237	NC_015733	TGC	2	6	199312	199317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485111
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4239	NC_015733	CG	3	6	199439	199444	0 %	0 %	50 %	50 %	339485111
4240	NC_015733	ACG	2	6	199489	199494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485111
4241	NC_015733	GC	3	6	199506	199511	0 %	0 %	50 %	50 %	339485111
4242	NC_015733	GC	3	6	199560	199565	0 %	0 %	50 %	50 %	339485111
4243	NC_015733	GGCC	2	8	199574	199581	0 %	0 %	50 %	50 %	339485111
4244	NC_015733	CCG	2	6	199607	199612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485111
4245	NC_015733	TGGC	2	8	199631	199638	0 %	25 %	50 %	25 %	339485111
4246	NC_015733	CTG	3	9	199683	199691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485111
4247	NC_015733	CGA	2	6	199694	199699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485111
4248	NC_015733	ACCA	2	8	199704	199711	50 %	0 %	0 %	50 %	339485111
4249	NC_015733	GGA	2	6	199739	199744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485111
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4260	NC_015733	GCC	2	6	200275	200280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485111
4261	NC_015733	GAC	2	6	200340	200345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485111
4262	NC_015733	GCT	2	6	200357	200362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485111
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4264	NC_015733	CGA	2	6	200447	200452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485111
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4267	NC_015733	CTG	3	9	200526	200534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485111
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4271	NC_015733	CGA	2	6	200657	200662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485111
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4274	NC_015733	GCTG	2	8	200725	200732	0 %	25 %	50 %	25 %	339485111
4275	NC_015733	CAGCG	2	10	200745	200754	20 %	0 %	40 %	40 %	339485111
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4283	NC_015733	CTG	2	6	200973	200978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485111
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4288	NC_015733	GGA	2	6	201110	201115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4289	NC_015733	A	7	7	201148	201154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4290	NC_015733	T	6	6	201164	201169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4291	NC_015733	CGAG	2	8	201206	201213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4292	NC_015733	GT	3	6	201214	201219	0 %	50 %	50 %	0 %	339485112
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4300	NC_015733	GCGT	2	8	201528	201535	0 %	25 %	50 %	25 %	339485112
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4302	NC_015733	TCA	2	6	201633	201638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485112
4303	NC_015733	TGC	2	6	201750	201755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485112
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4312	NC_015733	GCTG	2	8	202383	202390	0 %	25 %	50 %	25 %	339485113
4313	NC_015733	GAT	2	6	202417	202422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485113
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4328	NC_015733	CAG	2	6	203274	203279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485114
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4347	NC_015733	CTGC	2	8	204107	204114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4348	NC_015733	G	6	6	204141	204146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4349	NC_015733	CAT	2	6	204161	204166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4350	NC_015733	CAT	2	6	204221	204226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485115
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4353	NC_015733	CCG	2	6	204280	204285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485115
4354	NC_015733	CAT	2	6	204332	204337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485115
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4358	NC_015733	GGCG	2	8	204643	204650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4359	NC_015733	AGG	2	6	204675	204680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4360	NC_015733	ATCC	2	8	204697	204704	25 %	25 %	0 %	50 %	339485116
4361	NC_015733	AAC	2	6	204722	204727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485116
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4363	NC_015733	GCCA	2	8	204769	204776	25 %	0 %	25 %	50 %	339485116
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4485	NC_015733	GCCA	2	8	211022	211029	25 %	0 %	25 %	50 %	339485122
4486	NC_015733	TGC	2	6	211031	211036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4487	NC_015733	ACC	2	6	211053	211058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485122
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4489	NC_015733	CAG	2	6	211075	211080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4490	NC_015733	AGC	2	6	211085	211090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4491	NC_015733	GCA	2	6	211092	211097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4492	NC_015733	CGG	2	6	211124	211129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485122
4493	NC_015733	GCC	2	6	211268	211273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485122
4494	NC_015733	TGGCC	2	10	211278	211287	0 %	20 %	40 %	40 %	339485122
4495	NC_015733	TCG	2	6	211334	211339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4496	NC_015733	GCA	2	6	211347	211352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4497	NC_015733	CTGC	2	8	211356	211363	0 %	25 %	25 %	50 %	339485122
4498	NC_015733	ACC	2	6	211413	211418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485122
4499	NC_015733	GTG	2	6	211446	211451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485122
4500	NC_015733	GAT	2	6	211492	211497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485122

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