MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015733	TGAC	2	8	133798	133805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_015733	ACTG	2	8	134079	134086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_015733	ACCGA	2	10	134091	134100	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3004	NC_015733	AC	3	6	134305	134310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_015733	CGTC	2	8	134323	134330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_015733	AAC	2	6	134342	134347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015733	AGG	2	6	134416	134421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015733	AGC	2	6	134432	134437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_015733	AAAG	2	8	134446	134453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015733	AGTCG	2	10	134468	134477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3011	NC_015733	TGA	2	6	134537	134542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015733	GTTG	2	8	134812	134819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015733	GGT	2	6	134831	134836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015733	TGA	2	6	134880	134885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015733	CGA	2	6	134901	134906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015733	GGT	2	6	134981	134986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015733	GA	3	6	135011	135016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015733	TTA	2	6	135137	135142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015733	CGG	2	6	135261	135266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015733	GGC	2	6	135342	135347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015733	TGAAAT	2	12	135370	135381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015733	ACC	2	6	135532	135537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_015733	TGG	2	6	135592	135597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015733	TCC	2	6	135618	135623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_015733	GGA	2	6	135635	135640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015733	GC	3	6	135696	135701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_015733	GGT	2	6	135755	135760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015733	CGG	2	6	135842	135847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015733	TCA	2	6	135870	135875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_015733	CGT	2	6	135950	135955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_015733	GCT	2	6	136004	136009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_015733	ACG	2	6	136186	136191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015733	GT	3	6	136204	136209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015733	GGT	2	6	136299	136304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015733	GAC	2	6	136397	136402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_015733	ACC	2	6	136417	136422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_015733	ATCCC	2	10	136425	136434	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3038	NC_015733	CAG	2	6	136440	136445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015733	CA	3	6	136606	136611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_015733	GAC	2	6	136621	136626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_015733	ACC	2	6	136641	136646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_015733	ATCCC	2	10	136649	136658	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3043	NC_015733	CAG	2	6	136664	136669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_015733	GC	3	6	136845	136850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_015733	GC	3	6	136915	136920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_015733	CGT	2	6	136967	136972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_015733	AGT	2	6	137030	137035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485068
3048	NC_015733	TTG	2	6	137317	137322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485068
3049	NC_015733	CAG	2	6	137391	137396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3050	NC_015733	GCGA	2	8	137444	137451	25 %	0 %	50 %	25 %	339485068
3051	NC_015733	TCA	2	6	137479	137484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485068
3052	NC_015733	TCGG	2	8	137593	137600	0 %	25 %	50 %	25 %	339485068
3053	NC_015733	CCA	2	6	137822	137827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485068
3054	NC_015733	TGC	2	6	137851	137856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3055	NC_015733	GCG	2	6	137859	137864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485068
3056	NC_015733	CACGT	2	10	137953	137962	20 %	20 %	20 %	40 %	339485068
3057	NC_015733	GGC	2	6	138009	138014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485068
3058	NC_015733	GAA	2	6	138021	138026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485068
3059	NC_015733	CTGC	2	8	138029	138036	0 %	25 %	25 %	50 %	339485068
3060	NC_015733	TGT	2	6	138041	138046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485068
3061	NC_015733	GAT	2	6	138048	138053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485068
3062	NC_015733	TCG	2	6	138070	138075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3063	NC_015733	CG	3	6	138181	138186	0 %	0 %	50 %	50 %	339485068
3064	NC_015733	GCA	2	6	138311	138316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3065	NC_015733	GCC	2	6	138333	138338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485068
3066	NC_015733	GCC	2	6	138345	138350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485068
3067	NC_015733	TGC	2	6	138361	138366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3068	NC_015733	CGGC	2	8	138416	138423	0 %	0 %	50 %	50 %	339485068
3069	NC_015733	TTC	2	6	138438	138443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485068
3070	NC_015733	TTG	2	6	138445	138450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485068
3071	NC_015733	TG	3	6	138460	138465	0 %	50 %	50 %	0 %	339485068
3072	NC_015733	CTT	2	6	138606	138611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485068
3073	NC_015733	GGT	2	6	138612	138617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485068
3074	NC_015733	CCA	2	6	138623	138628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485068
3075	NC_015733	CGT	2	6	138782	138787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3076	NC_015733	TCA	2	6	138895	138900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485068
3077	NC_015733	CTG	2	6	138903	138908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3078	NC_015733	ACC	2	6	138916	138921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485068
3079	NC_015733	CCA	2	6	138941	138946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485068
3080	NC_015733	TGC	2	6	139001	139006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3081	NC_015733	GCA	2	6	139082	139087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3082	NC_015733	AGC	2	6	139135	139140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3083	NC_015733	GGT	2	6	139158	139163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485068
3084	NC_015733	GCGA	2	8	139239	139246	25 %	0 %	50 %	25 %	339485068
3085	NC_015733	CCGG	2	8	139273	139280	0 %	0 %	50 %	50 %	339485068
3086	NC_015733	GTG	2	6	139290	139295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485068
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3088	NC_015733	GCT	2	6	139336	139341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485068
3089	NC_015733	CAGGC	2	10	139558	139567	20 %	0 %	40 %	40 %	339485069
3090	NC_015733	CACC	2	8	139578	139585	25 %	0 %	0 %	75 %	339485069
3091	NC_015733	GCGT	2	8	139616	139623	0 %	25 %	50 %	25 %	339485069
3092	NC_015733	GCA	2	6	139634	139639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485069
3093	NC_015733	AC	3	6	139664	139669	50 %	0 %	0 %	50 %	339485069
3094	NC_015733	TCG	2	6	139693	139698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485069
3095	NC_015733	CAGGT	2	10	139702	139711	20 %	20 %	40 %	20 %	339485069
3096	NC_015733	GCCGG	2	10	139887	139896	0 %	0 %	60 %	40 %	339485069
3097	NC_015733	TGAC	2	8	139915	139922	25 %	25 %	25 %	25 %	339485069
3098	NC_015733	ATC	2	6	140032	140037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485069
3099	NC_015733	TGC	2	6	140065	140070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485069
3100	NC_015733	CGT	2	6	140146	140151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485069
3101	NC_015733	CGC	2	6	140240	140245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485069
3102	NC_015733	AGC	2	6	140248	140253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485069
3103	NC_015733	CGG	2	6	140266	140271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485069
3104	NC_015733	GCA	2	6	140357	140362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485069
3105	NC_015733	TGTTCG	2	12	140377	140388	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339485069
3106	NC_015733	GC	3	6	140408	140413	0 %	0 %	50 %	50 %	339485069
3107	NC_015733	TGC	2	6	140419	140424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485069
3108	NC_015733	GCG	2	6	140503	140508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485069
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3110	NC_015733	CG	3	6	140656	140661	0 %	0 %	50 %	50 %	339485070
3111	NC_015733	GC	3	6	140692	140697	0 %	0 %	50 %	50 %	339485070
3112	NC_015733	CAG	3	9	140716	140724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485070
3113	NC_015733	CTC	2	6	140797	140802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485070
3114	NC_015733	GCG	2	6	140803	140808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485070
3115	NC_015733	GATC	2	8	140814	140821	25 %	25 %	25 %	25 %	339485070
3116	NC_015733	CG	3	6	140829	140834	0 %	0 %	50 %	50 %	339485070
3117	NC_015733	AAG	2	6	140846	140851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485070
3118	NC_015733	GT	3	6	140859	140864	0 %	50 %	50 %	0 %	339485070
3119	NC_015733	GCT	2	6	140874	140879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485070
3120	NC_015733	GCA	2	6	140889	140894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485070
3121	NC_015733	CGG	2	6	140922	140927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485070
3122	NC_015733	CGG	2	6	140931	140936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485070
3123	NC_015733	TGC	2	6	140949	140954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485070
3124	NC_015733	CAGC	2	8	140968	140975	25 %	0 %	25 %	50 %	339485070
3125	NC_015733	GTG	2	6	140977	140982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485070
3126	NC_015733	GGA	2	6	141022	141027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015733	ATGA	2	8	141048	141055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015733	TTG	2	6	141068	141073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015733	TCAA	2	8	141081	141088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_015733	CGTG	2	8	141111	141118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3243	NC_015733	CGA	2	6	147234	147239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485075
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3245	NC_015733	TCT	2	6	147294	147299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485075
3246	NC_015733	GGA	2	6	147307	147312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485075
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3248	NC_015733	TCG	2	6	147344	147349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485075
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3366	NC_015733	CAC	2	6	152476	152481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3367	NC_015733	CGA	2	6	152508	152513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3490	NC_015733	AGC	2	6	161731	161736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3491	NC_015733	TGACC	2	10	161900	161909	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
3492	NC_015733	CAA	2	6	161921	161926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3493	NC_015733	TCA	2	6	161938	161943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485080
3494	NC_015733	CGA	2	6	161990	161995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3495	NC_015733	GTG	2	6	162123	162128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485080
3496	NC_015733	GGC	2	6	162162	162167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485080
3497	NC_015733	AGC	2	6	162394	162399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3498	NC_015733	TGACC	2	10	162563	162572	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
3499	NC_015733	CAA	2	6	162584	162589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3500	NC_015733	TCA	2	6	162601	162606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485080

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