MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Parachlamydia acanthamoebae UV-7 chromosome

Total Repeats: 2272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015702	TTAAT	2	10	1	10	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015702	ATTGG	2	10	524	533	20 %	40 %	40 %	0 %	338173995
3	NC_015702	GTTGT	2	10	2495	2504	0 %	60 %	40 %	0 %	338173998
4	NC_015702	TTATC	2	10	4109	4118	20 %	60 %	0 %	20 %	338174000
5	NC_015702	TTTCT	2	10	4872	4881	0 %	80 %	0 %	20 %	338174000
6	NC_015702	TTGCT	2	10	7105	7114	0 %	60 %	20 %	20 %	338174002
7	NC_015702	TAAGT	2	10	7951	7960	40 %	40 %	20 %	0 %	338174003
8	NC_015702	AGTTA	2	10	8734	8743	40 %	40 %	20 %	0 %	338174003
9	NC_015702	TCTTT	2	10	9114	9123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015702	CATGA	2	10	10657	10666	40 %	20 %	20 %	20 %	338174004
11	NC_015702	AAATC	2	10	12349	12358	60 %	20 %	0 %	20 %	338174005
12	NC_015702	AGTTA	2	10	13883	13892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015702	ACATC	2	10	15103	15112	40 %	20 %	0 %	40 %	338174007
14	NC_015702	AGAAA	2	10	15470	15479	80 %	0 %	20 %	0 %	338174007
15	NC_015702	ACTGC	2	10	15986	15995	20 %	20 %	20 %	40 %	338174008
16	NC_015702	GTGGG	2	10	16241	16250	0 %	20 %	80 %	0 %	338174008
17	NC_015702	TGAAG	2	10	16413	16422	40 %	20 %	40 %	0 %	338174008
18	NC_015702	TATGA	2	10	17356	17365	40 %	40 %	20 %	0 %	338174009
19	NC_015702	AACAG	2	10	17905	17914	60 %	0 %	20 %	20 %	338174009
20	NC_015702	AATGC	2	10	18262	18271	40 %	20 %	20 %	20 %	338174009
21	NC_015702	CGGAT	2	10	20125	20134	20 %	20 %	40 %	20 %	338174011
22	NC_015702	TGCTT	2	10	21052	21061	0 %	60 %	20 %	20 %	338174012
23	NC_015702	AATTA	2	10	21597	21606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015702	AAAAT	2	10	23218	23227	80 %	20 %	0 %	0 %	338174013
25	NC_015702	AAAGA	2	10	23375	23384	80 %	0 %	20 %	0 %	338174013
26	NC_015702	ATAAA	2	10	28992	29001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015702	TTTAA	2	10	29018	29027	40 %	60 %	0 %	0 %	338174018
28	NC_015702	AATAA	2	10	29296	29305	80 %	20 %	0 %	0 %	338174018
29	NC_015702	ATTTT	2	10	30197	30206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015702	GATGG	2	10	31375	31384	20 %	20 %	60 %	0 %	338174020
31	NC_015702	CCAAA	2	10	34826	34835	60 %	0 %	0 %	40 %	338174023
32	NC_015702	ACATA	2	10	35524	35533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015702	TAAAA	2	10	36397	36406	80 %	20 %	0 %	0 %	338174025
34	NC_015702	AGCGT	2	10	36506	36515	20 %	20 %	40 %	20 %	338174025
35	NC_015702	ATTGA	2	10	38589	38598	40 %	40 %	20 %	0 %	338174027
36	NC_015702	AAAGT	2	10	40877	40886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015702	CTTAA	2	10	41105	41114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015702	TGCCT	2	10	42739	42748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015702	ATCCA	2	10	44408	44417	40 %	20 %	0 %	40 %	338174033
40	NC_015702	GAAAA	2	10	49200	49209	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015702	GATTG	2	10	49910	49919	20 %	40 %	40 %	0 %	338174039
42	NC_015702	ATTTA	2	10	50062	50071	40 %	60 %	0 %	0 %	338174039
43	NC_015702	TTATT	2	10	52414	52423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015702	TAAAA	2	10	53614	53623	80 %	20 %	0 %	0 %	338174043
45	NC_015702	GATTG	2	10	54015	54024	20 %	40 %	40 %	0 %	338174043
46	NC_015702	ATTTC	2	10	54684	54693	20 %	60 %	0 %	20 %	338174044
47	NC_015702	TACGA	2	10	57996	58005	40 %	20 %	20 %	20 %	338174048
48	NC_015702	GTTTC	2	10	62436	62445	0 %	60 %	20 %	20 %	338174052
49	NC_015702	CCTCT	2	10	63515	63524	0 %	40 %	0 %	60 %	338174054
50	NC_015702	TCTTT	2	10	68543	68552	0 %	80 %	0 %	20 %	338174060
51	NC_015702	TCGAT	2	10	72378	72387	20 %	40 %	20 %	20 %	338174063
52	NC_015702	TAAGC	2	10	72805	72814	40 %	20 %	20 %	20 %	338174064
53	NC_015702	TCCAA	2	10	73864	73873	40 %	20 %	0 %	40 %	338174065
54	NC_015702	CAGTC	2	10	74577	74586	20 %	20 %	20 %	40 %	338174065
55	NC_015702	AAATA	2	10	75205	75214	80 %	20 %	0 %	0 %	338174066
56	NC_015702	AGAAA	2	10	75302	75311	80 %	0 %	20 %	0 %	338174066
57	NC_015702	AGAGT	2	10	76314	76323	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015702	ATGAA	2	10	77734	77743	60 %	20 %	20 %	0 %	338174067
59	NC_015702	TTTTA	2	10	77943	77952	20 %	80 %	0 %	0 %	338174067
60	NC_015702	ATTTC	2	10	81224	81233	20 %	60 %	0 %	20 %	338174070
61	NC_015702	AGAAA	2	10	81424	81433	80 %	0 %	20 %	0 %	338174070
62	NC_015702	GCAGA	2	10	82105	82114	40 %	0 %	40 %	20 %	338174072
63	NC_015702	TTTTA	2	10	83964	83973	20 %	80 %	0 %	0 %	338174074
64	NC_015702	GGATC	2	10	86278	86287	20 %	20 %	40 %	20 %	338174076
65	NC_015702	TGTCA	2	10	86429	86438	20 %	40 %	20 %	20 %	338174076
66	NC_015702	TTGGT	2	10	87514	87523	0 %	60 %	40 %	0 %	338174077
67	NC_015702	GCTTA	2	10	87607	87616	20 %	40 %	20 %	20 %	338174077
68	NC_015702	AAATT	2	10	95696	95705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015702	AAATG	2	10	96773	96782	60 %	20 %	20 %	0 %	338174083
70	NC_015702	CTTTG	2	10	97435	97444	0 %	60 %	20 %	20 %	338174084
71	NC_015702	TGACT	2	10	99737	99746	20 %	40 %	20 %	20 %	338174085
72	NC_015702	AAAAT	2	10	100864	100873	80 %	20 %	0 %	0 %	338174085
73	NC_015702	TCCCT	2	10	102115	102124	0 %	40 %	0 %	60 %	338174085
74	NC_015702	AAATA	2	10	102672	102681	80 %	20 %	0 %	0 %	338174086
75	NC_015702	AATGA	2	10	105407	105416	60 %	20 %	20 %	0 %	338174086
76	NC_015702	TTAAA	2	10	108964	108973	60 %	40 %	0 %	0 %	338174092
77	NC_015702	GAAAT	2	10	112695	112704	60 %	20 %	20 %	0 %	338174098
78	NC_015702	AAATT	2	10	113372	113381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015702	TGACC	2	10	116594	116603	20 %	20 %	20 %	40 %	338174102
80	NC_015702	ATAGC	2	10	116666	116675	40 %	20 %	20 %	20 %	338174102
81	NC_015702	ATTTT	2	10	117454	117463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015702	TATTT	2	10	118764	118773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015702	CAAGA	2	10	120486	120495	60 %	0 %	20 %	20 %	338174105
84	NC_015702	CGATC	2	10	120911	120920	20 %	20 %	20 %	40 %	338174106
85	NC_015702	TGGAA	2	10	121890	121899	40 %	20 %	40 %	0 %	338174107
86	NC_015702	CATTT	2	10	122194	122203	20 %	60 %	0 %	20 %	338174107
87	NC_015702	GTTTG	2	10	123815	123824	0 %	60 %	40 %	0 %	338174108
88	NC_015702	TTTTG	2	10	123951	123960	0 %	80 %	20 %	0 %	338174108
89	NC_015702	GCACA	2	10	125446	125455	40 %	0 %	20 %	40 %	338174111
90	NC_015702	CAAAA	2	10	127228	127237	80 %	0 %	0 %	20 %	338174111
91	NC_015702	CACGA	2	10	127373	127382	40 %	0 %	20 %	40 %	338174111
92	NC_015702	ACAAG	2	10	128229	128238	60 %	0 %	20 %	20 %	338174111
93	NC_015702	TCTGT	2	10	135807	135816	0 %	60 %	20 %	20 %	338174118
94	NC_015702	TCAAT	2	10	138687	138696	40 %	40 %	0 %	20 %	338174122
95	NC_015702	TTTTC	2	10	143590	143599	0 %	80 %	0 %	20 %	338174130
96	NC_015702	ATCAA	2	10	143795	143804	60 %	20 %	0 %	20 %	338174130
97	NC_015702	CGCCT	2	10	144796	144805	0 %	20 %	20 %	60 %	338174131
98	NC_015702	AGGAA	2	10	145514	145523	60 %	0 %	40 %	0 %	338174131
99	NC_015702	ATTTA	2	10	146462	146471	40 %	60 %	0 %	0 %	338174131
100	NC_015702	ATTTT	2	10	146536	146545	20 %	80 %	0 %	0 %	338174131
101	NC_015702	CTTTT	2	10	150772	150781	0 %	80 %	0 %	20 %	338174134
102	NC_015702	GCTTT	2	10	150920	150929	0 %	60 %	20 %	20 %	338174135
103	NC_015702	TTTAA	2	10	151418	151427	40 %	60 %	0 %	0 %	338174136
104	NC_015702	ATTGA	2	10	152040	152049	40 %	40 %	20 %	0 %	338174136
105	NC_015702	TTTAA	2	10	152673	152682	40 %	60 %	0 %	0 %	338174136
106	NC_015702	CGATG	2	10	153075	153084	20 %	20 %	40 %	20 %	338174137
107	NC_015702	TTGTG	2	10	153128	153137	0 %	60 %	40 %	0 %	338174137
108	NC_015702	AAAAT	2	10	154069	154078	80 %	20 %	0 %	0 %	338174138
109	NC_015702	TTTGC	2	10	154242	154251	0 %	60 %	20 %	20 %	338174138
110	NC_015702	AAAGC	2	10	155713	155722	60 %	0 %	20 %	20 %	338174140
111	NC_015702	CATTC	2	10	156274	156283	20 %	40 %	0 %	40 %	338174140
112	NC_015702	CCTTT	2	10	156603	156612	0 %	60 %	0 %	40 %	338174141
113	NC_015702	TTCTT	2	10	157655	157664	0 %	80 %	0 %	20 %	338174143
114	NC_015702	ATATC	2	10	158183	158192	40 %	40 %	0 %	20 %	338174143
115	NC_015702	CAAGA	2	10	159576	159585	60 %	0 %	20 %	20 %	338174144
116	NC_015702	GCTTT	2	10	160702	160711	0 %	60 %	20 %	20 %	338174146
117	NC_015702	CTTCC	2	10	162029	162038	0 %	40 %	0 %	60 %	338174148
118	NC_015702	AAAAC	2	10	162112	162121	80 %	0 %	0 %	20 %	338174148
119	NC_015702	AAGTG	2	10	162228	162237	40 %	20 %	40 %	0 %	338174148
120	NC_015702	AAATC	2	10	162904	162913	60 %	20 %	0 %	20 %	338174148
121	NC_015702	AAAAG	2	10	163706	163715	80 %	0 %	20 %	0 %	338174149
122	NC_015702	GGAAT	2	10	164291	164300	40 %	20 %	40 %	0 %	338174150
123	NC_015702	TTTTC	2	10	167064	167073	0 %	80 %	0 %	20 %	338174154
124	NC_015702	AAGCT	2	10	170495	170504	40 %	20 %	20 %	20 %	338174158
125	NC_015702	ACCAA	2	10	170590	170599	60 %	0 %	0 %	40 %	338174158
126	NC_015702	GACAT	2	10	174104	174113	40 %	20 %	20 %	20 %	338174161
127	NC_015702	AAGAC	2	10	174134	174143	60 %	0 %	20 %	20 %	338174161
128	NC_015702	TGATC	2	10	176930	176939	20 %	40 %	20 %	20 %	338174163
129	NC_015702	TGTGA	2	10	177498	177507	20 %	40 %	40 %	0 %	338174164
130	NC_015702	GATCA	2	10	179040	179049	40 %	20 %	20 %	20 %	338174164
131	NC_015702	CCCAA	2	10	179525	179534	40 %	0 %	0 %	60 %	338174164
132	NC_015702	TTAAA	2	10	179765	179774	60 %	40 %	0 %	0 %	338174164
133	NC_015702	GGTTG	2	10	180197	180206	0 %	40 %	60 %	0 %	338174164
134	NC_015702	GTGAT	2	10	181938	181947	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015702	ATGGA	2	10	184401	184410	40 %	20 %	40 %	0 %	338174166
136	NC_015702	CAAGA	2	10	184868	184877	60 %	0 %	20 %	20 %	338174166
137	NC_015702	ATCCT	2	10	185525	185534	20 %	40 %	0 %	40 %	338174166
138	NC_015702	AGTAA	2	10	187165	187174	60 %	20 %	20 %	0 %	338174166
139	NC_015702	CAAGT	2	10	188145	188154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015702	AAAAT	2	10	188332	188341	80 %	20 %	0 %	0 %	338174168
141	NC_015702	TAAAT	2	10	190178	190187	60 %	40 %	0 %	0 %	338174169
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145	NC_015702	ATTTA	2	10	192410	192419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_015702	TCCTC	2	10	269400	269409	0 %	40 %	0 %	60 %	338174246
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253	NC_015702	TTGGT	2	10	354225	354234	0 %	60 %	40 %	0 %	338174315
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255	NC_015702	ATCGA	2	10	355578	355587	40 %	20 %	20 %	20 %	338174317
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257	NC_015702	AGTTT	2	10	359877	359886	20 %	60 %	20 %	0 %	338174320
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259	NC_015702	TAAAA	2	10	363469	363478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_015702	TTTAT	2	10	364240	364249	20 %	80 %	0 %	0 %	338174321
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264	NC_015702	AATCT	2	10	368991	369000	40 %	40 %	0 %	20 %	338174322
265	NC_015702	GATAT	2	10	369146	369155	40 %	40 %	20 %	0 %	338174322
266	NC_015702	ATTGC	2	10	370313	370322	20 %	40 %	20 %	20 %	338174323
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