MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015680	GCAAAG	2	12	50681	50692	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	337283562
1003	NC_015680	AGC	2	6	50737	50742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283562
1004	NC_015680	GCT	2	6	50750	50755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283562
1005	NC_015680	GCA	2	6	50811	50816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283562
1006	NC_015680	CAA	2	6	50844	50849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283562
1007	NC_015680	AAAG	2	8	51084	51091	75 %	0 %	25 %	0 %	337283562
1008	NC_015680	TGA	2	6	51212	51217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283563
1009	NC_015680	ACG	2	6	51274	51279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283563
1010	NC_015680	CTT	2	6	51284	51289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283563
1011	NC_015680	TG	3	6	51470	51475	0 %	50 %	50 %	0 %	337283563
1012	NC_015680	GGA	2	6	51558	51563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283563
1013	NC_015680	TTC	2	6	51583	51588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283563
1014	NC_015680	CTG	2	6	51596	51601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283563
1015	NC_015680	CTTG	2	8	51606	51613	0 %	50 %	25 %	25 %	337283563
1016	NC_015680	GTA	2	6	51633	51638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283563
1017	NC_015680	TTC	2	6	51660	51665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283563
1018	NC_015680	CTT	2	6	51669	51674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283563
1019	NC_015680	TTA	2	6	51704	51709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283563
1020	NC_015680	TTCCG	2	10	51732	51741	0 %	40 %	20 %	40 %	337283563
1021	NC_015680	GCC	2	6	51831	51836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283563
1022	NC_015680	ATT	2	6	51853	51858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283563
1023	NC_015680	GGAA	2	8	51943	51950	50 %	0 %	50 %	0 %	337283563
1024	NC_015680	CAA	2	6	51980	51985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283563
1025	NC_015680	GTC	2	6	51990	51995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283563
1026	NC_015680	CT	3	6	52046	52051	0 %	50 %	0 %	50 %	337283563
1027	NC_015680	TCC	2	6	52076	52081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283563
1028	NC_015680	AGC	2	6	52138	52143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283563
1029	NC_015680	ATA	2	6	52170	52175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283563
1030	NC_015680	TAT	2	6	52215	52220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283563
1031	NC_015680	AAG	2	6	52237	52242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283563
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1033	NC_015680	CTT	2	6	52277	52282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283563
1034	NC_015680	CT	3	6	52345	52350	0 %	50 %	0 %	50 %	337283563
1035	NC_015680	TGAA	2	8	52355	52362	50 %	25 %	25 %	0 %	337283563
1036	NC_015680	TAT	2	6	52368	52373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283563
1037	NC_015680	TCT	2	6	52406	52411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283563
1038	NC_015680	CGA	2	6	52472	52477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283563
1039	NC_015680	ACC	2	6	52527	52532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283563
1040	NC_015680	GAA	2	6	52556	52561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283563
1041	NC_015680	CAA	2	6	52685	52690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283563
1042	NC_015680	TGT	2	6	52697	52702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283563
1043	NC_015680	TCC	2	6	52785	52790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283563
1044	NC_015680	ATT	2	6	52804	52809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283563
1045	NC_015680	CTT	2	6	52875	52880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283563
1046	NC_015680	AT	3	6	52897	52902	50 %	50 %	0 %	0 %	337283563
1047	NC_015680	CT	4	8	52997	53004	0 %	50 %	0 %	50 %	337283563
1048	NC_015680	GGC	2	6	53005	53010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283563
1049	NC_015680	GTA	2	6	53110	53115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015680	CCA	2	6	53192	53197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_015680	CCA	2	6	53237	53242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_015680	CTT	2	6	53345	53350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015680	CAA	2	6	53370	53375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015680	CAGG	2	8	53382	53389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_015680	CAA	2	6	53459	53464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283564
1056	NC_015680	CCT	2	6	53470	53475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283564
1057	NC_015680	CTCC	2	8	53629	53636	0 %	25 %	0 %	75 %	337283564
1058	NC_015680	CCCT	2	8	53734	53741	0 %	25 %	0 %	75 %	337283564
1059	NC_015680	GGA	2	6	53844	53849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283564
1060	NC_015680	TCA	2	6	53875	53880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283564
1061	NC_015680	CTT	2	6	53963	53968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283564
1062	NC_015680	TAAG	2	8	54028	54035	50 %	25 %	25 %	0 %	337283564
1063	NC_015680	ACC	2	6	54086	54091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283564
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1067	NC_015680	CGT	2	6	54362	54367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283564
1068	NC_015680	CTT	2	6	54470	54475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283564
1069	NC_015680	GAA	2	6	54553	54558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283565
1070	NC_015680	CAT	2	6	54565	54570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283565
1071	NC_015680	TAA	2	6	54608	54613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283565
1072	NC_015680	C	7	7	54624	54630	0 %	0 %	0 %	100 %	337283565
1073	NC_015680	CTA	2	6	54642	54647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283565
1074	NC_015680	TAT	2	6	54675	54680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283565
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1081	NC_015680	CAG	2	6	55099	55104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283565
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1088	NC_015680	GAC	2	6	55518	55523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283566
1089	NC_015680	AG	3	6	55544	55549	50 %	0 %	50 %	0 %	337283566
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1095	NC_015680	TA	3	6	55903	55908	50 %	50 %	0 %	0 %	337283566
1096	NC_015680	CGG	2	6	55988	55993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283566
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1098	NC_015680	TTC	2	6	56077	56082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283566
1099	NC_015680	GCC	2	6	56440	56445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283567
1100	NC_015680	GAA	2	6	56460	56465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283567
1101	NC_015680	TTC	2	6	56473	56478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283567
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1105	NC_015680	CGGGA	2	10	56610	56619	20 %	0 %	60 %	20 %	337283567
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1110	NC_015680	TCC	3	9	56983	56991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283567
1111	NC_015680	CCGG	2	8	56998	57005	0 %	0 %	50 %	50 %	337283567
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1115	NC_015680	AGCC	2	8	57157	57164	25 %	0 %	25 %	50 %	337283567
1116	NC_015680	GCC	2	6	57186	57191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283567
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1126	NC_015680	GA	5	10	57967	57976	50 %	0 %	50 %	0 %	337283568
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1251	NC_015680	ACC	2	6	64970	64975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1252	NC_015680	AAT	2	6	64983	64988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_015680	TTTGC	2	10	65126	65135	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1254	NC_015680	TGA	2	6	65143	65148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_015680	GAA	2	6	65231	65236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_015680	TA	3	6	65239	65244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_015680	ATGG	2	8	65335	65342	25 %	25 %	50 %	0 %	337283579
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1320	NC_015680	T	6	6	68825	68830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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