MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus sp. NA2 chromosome

Total Repeats: 36693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015474	A	7	7	24689	24695	100 %	0 %	0 %	0 %	332157674
502	NC_015474	AATT	2	8	24753	24760	50 %	50 %	0 %	0 %	332157674
503	NC_015474	TTA	2	6	24852	24857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157674
504	NC_015474	GAT	2	6	24977	24982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157674
505	NC_015474	AAC	2	6	24991	24996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157674
506	NC_015474	GAA	2	6	25099	25104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157674
507	NC_015474	AGA	2	6	25135	25140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157674
508	NC_015474	AAG	2	6	25190	25195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157674
509	NC_015474	TA	3	6	25256	25261	50 %	50 %	0 %	0 %	332157674
510	NC_015474	ATA	2	6	25397	25402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157674
511	NC_015474	GAG	2	6	25415	25420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157674
512	NC_015474	AG	3	6	25435	25440	50 %	0 %	50 %	0 %	332157674
513	NC_015474	GCT	2	6	25481	25486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157674
514	NC_015474	ATA	2	6	25574	25579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157674
515	NC_015474	GA	3	6	25676	25681	50 %	0 %	50 %	0 %	332157674
516	NC_015474	TGA	2	6	25729	25734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157674
517	NC_015474	GAA	2	6	25786	25791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157674
518	NC_015474	GA	3	6	25792	25797	50 %	0 %	50 %	0 %	332157674
519	NC_015474	T	6	6	25856	25861	0 %	100 %	0 %	0 %	332157675
520	NC_015474	TGG	2	6	25876	25881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157675
521	NC_015474	CTTAAA	2	12	25903	25914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332157675
522	NC_015474	GAT	2	6	25932	25937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157675
523	NC_015474	TTG	2	6	25958	25963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157675
524	NC_015474	ATTCT	2	10	25965	25974	20 %	60 %	0 %	20 %	332157675
525	NC_015474	TCC	2	6	26003	26008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157675
526	NC_015474	TTC	3	9	26062	26070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157675
527	NC_015474	GTT	2	6	26081	26086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157675
528	NC_015474	CT	3	6	26096	26101	0 %	50 %	0 %	50 %	332157675
529	NC_015474	GACA	2	8	26124	26131	50 %	0 %	25 %	25 %	332157675
530	NC_015474	CA	3	6	26134	26139	50 %	0 %	0 %	50 %	332157675
531	NC_015474	ATCT	2	8	26167	26174	25 %	50 %	0 %	25 %	332157675
532	NC_015474	TCTCT	2	10	26185	26194	0 %	60 %	0 %	40 %	332157675
533	NC_015474	CTT	2	6	26275	26280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157675
534	NC_015474	TCT	2	6	26325	26330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157675
535	NC_015474	CCAAG	2	10	26378	26387	40 %	0 %	20 %	40 %	332157675
536	NC_015474	GCT	2	6	26403	26408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157675
537	NC_015474	CTAT	2	8	26455	26462	25 %	50 %	0 %	25 %	332157676
538	NC_015474	TGG	2	6	26466	26471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157676
539	NC_015474	TCA	2	6	26486	26491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157676
540	NC_015474	CCAA	2	8	26521	26528	50 %	0 %	0 %	50 %	332157676
541	NC_015474	GTT	2	6	26531	26536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157676
542	NC_015474	TTA	2	6	26593	26598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157676
543	NC_015474	TAG	2	6	26636	26641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157676
544	NC_015474	TGG	2	6	26667	26672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157676
545	NC_015474	GTT	2	6	26750	26755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157676
546	NC_015474	TAT	2	6	26757	26762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157676
547	NC_015474	CTT	2	6	26788	26793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157676
548	NC_015474	CTT	2	6	26819	26824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157676
549	NC_015474	ATC	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157676
550	NC_015474	TATGT	2	10	26983	26992	20 %	60 %	20 %	0 %	332157676
551	NC_015474	TCT	2	6	27090	27095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157676
552	NC_015474	ACC	2	6	27099	27104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157676
553	NC_015474	ATT	2	6	27160	27165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157676
554	NC_015474	CT	4	8	27166	27173	0 %	50 %	0 %	50 %	332157676
555	NC_015474	GCC	2	6	27181	27186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332157676
556	NC_015474	CTG	2	6	27194	27199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157676
557	NC_015474	CT	3	6	27293	27298	0 %	50 %	0 %	50 %	332157676
558	NC_015474	ATT	2	6	27316	27321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157676
559	NC_015474	TCA	2	6	27322	27327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157676
560	NC_015474	TCCA	2	8	27483	27490	25 %	25 %	0 %	50 %	332157676
561	NC_015474	TC	3	6	27589	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	332157676
562	NC_015474	ATA	2	6	27625	27630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157676
563	NC_015474	TG	3	6	27725	27730	0 %	50 %	50 %	0 %	332157677
564	NC_015474	CT	3	6	27742	27747	0 %	50 %	0 %	50 %	332157677
565	NC_015474	AAG	2	6	27805	27810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157677
566	NC_015474	TA	3	6	27847	27852	50 %	50 %	0 %	0 %	332157677
567	NC_015474	TC	3	6	27959	27964	0 %	50 %	0 %	50 %	332157677
568	NC_015474	CTG	2	6	27983	27988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157677
569	NC_015474	ATT	2	6	28011	28016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157677
570	NC_015474	TC	3	6	28077	28082	0 %	50 %	0 %	50 %	332157677
571	NC_015474	ACCTT	2	10	28090	28099	20 %	40 %	0 %	40 %	332157677
572	NC_015474	TCC	2	6	28138	28143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157677
573	NC_015474	CCT	2	6	28168	28173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157678
574	NC_015474	TTCT	2	8	28251	28258	0 %	75 %	0 %	25 %	332157678
575	NC_015474	TCCA	2	8	28288	28295	25 %	25 %	0 %	50 %	332157678
576	NC_015474	TA	3	6	28332	28337	50 %	50 %	0 %	0 %	332157678
577	NC_015474	CCAT	2	8	28338	28345	25 %	25 %	0 %	50 %	332157678
578	NC_015474	TTA	3	9	28507	28515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157678
579	NC_015474	AGG	2	6	28631	28636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157678
580	NC_015474	CCA	2	6	28647	28652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157678
581	NC_015474	CAA	2	6	28669	28674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157678
582	NC_015474	CTT	2	6	28685	28690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157678
583	NC_015474	TAAA	2	8	28702	28709	75 %	25 %	0 %	0 %	332157678
584	NC_015474	AAT	2	6	28716	28721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157678
585	NC_015474	ACC	2	6	28740	28745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_015474	GCAA	2	8	28858	28865	50 %	0 %	25 %	25 %	332157679
587	NC_015474	CAC	2	6	28893	28898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157679
588	NC_015474	GTT	2	6	28936	28941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157679
589	NC_015474	GAA	2	6	28971	28976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157679
590	NC_015474	ACC	2	6	29034	29039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157679
591	NC_015474	ATA	2	6	29223	29228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157679
592	NC_015474	TTA	2	6	29240	29245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157679
593	NC_015474	GCAA	2	8	29272	29279	50 %	0 %	25 %	25 %	332157679
594	NC_015474	CT	3	6	29291	29296	0 %	50 %	0 %	50 %	332157679
595	NC_015474	ATT	2	6	29344	29349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157679
596	NC_015474	CTT	2	6	29511	29516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157679
597	NC_015474	GT	3	6	29531	29536	0 %	50 %	50 %	0 %	332157679
598	NC_015474	TAT	2	6	29538	29543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157679
599	NC_015474	TA	3	6	29551	29556	50 %	50 %	0 %	0 %	332157679
600	NC_015474	GGA	2	6	29557	29562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157679
601	NC_015474	TCC	2	6	29567	29572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157679
602	NC_015474	CATGAA	2	12	29607	29618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332157679
603	NC_015474	ACC	2	6	29662	29667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157679
604	NC_015474	CCT	2	6	29849	29854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157680
605	NC_015474	GAA	2	6	29865	29870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157680
606	NC_015474	CTGA	2	8	29915	29922	25 %	25 %	25 %	25 %	332157680
607	NC_015474	AACC	2	8	29997	30004	50 %	0 %	0 %	50 %	332157680
608	NC_015474	TCC	2	6	30063	30068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157680
609	NC_015474	CAA	2	6	30107	30112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157680
610	NC_015474	GC	3	6	30143	30148	0 %	0 %	50 %	50 %	332157680
611	NC_015474	ACCAA	2	10	30219	30228	60 %	0 %	0 %	40 %	332157680
612	NC_015474	TTA	2	6	30245	30250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157680
613	NC_015474	GAA	2	6	30276	30281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157680
614	NC_015474	GGA	2	6	30361	30366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157680
615	NC_015474	TCT	2	6	30419	30424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157680
616	NC_015474	GAA	2	6	30492	30497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157680
617	NC_015474	AG	3	6	30509	30514	50 %	0 %	50 %	0 %	332157680
618	NC_015474	AT	3	6	30531	30536	50 %	50 %	0 %	0 %	332157680
619	NC_015474	CCAA	2	8	30574	30581	50 %	0 %	0 %	50 %	332157680
620	NC_015474	GCA	2	6	30643	30648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157680
621	NC_015474	CCA	2	6	30655	30660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157680
622	NC_015474	TA	3	6	30693	30698	50 %	50 %	0 %	0 %	332157680
623	NC_015474	AG	3	6	30704	30709	50 %	0 %	50 %	0 %	332157680
624	NC_015474	CTC	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157680
625	NC_015474	GCTG	2	8	30946	30953	0 %	25 %	50 %	25 %	332157680
626	NC_015474	TCC	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157680
627	NC_015474	CAT	2	6	30969	30974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157680
628	NC_015474	TCCT	2	8	30979	30986	0 %	50 %	0 %	50 %	332157680
629	NC_015474	GAA	2	6	30987	30992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157680
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631	NC_015474	GCCT	2	8	31102	31109	0 %	25 %	25 %	50 %	332157680
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