MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas mendocina NK-01 chromosome

Total Repeats: 122247

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
122001	NC_015410	GCA	2	6	5423117	5423122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505861
122002	NC_015410	CAG	2	6	5423172	5423177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505861
122003	NC_015410	CAG	2	6	5423217	5423222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505861
122004	NC_015410	TCC	2	6	5423265	5423270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122005	NC_015410	TTG	2	6	5423298	5423303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122006	NC_015410	GTTT	2	8	5423322	5423329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122007	NC_015410	CAG	2	6	5423346	5423351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122008	NC_015410	CAT	2	6	5423459	5423464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330505862
122009	NC_015410	GCA	2	6	5423479	5423484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505862
122010	NC_015410	GAT	2	6	5423486	5423491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330505862
122011	NC_015410	GCA	2	6	5423521	5423526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505862
122012	NC_015410	CAC	2	6	5423527	5423532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330505862
122013	NC_015410	CAG	2	6	5423543	5423548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505862
122014	NC_015410	GCC	2	6	5423552	5423557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330505862
122015	NC_015410	ATG	2	6	5423565	5423570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330505862
122016	NC_015410	TGC	2	6	5423710	5423715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505862
122017	NC_015410	CCG	2	6	5423748	5423753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330505862
122018	NC_015410	GGT	2	6	5423831	5423836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330505862
122019	NC_015410	TGG	2	6	5423875	5423880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330505862
122020	NC_015410	CAGC	2	8	5423881	5423888	25 %	0 %	25 %	50 %	330505862
122021	NC_015410	TCA	2	6	5423926	5423931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330505862
122022	NC_015410	CGA	2	6	5424013	5424018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505862
122023	NC_015410	CGA	2	6	5424034	5424039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505862
122024	NC_015410	GC	3	6	5424077	5424082	0 %	0 %	50 %	50 %	330505862
122025	NC_015410	AGA	2	6	5424096	5424101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330505862
122026	NC_015410	ACC	2	6	5424120	5424125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330505862
122027	NC_015410	GGT	2	6	5424241	5424246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330505862
122028	NC_015410	CTG	2	6	5424271	5424276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505862
122029	NC_015410	ATT	2	6	5424279	5424284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330505862
122030	NC_015410	TTA	2	6	5424318	5424323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330505863
122031	NC_015410	CAG	2	6	5424355	5424360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505863
122032	NC_015410	AGC	2	6	5424484	5424489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505863
122033	NC_015410	GCC	2	6	5424553	5424558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330505863
122034	NC_015410	CAA	2	6	5424559	5424564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330505863
122035	NC_015410	AGC	2	6	5424617	5424622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505863
122036	NC_015410	CCA	2	6	5424639	5424644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330505863
122037	NC_015410	GCG	2	6	5424691	5424696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505863
122038	NC_015410	CAA	2	6	5424760	5424765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122039	NC_015410	GC	3	6	5424770	5424775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122040	NC_015410	C	6	6	5424795	5424800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122041	NC_015410	TCG	2	6	5424893	5424898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122042	NC_015410	GGC	2	6	5424993	5424998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505864
122043	NC_015410	CTG	2	6	5425120	5425125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122044	NC_015410	AGC	2	6	5425184	5425189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122045	NC_015410	GCA	2	6	5425221	5425226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122046	NC_015410	TGGTGA	2	12	5425230	5425241	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	330505864
122047	NC_015410	CTG	3	9	5425270	5425278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122048	NC_015410	CTG	2	6	5425294	5425299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122049	NC_015410	GGC	2	6	5425378	5425383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505864
122050	NC_015410	TGGC	2	8	5425436	5425443	0 %	25 %	50 %	25 %	330505864
122051	NC_015410	GCA	2	6	5425497	5425502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122052	NC_015410	GCG	2	6	5425538	5425543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505864
122053	NC_015410	TTC	2	6	5425546	5425551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330505864
122054	NC_015410	ACG	2	6	5425573	5425578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505864
122055	NC_015410	GGC	2	6	5425645	5425650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505864
122056	NC_015410	TTC	2	6	5425718	5425723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330505864
122057	NC_015410	AGCGGT	2	12	5425746	5425757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330505865
122058	NC_015410	CGG	2	6	5425763	5425768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505865
122059	NC_015410	GGC	2	6	5425775	5425780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505865
122060	NC_015410	GGCCAG	2	12	5425794	5425805	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330505865
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122063	NC_015410	TGC	2	6	5425924	5425929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505865
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122065	NC_015410	GTA	2	6	5426073	5426078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330505865
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122068	NC_015410	GGC	2	6	5426210	5426215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505865
122069	NC_015410	CTTCAT	2	12	5426220	5426231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330505865
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122072	NC_015410	GCA	2	6	5426276	5426281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505865
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122076	NC_015410	CAG	2	6	5426424	5426429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505865
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122079	NC_015410	CGC	2	6	5426492	5426497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330505865
122080	NC_015410	CTTC	2	8	5426532	5426539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122081	NC_015410	GCA	2	6	5426600	5426605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505866
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122084	NC_015410	GCCA	2	8	5426677	5426684	25 %	0 %	25 %	50 %	330505866
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122086	NC_015410	GCT	2	6	5426771	5426776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505866
122087	NC_015410	CGGT	2	8	5426778	5426785	0 %	25 %	50 %	25 %	330505866
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122097	NC_015410	GCA	2	6	5427152	5427157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505866
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122099	NC_015410	GCGCT	2	10	5427216	5427225	0 %	20 %	40 %	40 %	330505867
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122101	NC_015410	GGCGG	2	10	5427299	5427308	0 %	0 %	80 %	20 %	330505867
122102	NC_015410	CTG	2	6	5427419	5427424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505867
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122109	NC_015410	GTC	2	6	5427833	5427838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505867
122110	NC_015410	AC	3	6	5427844	5427849	50 %	0 %	0 %	50 %	330505867
122111	NC_015410	ACG	2	6	5427866	5427871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505867
122112	NC_015410	GCG	2	6	5427906	5427911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330505867
122113	NC_015410	CCT	2	6	5427943	5427948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330505867
122114	NC_015410	GGT	2	6	5427956	5427961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330505867
122115	NC_015410	GAA	2	6	5427980	5427985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330505867
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122118	NC_015410	ATG	2	6	5428071	5428076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330505867
122119	NC_015410	TG	3	6	5428075	5428080	0 %	50 %	50 %	0 %	330505867
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122142	NC_015410	AG	3	6	5429257	5429262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122143	NC_015410	TTTATG	2	12	5429283	5429294	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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122145	NC_015410	CTG	2	6	5429344	5429349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122149	NC_015410	TTTA	2	8	5429504	5429511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122227	NC_015410	GCCA	3	12	5433213	5433224	25 %	0 %	25 %	50 %	330505870
122228	NC_015410	AGC	2	6	5433271	5433276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505870
122229	NC_015410	CTG	2	6	5433444	5433449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330505871
122230	NC_015410	ACC	2	6	5433493	5433498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330505871
122231	NC_015410	CTT	2	6	5433594	5433599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330505871
122232	NC_015410	GAT	2	6	5433623	5433628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122233	NC_015410	CG	3	6	5433641	5433646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122234	NC_015410	AGC	2	6	5433649	5433654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122235	NC_015410	CAG	2	6	5433720	5433725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122236	NC_015410	CAC	2	6	5433753	5433758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122237	NC_015410	CGA	2	6	5433803	5433808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330505872
122238	NC_015410	ACGGC	2	10	5433818	5433827	20 %	0 %	40 %	40 %	330505872
122239	NC_015410	TGG	2	6	5433834	5433839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330505872
122240	NC_015410	GC	3	6	5433869	5433874	0 %	0 %	50 %	50 %	330505872
122241	NC_015410	CG	3	6	5433980	5433985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122242	NC_015410	CCAA	2	8	5433998	5434005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122243	NC_015410	ATAGAA	2	12	5434019	5434030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122244	NC_015410	TATGTT	2	12	5434060	5434071	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122245	NC_015410	CTTGG	2	10	5434079	5434088	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122246	NC_015410	GGC	2	6	5434289	5434294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122247	NC_015410	TGA	2	6	5434304	5434309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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