MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED01

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015314	GT	3	6	199	204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015314	GC	3	6	1040	1045	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
3	NC_015314	CG	3	6	1213	1218	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
4	NC_015314	CA	3	6	1290	1295	50 %	0 %	0 %	50 %	327309751
5	NC_015314	CG	3	6	1379	1384	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
6	NC_015314	TC	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	327309751
7	NC_015314	CG	3	6	1962	1967	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
8	NC_015314	GC	3	6	3188	3193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015314	CG	3	6	4277	4282	0 %	0 %	50 %	50 %	327309752
10	NC_015314	GC	3	6	4541	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015314	GC	3	6	4759	4764	0 %	0 %	50 %	50 %	327309753
12	NC_015314	AC	3	6	5110	5115	50 %	0 %	0 %	50 %	327309753
13	NC_015314	GT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	50 %	0 %	327309754
14	NC_015314	AC	3	6	5568	5573	50 %	0 %	0 %	50 %	327309754
15	NC_015314	GT	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	327309754
16	NC_015314	TG	3	6	5942	5947	0 %	50 %	50 %	0 %	327309754
17	NC_015314	TC	3	6	6378	6383	0 %	50 %	0 %	50 %	327309754
18	NC_015314	GC	3	6	6714	6719	0 %	0 %	50 %	50 %	327309754
19	NC_015314	AC	3	6	7292	7297	50 %	0 %	0 %	50 %	327309755
20	NC_015314	CA	3	6	8765	8770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015314	TG	3	6	8791	8796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015314	TC	4	8	9491	9498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015314	CG	3	6	9941	9946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015314	CA	3	6	10087	10092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015314	TC	3	6	10900	10905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015314	AC	3	6	11705	11710	50 %	0 %	0 %	50 %	327309756
27	NC_015314	GC	3	6	11913	11918	0 %	0 %	50 %	50 %	327309756
28	NC_015314	GC	3	6	12594	12599	0 %	0 %	50 %	50 %	327309757
29	NC_015314	CG	3	6	12755	12760	0 %	0 %	50 %	50 %	327309757
30	NC_015314	CG	3	6	13621	13626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015314	GC	3	6	15453	15458	0 %	0 %	50 %	50 %	327309758
32	NC_015314	GC	3	6	16416	16421	0 %	0 %	50 %	50 %	327309759
33	NC_015314	GC	3	6	16899	16904	0 %	0 %	50 %	50 %	327309759
34	NC_015314	GC	3	6	17257	17262	0 %	0 %	50 %	50 %	327309759
35	NC_015314	GC	3	6	17447	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015314	CG	3	6	17464	17469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015314	GT	3	6	17792	17797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015314	GC	3	6	18272	18277	0 %	0 %	50 %	50 %	327309760
39	NC_015314	GC	3	6	18498	18503	0 %	0 %	50 %	50 %	327309760
40	NC_015314	CT	3	6	19299	19304	0 %	50 %	0 %	50 %	327309761
41	NC_015314	CG	3	6	19658	19663	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
42	NC_015314	CG	3	6	20199	20204	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
43	NC_015314	CG	4	8	20254	20261	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
44	NC_015314	CG	3	6	21016	21021	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
45	NC_015314	CG	3	6	21525	21530	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
46	NC_015314	CG	3	6	21669	21674	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
47	NC_015314	CG	3	6	22220	22225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015314	GC	3	6	22772	22777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015314	GC	4	8	22817	22824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015314	CG	3	6	23706	23711	0 %	0 %	50 %	50 %	327309762
51	NC_015314	CT	3	6	23964	23969	0 %	50 %	0 %	50 %	327309762
52	NC_015314	TG	3	6	24148	24153	0 %	50 %	50 %	0 %	327309762
53	NC_015314	GT	4	8	24229	24236	0 %	50 %	50 %	0 %	327309762
54	NC_015314	TG	3	6	24780	24785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015314	GC	3	6	25191	25196	0 %	0 %	50 %	50 %	327309763
56	NC_015314	GC	3	6	25810	25815	0 %	0 %	50 %	50 %	327309764
57	NC_015314	GC	3	6	26058	26063	0 %	0 %	50 %	50 %	327309765
58	NC_015314	CG	3	6	26558	26563	0 %	0 %	50 %	50 %	327309765
59	NC_015314	AC	4	8	27367	27374	50 %	0 %	0 %	50 %	327309766
60	NC_015314	CA	3	6	27450	27455	50 %	0 %	0 %	50 %	327309766
61	NC_015314	AG	3	6	27634	27639	50 %	0 %	50 %	0 %	327309766
62	NC_015314	AG	3	6	28341	28346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015314	CG	4	8	28777	28784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015314	TC	3	6	28798	28803	0 %	50 %	0 %	50 %	327309767
65	NC_015314	GC	3	6	29565	29570	0 %	0 %	50 %	50 %	327309767
66	NC_015314	TG	3	6	30217	30222	0 %	50 %	50 %	0 %	327309768
67	NC_015314	GC	3	6	30892	30897	0 %	0 %	50 %	50 %	327309769
68	NC_015314	GC	3	6	31462	31467	0 %	0 %	50 %	50 %	327309770
69	NC_015314	GC	3	6	33637	33642	0 %	0 %	50 %	50 %	327309773
70	NC_015314	GT	3	6	33668	33673	0 %	50 %	50 %	0 %	327309773
71	NC_015314	CA	3	6	33861	33866	50 %	0 %	0 %	50 %	327309774
72	NC_015314	GC	3	6	34642	34647	0 %	0 %	50 %	50 %	327309774
73	NC_015314	GC	3	6	35612	35617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015314	CA	3	6	36088	36093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015314	CG	3	6	36523	36528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015314	GC	3	6	36577	36582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015314	CG	4	8	37269	37276	0 %	0 %	50 %	50 %	327309776
78	NC_015314	GC	3	6	37538	37543	0 %	0 %	50 %	50 %	327309776
79	NC_015314	CG	4	8	38092	38099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015314	CG	3	6	38374	38379	0 %	0 %	50 %	50 %	327309777
81	NC_015314	GC	3	6	38554	38559	0 %	0 %	50 %	50 %	327309777
82	NC_015314	CG	3	6	38657	38662	0 %	0 %	50 %	50 %	327309777
83	NC_015314	AC	3	6	38789	38794	50 %	0 %	0 %	50 %	327309777
84	NC_015314	GC	3	6	38978	38983	0 %	0 %	50 %	50 %	327309777
85	NC_015314	CG	3	6	39062	39067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015314	TG	3	6	40693	40698	0 %	50 %	50 %	0 %	327309778
87	NC_015314	GC	3	6	40818	40823	0 %	0 %	50 %	50 %	327309778
88	NC_015314	GC	4	8	41111	41118	0 %	0 %	50 %	50 %	327309779
89	NC_015314	CG	3	6	41207	41212	0 %	0 %	50 %	50 %	327309779
90	NC_015314	CA	3	6	41688	41693	50 %	0 %	0 %	50 %	327309780
91	NC_015314	TG	3	6	42053	42058	0 %	50 %	50 %	0 %	327309780
92	NC_015314	GT	3	6	42460	42465	0 %	50 %	50 %	0 %	327309780
93	NC_015314	GC	3	6	42925	42930	0 %	0 %	50 %	50 %	327309781
94	NC_015314	GC	3	6	43379	43384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015314	CA	3	6	43735	43740	50 %	0 %	0 %	50 %	327309782
96	NC_015314	GC	3	6	44692	44697	0 %	0 %	50 %	50 %	327309783
97	NC_015314	GC	3	6	44990	44995	0 %	0 %	50 %	50 %	327309783
98	NC_015314	CG	3	6	45121	45126	0 %	0 %	50 %	50 %	327309783
99	NC_015314	GC	3	6	45596	45601	0 %	0 %	50 %	50 %	327309784
100	NC_015314	CG	3	6	45721	45726	0 %	0 %	50 %	50 %	327309784
101	NC_015314	CG	3	6	46045	46050	0 %	0 %	50 %	50 %	327309784
102	NC_015314	GC	3	6	46620	46625	0 %	0 %	50 %	50 %	327309785
103	NC_015314	TC	3	6	47125	47130	0 %	50 %	0 %	50 %	327309786
104	NC_015314	GA	3	6	47134	47139	50 %	0 %	50 %	0 %	327309786
105	NC_015314	GC	3	6	47252	47257	0 %	0 %	50 %	50 %	327309786
106	NC_015314	CG	3	6	47361	47366	0 %	0 %	50 %	50 %	327309786
107	NC_015314	CT	3	6	47825	47830	0 %	50 %	0 %	50 %	327309786
108	NC_015314	TC	3	6	48524	48529	0 %	50 %	0 %	50 %	327309786
109	NC_015314	TG	3	6	48711	48716	0 %	50 %	50 %	0 %	327309787
110	NC_015314	GC	3	6	48876	48881	0 %	0 %	50 %	50 %	327309787
111	NC_015314	GC	4	8	49648	49655	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
112	NC_015314	CG	3	6	49791	49796	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
113	NC_015314	CG	3	6	49929	49934	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
114	NC_015314	CG	3	6	49972	49977	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
115	NC_015314	CG	3	6	50224	50229	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
116	NC_015314	GC	3	6	50316	50321	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
117	NC_015314	GC	3	6	50425	50430	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
118	NC_015314	CG	3	6	50532	50537	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
119	NC_015314	CG	3	6	50589	50594	0 %	0 %	50 %	50 %	327309788
120	NC_015314	GT	3	6	51918	51923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015314	GC	3	6	51974	51979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015314	CG	3	6	52002	52007	0 %	0 %	50 %	50 %	327309790
123	NC_015314	CG	3	6	52342	52347	0 %	0 %	50 %	50 %	327309790
124	NC_015314	CG	3	6	52753	52758	0 %	0 %	50 %	50 %	327309791
125	NC_015314	GC	4	8	53709	53716	0 %	0 %	50 %	50 %	327309791
126	NC_015314	GA	3	6	55013	55018	50 %	0 %	50 %	0 %	327309792
127	NC_015314	GC	3	6	55577	55582	0 %	0 %	50 %	50 %	327309792
128	NC_015314	AC	3	6	56336	56341	50 %	0 %	0 %	50 %	327309793
129	NC_015314	CG	3	6	56481	56486	0 %	0 %	50 %	50 %	327309793
130	NC_015314	GC	3	6	56789	56794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015314	GC	3	6	56972	56977	0 %	0 %	50 %	50 %	327309794
132	NC_015314	GC	3	6	57717	57722	0 %	0 %	50 %	50 %	327309794
133	NC_015314	CG	4	8	58033	58040	0 %	0 %	50 %	50 %	327309794
134	NC_015314	CG	3	6	58084	58089	0 %	0 %	50 %	50 %	327309794
135	NC_015314	CG	4	8	58686	58693	0 %	0 %	50 %	50 %	327309795
136	NC_015314	CG	3	6	58725	58730	0 %	0 %	50 %	50 %	327309795
137	NC_015314	GC	3	6	59011	59016	0 %	0 %	50 %	50 %	327309795
138	NC_015314	GC	4	8	59360	59367	0 %	0 %	50 %	50 %	327309795
139	NC_015314	GC	4	8	60152	60159	0 %	0 %	50 %	50 %	327309796
140	NC_015314	CG	3	6	60419	60424	0 %	0 %	50 %	50 %	327309796
141	NC_015314	CG	3	6	61002	61007	0 %	0 %	50 %	50 %	327309796
142	NC_015314	CG	3	6	62263	62268	0 %	0 %	50 %	50 %	327309797
143	NC_015314	CG	3	6	62432	62437	0 %	0 %	50 %	50 %	327309797
144	NC_015314	GC	3	6	62607	62612	0 %	0 %	50 %	50 %	327309797
145	NC_015314	GC	3	6	63267	63272	0 %	0 %	50 %	50 %	327309798
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.