MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED03

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015313	GT	4	8	41	48	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015313	GC	3	6	55	60	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015313	TA	3	6	340	345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015313	CG	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015313	CG	3	6	1042	1047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015313	TA	3	6	1442	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015313	GC	3	6	1798	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
8	NC_015313	GA	3	6	1925	1930	50 %	0 %	50 %	0 %	327309735
9	NC_015313	GC	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
10	NC_015313	GC	4	8	2561	2568	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
11	NC_015313	CG	3	6	2899	2904	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
12	NC_015313	CG	3	6	3045	3050	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
13	NC_015313	GC	3	6	3646	3651	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
14	NC_015313	CG	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	327309736
15	NC_015313	TC	3	6	5244	5249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015313	CG	3	6	5375	5380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015313	TC	3	6	5670	5675	0 %	50 %	0 %	50 %	327309737
18	NC_015313	CG	3	6	5883	5888	0 %	0 %	50 %	50 %	327309738
19	NC_015313	GC	3	6	6259	6264	0 %	0 %	50 %	50 %	327309739
20	NC_015313	CG	3	6	6437	6442	0 %	0 %	50 %	50 %	327309740
21	NC_015313	AG	4	8	6695	6702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015313	CG	3	6	7220	7225	0 %	0 %	50 %	50 %	327309741
23	NC_015313	GC	3	6	7350	7355	0 %	0 %	50 %	50 %	327309741
24	NC_015313	CT	3	6	8239	8244	0 %	50 %	0 %	50 %	327309743
25	NC_015313	AC	3	6	8269	8274	50 %	0 %	0 %	50 %	327309743
26	NC_015313	TC	3	6	8562	8567	0 %	50 %	0 %	50 %	327309743
27	NC_015313	CG	3	6	9031	9036	0 %	0 %	50 %	50 %	327309744
28	NC_015313	CG	3	6	9437	9442	0 %	0 %	50 %	50 %	327309745
29	NC_015313	CG	3	6	9821	9826	0 %	0 %	50 %	50 %	327309745
30	NC_015313	GC	3	6	10436	10441	0 %	0 %	50 %	50 %	327309745
31	NC_015313	CG	3	6	10724	10729	0 %	0 %	50 %	50 %	327309745
32	NC_015313	GC	3	6	11019	11024	0 %	0 %	50 %	50 %	327309745
33	NC_015313	CG	3	6	11255	11260	0 %	0 %	50 %	50 %	327309745
34	NC_015313	TA	3	6	11611	11616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015313	TG	3	6	12050	12055	0 %	50 %	50 %	0 %	327309746
36	NC_015313	GC	3	6	12188	12193	0 %	0 %	50 %	50 %	327309746
37	NC_015313	TG	3	6	12242	12247	0 %	50 %	50 %	0 %	327309746
38	NC_015313	CG	3	6	12597	12602	0 %	0 %	50 %	50 %	327309746
39	NC_015313	GC	3	6	12653	12658	0 %	0 %	50 %	50 %	327309746
40	NC_015313	CG	3	6	12740	12745	0 %	0 %	50 %	50 %	327309746
41	NC_015313	AC	3	6	12817	12822	50 %	0 %	0 %	50 %	327309746
42	NC_015313	AG	3	6	13135	13140	50 %	0 %	50 %	0 %	327309747
43	NC_015313	AG	3	6	13575	13580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015313	AT	3	6	14527	14532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015313	AT	3	6	15034	15039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.