MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Polymorphum gilvum SL003B-26A1 plasmid pSL003B

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015258	AAGCG	2	10	2795	2804	40 %	0 %	40 %	20 %	328541558
2	NC_015258	CGAGG	2	10	4536	4545	20 %	0 %	60 %	20 %	328541559
3	NC_015258	GGTGA	2	10	6035	6044	20 %	20 %	60 %	0 %	328541560
4	NC_015258	TTCGC	2	10	6681	6690	0 %	40 %	20 %	40 %	328541560
5	NC_015258	CAGCT	2	10	7061	7070	20 %	20 %	20 %	40 %	328541560
6	NC_015258	CTTTT	2	10	8488	8497	0 %	80 %	0 %	20 %	328541561
7	NC_015258	GAAGA	2	10	10665	10674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015258	TCCCG	2	10	11091	11100	0 %	20 %	20 %	60 %	328541566
9	NC_015258	CGACG	2	10	11680	11689	20 %	0 %	40 %	40 %	328541567
10	NC_015258	ACAGC	2	10	12809	12818	40 %	0 %	20 %	40 %	328541568
11	NC_015258	ACCAC	2	10	13526	13535	40 %	0 %	0 %	60 %	328541568
12	NC_015258	CGCGC	2	10	14427	14436	0 %	0 %	40 %	60 %	328541568
13	NC_015258	AGGCC	2	10	16257	16266	20 %	0 %	40 %	40 %	328541568
14	NC_015258	GGACA	2	10	16459	16468	40 %	0 %	40 %	20 %	328541568
15	NC_015258	CATCG	2	10	16611	16620	20 %	20 %	20 %	40 %	328541568
16	NC_015258	GCTGG	2	10	18291	18300	0 %	20 %	60 %	20 %	328541570
17	NC_015258	CATGA	2	10	18982	18991	40 %	20 %	20 %	20 %	328541570
18	NC_015258	TCGCG	2	10	19773	19782	0 %	20 %	40 %	40 %	328541570
19	NC_015258	CTTTC	2	10	19803	19812	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015258	GGATC	2	10	30562	30571	20 %	20 %	40 %	20 %	328541585
21	NC_015258	GCGAG	2	10	31049	31058	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015258	TGATT	2	10	31130	31139	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015258	CCGCG	2	10	31743	31752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_015258	CGCGC	2	10	32905	32914	0 %	0 %	40 %	60 %	328541588
25	NC_015258	AGATC	2	10	35086	35095	40 %	20 %	20 %	20 %	328541590
26	NC_015258	CATCG	2	10	37195	37204	20 %	20 %	20 %	40 %	328541593
27	NC_015258	CGCGA	2	10	37678	37687	20 %	0 %	40 %	40 %	328541593
28	NC_015258	GCCGC	2	10	37825	37834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_015258	GGAAA	2	10	38867	38876	60 %	0 %	40 %	0 %	328541594
30	NC_015258	GACCT	2	10	39758	39767	20 %	20 %	20 %	40 %	328541595
31	NC_015258	GTTGC	2	10	44621	44630	0 %	40 %	40 %	20 %	328541600
32	NC_015258	CTTGC	2	10	44724	44733	0 %	40 %	20 %	40 %	328541600
33	NC_015258	GGACC	2	10	45135	45144	20 %	0 %	40 %	40 %	328541600
34	NC_015258	CTGTT	2	10	45221	45230	0 %	60 %	20 %	20 %	328541601
35	NC_015258	CGGGC	2	10	45686	45695	0 %	0 %	60 %	40 %	328541601
36	NC_015258	GCTGG	2	10	46242	46251	0 %	20 %	60 %	20 %	328541601
37	NC_015258	TCCGG	2	10	47927	47936	0 %	20 %	40 %	40 %	328541602
38	NC_015258	GCCGC	2	10	48117	48126	0 %	0 %	40 %	60 %	328541603
39	NC_015258	AGCCG	2	10	50964	50973	20 %	0 %	40 %	40 %	328541606
40	NC_015258	CCGCG	2	10	51174	51183	0 %	0 %	40 %	60 %	328541606
41	NC_015258	GAACC	2	10	51245	51254	40 %	0 %	20 %	40 %	328541606
42	NC_015258	TCTGC	2	10	52152	52161	0 %	40 %	20 %	40 %	328541608
43	NC_015258	CGACA	2	10	54287	54296	40 %	0 %	20 %	40 %	328541609
44	NC_015258	GAGCC	2	10	54606	54615	20 %	0 %	40 %	40 %	328541609
45	NC_015258	CCCCT	2	10	55131	55140	0 %	20 %	0 %	80 %	328541611
46	NC_015258	TTGCA	2	10	57913	57922	20 %	40 %	20 %	20 %	328541614
47	NC_015258	AGGGG	2	10	60524	60533	20 %	0 %	80 %	0 %	328541616
48	NC_015258	GGGGA	2	10	61695	61704	20 %	0 %	80 %	0 %	328541617
49	NC_015258	TCCGC	2	10	61731	61740	0 %	20 %	20 %	60 %	328541617
50	NC_015258	CGGCG	2	10	61755	61764	0 %	0 %	60 %	40 %	328541617
51	NC_015258	AGGGG	2	10	63095	63104	20 %	0 %	80 %	0 %	328541618

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.