MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B05

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014842	GGTGGA	2	12	23	34	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014842	CGTAAG	2	12	2554	2565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317052776
3	NC_014842	GAACTG	2	12	7253	7264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317052780
4	NC_014842	GTACTG	2	12	7587	7598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	317052780
5	NC_014842	GTTTCT	2	12	9013	9024	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	317052780
6	NC_014842	CTTTGA	2	12	9400	9411	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	317052780
7	NC_014842	ACGCGG	2	12	14741	14752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	317052785
8	NC_014842	GGACAG	2	12	19152	19163	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014842	GGATCT	2	12	19335	19346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014842	TCCGCC	2	12	19685	19696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	317052792
11	NC_014842	GCAACC	2	12	19742	19753	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014842	GCGCTG	2	12	23149	23160	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317052798
13	NC_014842	CTGTTT	2	12	36540	36551	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	317052805
14	NC_014842	AGGTGC	2	12	36635	36646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317052805
15	NC_014842	GTCAGG	2	12	37578	37589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317052805
16	NC_014842	CGCTGG	2	12	48846	48857	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317052817
17	NC_014842	TGCCGG	2	12	54239	54250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317052827
18	NC_014842	GCATCA	2	12	58061	58072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	317052832
19	NC_014842	CCGCCA	2	12	58779	58790	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	317052833
20	NC_014842	CGTCCG	2	12	59312	59323	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317052833
21	NC_014842	GCTGGC	2	12	60357	60368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317052836
22	NC_014842	CGGCAC	2	12	62165	62176	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317052838
23	NC_014842	ACGCCA	2	12	62299	62310	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	317052838
24	NC_014842	AGAGAA	2	12	62867	62878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052838
25	NC_014842	ACAGGA	2	12	63020	63031	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	317052838
26	NC_014842	CCGGTG	2	12	65587	65598	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317052844
27	NC_014842	GGCTGG	2	12	70880	70891	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	317052851
28	NC_014842	ACCGGC	3	18	70987	71004	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317052851
29	NC_014842	GGACAT	2	12	71115	71126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317052851
30	NC_014842	CGGAGA	2	12	72476	72487	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	317052853
31	NC_014842	GCACGG	2	12	72742	72753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	317052853
32	NC_014842	CGCTGA	2	12	75459	75470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317052856
33	NC_014842	GTCAAC	2	12	76047	76058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	317052857
34	NC_014842	GGCAGG	2	12	76694	76705	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	317052859
35	NC_014842	CGCAGA	2	12	80184	80195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052860
36	NC_014842	CTGCGC	2	12	83621	83632	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014842	CGCCGG	2	12	85591	85602	0 %	0 %	50 %	50 %	317052865
38	NC_014842	TGACGC	2	12	86021	86032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317052865
39	NC_014842	CGCTGG	2	12	86625	86636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317052866
40	NC_014842	TGACCG	2	12	90375	90386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317052866
41	NC_014842	ACGGCA	2	12	91089	91100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052866
42	NC_014842	ATTGTC	2	12	101186	101197	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014842	TCAGGC	2	12	105533	105544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317052880
44	NC_014842	GCTGAA	2	12	106524	106535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014842	GCCTGC	2	12	113506	113517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317052887
46	NC_014842	GGACGT	2	12	114672	114683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317052888
47	NC_014842	GCACCG	2	12	114942	114953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317052888
48	NC_014842	ACAGGC	2	12	115903	115914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.