MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Pseudoalteromonas sp. SM9913 chromosome II

Total Repeats: 533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014800	CTATC	2	10	1195	1204	20 %	40 %	0 %	40 %	315122944
2	NC_014800	TAAAT	2	10	1378	1387	60 %	40 %	0 %	0 %	315122944
3	NC_014800	ACTCA	2	10	1599	1608	40 %	20 %	0 %	40 %	315122945
4	NC_014800	GCAAC	2	10	2272	2281	40 %	0 %	20 %	40 %	315122945
5	NC_014800	AGTAA	2	10	4214	4223	60 %	20 %	20 %	0 %	315122947
6	NC_014800	TGGCT	2	10	4596	4605	0 %	40 %	40 %	20 %	315122947
7	NC_014800	ATACA	2	10	4699	4708	60 %	20 %	0 %	20 %	315122947
8	NC_014800	AGCCA	2	10	7218	7227	40 %	0 %	20 %	40 %	315122948
9	NC_014800	CATTT	2	10	9003	9012	20 %	60 %	0 %	20 %	315122950
10	NC_014800	TTTCA	2	10	9230	9239	20 %	60 %	0 %	20 %	315122950
11	NC_014800	CGCAG	2	10	9981	9990	20 %	0 %	40 %	40 %	315122951
12	NC_014800	TACCC	2	10	11814	11823	20 %	20 %	0 %	60 %	315122952
13	NC_014800	GCTGG	2	10	11959	11968	0 %	20 %	60 %	20 %	315122952
14	NC_014800	AAATA	2	10	16409	16418	80 %	20 %	0 %	0 %	315122956
15	NC_014800	AGCAA	2	10	21787	21796	60 %	0 %	20 %	20 %	315122961
16	NC_014800	TTTAC	2	10	22726	22735	20 %	60 %	0 %	20 %	315122962
17	NC_014800	AACCC	2	10	23723	23732	40 %	0 %	0 %	60 %	315122963
18	NC_014800	CAATT	2	10	24937	24946	40 %	40 %	0 %	20 %	315122965
19	NC_014800	ATCCA	2	10	25691	25700	40 %	20 %	0 %	40 %	315122965
20	NC_014800	TTACA	2	10	26554	26563	40 %	40 %	0 %	20 %	315122966
21	NC_014800	TATTT	2	10	28316	28325	20 %	80 %	0 %	0 %	315122967
22	NC_014800	GCCTT	2	10	28830	28839	0 %	40 %	20 %	40 %	315122967
23	NC_014800	TTGGT	2	10	33088	33097	0 %	60 %	40 %	0 %	315122971
24	NC_014800	TATTT	2	10	35049	35058	20 %	80 %	0 %	0 %	315122973
25	NC_014800	TATGA	2	10	35397	35406	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014800	CTAAG	2	10	37131	37140	40 %	20 %	20 %	20 %	315122974
27	NC_014800	TTATA	2	10	37643	37652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014800	GCTTA	2	10	37935	37944	20 %	40 %	20 %	20 %	315122975
29	NC_014800	TTACA	2	10	41703	41712	40 %	40 %	0 %	20 %	315122979
30	NC_014800	GGGTT	2	10	42585	42594	0 %	40 %	60 %	0 %	315122980
31	NC_014800	ATTAA	2	10	42777	42786	60 %	40 %	0 %	0 %	315122980
32	NC_014800	TTTGG	2	10	42867	42876	0 %	60 %	40 %	0 %	315122981
33	NC_014800	TTTGC	2	10	43825	43834	0 %	60 %	20 %	20 %	315122983
34	NC_014800	CATTA	2	10	47117	47126	40 %	40 %	0 %	20 %	315122984
35	NC_014800	AGTTA	2	10	48045	48054	40 %	40 %	20 %	0 %	315122985
36	NC_014800	AATTT	2	10	48874	48883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014800	GTTTG	2	10	51207	51216	0 %	60 %	40 %	0 %	315122987
38	NC_014800	ACTGC	2	10	51247	51256	20 %	20 %	20 %	40 %	315122987
39	NC_014800	ATTGC	2	10	51303	51312	20 %	40 %	20 %	20 %	315122987
40	NC_014800	CCTTT	2	10	51747	51756	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014800	CATGC	2	10	52552	52561	20 %	20 %	20 %	40 %	315122990
42	NC_014800	AAGTG	2	10	52686	52695	40 %	20 %	40 %	0 %	315122990
43	NC_014800	TGCCC	2	10	53101	53110	0 %	20 %	20 %	60 %	315122991
44	NC_014800	AGCAA	2	10	54346	54355	60 %	0 %	20 %	20 %	315122993
45	NC_014800	GCTCA	2	10	57345	57354	20 %	20 %	20 %	40 %	315122996
46	NC_014800	GTGTT	2	10	57633	57642	0 %	60 %	40 %	0 %	315122996
47	NC_014800	TTTTG	2	10	58364	58373	0 %	80 %	20 %	0 %	315122996
48	NC_014800	TATTT	2	10	59130	59139	20 %	80 %	0 %	0 %	315122996
49	NC_014800	AAGCT	2	10	61772	61781	40 %	20 %	20 %	20 %	315123000
50	NC_014800	ACAAA	2	10	62782	62791	80 %	0 %	0 %	20 %	315123001
51	NC_014800	ATTGA	2	10	64382	64391	40 %	40 %	20 %	0 %	315123002
52	NC_014800	AATGA	2	10	65014	65023	60 %	20 %	20 %	0 %	315123003
53	NC_014800	AGCAT	2	10	65708	65717	40 %	20 %	20 %	20 %	315123004
54	NC_014800	TGCCT	2	10	67085	67094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014800	GTGCT	2	10	67188	67197	0 %	40 %	40 %	20 %	315123006
56	NC_014800	GTGTG	2	10	68735	68744	0 %	40 %	60 %	0 %	315123006
57	NC_014800	CAATG	2	10	71314	71323	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014800	GCGCT	2	10	72718	72727	0 %	20 %	40 %	40 %	315123008
59	NC_014800	TTTAA	2	10	75481	75490	40 %	60 %	0 %	0 %	315123010
60	NC_014800	AAAAT	2	10	76427	76436	80 %	20 %	0 %	0 %	315123010
61	NC_014800	TAAAT	2	10	78436	78445	60 %	40 %	0 %	0 %	315123012
62	NC_014800	TGAGT	2	10	80443	80452	20 %	40 %	40 %	0 %	315123014
63	NC_014800	TAAAA	2	10	82087	82096	80 %	20 %	0 %	0 %	315123016
64	NC_014800	ACCAC	2	10	82308	82317	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014800	TGCCT	2	10	82326	82335	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014800	AACAA	2	10	83052	83061	80 %	0 %	0 %	20 %	315123017
67	NC_014800	CATTA	2	10	85732	85741	40 %	40 %	0 %	20 %	315123022
68	NC_014800	TTGAT	2	10	85955	85964	20 %	60 %	20 %	0 %	315123022
69	NC_014800	TTATT	2	10	86121	86130	20 %	80 %	0 %	0 %	315123022
70	NC_014800	AGCGC	2	10	86336	86345	20 %	0 %	40 %	40 %	315123023
71	NC_014800	GCAGG	2	10	86471	86480	20 %	0 %	60 %	20 %	315123023
72	NC_014800	TAAAT	2	10	86922	86931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014800	AATTT	2	10	87102	87111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014800	ATCCA	2	10	89908	89917	40 %	20 %	0 %	40 %	315123027
75	NC_014800	AGTGA	2	10	93139	93148	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014800	AAAGT	2	10	95175	95184	60 %	20 %	20 %	0 %	315123033
77	NC_014800	CGATA	2	10	95789	95798	40 %	20 %	20 %	20 %	315123034
78	NC_014800	AGGCA	2	10	97651	97660	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014800	TGTGG	2	10	97668	97677	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014800	AATAA	2	10	97877	97886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014800	ATGGC	2	10	98237	98246	20 %	20 %	40 %	20 %	315123036
82	NC_014800	ACCGT	2	10	99611	99620	20 %	20 %	20 %	40 %	315123036
83	NC_014800	CAGCG	2	10	100561	100570	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014800	TGTTT	2	10	104181	104190	0 %	80 %	20 %	0 %	315123041
85	NC_014800	CTTTG	2	10	104423	104432	0 %	60 %	20 %	20 %	315123041
86	NC_014800	GGCTC	2	10	110502	110511	0 %	20 %	40 %	40 %	315123047
87	NC_014800	ATTTG	2	10	111262	111271	20 %	60 %	20 %	0 %	315123048
88	NC_014800	TTAAA	2	10	112522	112531	60 %	40 %	0 %	0 %	315123048
89	NC_014800	AAATT	2	10	115863	115872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014800	ATTGA	2	10	115960	115969	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014800	GCGCT	2	10	117233	117242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014800	TACTT	2	10	117537	117546	20 %	60 %	0 %	20 %	315123051
93	NC_014800	CCAAA	2	10	118035	118044	60 %	0 %	0 %	40 %	315123052
94	NC_014800	ATAAC	2	10	120045	120054	60 %	20 %	0 %	20 %	315123053
95	NC_014800	CAAAA	2	10	121668	121677	80 %	0 %	0 %	20 %	315123054
96	NC_014800	ACCAC	2	10	121973	121982	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_014800	TGCCT	2	10	121991	122000	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014800	ATGCA	2	10	122269	122278	40 %	20 %	20 %	20 %	315123055
99	NC_014800	GGCAA	2	10	122755	122764	40 %	0 %	40 %	20 %	315123055
100	NC_014800	GAGCA	2	10	124393	124402	40 %	0 %	40 %	20 %	315123056
101	NC_014800	GGCTG	2	10	128377	128386	0 %	20 %	60 %	20 %	315123060
102	NC_014800	ATTTA	2	10	128932	128941	40 %	60 %	0 %	0 %	315123060
103	NC_014800	TACGA	2	10	129082	129091	40 %	20 %	20 %	20 %	315123060
104	NC_014800	TTTGT	2	10	130140	130149	0 %	80 %	20 %	0 %	315123061
105	NC_014800	AAGCA	2	10	134851	134860	60 %	0 %	20 %	20 %	315123065
106	NC_014800	GATTG	2	10	135820	135829	20 %	40 %	40 %	0 %	315123065
107	NC_014800	TGGAT	2	10	136478	136487	20 %	40 %	40 %	0 %	315123066
108	NC_014800	ATTTG	2	10	136766	136775	20 %	60 %	20 %	0 %	315123066
109	NC_014800	ATCTT	2	10	136844	136853	20 %	60 %	0 %	20 %	315123066
110	NC_014800	GCAAA	2	10	141850	141859	60 %	0 %	20 %	20 %	315123070
111	NC_014800	AGCGC	2	10	142214	142223	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014800	AGAGA	2	10	142270	142279	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014800	CAGCG	2	10	142412	142421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014800	AAATA	2	10	145354	145363	80 %	20 %	0 %	0 %	315123074
115	NC_014800	GCAAG	2	10	147374	147383	40 %	0 %	40 %	20 %	315123074
116	NC_014800	ATGCA	2	10	148643	148652	40 %	20 %	20 %	20 %	315123075
117	NC_014800	TATTG	2	10	149322	149331	20 %	60 %	20 %	0 %	315123076
118	NC_014800	AAAGC	2	10	150738	150747	60 %	0 %	20 %	20 %	315123077
119	NC_014800	GATGC	2	10	150774	150783	20 %	20 %	40 %	20 %	315123077
120	NC_014800	ACCGT	2	10	150823	150832	20 %	20 %	20 %	40 %	315123077
121	NC_014800	ATTTT	2	10	151295	151304	20 %	80 %	0 %	0 %	315123078
122	NC_014800	CGGTA	2	10	151645	151654	20 %	20 %	40 %	20 %	315123078
123	NC_014800	CAAAG	2	10	154132	154141	60 %	0 %	20 %	20 %	315123080
124	NC_014800	GGTTA	2	10	154237	154246	20 %	40 %	40 %	0 %	315123080
125	NC_014800	AGGTA	2	10	157757	157766	40 %	20 %	40 %	0 %	315123082
126	NC_014800	TACTC	2	10	158143	158152	20 %	40 %	0 %	40 %	315123082
127	NC_014800	GAAAA	2	10	158877	158886	80 %	0 %	20 %	0 %	315123083
128	NC_014800	CCAGT	2	10	160790	160799	20 %	20 %	20 %	40 %	315123085
129	NC_014800	GTTTT	2	10	161179	161188	0 %	80 %	20 %	0 %	315123086
130	NC_014800	AGTTG	2	10	163176	163185	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014800	CTGCA	2	10	163216	163225	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014800	TGGGC	2	10	164536	164545	0 %	20 %	60 %	20 %	315123089
133	NC_014800	TTAAT	2	10	166844	166853	40 %	60 %	0 %	0 %	315123091
134	NC_014800	TGCCT	2	10	171541	171550	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014800	TAAAA	2	10	172255	172264	80 %	20 %	0 %	0 %	315123097
136	NC_014800	CGTGC	2	10	173456	173465	0 %	20 %	40 %	40 %	315123098
137	NC_014800	ATATT	2	10	173936	173945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014800	CTTAG	2	10	174010	174019	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014800	TTAGC	2	10	175305	175314	20 %	40 %	20 %	20 %	315123099
140	NC_014800	TGGTA	2	10	175852	175861	20 %	40 %	40 %	0 %	315123099
141	NC_014800	CTTAG	2	10	176641	176650	20 %	40 %	20 %	20 %	315123100
142	NC_014800	CACAT	2	10	176958	176967	40 %	20 %	0 %	40 %	315123100
143	NC_014800	AACAT	2	10	179220	179229	60 %	20 %	0 %	20 %	315123102
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147	NC_014800	CAAAC	2	10	184149	184158	60 %	0 %	0 %	40 %	315123105
148	NC_014800	AACAA	2	10	185262	185271	80 %	0 %	0 %	20 %	315123105
149	NC_014800	TGGCC	2	10	187514	187523	0 %	20 %	40 %	40 %	315123108
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151	NC_014800	TAAAA	2	10	189179	189188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014800	TAAAA	2	10	189447	189456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014800	GTAAG	2	10	192196	192205	40 %	20 %	40 %	0 %	315123113
154	NC_014800	AGCTT	2	10	193079	193088	20 %	40 %	20 %	20 %	315123114
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161	NC_014800	CTTTT	2	10	199266	199275	0 %	80 %	0 %	20 %	315123120
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172	NC_014800	TACAA	2	10	214142	214151	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014800	TAGGG	2	10	215394	215403	20 %	20 %	60 %	0 %	315123134
174	NC_014800	GTAAT	2	10	215583	215592	40 %	40 %	20 %	0 %	315123134
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176	NC_014800	CTAAA	2	10	219573	219582	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
177	NC_014800	GTAAG	2	10	219593	219602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014800	TGCAC	2	10	221495	221504	20 %	20 %	20 %	40 %	315123140
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181	NC_014800	AAAAG	2	10	226927	226936	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014800	GAACA	2	10	227969	227978	60 %	0 %	20 %	20 %	315123147
183	NC_014800	GAAAG	2	10	228358	228367	60 %	0 %	40 %	0 %	315123147
184	NC_014800	TTGAG	2	10	228543	228552	20 %	40 %	40 %	0 %	315123148
185	NC_014800	AACTT	2	10	230176	230185	40 %	40 %	0 %	20 %	315123149
186	NC_014800	TTTGG	2	10	231589	231598	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014800	ACACA	2	10	232063	232072	60 %	0 %	0 %	40 %	315123151
188	NC_014800	TGTGG	2	10	233258	233267	0 %	40 %	60 %	0 %	315123151
189	NC_014800	AACTA	2	10	233417	233426	60 %	20 %	0 %	20 %	315123151
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192	NC_014800	TAATT	2	10	236633	236642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014800	GAAAA	2	10	237257	237266	80 %	0 %	20 %	0 %	315123154
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199	NC_014800	AATCG	2	10	242819	242828	40 %	20 %	20 %	20 %	315123160
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210	NC_014800	TTACA	2	10	256927	256936	40 %	40 %	0 %	20 %	315123169
211	NC_014800	AGTTC	2	10	257326	257335	20 %	40 %	20 %	20 %	315123169
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234	NC_014800	ATGCA	2	10	286814	286823	40 %	20 %	20 %	20 %	315123197
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238	NC_014800	CACGC	2	10	297190	297199	20 %	0 %	20 %	60 %	315123206
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240	NC_014800	CAATT	2	10	299029	299038	40 %	40 %	0 %	20 %	315123207
241	NC_014800	ACTCA	2	10	304151	304160	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
242	NC_014800	TTTTA	2	10	304244	304253	20 %	80 %	0 %	0 %	315123213
243	NC_014800	TATTT	2	10	304289	304298	20 %	80 %	0 %	0 %	315123213
244	NC_014800	CGTAC	2	10	304969	304978	20 %	20 %	20 %	40 %	315123214
245	NC_014800	TTGTT	2	10	305203	305212	0 %	80 %	20 %	0 %	315123215
246	NC_014800	GTGAT	2	10	305974	305983	20 %	40 %	40 %	0 %	315123216
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248	NC_014800	TTTAC	2	10	307544	307553	20 %	60 %	0 %	20 %	315123217
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250	NC_014800	ATTTG	2	10	308711	308720	20 %	60 %	20 %	0 %	315123217
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254	NC_014800	TAAAA	2	10	314235	314244	80 %	20 %	0 %	0 %	315123220
255	NC_014800	GCATA	2	10	317239	317248	40 %	20 %	20 %	20 %	315123223
256	NC_014800	AATTT	2	10	318220	318229	40 %	60 %	0 %	0 %	315123224
257	NC_014800	CAGCG	2	10	319712	319721	20 %	0 %	40 %	40 %	315123225
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259	NC_014800	CGGTG	2	10	322911	322920	0 %	20 %	60 %	20 %	315123226
260	NC_014800	AAAGC	2	10	324334	324343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_014800	AAGTG	2	10	328475	328484	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014800	AGGCA	2	10	331156	331165	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
263	NC_014800	TGTGG	2	10	331173	331182	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
264	NC_014800	AACCA	2	10	335295	335304	60 %	0 %	0 %	40 %	315123236
265	NC_014800	AAAAT	2	10	338417	338426	80 %	20 %	0 %	0 %	315123239
266	NC_014800	GTAAG	2	10	338678	338687	40 %	20 %	40 %	0 %	315123239
267	NC_014800	TACAG	2	10	339414	339423	40 %	20 %	20 %	20 %	315123240
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269	NC_014800	CTTAA	2	10	339859	339868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_014800	TGCAC	2	10	512500	512509	20 %	20 %	20 %	40 %	315123404
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401	NC_014800	AAGTA	2	10	517311	517320	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
402	NC_014800	ATTTA	2	10	517806	517815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_014800	CAATA	2	10	518412	518421	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
404	NC_014800	TTGAG	2	10	520323	520332	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
405	NC_014800	AAAGT	2	10	520774	520783	60 %	20 %	20 %	0 %	315123414
406	NC_014800	CGTAC	2	10	521069	521078	20 %	20 %	20 %	40 %	315123414
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408	NC_014800	ACAAT	2	10	525719	525728	60 %	20 %	0 %	20 %	315123419
409	NC_014800	ATTTA	2	10	526204	526213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_014800	CTAAT	2	10	528654	528663	40 %	40 %	0 %	20 %	315123423
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441	NC_014800	ATAAA	2	10	575282	575291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014800	CGCTT	2	10	576728	576737	0 %	40 %	20 %	40 %	315123462
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444	NC_014800	TTTTA	2	10	580597	580606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_014800	TACCG	2	10	605840	605849	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
464	NC_014800	AGCTG	2	10	605915	605924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
465	NC_014800	GCGCT	2	10	611305	611314	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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470	NC_014800	CTTTG	2	10	615442	615451	0 %	60 %	20 %	20 %	315123499
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483	NC_014800	ATTCA	2	10	631029	631038	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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485	NC_014800	TAAAA	2	10	634005	634014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_014800	CAAAG	2	10	637251	637260	60 %	0 %	20 %	20 %	315123516
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499	NC_014800	TGAAA	2	10	654626	654635	60 %	20 %	20 %	0 %	315123533
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