MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 111263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014622	GCA	2	6	412063	412068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639828
8002	NC_014622	CAA	2	6	412102	412107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639828
8003	NC_014622	TCA	2	6	412109	412114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639828
8004	NC_014622	CAG	2	6	412177	412182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639828
8005	NC_014622	A	6	6	412198	412203	100 %	0 %	0 %	0 %	310639828
8006	NC_014622	CAT	2	6	412293	412298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639829
8007	NC_014622	GTT	2	6	412317	412322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639829
8008	NC_014622	TAC	2	6	412328	412333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639829
8009	NC_014622	CCTT	2	8	412438	412445	0 %	50 %	0 %	50 %	310639829
8010	NC_014622	GTT	2	6	412467	412472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639829
8011	NC_014622	TCA	2	6	412478	412483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639829
8012	NC_014622	CGT	2	6	412569	412574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639829
8013	NC_014622	CCGT	2	8	412585	412592	0 %	25 %	25 %	50 %	310639829
8014	NC_014622	ATT	2	6	412650	412655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639829
8015	NC_014622	TGA	2	6	412673	412678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639829
8016	NC_014622	GTCCC	2	10	412685	412694	0 %	20 %	20 %	60 %	310639829
8017	NC_014622	ATT	2	6	412771	412776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639829
8018	NC_014622	TTA	2	6	412809	412814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639829
8019	NC_014622	GCA	2	6	412848	412853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639829
8020	NC_014622	TTC	2	6	412894	412899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639829
8021	NC_014622	GAT	2	6	412914	412919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639829
8022	NC_014622	GGCT	2	8	412921	412928	0 %	25 %	50 %	25 %	310639829
8023	NC_014622	CGG	2	6	413045	413050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639829
8024	NC_014622	ATC	2	6	413074	413079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639829
8025	NC_014622	AG	4	8	413129	413136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_014622	TGA	2	6	413138	413143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_014622	GTG	2	6	413186	413191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639830
8028	NC_014622	A	6	6	413192	413197	100 %	0 %	0 %	0 %	310639830
8029	NC_014622	TGC	2	6	413249	413254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639830
8030	NC_014622	GAT	2	6	413265	413270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639830
8031	NC_014622	TCC	2	6	413275	413280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639830
8032	NC_014622	TCC	2	6	413310	413315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639830
8033	NC_014622	CTTC	2	8	413417	413424	0 %	50 %	0 %	50 %	310639830
8034	NC_014622	ATT	2	6	413430	413435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639830
8035	NC_014622	AAGGGC	2	12	413479	413490	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310639830
8036	NC_014622	ATG	2	6	413518	413523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639830
8037	NC_014622	GAT	2	6	413541	413546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639830
8038	NC_014622	TCCT	2	8	413603	413610	0 %	50 %	0 %	50 %	310639830
8039	NC_014622	TGG	2	6	413615	413620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639830
8040	NC_014622	TCTTCC	2	12	413633	413644	0 %	50 %	0 %	50 %	310639830
8041	NC_014622	AGA	2	6	413667	413672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639830
8042	NC_014622	CTG	2	6	413674	413679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639830
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8044	NC_014622	CTT	2	6	413799	413804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639830
8045	NC_014622	ATT	2	6	413815	413820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639830
8046	NC_014622	ATT	2	6	413947	413952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639830
8047	NC_014622	TAT	2	6	413964	413969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639830
8048	NC_014622	ATA	2	6	414005	414010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_014622	GGA	2	6	414036	414041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_014622	TCC	2	6	414065	414070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_014622	T	6	6	414072	414077	0 %	100 %	0 %	0 %	310639831
8052	NC_014622	A	8	8	414084	414091	100 %	0 %	0 %	0 %	310639831
8053	NC_014622	ATTC	2	8	414108	414115	25 %	50 %	0 %	25 %	310639831
8054	NC_014622	TA	3	6	414143	414148	50 %	50 %	0 %	0 %	310639831
8055	NC_014622	CATTA	2	10	414238	414247	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8056	NC_014622	T	6	6	414260	414265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_014622	T	7	7	414284	414290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_014622	ATTT	2	8	414293	414300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_014622	ATA	2	6	414315	414320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_014622	TA	3	6	414334	414339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_014622	AACG	2	8	414387	414394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_014622	CTT	2	6	414423	414428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_014622	ATC	2	6	414434	414439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_014622	CAGAA	2	10	414502	414511	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8065	NC_014622	AAGGG	2	10	414614	414623	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_014622	AAGA	2	8	414632	414639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_014622	AGAGA	2	10	414668	414677	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_014622	TGG	2	6	414713	414718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_014622	AAT	2	6	414800	414805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639832
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8092	NC_014622	CAT	2	6	415943	415948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639834
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8098	NC_014622	TG	3	6	416138	416143	0 %	50 %	50 %	0 %	310639834
8099	NC_014622	GAC	2	6	416152	416157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639834
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8106	NC_014622	GAAT	2	8	416471	416478	50 %	25 %	25 %	0 %	310639834
8107	NC_014622	TAA	2	6	416573	416578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639835
8108	NC_014622	TGAA	2	8	416579	416586	50 %	25 %	25 %	0 %	310639835
8109	NC_014622	T	8	8	416628	416635	0 %	100 %	0 %	0 %	310639835
8110	NC_014622	TA	5	10	416680	416689	50 %	50 %	0 %	0 %	310639835
8111	NC_014622	CT	3	6	416756	416761	0 %	50 %	0 %	50 %	310639835
8112	NC_014622	ATG	2	6	416767	416772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639835
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8122	NC_014622	A	6	6	417212	417217	100 %	0 %	0 %	0 %	310639835
8123	NC_014622	AC	3	6	417325	417330	50 %	0 %	0 %	50 %	310639835
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8252	NC_014622	ATC	2	6	423240	423245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639839
8253	NC_014622	AAG	2	6	423258	423263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639839
8254	NC_014622	GTA	2	6	423351	423356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639839
8255	NC_014622	GAAG	2	8	423371	423378	50 %	0 %	50 %	0 %	310639839
8256	NC_014622	ATGGA	2	10	423387	423396	40 %	20 %	40 %	0 %	310639839
8257	NC_014622	TCG	2	6	423425	423430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639839
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8259	NC_014622	TAT	2	6	423495	423500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639839
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8262	NC_014622	TCCTG	2	10	423554	423563	0 %	40 %	20 %	40 %	310639839
8263	NC_014622	CTGT	2	8	423564	423571	0 %	50 %	25 %	25 %	310639839
8264	NC_014622	CATT	2	8	423742	423749	25 %	50 %	0 %	25 %	310639839
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8283	NC_014622	ATG	2	6	424701	424706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639839
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8288	NC_014622	ATG	2	6	424848	424853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639840
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8320	NC_014622	T	9	9	426837	426845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8331	NC_014622	TCCA	2	8	427342	427349	25 %	25 %	0 %	50 %	310639842
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8363	NC_014622	CTTTC	2	10	428752	428761	0 %	60 %	0 %	40 %	310639844
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8371	NC_014622	AGC	2	6	429136	429141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639844
8372	NC_014622	TA	3	6	429193	429198	50 %	50 %	0 %	0 %	310639845
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8496	NC_014622	C	6	6	435074	435079	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8497	NC_014622	G	6	6	435109	435114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8498	NC_014622	TAA	2	6	435239	435244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639849
8499	NC_014622	ACTT	2	8	435255	435262	25 %	50 %	0 %	25 %	310639849
8500	NC_014622	ATGGT	2	10	435306	435315	20 %	40 %	40 %	0 %	310639849

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