MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 10991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014258	GAT	2	6	199898	199903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717303
4003	NC_014258	CAG	2	6	199955	199960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717303
4004	NC_014258	TGG	2	6	200006	200011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717303
4005	NC_014258	CTG	2	6	200123	200128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717303
4006	NC_014258	GCG	2	6	200138	200143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717303
4007	NC_014258	GCG	2	6	200161	200166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717303
4008	NC_014258	GGT	2	6	200230	200235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717303
4009	NC_014258	A	6	6	200347	200352	100 %	0 %	0 %	0 %	298717303
4010	NC_014258	GCAG	2	8	200386	200393	25 %	0 %	50 %	25 %	298717304
4011	NC_014258	CGC	2	6	200465	200470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717304
4012	NC_014258	GGT	2	6	200486	200491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717304
4013	NC_014258	CAC	2	6	200504	200509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717304
4014	NC_014258	GCT	2	6	200519	200524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717304
4015	NC_014258	CGC	2	6	200550	200555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717304
4016	NC_014258	AGCG	2	8	200559	200566	25 %	0 %	50 %	25 %	298717304
4017	NC_014258	GCG	2	6	200574	200579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717304
4018	NC_014258	TGC	2	6	200585	200590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717304
4019	NC_014258	CAA	2	6	200604	200609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717304
4020	NC_014258	TG	3	6	200643	200648	0 %	50 %	50 %	0 %	298717304
4021	NC_014258	GCC	2	6	200709	200714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717304
4022	NC_014258	GCA	2	6	200779	200784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717304
4023	NC_014258	CTG	2	6	200814	200819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717304
4024	NC_014258	G	6	6	200819	200824	0 %	0 %	100 %	0 %	298717304
4025	NC_014258	CAG	2	6	200880	200885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717304
4026	NC_014258	TGG	2	6	200911	200916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717304
4027	NC_014258	A	6	6	200946	200951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_014258	GGC	2	6	200952	200957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_014258	GCC	2	6	200964	200969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_014258	ATG	2	6	201017	201022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_014258	CCCG	2	8	201040	201047	0 %	0 %	25 %	75 %	298717305
4032	NC_014258	CCAG	2	8	201063	201070	25 %	0 %	25 %	50 %	298717305
4033	NC_014258	CAG	2	6	201079	201084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717305
4034	NC_014258	CCG	3	9	201117	201125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717305
4035	NC_014258	CTG	2	6	201166	201171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717305
4036	NC_014258	GCA	3	9	201207	201215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717305
4037	NC_014258	AATA	2	8	201259	201266	75 %	25 %	0 %	0 %	298717305
4038	NC_014258	GCA	3	9	201294	201302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717305
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4040	NC_014258	CCA	2	6	201504	201509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717305
4041	NC_014258	CCG	2	6	201519	201524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717305
4042	NC_014258	CAG	2	6	201553	201558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717305
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4044	NC_014258	GC	3	6	201630	201635	0 %	0 %	50 %	50 %	298717305
4045	NC_014258	CAG	2	6	201670	201675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717305
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4047	NC_014258	GCC	2	6	201738	201743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717305
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4049	NC_014258	AATA	2	8	201847	201854	75 %	25 %	0 %	0 %	298717305
4050	NC_014258	CAG	4	12	201856	201867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717305
4051	NC_014258	CAG	2	6	201877	201882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717305
4052	NC_014258	AAC	2	6	201919	201924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_014258	CAG	2	6	202005	202010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4054	NC_014258	GGC	2	6	202029	202034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717306
4055	NC_014258	CAG	2	6	202095	202100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4056	NC_014258	CCG	2	6	202144	202149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717306
4057	NC_014258	CAG	2	6	202155	202160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4058	NC_014258	TTA	2	6	202177	202182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717306
4059	NC_014258	ATC	2	6	202204	202209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717306
4060	NC_014258	CAG	3	9	202227	202235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4061	NC_014258	GAA	2	6	202251	202256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717306
4062	NC_014258	GTC	2	6	202302	202307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4063	NC_014258	CAG	2	6	202320	202325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4064	NC_014258	ATC	2	6	202339	202344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717306
4065	NC_014258	GC	3	6	202389	202394	0 %	0 %	50 %	50 %	298717306
4066	NC_014258	GC	3	6	202436	202441	0 %	0 %	50 %	50 %	298717306
4067	NC_014258	CGGCA	2	10	202512	202521	20 %	0 %	40 %	40 %	298717306
4068	NC_014258	CAC	2	6	202617	202622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717306
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4070	NC_014258	TCG	2	6	202684	202689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4071	NC_014258	CTG	2	6	202827	202832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717306
4072	NC_014258	GC	3	6	202850	202855	0 %	0 %	50 %	50 %	298717306
4073	NC_014258	GAC	2	6	202913	202918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717306
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4075	NC_014258	GTGGC	2	10	203000	203009	0 %	20 %	60 %	20 %	298717306
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4083	NC_014258	CTG	2	6	203200	203205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717306
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4102	NC_014258	ATG	2	6	204206	204211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717307
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4104	NC_014258	GCA	2	6	204282	204287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717307
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4115	NC_014258	CAT	2	6	204767	204772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4117	NC_014258	A	6	6	204877	204882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014258	A	6	6	204909	204914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014258	CG	3	6	204924	204929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_014258	TCC	3	9	204954	204962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_014258	CCT	2	6	204965	204970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_014258	CAG	2	6	204975	204980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_014258	GGC	2	6	204988	204993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_014258	GGA	2	6	204994	204999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_014258	GCC	2	6	205046	205051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4241	NC_014258	GC	3	6	210308	210313	0 %	0 %	50 %	50 %	298717312
4242	NC_014258	CG	3	6	210337	210342	0 %	0 %	50 %	50 %	298717312
4243	NC_014258	GGC	2	6	210368	210373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717312
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4245	NC_014258	CGCT	2	8	210449	210456	0 %	25 %	25 %	50 %	298717312
4246	NC_014258	CTG	4	12	210520	210531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717312
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4248	NC_014258	CTG	2	6	210556	210561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717312
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4250	NC_014258	AGCCAG	2	12	210578	210589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717312
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4344	NC_014258	AAT	2	6	214240	214245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4346	NC_014258	CG	3	6	214287	214292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4347	NC_014258	GA	3	6	214353	214358	50 %	0 %	50 %	0 %	298717314
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4362	NC_014258	GGC	2	6	214892	214897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717314
4363	NC_014258	AG	3	6	214913	214918	50 %	0 %	50 %	0 %	298717314
4364	NC_014258	GCC	2	6	214921	214926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717314
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4366	NC_014258	ATG	2	6	214933	214938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717314
4367	NC_014258	GCA	2	6	215003	215008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717314
4368	NC_014258	TC	3	6	215021	215026	0 %	50 %	0 %	50 %	298717314
4369	NC_014258	GCCA	2	8	215037	215044	25 %	0 %	25 %	50 %	298717314
4370	NC_014258	TGG	2	6	215059	215064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717314
4371	NC_014258	GCT	2	6	215120	215125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717314
4372	NC_014258	AATG	2	8	215132	215139	50 %	25 %	25 %	0 %	298717314
4373	NC_014258	GGA	2	6	215189	215194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717314
4374	NC_014258	GAC	2	6	215229	215234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717314
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4376	NC_014258	GGC	2	6	215303	215308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717314
4377	NC_014258	TGCAT	2	10	215318	215327	20 %	40 %	20 %	20 %	298717314
4378	NC_014258	GGC	2	6	215330	215335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717314
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4382	NC_014258	TGC	2	6	215422	215427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717314
4383	NC_014258	GCT	2	6	215468	215473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717314
4384	NC_014258	GAT	2	6	215504	215509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717314
4385	NC_014258	CTG	2	6	215586	215591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717314
4386	NC_014258	TGCGC	2	10	215651	215660	0 %	20 %	40 %	40 %	298717314
4387	NC_014258	AGCGG	2	10	215696	215705	20 %	0 %	60 %	20 %	298717314
4388	NC_014258	CAG	2	6	215892	215897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717314
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4392	NC_014258	GAC	2	6	216046	216051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717314
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4394	NC_014258	GCA	3	9	216110	216118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717314
4395	NC_014258	GC	3	6	216156	216161	0 %	0 %	50 %	50 %	298717314
4396	NC_014258	CTG	2	6	216207	216212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717314
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4399	NC_014258	CG	3	6	216381	216386	0 %	0 %	50 %	50 %	298717314
4400	NC_014258	GTCA	2	8	216405	216412	25 %	25 %	25 %	25 %	298717314
4401	NC_014258	GGT	2	6	216419	216424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717314
4402	NC_014258	GGA	2	6	216428	216433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717314
4403	NC_014258	TGA	2	6	216463	216468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717314
4404	NC_014258	CTG	4	12	216486	216497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717314
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4406	NC_014258	GC	3	6	216567	216572	0 %	0 %	50 %	50 %	298717314
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4415	NC_014258	TGC	2	6	217115	217120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4417	NC_014258	GA	3	6	217128	217133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4418	NC_014258	CAC	2	6	217144	217149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4419	NC_014258	GCCG	2	8	217179	217186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4420	NC_014258	TG	3	6	217277	217282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4421	NC_014258	TCA	2	6	217381	217386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717315
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4423	NC_014258	CTG	2	6	217406	217411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717315
4424	NC_014258	CGC	2	6	217412	217417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717315
4425	NC_014258	CTG	2	6	217448	217453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717315
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4445	NC_014258	CGT	2	6	218327	218332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717316
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4452	NC_014258	ATCCG	2	10	218666	218675	20 %	20 %	20 %	40 %	298717316
4453	NC_014258	GCT	2	6	218759	218764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717316
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4458	NC_014258	GAC	2	6	218970	218975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717316
4459	NC_014258	A	6	6	219116	219121	100 %	0 %	0 %	0 %	298717316
4460	NC_014258	CGCTGG	2	12	219165	219176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	298717317
4461	NC_014258	GTCA	2	8	219183	219190	25 %	25 %	25 %	25 %	298717317
4462	NC_014258	CAG	2	6	219428	219433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717317
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4470	NC_014258	TGA	2	6	219877	219882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717318
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4473	NC_014258	CACC	2	8	220024	220031	25 %	0 %	0 %	75 %	298717318
4474	NC_014258	GC	4	8	220088	220095	0 %	0 %	50 %	50 %	298717318
4475	NC_014258	CAG	2	6	220109	220114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717318
4476	NC_014258	GAC	2	6	220140	220145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717318
4477	NC_014258	TCA	2	6	220191	220196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717318
4478	NC_014258	CAG	2	6	220199	220204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717318
4479	NC_014258	GCA	2	6	220210	220215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717318
4480	NC_014258	GC	3	6	220291	220296	0 %	0 %	50 %	50 %	298717318
4481	NC_014258	GCA	2	6	220300	220305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717318
4482	NC_014258	CGC	2	6	220324	220329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717318
4483	NC_014258	AGG	2	6	220531	220536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717318
4484	NC_014258	GATCA	2	10	220568	220577	40 %	20 %	20 %	20 %	298717318
4485	NC_014258	GC	3	6	220595	220600	0 %	0 %	50 %	50 %	298717318
4486	NC_014258	CAA	2	6	220618	220623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717318
4487	NC_014258	CTG	2	6	220625	220630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717318
4488	NC_014258	CCA	2	6	220660	220665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717318
4489	NC_014258	CG	3	6	220666	220671	0 %	0 %	50 %	50 %	298717318
4490	NC_014258	CGG	2	6	220695	220700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717318
4491	NC_014258	TCA	2	6	220834	220839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717319
4492	NC_014258	GGA	2	6	220841	220846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717319
4493	NC_014258	TCT	2	6	220882	220887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717319
4494	NC_014258	TGT	2	6	220902	220907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717319
4495	NC_014258	TGC	2	6	220909	220914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717319
4496	NC_014258	ATG	2	6	220938	220943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717319
4497	NC_014258	TCG	2	6	220950	220955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717319
4498	NC_014258	GAT	3	9	221062	221070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717319
4499	NC_014258	CGG	2	6	221239	221244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717319
4500	NC_014258	GGCG	2	8	221323	221330	0 %	0 %	75 %	25 %	298717319

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