MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. Y412MC10 chromosome

Total Repeats: 141428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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141002	NC_013406	TTC	2	6	7099997	7100002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261410094
141003	NC_013406	ATCC	2	8	7100062	7100069	25 %	25 %	0 %	50 %	261410094
141004	NC_013406	AAT	2	6	7100077	7100082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261410094
141005	NC_013406	ATT	2	6	7100092	7100097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261410094
141006	NC_013406	CTT	2	6	7100113	7100118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261410094
141007	NC_013406	TCG	2	6	7100181	7100186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141008	NC_013406	TAT	2	6	7100197	7100202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141009	NC_013406	CGG	2	6	7100410	7100415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261410095
141010	NC_013406	CTG	2	6	7100466	7100471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261410095
141011	NC_013406	TTC	2	6	7100476	7100481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261410095
141012	NC_013406	CGAG	2	8	7100501	7100508	25 %	0 %	50 %	25 %	261410095
141013	NC_013406	AG	3	6	7100515	7100520	50 %	0 %	50 %	0 %	261410095
141014	NC_013406	ATC	2	6	7100539	7100544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261410095
141015	NC_013406	AAT	2	6	7100553	7100558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261410095
141016	NC_013406	CGC	2	6	7100630	7100635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261410095
141017	NC_013406	GAA	2	6	7100679	7100684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261410095
141018	NC_013406	TAA	2	6	7100690	7100695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261410095
141019	NC_013406	ACG	2	6	7100821	7100826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261410095
141020	NC_013406	T	6	6	7100836	7100841	0 %	100 %	0 %	0 %	261410095
141021	NC_013406	ATCA	2	8	7100916	7100923	50 %	25 %	0 %	25 %	261410095
141022	NC_013406	AATA	2	8	7100958	7100965	75 %	25 %	0 %	0 %	261410095
141023	NC_013406	TGA	2	6	7100966	7100971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261410095
141024	NC_013406	ATCTT	2	10	7101034	7101043	20 %	60 %	0 %	20 %	261410095
141025	NC_013406	CCT	2	6	7101056	7101061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261410095
141026	NC_013406	TCT	2	6	7101088	7101093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261410095
141027	NC_013406	TCC	2	6	7101137	7101142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141028	NC_013406	TCA	2	6	7101175	7101180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261410096
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141031	NC_013406	CG	3	6	7101345	7101350	0 %	0 %	50 %	50 %	261410096
141032	NC_013406	CTG	2	6	7101357	7101362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261410096
141033	NC_013406	TCC	2	6	7101406	7101411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141034	NC_013406	TGC	2	6	7101416	7101421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141035	NC_013406	TA	3	6	7101437	7101442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141036	NC_013406	TC	3	6	7101443	7101448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141037	NC_013406	TA	3	6	7101476	7101481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141038	NC_013406	AAAT	2	8	7101491	7101498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141039	NC_013406	TAC	2	6	7101628	7101633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141042	NC_013406	TAT	2	6	7101742	7101747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261410097
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141044	NC_013406	ACCG	2	8	7101818	7101825	25 %	0 %	25 %	50 %	261410097
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141065	NC_013406	GCT	2	6	7102706	7102711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261410098
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141067	NC_013406	TGTT	2	8	7102771	7102778	0 %	75 %	25 %	0 %	261410099
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141073	NC_013406	TA	3	6	7103100	7103105	50 %	50 %	0 %	0 %	261410099
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141118	NC_013406	ATG	2	6	7105479	7105484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261410101
141119	NC_013406	TGA	2	6	7105537	7105542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261410101
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141224	NC_013406	A	6	6	7110830	7110835	100 %	0 %	0 %	0 %	261410105
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141250	NC_013406	A	6	6	7112310	7112315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141251	NC_013406	TA	3	6	7112352	7112357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.