MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012914	CAA	2	6	197538	197543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794217
4002	NC_012914	CGC	2	6	197548	197553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794217
4003	NC_012914	ACC	2	6	197640	197645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794217
4004	NC_012914	CGAAGG	2	12	197647	197658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	251794217
4005	NC_012914	TGCT	2	8	197691	197698	0 %	50 %	25 %	25 %	251794217
4006	NC_012914	ATC	2	6	197720	197725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794217
4007	NC_012914	GCT	2	6	197739	197744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794217
4008	NC_012914	GAC	2	6	197750	197755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794217
4009	NC_012914	CGG	2	6	197788	197793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794217
4010	NC_012914	TGA	2	6	197812	197817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794217
4011	NC_012914	CGG	2	6	197958	197963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794217
4012	NC_012914	CTA	2	6	198021	198026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794217
4013	NC_012914	T	6	6	198174	198179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012914	TAAAA	2	10	198183	198192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012914	A	6	6	198189	198194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012914	T	7	7	198217	198223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012914	CGT	2	6	198554	198559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794218
4018	NC_012914	TAAT	2	8	198567	198574	50 %	50 %	0 %	0 %	251794218
4019	NC_012914	T	6	6	198610	198615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012914	T	6	6	198617	198622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_012914	ATG	2	6	198745	198750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794219
4022	NC_012914	CTT	2	6	198763	198768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794219
4023	NC_012914	AAC	2	6	198818	198823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794219
4024	NC_012914	ACG	2	6	198836	198841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4025	NC_012914	CGG	2	6	198842	198847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4026	NC_012914	GCT	2	6	198867	198872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4027	NC_012914	CCT	2	6	198945	198950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794219
4028	NC_012914	TACA	2	8	199024	199031	50 %	25 %	0 %	25 %	251794219
4029	NC_012914	AGA	2	6	199043	199048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794219
4030	NC_012914	GTC	2	6	199123	199128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4031	NC_012914	TGT	2	6	199194	199199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794219
4032	NC_012914	GGT	2	6	199275	199280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794219
4033	NC_012914	GCG	2	6	199315	199320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4034	NC_012914	GGCCGA	2	12	199428	199439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	251794219
4035	NC_012914	GGC	2	6	199440	199445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4036	NC_012914	GAA	2	6	199462	199467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794219
4037	NC_012914	TTG	2	6	199472	199477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794219
4038	NC_012914	GCC	2	6	199484	199489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794219
4039	NC_012914	TGA	2	6	199545	199550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794219
4040	NC_012914	CTA	2	6	199617	199622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794219
4041	NC_012914	CGC	2	6	199660	199665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794219
4042	NC_012914	TGG	2	6	199682	199687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794219
4043	NC_012914	TGC	2	6	199703	199708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4044	NC_012914	GAA	2	6	199888	199893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794219
4045	NC_012914	GAA	2	6	199977	199982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794219
4046	NC_012914	GCG	2	6	199994	199999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4047	NC_012914	AAGG	2	8	200041	200048	50 %	0 %	50 %	0 %	251794219
4048	NC_012914	ATT	2	6	200095	200100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794219
4049	NC_012914	GGC	2	6	200115	200120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4050	NC_012914	GCT	2	6	200202	200207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4051	NC_012914	AAGGGC	2	12	200248	200259	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	251794219
4052	NC_012914	CG	3	6	200273	200278	0 %	0 %	50 %	50 %	251794219
4053	NC_012914	CTT	2	6	200290	200295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794219
4054	NC_012914	GAG	2	6	200296	200301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794219
4055	NC_012914	GAA	2	6	200317	200322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794219
4056	NC_012914	GCG	2	6	200401	200406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4057	NC_012914	CGG	2	6	200490	200495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4058	NC_012914	TTC	2	6	200556	200561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794219
4059	NC_012914	CGAACG	2	12	200562	200573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4060	NC_012914	A	6	6	200611	200616	100 %	0 %	0 %	0 %	251794219
4061	NC_012914	CAG	2	6	200664	200669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4062	NC_012914	ATA	2	6	200702	200707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794219
4063	NC_012914	GAT	2	6	200743	200748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794219
4064	NC_012914	TGG	2	6	200879	200884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794219
4065	NC_012914	GC	4	8	200933	200940	0 %	0 %	50 %	50 %	251794219
4066	NC_012914	GGC	2	6	200947	200952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4067	NC_012914	CGG	2	6	200976	200981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4068	NC_012914	CGG	2	6	201006	201011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4069	NC_012914	GCC	2	6	201020	201025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794219
4070	NC_012914	GGAA	2	8	201029	201036	50 %	0 %	50 %	0 %	251794219
4071	NC_012914	GGC	2	6	201088	201093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4072	NC_012914	GC	3	6	201108	201113	0 %	0 %	50 %	50 %	251794219
4073	NC_012914	GCG	2	6	201122	201127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4074	NC_012914	GAAGCG	2	12	201141	201152	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	251794219
4075	NC_012914	CGG	2	6	201165	201170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4076	NC_012914	AGC	2	6	201171	201176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794219
4077	NC_012914	CG	3	6	201190	201195	0 %	0 %	50 %	50 %	251794219
4078	NC_012914	GCG	2	6	201205	201210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4079	NC_012914	GGC	2	6	201254	201259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4080	NC_012914	GGC	2	6	201370	201375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4081	NC_012914	GCG	2	6	201386	201391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4082	NC_012914	GGC	2	6	201412	201417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4083	NC_012914	AGCGA	2	10	201425	201434	40 %	0 %	40 %	20 %	251794219
4084	NC_012914	TTC	2	6	201441	201446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794219
4085	NC_012914	AAT	2	6	201457	201462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794219
4086	NC_012914	GAA	2	6	201469	201474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794219
4087	NC_012914	AAG	2	6	201484	201489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794219
4088	NC_012914	GGC	3	9	201523	201531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794219
4089	NC_012914	TAAA	2	8	201564	201571	75 %	25 %	0 %	0 %	251794219
4090	NC_012914	GCT	2	6	201611	201616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_012914	AGC	2	6	201640	201645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_012914	AT	3	6	201673	201678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012914	TGA	2	6	201730	201735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_012914	TG	3	6	201794	201799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_012914	T	6	6	201802	201807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_012914	CAA	2	6	201861	201866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794220
4097	NC_012914	GGC	2	6	201921	201926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794220
4098	NC_012914	GAA	2	6	201981	201986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794220
4099	NC_012914	GTT	2	6	202008	202013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794220
4100	NC_012914	GTT	2	6	202044	202049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794220
4101	NC_012914	AACG	2	8	202070	202077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_012914	T	7	7	202100	202106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_012914	GTT	2	6	202153	202158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_012914	TAA	2	6	202171	202176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012914	TC	3	6	202183	202188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_012914	CAAAA	2	10	202257	202266	80 %	0 %	0 %	20 %	251794221
4107	NC_012914	A	6	6	202263	202268	100 %	0 %	0 %	0 %	251794221
4108	NC_012914	GCT	3	9	202478	202486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794221
4109	NC_012914	AGC	2	6	202492	202497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794221
4110	NC_012914	GCT	2	6	202508	202513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794221
4111	NC_012914	AGG	2	6	202528	202533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794221
4112	NC_012914	GCT	2	6	202583	202588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794221
4113	NC_012914	AAG	2	6	202608	202613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794221
4114	NC_012914	GCGT	2	8	202667	202674	0 %	25 %	50 %	25 %	251794221
4115	NC_012914	CAT	2	6	202747	202752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_012914	CAA	2	6	202830	202835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_012914	AGT	2	6	202844	202849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012914	CTTG	2	8	202851	202858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_012914	GTC	2	6	202999	203004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_012914	TCA	2	6	203009	203014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_012914	ACA	3	9	203039	203047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_012914	TAA	2	6	203067	203072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012914	CCTA	2	8	203087	203094	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_012914	GACTA	2	10	203108	203117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4125	NC_012914	AGT	2	6	203128	203133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_012914	GAA	2	6	203169	203174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012914	GAC	2	6	203211	203216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_012914	TG	3	6	203258	203263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012914	CCA	2	6	203301	203306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_012914	GTTTTT	2	12	203335	203346	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4132	NC_012914	T	6	6	203387	203392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_012914	TTAG	2	8	203398	203405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_012914	GTT	2	6	203611	203616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_012914	GAAT	2	8	203620	203627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_012914	TGGC	2	8	203654	203661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_012914	CGG	2	6	203699	203704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_012914	ATG	2	6	203774	203779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_012914	TGTA	2	8	203791	203798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_012914	GAG	2	6	203843	203848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_012914	ATT	2	6	203866	203871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_012914	ATT	2	6	203903	203908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_012914	GATG	2	8	203958	203965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4146	NC_012914	ATGC	2	8	204037	204044	25 %	25 %	25 %	25 %	251794222
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4151	NC_012914	GCTG	2	8	204471	204478	0 %	25 %	50 %	25 %	251794222
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4159	NC_012914	AGG	2	6	205095	205100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_012914	T	6	6	205310	205315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_012914	AAT	2	6	205318	205323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_012914	GA	4	8	205368	205375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_012914	GTT	2	6	205469	205474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4240	NC_012914	TTAC	2	8	210520	210527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4241	NC_012914	ATAA	2	8	210547	210554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_012914	CCA	2	6	210559	210564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4243	NC_012914	T	6	6	210574	210579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_012914	T	6	6	210593	210598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_012914	AG	3	6	210686	210691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_012914	AGC	2	6	211052	211057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_012914	TCG	2	6	211066	211071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_012914	TGCC	2	8	211180	211187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4253	NC_012914	CGG	2	6	211294	211299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_012914	CCA	2	6	211317	211322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_012914	GGT	2	6	211488	211493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_012914	CCA	2	6	211510	211515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_012914	T	6	6	211516	211521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_012914	TGG	2	6	211624	211629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_012914	GCT	2	6	211768	211773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_012914	AAT	2	6	211788	211793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_012914	A	6	6	211859	211864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_012914	AATTG	2	10	211886	211895	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_012914	CAT	2	6	211923	211928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NC_012914	AG	3	6	212021	212026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_012914	GGT	2	6	212066	212071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_012914	AGC	2	6	212153	212158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794225
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4271	NC_012914	TTC	2	6	212611	212616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794225
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4273	NC_012914	TGC	2	6	212760	212765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794225
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4280	NC_012914	GCT	2	6	213034	213039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794225
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4283	NC_012914	A	6	6	213198	213203	100 %	0 %	0 %	0 %	251794225
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4289	NC_012914	TTCGT	2	10	213540	213549	0 %	60 %	20 %	20 %	251794225
4290	NC_012914	GCT	2	6	213610	213615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794225
4291	NC_012914	TAT	2	6	213654	213659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794225
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4302	NC_012914	AGC	2	6	214385	214390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794226
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4332	NC_012914	ACGA	2	8	215556	215563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4333	NC_012914	ATATGA	2	12	215597	215608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	251794227
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4368	NC_012914	GA	3	6	217006	217011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_012914	A	7	7	217030	217036	100 %	0 %	0 %	0 %	251794228
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4378	NC_012914	GAT	2	6	217530	217535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794228
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4380	NC_012914	CGCTGC	2	12	217631	217642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	251794228
4381	NC_012914	TGC	2	6	217667	217672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794228
4382	NC_012914	CGG	2	6	217725	217730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794228
4383	NC_012914	TTTA	2	8	217762	217769	25 %	75 %	0 %	0 %	251794228
4384	NC_012914	TCT	2	6	217823	217828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794228
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4408	NC_012914	A	6	6	218767	218772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_012914	ATT	2	6	218777	218782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_012914	TCA	2	6	218832	218837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4500	NC_012914	GGAA	2	8	224227	224234	50 %	0 %	50 %	0 %	251794231

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