MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 142585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012914	CAGA	2	8	224292	224299	50 %	0 %	25 %	25 %	251794231
4502	NC_012914	AGG	2	6	224428	224433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794232
4503	NC_012914	GAAG	2	8	224539	224546	50 %	0 %	50 %	0 %	251794232
4504	NC_012914	ATT	2	6	224614	224619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794232
4505	NC_012914	TCA	3	9	224740	224748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794232
4506	NC_012914	TCCG	2	8	224766	224773	0 %	25 %	25 %	50 %	251794232
4507	NC_012914	CTG	3	9	224832	224840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
4508	NC_012914	GCT	2	6	224870	224875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
4509	NC_012914	GA	3	6	224972	224977	50 %	0 %	50 %	0 %	251794232
4510	NC_012914	ACG	2	6	224995	225000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794232
4511	NC_012914	GGA	2	6	225092	225097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794232
4512	NC_012914	GCA	2	6	225139	225144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794232
4513	NC_012914	CG	3	6	225185	225190	0 %	0 %	50 %	50 %	251794232
4514	NC_012914	GGC	2	6	225212	225217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794232
4515	NC_012914	CGG	2	6	225244	225249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794232
4516	NC_012914	GCT	2	6	225260	225265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
4517	NC_012914	GAA	2	6	225320	225325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794232
4518	NC_012914	AAG	2	6	225345	225350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794232
4519	NC_012914	GCT	2	6	225422	225427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
4520	NC_012914	T	7	7	225477	225483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_012914	T	7	7	225531	225537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_012914	CTTT	2	8	225542	225549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_012914	TCTG	2	8	225599	225606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_012914	GGA	2	6	225840	225845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794233
4525	NC_012914	TTAA	2	8	225874	225881	50 %	50 %	0 %	0 %	251794233
4526	NC_012914	TTA	2	6	225917	225922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794233
4527	NC_012914	GCT	2	6	225954	225959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4528	NC_012914	GGC	2	6	226032	226037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4529	NC_012914	GCG	2	6	226111	226116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4530	NC_012914	GTT	2	6	226141	226146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794233
4531	NC_012914	ACGGG	2	10	226149	226158	20 %	0 %	60 %	20 %	251794233
4532	NC_012914	CAG	2	6	226282	226287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4533	NC_012914	TCA	2	6	226307	226312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794233
4534	NC_012914	CAG	2	6	226330	226335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4535	NC_012914	GCA	2	6	226369	226374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4536	NC_012914	TCG	3	9	226439	226447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4537	NC_012914	CGT	2	6	226617	226622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4538	NC_012914	GAA	2	6	226629	226634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794233
4539	NC_012914	GTC	2	6	226654	226659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4540	NC_012914	ACG	2	6	226666	226671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4541	NC_012914	GTC	2	6	226672	226677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4542	NC_012914	CGG	2	6	226719	226724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4543	NC_012914	ATTACG	2	12	226735	226746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251794233
4544	NC_012914	GCG	2	6	226747	226752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4545	NC_012914	TGC	2	6	226760	226765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4546	NC_012914	AAGG	2	8	226852	226859	50 %	0 %	50 %	0 %	251794233
4547	NC_012914	CGA	2	6	226868	226873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4548	NC_012914	GAT	2	6	227001	227006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794233
4549	NC_012914	ACA	2	6	227011	227016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794233
4550	NC_012914	CGG	2	6	227025	227030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4551	NC_012914	CGG	3	9	227034	227042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4552	NC_012914	CGG	2	6	227055	227060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4553	NC_012914	GGC	2	6	227062	227067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4554	NC_012914	CTC	2	6	227134	227139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794233
4555	NC_012914	AGC	2	6	227202	227207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4556	NC_012914	GCA	2	6	227237	227242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4557	NC_012914	CGG	2	6	227255	227260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4558	NC_012914	CGG	2	6	227501	227506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4559	NC_012914	GAAG	2	8	227739	227746	50 %	0 %	50 %	0 %	251794233
4560	NC_012914	GCG	2	6	227747	227752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4561	NC_012914	GGT	2	6	227910	227915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794233
4562	NC_012914	CGT	2	6	228054	228059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4563	NC_012914	GCAA	2	8	228065	228072	50 %	0 %	25 %	25 %	251794233
4564	NC_012914	AAG	2	6	228128	228133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794233
4565	NC_012914	CCAG	2	8	228147	228154	25 %	0 %	25 %	50 %	251794233
4566	NC_012914	ACG	2	6	228187	228192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4567	NC_012914	ATG	2	6	228407	228412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794233
4568	NC_012914	TGG	2	6	228494	228499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794233
4569	NC_012914	AGC	2	6	228509	228514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4570	NC_012914	TCC	2	6	228572	228577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794233
4571	NC_012914	GGA	2	6	228594	228599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794233
4572	NC_012914	GAAG	2	8	228601	228608	50 %	0 %	50 %	0 %	251794233
4573	NC_012914	GGC	2	6	228673	228678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4574	NC_012914	AACCC	2	10	228709	228718	40 %	0 %	0 %	60 %	251794233
4575	NC_012914	GGCC	2	8	228759	228766	0 %	0 %	50 %	50 %	251794233
4576	NC_012914	CGG	2	6	228818	228823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4577	NC_012914	ACG	2	6	228827	228832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4578	NC_012914	ACT	2	6	228859	228864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794233
4579	NC_012914	CGG	2	6	228888	228893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4580	NC_012914	CGG	2	6	228897	228902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4581	NC_012914	GTCC	2	8	228918	228925	0 %	25 %	25 %	50 %	251794233
4582	NC_012914	GC	3	6	228947	228952	0 %	0 %	50 %	50 %	251794233
4583	NC_012914	GAA	2	6	228954	228959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794233
4584	NC_012914	AAC	2	6	228996	229001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794233
4585	NC_012914	AGG	2	6	229119	229124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794233
4586	NC_012914	TCC	2	6	229166	229171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794233
4587	NC_012914	CGG	2	6	229217	229222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4588	NC_012914	CGG	2	6	229254	229259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4589	NC_012914	AGC	2	6	229303	229308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4590	NC_012914	GCATC	2	10	229346	229355	20 %	20 %	20 %	40 %	251794233
4591	NC_012914	GGC	2	6	229375	229380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4592	NC_012914	GAA	2	6	229447	229452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794233
4593	NC_012914	CAA	2	6	229596	229601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794233
4594	NC_012914	GAC	2	6	229620	229625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4595	NC_012914	GCC	2	6	229666	229671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794233
4596	NC_012914	CGT	2	6	229707	229712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4597	NC_012914	GGT	2	6	229746	229751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794233
4598	NC_012914	GAA	2	6	229773	229778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794233
4599	NC_012914	TTC	2	6	229793	229798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794233
4600	NC_012914	ACT	2	6	229829	229834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794233
4601	NC_012914	ACT	2	6	229880	229885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794233
4602	NC_012914	AAC	2	6	229930	229935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794233
4603	NC_012914	GGC	2	6	230037	230042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4604	NC_012914	TCG	2	6	230044	230049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4605	NC_012914	AGC	2	6	230113	230118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4606	NC_012914	CGA	2	6	230150	230155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4607	NC_012914	CGG	2	6	230160	230165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4608	NC_012914	GGAA	2	8	230196	230203	50 %	0 %	50 %	0 %	251794233
4609	NC_012914	CGG	2	6	230306	230311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4610	NC_012914	TGC	2	6	230357	230362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4611	NC_012914	ATT	2	6	230402	230407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794233
4612	NC_012914	GA	3	6	230496	230501	50 %	0 %	50 %	0 %	251794233
4613	NC_012914	ACG	2	6	230569	230574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4614	NC_012914	CGG	2	6	230615	230620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4615	NC_012914	ATCA	2	8	230722	230729	50 %	25 %	0 %	25 %	251794233
4616	NC_012914	GCT	2	6	230838	230843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4617	NC_012914	GACG	2	8	230889	230896	25 %	0 %	50 %	25 %	251794233
4618	NC_012914	CGG	3	9	230909	230917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4619	NC_012914	CCT	2	6	230921	230926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794233
4620	NC_012914	CGG	2	6	230933	230938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4621	NC_012914	TAT	2	6	230953	230958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794233
4622	NC_012914	CGA	2	6	231078	231083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
4623	NC_012914	CGGA	2	8	231200	231207	25 %	0 %	50 %	25 %	251794233
4624	NC_012914	GCG	2	6	231229	231234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
4625	NC_012914	CGG	2	6	231288	231293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
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4651	NC_012914	ATGA	2	8	233188	233195	50 %	25 %	25 %	0 %	251794233
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4730	NC_012914	GCCG	2	8	237507	237514	0 %	0 %	50 %	50 %	251794233
4731	NC_012914	TGC	2	6	237530	237535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
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4734	NC_012914	TTG	2	6	237856	237861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794233
4735	NC_012914	AG	3	6	237885	237890	50 %	0 %	50 %	0 %	251794233
4736	NC_012914	CGA	2	6	237972	237977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
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4740	NC_012914	GTC	2	6	238111	238116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
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4742	NC_012914	GGA	2	6	238216	238221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794233
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4744	NC_012914	GTT	2	6	238275	238280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794233
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4858	NC_012914	CCGT	2	8	244260	244267	0 %	25 %	25 %	50 %	251794236
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4864	NC_012914	CGG	2	6	244460	244465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794236
4865	NC_012914	GAA	2	6	244482	244487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794236
4866	NC_012914	ATC	2	6	244547	244552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4867	NC_012914	AGG	2	6	244565	244570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4868	NC_012914	TAT	2	6	244606	244611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794237
4869	NC_012914	TGC	3	9	244616	244624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794237
4870	NC_012914	ATT	2	6	244798	244803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794237
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4877	NC_012914	GGC	2	6	245109	245114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794237
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4881	NC_012914	GCT	2	6	245479	245484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4919	NC_012914	ATCCA	2	10	247407	247416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4948	NC_012914	TAA	2	6	249257	249262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4950	NC_012914	TGATAA	2	12	249323	249334	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4953	NC_012914	TACA	2	8	249367	249374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4954	NC_012914	T	7	7	249423	249429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4955	NC_012914	ATG	2	6	249528	249533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794242
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4972	NC_012914	TGA	2	6	250460	250465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794243
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4980	NC_012914	CT	3	6	250834	250839	0 %	50 %	0 %	50 %	251794243
4981	NC_012914	TTGCGG	2	12	250889	250900	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	251794243
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4986	NC_012914	CGG	2	6	251318	251323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794243
4987	NC_012914	TTCC	2	8	251335	251342	0 %	50 %	0 %	50 %	251794243
4988	NC_012914	CCGG	2	8	251353	251360	0 %	0 %	50 %	50 %	251794243
4989	NC_012914	TATT	2	8	251398	251405	25 %	75 %	0 %	0 %	251794243
4990	NC_012914	ATG	2	6	251459	251464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794244
4991	NC_012914	A	7	7	251471	251477	100 %	0 %	0 %	0 %	251794244
4992	NC_012914	AAT	2	6	251482	251487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794244
4993	NC_012914	GCT	2	6	251488	251493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794244
4994	NC_012914	GGC	2	6	251563	251568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794244
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4999	NC_012914	GAAG	2	8	251773	251780	50 %	0 %	50 %	0 %	251794244
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