MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 chromosome

Total Repeats: 49907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011059	GCT	2	6	251736	251741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333086
5002	NC_011059	AG	3	6	251746	251751	50 %	0 %	50 %	0 %	194333086
5003	NC_011059	TAA	2	6	251781	251786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194333086
5004	NC_011059	ATC	2	6	251867	251872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_011059	A	6	6	251874	251879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011059	TCG	2	6	252011	252016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333087
5007	NC_011059	GCC	2	6	252025	252030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194333087
5008	NC_011059	GC	3	6	252045	252050	0 %	0 %	50 %	50 %	194333087
5009	NC_011059	TTG	2	6	252173	252178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333087
5010	NC_011059	ATG	2	6	252224	252229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333087
5011	NC_011059	CGG	2	6	252230	252235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333087
5012	NC_011059	AGGAG	2	10	252276	252285	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011059	GA	3	6	252293	252298	50 %	0 %	50 %	0 %	194333088
5014	NC_011059	GCT	2	6	252368	252373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5015	NC_011059	CG	3	6	252403	252408	0 %	0 %	50 %	50 %	194333088
5016	NC_011059	CGG	2	6	252461	252466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333088
5017	NC_011059	CGA	2	6	252599	252604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5018	NC_011059	GAG	2	6	252609	252614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194333088
5019	NC_011059	CAT	2	6	252638	252643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333088
5020	NC_011059	GCC	2	6	252677	252682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194333088
5021	NC_011059	AAG	2	6	252690	252695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194333088
5022	NC_011059	GAT	2	6	252705	252710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333088
5023	NC_011059	TGC	2	6	252773	252778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5024	NC_011059	CGG	2	6	252833	252838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333088
5025	NC_011059	ATT	2	6	252858	252863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194333088
5026	NC_011059	CAGT	2	8	252935	252942	25 %	25 %	25 %	25 %	194333088
5027	NC_011059	CGG	2	6	252946	252951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333088
5028	NC_011059	ATT	2	6	253029	253034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194333088
5029	NC_011059	GGC	2	6	253133	253138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333088
5030	NC_011059	TCA	2	6	253267	253272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333088
5031	NC_011059	CTT	2	6	253338	253343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333088
5032	NC_011059	GTT	2	6	253362	253367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333088
5033	NC_011059	TTG	3	9	253378	253386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333088
5034	NC_011059	GGAGG	2	10	253402	253411	20 %	0 %	80 %	0 %	194333088
5035	NC_011059	CTT	2	6	253455	253460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333088
5036	NC_011059	CTA	2	6	253463	253468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333088
5037	NC_011059	TGG	2	6	253531	253536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333088
5038	NC_011059	ATC	2	6	253548	253553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333088
5039	NC_011059	TGC	2	6	253613	253618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5040	NC_011059	TCT	2	6	253753	253758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333088
5041	NC_011059	TTTG	2	8	253760	253767	0 %	75 %	25 %	0 %	194333088
5042	NC_011059	TGG	2	6	253902	253907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333088
5043	NC_011059	GTTTTT	2	12	253920	253931	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	194333088
5044	NC_011059	G	8	8	253946	253953	0 %	0 %	100 %	0 %	194333088
5045	NC_011059	TGG	2	6	253978	253983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333088
5046	NC_011059	ACG	2	6	254049	254054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5047	NC_011059	TAC	2	6	254130	254135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333088
5048	NC_011059	ACT	2	6	254179	254184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333088
5049	NC_011059	TCC	2	6	254339	254344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333088
5050	NC_011059	C	6	6	254348	254353	0 %	0 %	0 %	100 %	194333088
5051	NC_011059	TCG	2	6	254368	254373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5052	NC_011059	AGC	2	6	254398	254403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5053	NC_011059	TGGAT	2	10	254464	254473	20 %	40 %	40 %	0 %	194333088
5054	NC_011059	GAT	2	6	254481	254486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333088
5055	NC_011059	GCA	2	6	254523	254528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5056	NC_011059	GAC	2	6	254720	254725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5057	NC_011059	GA	3	6	254740	254745	50 %	0 %	50 %	0 %	194333088
5058	NC_011059	CTG	2	6	254836	254841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5059	NC_011059	TC	3	6	254932	254937	0 %	50 %	0 %	50 %	194333088
5060	NC_011059	TGC	2	6	255032	255037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5061	NC_011059	ATT	2	6	255057	255062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194333088
5062	NC_011059	TCT	2	6	255065	255070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333088
5063	NC_011059	CTC	2	6	255100	255105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333088
5064	NC_011059	TGA	2	6	255109	255114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333088
5065	NC_011059	TGG	2	6	255115	255120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333088
5066	NC_011059	CAT	2	6	255143	255148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333088
5067	NC_011059	T	6	6	255174	255179	0 %	100 %	0 %	0 %	194333088
5068	NC_011059	TAT	2	6	255218	255223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194333088
5069	NC_011059	AGG	2	6	255271	255276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194333088
5070	NC_011059	GCAG	2	8	255290	255297	25 %	0 %	50 %	25 %	194333088
5071	NC_011059	CTG	2	6	255307	255312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5072	NC_011059	TTC	2	6	255331	255336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333088
5073	NC_011059	GCT	2	6	255461	255466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333088
5074	NC_011059	A	7	7	255481	255487	100 %	0 %	0 %	0 %	194333088
5075	NC_011059	CAG	2	6	255602	255607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333089
5076	NC_011059	TGG	2	6	255657	255662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333089
5077	NC_011059	CTC	2	6	255689	255694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194333089
5078	NC_011059	ATC	2	6	255735	255740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333089
5079	NC_011059	CGATAG	2	12	255760	255771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194333089
5080	NC_011059	TGA	2	6	255799	255804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333089
5081	NC_011059	A	6	6	255811	255816	100 %	0 %	0 %	0 %	194333089
5082	NC_011059	TGA	2	6	255883	255888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333090
5083	NC_011059	GTC	2	6	255894	255899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333090
5084	NC_011059	GAT	2	6	255934	255939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333090
5085	NC_011059	AGGG	2	8	255956	255963	25 %	0 %	75 %	0 %	194333090
5086	NC_011059	TGA	2	6	256162	256167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333090
5087	NC_011059	CGT	2	6	256192	256197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333090
5088	NC_011059	GGAC	2	8	256236	256243	25 %	0 %	50 %	25 %	194333090
5089	NC_011059	CTT	2	6	256289	256294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333090
5090	NC_011059	GAC	2	6	256306	256311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333090
5091	NC_011059	TCT	2	6	256387	256392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333090
5092	NC_011059	GCG	2	6	256436	256441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333090
5093	NC_011059	CATGG	2	10	256517	256526	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_011059	ATT	2	6	256560	256565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_011059	T	9	9	256564	256572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011059	TC	3	6	256582	256587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_011059	ATA	2	6	256659	256664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011059	T	6	6	256684	256689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011059	TGA	2	6	256811	256816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333091
5100	NC_011059	A	8	8	256816	256823	100 %	0 %	0 %	0 %	194333091
5101	NC_011059	TCG	2	6	256841	256846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333091
5102	NC_011059	ATC	2	6	256978	256983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333091
5103	NC_011059	CAA	2	6	257067	257072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194333091
5104	NC_011059	TTC	2	6	257102	257107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333091
5105	NC_011059	CTGC	2	8	257122	257129	0 %	25 %	25 %	50 %	194333091
5106	NC_011059	GAC	2	6	257134	257139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333091
5107	NC_011059	GCCG	2	8	257259	257266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_011059	GTC	2	6	257311	257316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333092
5109	NC_011059	GGC	3	9	257317	257325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333092
5110	NC_011059	AACC	2	8	257361	257368	50 %	0 %	0 %	50 %	194333092
5111	NC_011059	GTG	2	6	257435	257440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194333092
5112	NC_011059	TGC	2	6	257445	257450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333092
5113	NC_011059	CAA	2	6	257457	257462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194333092
5114	NC_011059	GAT	2	6	257470	257475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333092
5115	NC_011059	ATA	2	6	257585	257590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194333092
5116	NC_011059	CGG	2	6	257643	257648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333092
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5118	NC_011059	TTC	2	6	257743	257748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333092
5119	NC_011059	TTGC	2	8	257800	257807	0 %	50 %	25 %	25 %	194333092
5120	NC_011059	GCG	2	6	257921	257926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194333092
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5122	NC_011059	CCACC	2	10	257988	257997	20 %	0 %	0 %	80 %	194333092
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5151	NC_011059	GAAT	2	8	259583	259590	50 %	25 %	25 %	0 %	194333093
5152	NC_011059	TG	3	6	259690	259695	0 %	50 %	50 %	0 %	194333093
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5349	NC_011059	AGAA	2	8	269522	269529	75 %	0 %	25 %	0 %	194333104
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5367	NC_011059	T	7	7	270644	270650	0 %	100 %	0 %	0 %	194333104
5368	NC_011059	CTT	2	6	270682	270687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194333104
5369	NC_011059	GA	3	6	270709	270714	50 %	0 %	50 %	0 %	194333104
5370	NC_011059	GCC	2	6	270743	270748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194333104
5371	NC_011059	GTA	2	6	270815	270820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333104
5372	NC_011059	TGT	2	6	270830	270835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_011059	TCA	2	6	270915	270920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194333105
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5387	NC_011059	TGA	2	6	271688	271693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194333105
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5391	NC_011059	AGGAA	2	10	271950	271959	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_011059	TAA	2	6	271990	271995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5475	NC_011059	GA	3	6	276344	276349	50 %	0 %	50 %	0 %	194333108
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5488	NC_011059	GTC	2	6	277082	277087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333108
5489	NC_011059	ACG	2	6	277091	277096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333108
5490	NC_011059	TTG	2	6	277119	277124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194333108
5491	NC_011059	GCGG	2	8	277139	277146	0 %	0 %	75 %	25 %	194333108
5492	NC_011059	GCGG	2	8	277157	277164	0 %	0 %	75 %	25 %	194333108
5493	NC_011059	ATT	2	6	277229	277234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194333109
5494	NC_011059	CGA	2	6	277243	277248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333109
5495	NC_011059	GCT	2	6	277249	277254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194333109
5496	NC_011059	GCAGGG	2	12	277304	277315	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	194333109
5497	NC_011059	GCC	2	6	277355	277360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194333109
5498	NC_011059	CT	3	6	277381	277386	0 %	50 %	0 %	50 %	194333109
5499	NC_011059	GAC	2	6	277436	277441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194333109
5500	NC_011059	GAA	2	6	277447	277452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194333109

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