MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 29422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_010531	AT	3	6	1013778	1013783	50 %	50 %	0 %	0 %	171463826
19002	NC_010531	ATT	2	6	1013844	1013849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_010531	CTT	2	6	1013883	1013888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_010531	GCAT	2	8	1013911	1013918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19005	NC_010531	TAG	2	6	1013951	1013956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_010531	AAG	2	6	1013995	1014000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_010531	CT	3	6	1014031	1014036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19008	NC_010531	AAG	2	6	1014166	1014171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_010531	CTT	2	6	1014183	1014188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19010	NC_010531	AAT	2	6	1014234	1014239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_010531	TCTT	2	8	1014267	1014274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19012	NC_010531	TCA	3	9	1014436	1014444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_010531	GAT	2	6	1014566	1014571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_010531	CAA	2	6	1014597	1014602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19015	NC_010531	ATTG	2	8	1014624	1014631	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_010531	CA	3	6	1014674	1014679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19017	NC_010531	TAA	2	6	1014694	1014699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19018	NC_010531	GAA	2	6	1014789	1014794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171463827
19019	NC_010531	TGC	2	6	1014881	1014886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171463827
19020	NC_010531	GGC	2	6	1015065	1015070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171463827
19021	NC_010531	GGC	2	6	1015089	1015094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171463827
19022	NC_010531	ATG	2	6	1015095	1015100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171463827
19023	NC_010531	GGC	2	6	1015140	1015145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171463827
19024	NC_010531	AAC	2	6	1015258	1015263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171463827
19025	NC_010531	GGT	2	6	1015290	1015295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171463827
19026	NC_010531	CTC	2	6	1015355	1015360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171463827
19027	NC_010531	AGCA	2	8	1015391	1015398	50 %	0 %	25 %	25 %	171463827
19028	NC_010531	CA	3	6	1015397	1015402	50 %	0 %	0 %	50 %	171463827
19029	NC_010531	CTG	2	6	1015408	1015413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171463827
19030	NC_010531	CAT	2	6	1015457	1015462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171463827
19031	NC_010531	TGG	2	6	1015508	1015513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171463827
19032	NC_010531	TGC	2	6	1015528	1015533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171463827
19033	NC_010531	TGA	2	6	1015577	1015582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171463827
19034	NC_010531	ACCT	2	8	1015638	1015645	25 %	25 %	0 %	50 %	171463827
19035	NC_010531	GGC	2	6	1015668	1015673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171463827
19036	NC_010531	TGA	2	6	1015684	1015689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171463827
19037	NC_010531	CGA	2	6	1015700	1015705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171463827
19038	NC_010531	CG	3	6	1015783	1015788	0 %	0 %	50 %	50 %	171463827
19039	NC_010531	TG	3	6	1015878	1015883	0 %	50 %	50 %	0 %	171463827
19040	NC_010531	GAT	2	6	1015947	1015952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171463827
19041	NC_010531	CAT	2	6	1015964	1015969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171463827
19042	NC_010531	AGA	2	6	1015975	1015980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171463827
19043	NC_010531	GGC	2	6	1016025	1016030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171463827
19044	NC_010531	TTA	2	6	1016101	1016106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171463827
19045	NC_010531	TGG	2	6	1016123	1016128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171463827
19046	NC_010531	TCAT	2	8	1016191	1016198	25 %	50 %	0 %	25 %	171463827
19047	NC_010531	CGAT	2	8	1016215	1016222	25 %	25 %	25 %	25 %	171463827
19048	NC_010531	GAT	2	6	1016253	1016258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171463827
19049	NC_010531	GCTT	2	8	1016317	1016324	0 %	50 %	25 %	25 %	171463827
19050	NC_010531	GCAA	2	8	1016352	1016359	50 %	0 %	25 %	25 %	171463827
19051	NC_010531	A	6	6	1016403	1016408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_010531	T	6	6	1016437	1016442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19053	NC_010531	TGC	2	6	1016456	1016461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19054	NC_010531	TACTTC	2	12	1016522	1016533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	171463828
19055	NC_010531	GCC	2	6	1016642	1016647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171463828
19056	NC_010531	CAG	2	6	1016761	1016766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171463828
19057	NC_010531	CCG	2	6	1016793	1016798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171463828
19058	NC_010531	CTG	2	6	1016804	1016809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171463828
19059	NC_010531	CAA	2	6	1016915	1016920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171463828
19060	NC_010531	TAA	2	6	1016927	1016932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171463828
19061	NC_010531	CTC	2	6	1016953	1016958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19062	NC_010531	TTAAAT	2	12	1016963	1016974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_010531	CTT	2	6	1016982	1016987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19064	NC_010531	AGC	2	6	1017113	1017118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171463829
19065	NC_010531	AAG	3	9	1017144	1017152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171463829
19066	NC_010531	ATCA	2	8	1017176	1017183	50 %	25 %	0 %	25 %	171463829
19067	NC_010531	TGC	2	6	1017346	1017351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171463829
19068	NC_010531	TAA	2	6	1017362	1017367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171463830
19069	NC_010531	CTTG	2	8	1017395	1017402	0 %	50 %	25 %	25 %	171463830
19070	NC_010531	ATC	2	6	1017442	1017447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171463830
19071	NC_010531	TCT	2	6	1017590	1017595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171463830
19072	NC_010531	ATC	2	6	1017663	1017668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171463830
19073	NC_010531	AAC	2	6	1017717	1017722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171463830
19074	NC_010531	GATT	2	8	1017739	1017746	25 %	50 %	25 %	0 %	171463830
19075	NC_010531	AATT	2	8	1017762	1017769	50 %	50 %	0 %	0 %	171463830
19076	NC_010531	AAT	2	6	1017821	1017826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171463830
19077	NC_010531	TCTGC	2	10	1017836	1017845	0 %	40 %	20 %	40 %	171463830
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19079	NC_010531	AAT	2	6	1017876	1017881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171463830
19080	NC_010531	AAT	2	6	1017915	1017920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171463830
19081	NC_010531	CATA	2	8	1017923	1017930	50 %	25 %	0 %	25 %	171463830
19082	NC_010531	CCT	2	6	1017935	1017940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19083	NC_010531	CAG	2	6	1018010	1018015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19084	NC_010531	GAAG	2	8	1018027	1018034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19085	NC_010531	AATA	2	8	1018134	1018141	75 %	25 %	0 %	0 %	171463831
19086	NC_010531	TTGG	2	8	1018144	1018151	0 %	50 %	50 %	0 %	171463831
19087	NC_010531	GCC	2	6	1018172	1018177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171463831
19088	NC_010531	GTA	2	6	1018239	1018244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171463831
19089	NC_010531	CAG	2	6	1018300	1018305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171463831
19090	NC_010531	A	6	6	1018390	1018395	100 %	0 %	0 %	0 %	171463832
19091	NC_010531	TGCT	2	8	1018506	1018513	0 %	50 %	25 %	25 %	171463832
19092	NC_010531	ACC	2	6	1018534	1018539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171463832
19093	NC_010531	ATAA	2	8	1018728	1018735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19094	NC_010531	TTC	2	6	1018821	1018826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19095	NC_010531	TGA	2	6	1018966	1018971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_010531	ATC	2	6	1018987	1018992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19097	NC_010531	TGG	2	6	1019072	1019077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_010531	GGC	2	6	1019088	1019093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19099	NC_010531	AGAA	2	8	1019117	1019124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_010531	AAG	2	6	1019251	1019256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_010531	AAT	2	6	1019271	1019276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_010531	AG	3	6	1019289	1019294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_010531	TGG	2	6	1019306	1019311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_010531	GGGT	2	8	1019343	1019350	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_010531	GT	3	6	1019359	1019364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19106	NC_010531	TCT	2	6	1019457	1019462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19107	NC_010531	ATT	2	6	1019483	1019488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_010531	GCA	2	6	1019526	1019531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19109	NC_010531	TAAT	2	8	1019559	1019566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_010531	ACC	2	6	1019618	1019623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19111	NC_010531	GTA	2	6	1019645	1019650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_010531	ATT	2	6	1019651	1019656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19113	NC_010531	CAG	2	6	1019674	1019679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19114	NC_010531	CTA	2	6	1019879	1019884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19115	NC_010531	ACC	2	6	1019889	1019894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19116	NC_010531	TTCC	2	8	1019913	1019920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19117	NC_010531	TTA	2	6	1019983	1019988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_010531	GCT	2	6	1020076	1020081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19119	NC_010531	TAGG	2	8	1020088	1020095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19120	NC_010531	TGCTGG	2	12	1020102	1020113	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19121	NC_010531	TTA	2	6	1020421	1020426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19122	NC_010531	GCA	2	6	1020485	1020490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19123	NC_010531	ATC	2	6	1020522	1020527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19124	NC_010531	AT	3	6	1020540	1020545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19125	NC_010531	AATA	2	8	1020587	1020594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19126	NC_010531	GCC	2	6	1020611	1020616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19127	NC_010531	CTG	2	6	1020672	1020677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19128	NC_010531	TCA	2	6	1020698	1020703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19129	NC_010531	TCAATC	2	12	1020734	1020745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19130	NC_010531	CAA	2	6	1020772	1020777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19131	NC_010531	AT	3	6	1020797	1020802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19132	NC_010531	AG	3	6	1020819	1020824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19133	NC_010531	CTT	2	6	1020948	1020953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19134	NC_010531	T	6	6	1021012	1021017	0 %	100 %	0 %	0 %	171463833
19135	NC_010531	GCA	2	6	1021074	1021079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171463833
19136	NC_010531	TCT	2	6	1021278	1021283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171463833
19137	NC_010531	A	8	8	1021351	1021358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19138	NC_010531	GAA	2	6	1021369	1021374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19139	NC_010531	CA	3	6	1021407	1021412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19140	NC_010531	GAT	2	6	1021430	1021435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19141	NC_010531	TAAT	2	8	1021468	1021475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19142	NC_010531	GCA	2	6	1021498	1021503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171463834
19143	NC_010531	AGG	2	6	1021506	1021511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171463834
19144	NC_010531	TGAT	2	8	1021539	1021546	25 %	50 %	25 %	0 %	171463834
19145	NC_010531	GCA	2	6	1021559	1021564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171463834
19146	NC_010531	GCG	2	6	1021577	1021582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171463834
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19149	NC_010531	TGG	2	6	1021850	1021855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171463834
19150	NC_010531	TGAC	2	8	1021930	1021937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19151	NC_010531	CGG	2	6	1021990	1021995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19152	NC_010531	GAA	2	6	1022012	1022017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19153	NC_010531	CAAT	2	8	1022145	1022152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19154	NC_010531	ATT	2	6	1022246	1022251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19155	NC_010531	CTTG	2	8	1022281	1022288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19156	NC_010531	TGC	2	6	1022314	1022319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19157	NC_010531	CGC	2	6	1022393	1022398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19158	NC_010531	TTG	2	6	1022474	1022479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19159	NC_010531	GAT	2	6	1022528	1022533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19161	NC_010531	GT	3	6	1022604	1022609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19162	NC_010531	TTA	2	6	1022610	1022615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19163	NC_010531	CAA	2	6	1022627	1022632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19165	NC_010531	TTG	2	6	1022697	1022702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19166	NC_010531	GTT	2	6	1022723	1022728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19167	NC_010531	CAA	2	6	1022731	1022736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19170	NC_010531	GAG	2	6	1022849	1022854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19171	NC_010531	CAA	2	6	1022909	1022914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19172	NC_010531	GCCA	2	8	1023014	1023021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19173	NC_010531	TTGAT	2	10	1023066	1023075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19174	NC_010531	AGT	2	6	1023242	1023247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19178	NC_010531	GCT	2	6	1023366	1023371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19179	NC_010531	CCT	2	6	1023413	1023418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19181	NC_010531	TGT	2	6	1023599	1023604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19183	NC_010531	TCT	2	6	1023685	1023690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19232	NC_010531	GCT	2	6	1026014	1026019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19235	NC_010531	TGT	2	6	1026226	1026231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19238	NC_010531	AAG	2	6	1026372	1026377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19239	NC_010531	TTGG	2	8	1026380	1026387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19240	NC_010531	CTA	2	6	1026390	1026395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19241	NC_010531	AAGCA	2	10	1026396	1026405	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19242	NC_010531	TGC	2	6	1026460	1026465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19243	NC_010531	GAA	2	6	1026500	1026505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19244	NC_010531	CAA	2	6	1026571	1026576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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