MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP06

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008762	GTG	2	6	136	141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008762	TCT	2	6	334	339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008762	TGC	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008762	GCG	2	6	697	702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008762	CAG	2	6	721	726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008762	GGC	2	6	748	753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008762	TGG	2	6	779	784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008762	GGC	2	6	942	947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008762	GGC	2	6	1080	1085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583545
10	NC_008762	CAG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583545
11	NC_008762	TGG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583545
12	NC_008762	ATG	2	6	1431	1436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583545
13	NC_008762	GTC	2	6	1461	1466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583545
14	NC_008762	CCG	2	6	1496	1501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583545
15	NC_008762	AGC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583545
16	NC_008762	AGC	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583545
17	NC_008762	TGC	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583545
18	NC_008762	GCG	2	6	1788	1793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583545
19	NC_008762	GTT	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583546
20	NC_008762	CGT	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583546
21	NC_008762	ACC	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583546
22	NC_008762	GTG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583546
23	NC_008762	TGG	3	9	2094	2102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583546
24	NC_008762	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583546
25	NC_008762	GCA	2	6	2286	2291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583546
26	NC_008762	TCA	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583546
27	NC_008762	CTG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583546
28	NC_008762	CCA	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583546
29	NC_008762	GTC	2	6	2947	2952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583546
30	NC_008762	TCA	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583547
31	NC_008762	GAC	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583547
32	NC_008762	GAA	2	6	3523	3528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583547
33	NC_008762	GCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008762	ATG	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008762	CGA	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008762	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008762	CAT	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008762	GTC	3	9	3991	3999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583548
39	NC_008762	GTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583548
40	NC_008762	GGC	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583548
41	NC_008762	TGT	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583549
42	NC_008762	GCA	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583549
43	NC_008762	CCA	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583549
44	NC_008762	CCA	2	6	4848	4853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583549
45	NC_008762	GCG	2	6	5054	5059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008762	CGG	2	6	5061	5066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008762	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583550
48	NC_008762	TTG	2	6	5303	5308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583550
49	NC_008762	AAC	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583551
50	NC_008762	AGC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583551
51	NC_008762	CTT	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583551
52	NC_008762	GCC	2	6	5626	5631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583551
53	NC_008762	ATG	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583551
54	NC_008762	GAT	3	9	5727	5735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583551
55	NC_008762	TGG	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583551
56	NC_008762	ACA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583551
57	NC_008762	ACC	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008762	CAC	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583552
59	NC_008762	GGC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
60	NC_008762	CCT	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583552
61	NC_008762	CAG	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583552
62	NC_008762	GTC	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
63	NC_008762	CGG	2	6	6419	6424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
64	NC_008762	CGG	2	6	6446	6451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
65	NC_008762	TGC	2	6	6454	6459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
66	NC_008762	TTG	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583552
67	NC_008762	GCG	3	9	6568	6576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
68	NC_008762	TCA	2	6	6602	6607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583552
69	NC_008762	CGG	2	6	6647	6652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
70	NC_008762	GGC	2	6	6699	6704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
71	NC_008762	GTC	2	6	6730	6735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
72	NC_008762	TGC	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
73	NC_008762	CGG	3	9	6755	6763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
74	NC_008762	ATC	2	6	6789	6794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583552
75	NC_008762	GGC	5	15	6795	6809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
76	NC_008762	TTC	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583552
77	NC_008762	GGT	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583552
78	NC_008762	CGG	3	9	7031	7039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
79	NC_008762	ATG	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583552
80	NC_008762	TAT	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008762	TAA	3	9	7100	7108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008762	CTG	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
83	NC_008762	GCT	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
84	NC_008762	GCT	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
85	NC_008762	GGT	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
86	NC_008762	CGG	2	6	7382	7387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
87	NC_008762	GCG	4	12	7600	7611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
88	NC_008762	TGC	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
89	NC_008762	GTT	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583553
90	NC_008762	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
91	NC_008762	CTG	3	9	8007	8015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
92	NC_008762	GCA	2	6	8167	8172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583553
93	NC_008762	CGG	2	6	8465	8470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
94	NC_008762	TGT	2	6	8717	8722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583553
95	NC_008762	GTC	2	6	8756	8761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
96	NC_008762	TGG	2	6	8908	8913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
97	NC_008762	GGT	2	6	8938	8943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
98	NC_008762	GCT	2	6	9070	9075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
99	NC_008762	CTG	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
100	NC_008762	GCG	2	6	9127	9132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
101	NC_008762	CTG	2	6	9233	9238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
102	NC_008762	GAT	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583553
103	NC_008762	TGG	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
104	NC_008762	GCA	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583553
105	NC_008762	TTG	2	6	9373	9378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583553
106	NC_008762	GTC	2	6	9447	9452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
107	NC_008762	TGG	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
108	NC_008762	CAA	2	6	9497	9502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583553
109	NC_008762	GTG	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
110	NC_008762	CAA	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008762	TTG	2	6	9894	9899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583554
112	NC_008762	GCC	2	6	9905	9910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583554
113	NC_008762	ATC	2	6	9930	9935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583554
114	NC_008762	TCT	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583554
115	NC_008762	TTC	2	6	10040	10045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583554
116	NC_008762	TCA	2	6	10083	10088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583554
117	NC_008762	GTT	2	6	10132	10137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008762	GCC	2	6	10202	10207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008762	ATG	2	6	10310	10315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008762	ACA	2	6	10344	10349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008762	CAA	2	6	10363	10368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008762	GCA	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583555
123	NC_008762	GAT	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583555
124	NC_008762	ACA	2	6	10509	10514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583555
125	NC_008762	GCA	2	6	10535	10540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583555
126	NC_008762	GCA	2	6	10605	10610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583555
127	NC_008762	AGT	2	6	10695	10700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583555
128	NC_008762	CAC	2	6	10782	10787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583555
129	NC_008762	TTG	2	6	10882	10887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583556
130	NC_008762	GTT	3	9	11082	11090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583556
131	NC_008762	GCA	2	6	11131	11136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583556
132	NC_008762	GTT	2	6	11358	11363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583556
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253	NC_008762	ATT	2	6	20963	20968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_008762	CGT	2	6	21025	21030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_008762	ACG	2	6	21068	21073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.