MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Pseudomonas fluorescens Pf0-1 chromosome

Total Repeats: 14979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007492	AAGC	2	8	67	74	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007492	CCAA	2	8	89	96	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007492	CTGT	2	8	220	227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007492	GTCG	2	8	430	437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007492	CTGC	2	8	613	620	0 %	25 %	25 %	50 %	77456229
6	NC_007492	GAAA	2	8	1500	1507	75 %	0 %	25 %	0 %	77456229
7	NC_007492	ACCA	2	8	1936	1943	50 %	0 %	0 %	50 %	77456229
8	NC_007492	GGTC	2	8	2286	2293	0 %	25 %	50 %	25 %	77456230
9	NC_007492	GCCG	2	8	2428	2435	0 %	0 %	50 %	50 %	77456230
10	NC_007492	CGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	25 %	25 %	77456231
11	NC_007492	TACG	2	8	4369	4376	25 %	25 %	25 %	25 %	77456232
12	NC_007492	TCGA	2	8	4499	4506	25 %	25 %	25 %	25 %	77456232
13	NC_007492	TGCG	2	8	5022	5029	0 %	25 %	50 %	25 %	77456232
14	NC_007492	CGAA	2	8	5451	5458	50 %	0 %	25 %	25 %	77456232
15	NC_007492	GCAA	2	8	5976	5983	50 %	0 %	25 %	25 %	77456232
16	NC_007492	GCCG	2	8	6193	6200	0 %	0 %	50 %	50 %	77456232
17	NC_007492	CTGG	2	8	6241	6248	0 %	25 %	50 %	25 %	77456232
18	NC_007492	GATA	2	8	6936	6943	50 %	25 %	25 %	0 %	77456233
19	NC_007492	TCGT	2	8	6991	6998	0 %	50 %	25 %	25 %	77456233
20	NC_007492	CCAG	2	8	7750	7757	25 %	0 %	25 %	50 %	77456234
21	NC_007492	TGCG	2	8	7907	7914	0 %	25 %	50 %	25 %	77456234
22	NC_007492	CGCC	2	8	8424	8431	0 %	0 %	25 %	75 %	77456234
23	NC_007492	TGGC	2	8	8531	8538	0 %	25 %	50 %	25 %	77456234
24	NC_007492	CCGG	2	8	8973	8980	0 %	0 %	50 %	50 %	77456234
25	NC_007492	TGAT	2	8	9034	9041	25 %	50 %	25 %	0 %	77456234
26	NC_007492	AAAT	2	8	9344	9351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007492	CACG	2	8	9964	9971	25 %	0 %	25 %	50 %	77456235
28	NC_007492	TGGT	2	8	10656	10663	0 %	50 %	50 %	0 %	77456236
29	NC_007492	TCGA	2	8	10710	10717	25 %	25 %	25 %	25 %	77456236
30	NC_007492	TCGG	2	8	11092	11099	0 %	25 %	50 %	25 %	77456237
31	NC_007492	AGGT	2	8	11251	11258	25 %	25 %	50 %	0 %	77456237
32	NC_007492	CGCA	2	8	11289	11296	25 %	0 %	25 %	50 %	77456237
33	NC_007492	TGGC	2	8	11555	11562	0 %	25 %	50 %	25 %	77456237
34	NC_007492	TGCG	2	8	11756	11763	0 %	25 %	50 %	25 %	77456237
35	NC_007492	AAGT	2	8	13377	13384	50 %	25 %	25 %	0 %	77456238
36	NC_007492	GGCT	2	8	13815	13822	0 %	25 %	50 %	25 %	77456238
37	NC_007492	TGGC	2	8	14210	14217	0 %	25 %	50 %	25 %	77456239
38	NC_007492	ATCA	2	8	14270	14277	50 %	25 %	0 %	25 %	77456239
39	NC_007492	CAGT	2	8	14900	14907	25 %	25 %	25 %	25 %	77456240
40	NC_007492	AAGG	2	8	15009	15016	50 %	0 %	50 %	0 %	77456240
41	NC_007492	TCGG	2	8	16573	16580	0 %	25 %	50 %	25 %	77456242
42	NC_007492	GACC	2	8	16651	16658	25 %	0 %	25 %	50 %	77456242
43	NC_007492	GGCA	2	8	16906	16913	25 %	0 %	50 %	25 %	77456242
44	NC_007492	CAGC	2	8	17107	17114	25 %	0 %	25 %	50 %	77456242
45	NC_007492	GCCC	2	8	17231	17238	0 %	0 %	25 %	75 %	77456243
46	NC_007492	TCGG	2	8	17353	17360	0 %	25 %	50 %	25 %	77456243
47	NC_007492	TCAG	2	8	17917	17924	25 %	25 %	25 %	25 %	77456243
48	NC_007492	CAGC	2	8	18051	18058	25 %	0 %	25 %	50 %	77456243
49	NC_007492	GACC	2	8	18248	18255	25 %	0 %	25 %	50 %	77456243
50	NC_007492	CCGG	2	8	19320	19327	0 %	0 %	50 %	50 %	77456244
51	NC_007492	GCGG	2	8	19692	19699	0 %	0 %	75 %	25 %	77456245
52	NC_007492	GAGC	2	8	20117	20124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007492	CGGC	2	8	20214	20221	0 %	0 %	50 %	50 %	77456246
54	NC_007492	AAGG	2	8	20246	20253	50 %	0 %	50 %	0 %	77456246
55	NC_007492	CGTG	2	8	21049	21056	0 %	25 %	50 %	25 %	77456246
56	NC_007492	CGCT	2	8	21164	21171	0 %	25 %	25 %	50 %	77456246
57	NC_007492	GCCA	2	8	21501	21508	25 %	0 %	25 %	50 %	77456247
58	NC_007492	CCCG	2	8	21679	21686	0 %	0 %	25 %	75 %	77456247
59	NC_007492	GATG	2	8	22328	22335	25 %	25 %	50 %	0 %	77456247
60	NC_007492	CTGG	2	8	22703	22710	0 %	25 %	50 %	25 %	77456248
61	NC_007492	GCTG	2	8	23119	23126	0 %	25 %	50 %	25 %	77456249
62	NC_007492	GGCA	2	8	23539	23546	25 %	0 %	50 %	25 %	77456249
63	NC_007492	CCGG	2	8	24278	24285	0 %	0 %	50 %	50 %	77456250
64	NC_007492	GAAG	2	8	24508	24515	50 %	0 %	50 %	0 %	77456250
65	NC_007492	CGGG	2	8	24933	24940	0 %	0 %	75 %	25 %	77456250
66	NC_007492	CCGC	2	8	25308	25315	0 %	0 %	25 %	75 %	77456251
67	NC_007492	ACCG	2	8	25741	25748	25 %	0 %	25 %	50 %	77456251
68	NC_007492	ATGG	2	8	25790	25797	25 %	25 %	50 %	0 %	77456251
69	NC_007492	TGGC	2	8	26139	26146	0 %	25 %	50 %	25 %	77456252
70	NC_007492	CCAC	2	8	26464	26471	25 %	0 %	0 %	75 %	77456252
71	NC_007492	AAGG	2	8	27143	27150	50 %	0 %	50 %	0 %	77456252
72	NC_007492	CAGG	2	8	27275	27282	25 %	0 %	50 %	25 %	77456252
73	NC_007492	CCCG	2	8	27403	27410	0 %	0 %	25 %	75 %	77456252
74	NC_007492	CATC	2	8	29195	29202	25 %	25 %	0 %	50 %	77456254
75	NC_007492	TGGT	2	8	29560	29567	0 %	50 %	50 %	0 %	77456254
76	NC_007492	GCAC	2	8	29570	29577	25 %	0 %	25 %	50 %	77456254
77	NC_007492	TATG	2	8	30146	30153	25 %	50 %	25 %	0 %	77456255
78	NC_007492	CAGC	2	8	30263	30270	25 %	0 %	25 %	50 %	77456255
79	NC_007492	GATC	2	8	30349	30356	25 %	25 %	25 %	25 %	77456255
80	NC_007492	AGCG	2	8	30540	30547	25 %	0 %	50 %	25 %	77456255
81	NC_007492	TGGC	2	8	30881	30888	0 %	25 %	50 %	25 %	77456255
82	NC_007492	CTCA	2	8	30909	30916	25 %	25 %	0 %	50 %	77456255
83	NC_007492	GCCG	2	8	30928	30935	0 %	0 %	50 %	50 %	77456255
84	NC_007492	CTGA	2	8	31234	31241	25 %	25 %	25 %	25 %	77456256
85	NC_007492	GCAG	2	8	31530	31537	25 %	0 %	50 %	25 %	77456256
86	NC_007492	GCAG	2	8	31923	31930	25 %	0 %	50 %	25 %	77456257
87	NC_007492	TGGC	2	8	32044	32051	0 %	25 %	50 %	25 %	77456257
88	NC_007492	TCTG	2	8	32157	32164	0 %	50 %	25 %	25 %	77456257
89	NC_007492	CCCG	2	8	32849	32856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_007492	TCGG	2	8	33190	33197	0 %	25 %	50 %	25 %	77456259
91	NC_007492	GCCA	2	8	33976	33983	25 %	0 %	25 %	50 %	77456259
92	NC_007492	TACA	2	8	35166	35173	50 %	25 %	0 %	25 %	77456261
93	NC_007492	AAAC	2	8	36598	36605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007492	GCAC	2	8	36898	36905	25 %	0 %	25 %	50 %	77456262
95	NC_007492	TCGT	2	8	36907	36914	0 %	50 %	25 %	25 %	77456262
96	NC_007492	GCTG	2	8	36979	36986	0 %	25 %	50 %	25 %	77456262
97	NC_007492	TTTC	2	8	37199	37206	0 %	75 %	0 %	25 %	77456262
98	NC_007492	CGGC	2	8	37550	37557	0 %	0 %	50 %	50 %	77456262
99	NC_007492	GGCC	2	8	38183	38190	0 %	0 %	50 %	50 %	77456262
100	NC_007492	GTCA	2	8	38523	38530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007492	CCGT	2	8	39318	39325	0 %	25 %	25 %	50 %	77456263
102	NC_007492	CTGG	2	8	39402	39409	0 %	25 %	50 %	25 %	77456263
103	NC_007492	GGCC	2	8	39630	39637	0 %	0 %	50 %	50 %	77456263
104	NC_007492	GGCG	2	8	39915	39922	0 %	0 %	75 %	25 %	77456263
105	NC_007492	TGGC	2	8	40466	40473	0 %	25 %	50 %	25 %	77456264
106	NC_007492	AAGG	2	8	40949	40956	50 %	0 %	50 %	0 %	77456264
107	NC_007492	GGAC	2	8	41032	41039	25 %	0 %	50 %	25 %	77456264
108	NC_007492	CGAT	2	8	41305	41312	25 %	25 %	25 %	25 %	77456265
109	NC_007492	TCGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	25 %	50 %	77456265
110	NC_007492	GGCC	2	8	41840	41847	0 %	0 %	50 %	50 %	77456265
111	NC_007492	TCGG	2	8	42201	42208	0 %	25 %	50 %	25 %	77456265
112	NC_007492	ACCG	2	8	42947	42954	25 %	0 %	25 %	50 %	77456266
113	NC_007492	TGGC	2	8	43182	43189	0 %	25 %	50 %	25 %	77456267
114	NC_007492	CTGG	2	8	43359	43366	0 %	25 %	50 %	25 %	77456267
115	NC_007492	CCTT	2	8	45087	45094	0 %	50 %	0 %	50 %	77456269
116	NC_007492	GCCA	2	8	45675	45682	25 %	0 %	25 %	50 %	77456269
117	NC_007492	CGAC	2	8	45763	45770	25 %	0 %	25 %	50 %	77456269
118	NC_007492	GCGG	2	8	45991	45998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007492	CCGG	2	8	46020	46027	0 %	0 %	50 %	50 %	77456270
120	NC_007492	GCTG	2	8	46318	46325	0 %	25 %	50 %	25 %	77456270
121	NC_007492	GGCA	2	8	47589	47596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007492	GGTT	2	8	47627	47634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007492	TACG	2	8	47679	47686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007492	CGCA	2	8	47761	47768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007492	TCTT	2	8	48046	48053	0 %	75 %	0 %	25 %	77456271
126	NC_007492	CGGC	2	8	48137	48144	0 %	0 %	50 %	50 %	77456271
127	NC_007492	GAGC	2	8	50079	50086	25 %	0 %	50 %	25 %	77456274
128	NC_007492	TCGG	2	8	50135	50142	0 %	25 %	50 %	25 %	77456274
129	NC_007492	TTCA	2	8	50224	50231	25 %	50 %	0 %	25 %	77456274
130	NC_007492	TCAG	2	8	51114	51121	25 %	25 %	25 %	25 %	77456275
131	NC_007492	TTGC	2	8	51557	51564	0 %	50 %	25 %	25 %	77456275
132	NC_007492	GTCA	2	8	51845	51852	25 %	25 %	25 %	25 %	77456275
133	NC_007492	TGCG	2	8	51942	51949	0 %	25 %	50 %	25 %	77456275
134	NC_007492	CAGC	2	8	52675	52682	25 %	0 %	25 %	50 %	77456276
135	NC_007492	CCGG	2	8	53247	53254	0 %	0 %	50 %	50 %	77456276
136	NC_007492	CGTG	2	8	53476	53483	0 %	25 %	50 %	25 %	77456276
137	NC_007492	GGTG	2	8	53590	53597	0 %	25 %	75 %	0 %	77456276
138	NC_007492	CGGG	2	8	54261	54268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007492	CGGT	2	8	54705	54712	0 %	25 %	50 %	25 %	77456277
140	NC_007492	GATC	2	8	55628	55635	25 %	25 %	25 %	25 %	77456278
141	NC_007492	CTTG	2	8	55814	55821	0 %	50 %	25 %	25 %	77456278
142	NC_007492	CTGT	2	8	56014	56021	0 %	50 %	25 %	25 %	77456278
143	NC_007492	GCGG	2	8	56117	56124	0 %	0 %	75 %	25 %	77456278
144	NC_007492	CAGT	2	8	56942	56949	25 %	25 %	25 %	25 %	77456278
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