MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A large plasmid

Total Repeats: 2336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007274	GC	3	6	54142	54147	0 %	0 %	50 %	50 %	71725218
1002	NC_007274	CAA	2	6	54301	54306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725218
1003	NC_007274	CAA	2	6	54415	54420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725218
1004	NC_007274	AAG	2	6	54425	54430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725218
1005	NC_007274	CAGCG	2	10	54511	54520	20 %	0 %	40 %	40 %	71725218
1006	NC_007274	TGCA	2	8	54530	54537	25 %	25 %	25 %	25 %	71725218
1007	NC_007274	CAC	2	6	54634	54639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725218
1008	NC_007274	TGC	2	6	54699	54704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725218
1009	NC_007274	AGC	2	6	54885	54890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725218
1010	NC_007274	ACT	2	6	54932	54937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725218
1011	NC_007274	GGAA	2	8	54987	54994	50 %	0 %	50 %	0 %	71725218
1012	NC_007274	CAA	2	6	55074	55079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725218
1013	NC_007274	CGG	2	6	55121	55126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725218
1014	NC_007274	GT	3	6	55147	55152	0 %	50 %	50 %	0 %	71725218
1015	NC_007274	AAG	2	6	55165	55170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725218
1016	NC_007274	GAA	2	6	55198	55203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725252
1017	NC_007274	GCT	2	6	55231	55236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725252
1018	NC_007274	CAGC	2	8	55286	55293	25 %	0 %	25 %	50 %	71725252
1019	NC_007274	TGA	2	6	55335	55340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725252
1020	NC_007274	TGG	2	6	55557	55562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725252
1021	NC_007274	AGC	2	6	55582	55587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725252
1022	NC_007274	AAT	2	6	55626	55631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71725252
1023	NC_007274	A	6	6	55698	55703	100 %	0 %	0 %	0 %	71725216
1024	NC_007274	AGC	2	6	55725	55730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725216
1025	NC_007274	GGC	2	6	55798	55803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725216
1026	NC_007274	CAA	2	6	55809	55814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725216
1027	NC_007274	TTA	2	6	55859	55864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71725216
1028	NC_007274	GAC	3	9	55897	55905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725216
1029	NC_007274	GAT	2	6	56050	56055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725216
1030	NC_007274	CAA	2	6	56163	56168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725216
1031	NC_007274	AGC	2	6	56176	56181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725216
1032	NC_007274	TAG	2	6	56263	56268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725216
1033	NC_007274	CAG	2	6	56283	56288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_007274	CTA	2	6	56333	56338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_007274	A	7	7	56386	56392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_007274	CAG	2	6	56394	56399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_007274	TG	4	8	56472	56479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_007274	TAT	2	6	56482	56487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_007274	GGA	2	6	56526	56531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_007274	AGC	2	6	56557	56562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_007274	CAAT	2	8	56640	56647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_007274	TGA	2	6	56678	56683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007274	AC	3	6	56709	56714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_007274	TTCTG	2	10	56726	56735	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_007274	ATT	2	6	56746	56751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_007274	GCTTCG	2	12	56814	56825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725150
1047	NC_007274	TGC	2	6	56885	56890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725150
1048	NC_007274	GC	3	6	57088	57093	0 %	0 %	50 %	50 %	71725150
1049	NC_007274	AGG	2	6	57202	57207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71725150
1050	NC_007274	GT	3	6	57228	57233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_007274	AAAT	2	8	57329	57336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_007274	CTCG	2	8	57393	57400	0 %	25 %	25 %	50 %	71725145
1053	NC_007274	GCC	2	6	57404	57409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725145
1054	NC_007274	CCAG	2	8	57456	57463	25 %	0 %	25 %	50 %	71725145
1055	NC_007274	TTC	2	6	57482	57487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725145
1056	NC_007274	AGC	2	6	57561	57566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725145
1057	NC_007274	TAA	2	6	57598	57603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71725145
1058	NC_007274	CCG	2	6	57628	57633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725145
1059	NC_007274	AGC	2	6	57645	57650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725145
1060	NC_007274	GAG	2	6	57720	57725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71725145
1061	NC_007274	CCG	2	6	57847	57852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725145
1062	NC_007274	GAA	2	6	57917	57922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725145
1063	NC_007274	CAG	2	6	57939	57944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725145
1064	NC_007274	ACG	2	6	57999	58004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725145
1065	NC_007274	A	6	6	58010	58015	100 %	0 %	0 %	0 %	71725145
1066	NC_007274	CTG	3	9	58058	58066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725145
1067	NC_007274	TGC	2	6	58081	58086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725145
1068	NC_007274	CGG	2	6	58107	58112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725145
1069	NC_007274	ATG	2	6	58113	58118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725145
1070	NC_007274	TTG	2	6	58164	58169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725145
1071	NC_007274	AGA	2	6	58253	58258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725145
1072	NC_007274	GA	3	6	58370	58375	50 %	0 %	50 %	0 %	71725145
1073	NC_007274	CAT	2	6	58394	58399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725145
1074	NC_007274	TTGG	2	8	58432	58439	0 %	50 %	50 %	0 %	71725145
1075	NC_007274	CG	3	6	58456	58461	0 %	0 %	50 %	50 %	71725145
1076	NC_007274	CCT	2	6	58490	58495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_007274	AATT	2	8	58700	58707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_007274	GAC	2	6	58766	58771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725209
1079	NC_007274	AGA	2	6	58808	58813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725209
1080	NC_007274	AAG	2	6	58831	58836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725209
1081	NC_007274	ACT	2	6	58864	58869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725209
1082	NC_007274	GTC	2	6	58962	58967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725209
1083	NC_007274	TCG	2	6	59071	59076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725209
1084	NC_007274	GGT	2	6	59117	59122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725209
1085	NC_007274	GAC	2	6	59175	59180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725209
1086	NC_007274	TA	3	6	59239	59244	50 %	50 %	0 %	0 %	71725209
1087	NC_007274	GCG	2	6	59296	59301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725209
1088	NC_007274	GTGTCA	2	12	59335	59346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71725209
1089	NC_007274	GGC	2	6	59378	59383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725209
1090	NC_007274	CTGT	2	8	59421	59428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_007274	GATG	2	8	59472	59479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_007274	ATG	2	6	59499	59504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_007274	CGC	2	6	59660	59665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725153
1094	NC_007274	ATG	2	6	59698	59703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725153
1095	NC_007274	GATC	2	8	59729	59736	25 %	25 %	25 %	25 %	71725153
1096	NC_007274	TGC	2	6	59766	59771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725222
1097	NC_007274	GGT	2	6	59773	59778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725222
1098	NC_007274	GAT	2	6	59798	59803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725222
1099	NC_007274	AGCGC	2	10	59843	59852	20 %	0 %	40 %	40 %	71725222
1100	NC_007274	CCT	2	6	59866	59871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71725222
1101	NC_007274	AGG	2	6	59874	59879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71725222
1102	NC_007274	TGG	2	6	59946	59951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725222
1103	NC_007274	TGG	2	6	60048	60053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_007274	GCT	2	6	60075	60080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_007274	CAC	2	6	60216	60221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725229
1106	NC_007274	TTG	2	6	60319	60324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725229
1107	NC_007274	TGGGT	2	10	60383	60392	0 %	40 %	60 %	0 %	71725229
1108	NC_007274	TGA	2	6	60419	60424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725229
1109	NC_007274	GTC	2	6	60466	60471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725229
1110	NC_007274	CCG	2	6	60550	60555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725229
1111	NC_007274	GCAT	2	8	60602	60609	25 %	25 %	25 %	25 %	71725229
1112	NC_007274	CTG	2	6	60701	60706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725229
1113	NC_007274	CGC	2	6	60734	60739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725229
1114	NC_007274	TAG	2	6	60775	60780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725229
1115	NC_007274	GGC	2	6	60821	60826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725229
1116	NC_007274	CAG	2	6	60876	60881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725229
1117	NC_007274	TG	3	6	60887	60892	0 %	50 %	50 %	0 %	71725229
1118	NC_007274	TTC	2	6	60919	60924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725229
1119	NC_007274	GTCA	2	8	61062	61069	25 %	25 %	25 %	25 %	71725229
1120	NC_007274	C	6	6	61125	61130	0 %	0 %	0 %	100 %	71725229
1121	NC_007274	TCT	2	6	61178	61183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725229
1122	NC_007274	CCA	2	6	61197	61202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725229
1123	NC_007274	CGC	2	6	61244	61249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725229
1124	NC_007274	ATCA	2	8	61254	61261	50 %	25 %	0 %	25 %	71725229
1125	NC_007274	CGC	2	6	61277	61282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725229
1126	NC_007274	T	6	6	61294	61299	0 %	100 %	0 %	0 %	71725229
1127	NC_007274	TCG	2	6	61411	61416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725229
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1129	NC_007274	ACT	2	6	61675	61680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725229
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