MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 86121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007005	GCA	2	6	18	23	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043272
2	NC_007005	CGA	2	6	105	110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043272
3	NC_007005	GTC	2	6	170	175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
4	NC_007005	TTA	2	6	226	231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66043272
5	NC_007005	TGC	2	6	261	266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
6	NC_007005	CAG	2	6	321	326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043272
7	NC_007005	GCT	2	6	352	357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
8	NC_007005	GCT	3	9	361	369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
9	NC_007005	CAA	2	6	457	462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043272
10	NC_007005	AAC	2	6	479	484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043272
11	NC_007005	TCG	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
12	NC_007005	GGC	2	6	646	651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043272
13	NC_007005	ACC	2	6	692	697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043272
14	NC_007005	GAA	3	9	702	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043272
15	NC_007005	GCT	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
16	NC_007005	CGA	2	6	834	839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043272
17	NC_007005	GCT	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
18	NC_007005	CAG	2	6	916	921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043272
19	NC_007005	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043272
20	NC_007005	TAC	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043272
21	NC_007005	CTG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
22	NC_007005	CGT	2	6	1324	1329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
23	NC_007005	TGG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043272
24	NC_007005	CTG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043272
25	NC_007005	TCA	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007005	CGT	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043273
27	NC_007005	CGC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043273
28	NC_007005	GTC	2	6	1680	1685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043273
29	NC_007005	CCG	2	6	1759	1764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043273
30	NC_007005	GAA	2	6	1932	1937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043273
31	NC_007005	CAG	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043273
32	NC_007005	TAC	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043273
33	NC_007005	TGC	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043273
34	NC_007005	CTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043273
35	NC_007005	CGA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043273
36	NC_007005	TGC	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043273
37	NC_007005	GGT	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043273
38	NC_007005	CAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043273
39	NC_007005	GAA	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043273
40	NC_007005	AGA	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043273
41	NC_007005	ACC	2	6	2571	2576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043273
42	NC_007005	AGC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043273
43	NC_007005	ACG	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043273
44	NC_007005	CTG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043274
45	NC_007005	GCA	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043274
46	NC_007005	CTG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043274
47	NC_007005	AGC	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043274
48	NC_007005	TCA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043274
49	NC_007005	AGC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043274
50	NC_007005	CGC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043274
51	NC_007005	GGC	2	6	3228	3233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043274
52	NC_007005	CGA	2	6	3270	3275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043274
53	NC_007005	CCG	2	6	3279	3284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043274
54	NC_007005	TTG	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043274
55	NC_007005	CTA	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043274
56	NC_007005	TGG	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043274
57	NC_007005	GAT	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043274
58	NC_007005	GAA	2	6	3667	3672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043274
59	NC_007005	CAC	2	6	3923	3928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043275
60	NC_007005	GGT	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043275
61	NC_007005	CGA	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043275
62	NC_007005	CAT	3	9	3994	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043275
63	NC_007005	AGA	2	6	4066	4071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043275
64	NC_007005	TCA	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043275
65	NC_007005	GGT	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043275
66	NC_007005	TCG	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043275
67	NC_007005	TCG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043275
68	NC_007005	GAA	2	6	4448	4453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043275
69	NC_007005	TGA	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043275
70	NC_007005	CTG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043275
71	NC_007005	CAA	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043275
72	NC_007005	TGG	2	6	4656	4661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043275
73	NC_007005	AAC	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043275
74	NC_007005	AAG	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043275
75	NC_007005	ACC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043275
76	NC_007005	GAT	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043275
77	NC_007005	CGT	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043275
78	NC_007005	TGG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043275
79	NC_007005	CTG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043275
80	NC_007005	GAT	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043275
81	NC_007005	ACA	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043275
82	NC_007005	CAT	4	12	5287	5298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043275
83	NC_007005	CTG	3	9	5336	5344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043275
84	NC_007005	CTT	3	9	5347	5355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043275
85	NC_007005	GCC	2	6	5404	5409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043275
86	NC_007005	GAC	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043275
87	NC_007005	GAA	2	6	5468	5473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043275
88	NC_007005	GCC	2	6	5647	5652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043275
89	NC_007005	AAC	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043275
90	NC_007005	CTT	2	6	5851	5856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043275
91	NC_007005	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043275
92	NC_007005	GCT	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043275
93	NC_007005	GAA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043275
94	NC_007005	AAG	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043275
95	NC_007005	ACC	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043275
96	NC_007005	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043275
97	NC_007005	CTC	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043276
98	NC_007005	CCA	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043276
99	NC_007005	TCT	2	6	6551	6556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043276
100	NC_007005	ATC	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043276
101	NC_007005	GCT	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043276
102	NC_007005	GCA	2	6	6668	6673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043276
103	NC_007005	CGT	2	6	6710	6715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043276
104	NC_007005	GGT	2	6	6828	6833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043276
105	NC_007005	CAC	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043276
106	NC_007005	GTT	2	6	6909	6914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043276
107	NC_007005	GCC	2	6	7332	7337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043277
108	NC_007005	CGC	2	6	7433	7438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043277
109	NC_007005	TCG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043277
110	NC_007005	GGT	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043277
111	NC_007005	GCT	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043277
112	NC_007005	GCA	2	6	7646	7651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043277
113	NC_007005	TGC	2	6	7670	7675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043277
114	NC_007005	CCA	2	6	7890	7895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043277
115	NC_007005	CGT	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043277
116	NC_007005	CAC	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043277
117	NC_007005	GGT	2	6	8155	8160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043277
118	NC_007005	AGC	2	6	8261	8266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043278
119	NC_007005	GCT	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043278
120	NC_007005	GCT	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043278
121	NC_007005	GCA	2	6	8514	8519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043278
122	NC_007005	CAG	2	6	8759	8764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043278
123	NC_007005	ATG	2	6	8808	8813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043278
124	NC_007005	TCG	2	6	8894	8899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043278
125	NC_007005	TTG	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043278
126	NC_007005	CAC	2	6	8953	8958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043278
127	NC_007005	CTG	2	6	9025	9030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043278
128	NC_007005	CGG	2	6	9135	9140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043278
129	NC_007005	GCC	2	6	9143	9148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043278
130	NC_007005	GAC	2	6	9293	9298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007005	GTG	2	6	9473	9478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043279
132	NC_007005	GAC	2	6	9632	9637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043279
133	NC_007005	TCG	2	6	9739	9744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043279
134	NC_007005	GTG	2	6	9785	9790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043279
135	NC_007005	GCA	2	6	9811	9816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043279
136	NC_007005	GCA	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043279
137	NC_007005	TTG	2	6	9971	9976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043279
138	NC_007005	CTG	2	6	10037	10042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043279
139	NC_007005	CAG	2	6	10135	10140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043279
140	NC_007005	CAG	2	6	10291	10296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043279
141	NC_007005	CAT	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007005	GCA	2	6	10622	10627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043280
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148	NC_007005	GCA	2	6	10938	10943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043280
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153	NC_007005	AGC	2	6	11231	11236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043280
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159	NC_007005	CCA	2	6	11675	11680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043281
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162	NC_007005	CAG	2	6	11922	11927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043282
163	NC_007005	ACA	2	6	11969	11974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043282
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256	NC_007005	GCG	2	6	18377	18382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043286
257	NC_007005	GAT	2	6	18426	18431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043286
258	NC_007005	GGC	2	6	18450	18455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043286
259	NC_007005	CAT	2	6	18468	18473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043286
260	NC_007005	GAT	2	6	18504	18509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043286
261	NC_007005	TCC	2	6	18535	18540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043286
262	NC_007005	CGT	2	6	18543	18548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043286
263	NC_007005	GGT	3	9	18588	18596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043286
264	NC_007005	GGC	2	6	18669	18674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043286
265	NC_007005	TTC	2	6	18738	18743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043286
266	NC_007005	GGC	2	6	18795	18800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043286
267	NC_007005	GAA	2	6	18888	18893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043286
268	NC_007005	CTT	2	6	18972	18977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043286
269	NC_007005	AGC	2	6	18992	18997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043286
270	NC_007005	GCC	2	6	19011	19016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043286
271	NC_007005	TTG	2	6	19081	19086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043286
272	NC_007005	CGA	2	6	19261	19266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_007005	CAG	2	6	19319	19324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_007005	CTT	2	6	19380	19385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043287
275	NC_007005	TCG	2	6	19456	19461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043287
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277	NC_007005	CGA	2	6	19553	19558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
278	NC_007005	CAG	2	6	19629	19634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
279	NC_007005	TCA	2	6	19724	19729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043287
280	NC_007005	CAG	2	6	19755	19760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
281	NC_007005	CGA	2	6	19761	19766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
282	NC_007005	ATG	2	6	19768	19773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043287
283	NC_007005	TCG	2	6	19783	19788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043287
284	NC_007005	CAG	3	9	19833	19841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
285	NC_007005	CGA	2	6	19851	19856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
286	NC_007005	GCA	2	6	19865	19870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
287	NC_007005	GAT	2	6	19926	19931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043287
288	NC_007005	GCC	3	9	19983	19991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043287
289	NC_007005	GGC	2	6	20064	20069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043287
290	NC_007005	GAA	2	6	20073	20078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043287
291	NC_007005	TCG	3	9	20083	20091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043287
292	NC_007005	CGC	2	6	20145	20150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043287
293	NC_007005	CCA	2	6	20204	20209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043287
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295	NC_007005	GAC	2	6	20319	20324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043287
296	NC_007005	CGC	2	6	20394	20399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043287
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347	NC_007005	ACG	2	6	23032	23037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
348	NC_007005	TGC	2	6	23056	23061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043290
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364	NC_007005	TTG	2	6	24752	24757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_007005	TCA	2	6	25648	25653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043292
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