MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007005	TGG	2	6	171979	171984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043427
3502	NC_007005	GCCG	2	8	171986	171993	0 %	0 %	50 %	50 %	66043427
3503	NC_007005	T	8	8	172104	172111	0 %	100 %	0 %	0 %	66043427
3504	NC_007005	GTCA	2	8	172112	172119	25 %	25 %	25 %	25 %	66043427
3505	NC_007005	CA	3	6	172187	172192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_007005	CGA	2	6	172193	172198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_007005	GGC	2	6	172219	172224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043428
3508	NC_007005	TGGC	2	8	172291	172298	0 %	25 %	50 %	25 %	66043428
3509	NC_007005	TGCCT	2	10	172328	172337	0 %	40 %	20 %	40 %	66043428
3510	NC_007005	CAT	2	6	172352	172357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043428
3511	NC_007005	AGA	2	6	172411	172416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043428
3512	NC_007005	CCA	2	6	172462	172467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043428
3513	NC_007005	GCCC	2	8	172468	172475	0 %	0 %	25 %	75 %	66043428
3514	NC_007005	CAG	2	6	172476	172481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3515	NC_007005	GCC	2	6	172527	172532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043428
3516	NC_007005	GCT	2	6	172562	172567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3517	NC_007005	GC	5	10	172583	172592	0 %	0 %	50 %	50 %	66043428
3518	NC_007005	CCG	2	6	172593	172598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043428
3519	NC_007005	CAG	2	6	172601	172606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3520	NC_007005	GC	3	6	172662	172667	0 %	0 %	50 %	50 %	66043428
3521	NC_007005	TGG	2	6	172668	172673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043428
3522	NC_007005	TGACGA	2	12	172714	172725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	66043428
3523	NC_007005	CCAGC	2	10	172757	172766	20 %	0 %	20 %	60 %	66043428
3524	NC_007005	CAG	2	6	172796	172801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3525	NC_007005	GGCC	2	8	172804	172811	0 %	0 %	50 %	50 %	66043428
3526	NC_007005	GCC	2	6	172844	172849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043428
3527	NC_007005	CTG	2	6	172909	172914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3528	NC_007005	GCA	2	6	172969	172974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3529	NC_007005	GC	3	6	173007	173012	0 %	0 %	50 %	50 %	66043428
3530	NC_007005	CAG	2	6	173027	173032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3531	NC_007005	CGG	2	6	173055	173060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043428
3532	NC_007005	GC	3	6	173075	173080	0 %	0 %	50 %	50 %	66043428
3533	NC_007005	GCC	2	6	173106	173111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043428
3534	NC_007005	AGCTTG	2	12	173112	173123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	66043428
3535	NC_007005	TCG	2	6	173157	173162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3536	NC_007005	ACG	2	6	173172	173177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3537	NC_007005	ACG	2	6	173245	173250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043428
3538	NC_007005	ACC	2	6	173331	173336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043428
3539	NC_007005	CGC	3	9	173366	173374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043428
3540	NC_007005	CCG	2	6	173580	173585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043429
3541	NC_007005	TGG	2	6	173598	173603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043429
3542	NC_007005	GCT	2	6	173612	173617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043429
3543	NC_007005	GCT	2	6	173626	173631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043429
3544	NC_007005	TCATG	2	10	173668	173677	20 %	40 %	20 %	20 %	66043429
3545	NC_007005	AGC	2	6	173765	173770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043429
3546	NC_007005	GC	3	6	173824	173829	0 %	0 %	50 %	50 %	66043429
3547	NC_007005	CGG	2	6	173917	173922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043429
3548	NC_007005	CGT	2	6	173956	173961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043429
3549	NC_007005	CTT	2	6	173974	173979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043429
3550	NC_007005	GC	3	6	174011	174016	0 %	0 %	50 %	50 %	66043429
3551	NC_007005	TCG	2	6	174036	174041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043429
3552	NC_007005	CG	3	6	174142	174147	0 %	0 %	50 %	50 %	66043429
3553	NC_007005	GAA	2	6	174211	174216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043429
3554	NC_007005	TG	3	6	174224	174229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_007005	GCA	2	6	174304	174309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_007005	ACA	2	6	174320	174325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_007005	CAG	2	6	174335	174340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_007005	GCT	2	6	174359	174364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_007005	ACC	2	6	174373	174378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_007005	GC	3	6	174389	174394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_007005	CAG	2	6	174396	174401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_007005	GCGCC	2	10	174507	174516	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3563	NC_007005	TGGC	2	8	174523	174530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_007005	TA	3	6	174547	174552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_007005	TGC	2	6	174588	174593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_007005	GCG	2	6	174635	174640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_007005	GC	3	6	174661	174666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_007005	CCGC	2	8	174680	174687	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3569	NC_007005	ACA	2	6	174700	174705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_007005	GCTC	2	8	174760	174767	0 %	25 %	25 %	50 %	66043430
3571	NC_007005	TGC	2	6	174876	174881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043430
3572	NC_007005	TCG	2	6	174900	174905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043430
3573	NC_007005	TCA	2	6	174946	174951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043430
3574	NC_007005	CCA	2	6	174963	174968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043430
3575	NC_007005	AGGGCA	2	12	174999	175010	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	66043430
3576	NC_007005	CGCGC	2	10	175048	175057	0 %	0 %	40 %	60 %	66043430
3577	NC_007005	CGG	2	6	175059	175064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043430
3578	NC_007005	CAG	2	6	175133	175138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043430
3579	NC_007005	ACCG	2	8	175156	175163	25 %	0 %	25 %	50 %	66043430
3580	NC_007005	ACC	2	6	175215	175220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043430
3581	NC_007005	AAC	2	6	175289	175294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043430
3582	NC_007005	CTG	2	6	175346	175351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043430
3583	NC_007005	CCAGG	2	10	175405	175414	20 %	0 %	40 %	40 %	66043430
3584	NC_007005	CTG	2	6	175430	175435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043430
3585	NC_007005	CGTA	2	8	175456	175463	25 %	25 %	25 %	25 %	66043430
3586	NC_007005	CGAC	2	8	175473	175480	25 %	0 %	25 %	50 %	66043430
3587	NC_007005	CTGG	2	8	175495	175502	0 %	25 %	50 %	25 %	66043430
3588	NC_007005	AGCC	2	8	175564	175571	25 %	0 %	25 %	50 %	66043430
3589	NC_007005	ATC	2	6	175880	175885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_007005	CCCGA	2	10	175905	175914	20 %	0 %	20 %	60 %	66043431
3591	NC_007005	CAC	2	6	175976	175981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043431
3592	NC_007005	CCG	2	6	176018	176023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043431
3593	NC_007005	CGGC	2	8	176053	176060	0 %	0 %	50 %	50 %	66043431
3594	NC_007005	CAC	2	6	176329	176334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043431
3595	NC_007005	GCA	2	6	176374	176379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043431
3596	NC_007005	TGA	2	6	176476	176481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043431
3597	NC_007005	TCG	2	6	176557	176562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043431
3598	NC_007005	GC	3	6	176569	176574	0 %	0 %	50 %	50 %	66043431
3599	NC_007005	ACGTGA	2	12	176622	176633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	66043431
3600	NC_007005	ATC	2	6	176735	176740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_007005	TTTC	2	8	176780	176787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_007005	TCT	2	6	176837	176842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_007005	TCC	2	6	176886	176891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_007005	GGC	2	6	176992	176997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_007005	CTG	2	6	177001	177006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_007005	TAAT	2	8	177041	177048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_007005	TGT	2	6	177125	177130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043432
3608	NC_007005	ACC	2	6	177143	177148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043432
3609	NC_007005	GGT	2	6	177438	177443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043432
3610	NC_007005	CT	3	6	177477	177482	0 %	50 %	0 %	50 %	66043432
3611	NC_007005	CATG	2	8	177486	177493	25 %	25 %	25 %	25 %	66043432
3612	NC_007005	CTG	2	6	177496	177501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043432
3613	NC_007005	AAT	2	6	177514	177519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66043432
3614	NC_007005	CG	4	8	177546	177553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_007005	GGA	2	6	177563	177568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_007005	ATAG	2	8	177598	177605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_007005	GCA	2	6	177644	177649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043433
3618	NC_007005	CAG	2	6	177681	177686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043433
3619	NC_007005	CCCTA	2	10	177687	177696	20 %	20 %	0 %	60 %	66043433
3620	NC_007005	TAAG	2	8	177743	177750	50 %	25 %	25 %	0 %	66043433
3621	NC_007005	GC	3	6	177762	177767	0 %	0 %	50 %	50 %	66043433
3622	NC_007005	CT	3	6	177782	177787	0 %	50 %	0 %	50 %	66043433
3623	NC_007005	CAG	2	6	177810	177815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043433
3624	NC_007005	GC	3	6	177822	177827	0 %	0 %	50 %	50 %	66043433
3625	NC_007005	GTC	2	6	177842	177847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043433
3626	NC_007005	CGGTG	2	10	177864	177873	0 %	20 %	60 %	20 %	66043433
3627	NC_007005	AC	3	6	177904	177909	50 %	0 %	0 %	50 %	66043433
3628	NC_007005	CGA	2	6	177954	177959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043433
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3630	NC_007005	GA	3	6	177973	177978	50 %	0 %	50 %	0 %	66043433
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3632	NC_007005	TGC	2	6	178101	178106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043433
3633	NC_007005	CGA	2	6	178167	178172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043433
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3635	NC_007005	CGC	2	6	178317	178322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043433
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3641	NC_007005	TG	3	6	178502	178507	0 %	50 %	50 %	0 %	66043434
3642	NC_007005	CATC	2	8	178527	178534	25 %	25 %	0 %	50 %	66043434
3643	NC_007005	CCT	2	6	178585	178590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043434
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3646	NC_007005	GCTG	2	8	178659	178666	0 %	25 %	50 %	25 %	66043434
3647	NC_007005	CGA	2	6	178692	178697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043434
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3653	NC_007005	TCGA	2	8	178954	178961	25 %	25 %	25 %	25 %	66043434
3654	NC_007005	GCAGC	2	10	179048	179057	20 %	0 %	40 %	40 %	66043434
3655	NC_007005	GCAG	2	8	179164	179171	25 %	0 %	50 %	25 %	66043435
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3660	NC_007005	TCAGG	2	10	179477	179486	20 %	20 %	40 %	20 %	66043435
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3668	NC_007005	GAC	2	6	179868	179873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3672	NC_007005	TAC	2	6	180137	180142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043436
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3684	NC_007005	TGA	2	6	180712	180717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043436
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3710	NC_007005	TAAAG	2	10	181982	181991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3713	NC_007005	A	8	8	182162	182169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3714	NC_007005	TGA	2	6	182175	182180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3737	NC_007005	TGA	2	6	183379	183384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043438
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3741	NC_007005	TCG	2	6	183714	183719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043438
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3743	NC_007005	GTA	2	6	183804	183809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_007005	A	7	7	183809	183815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3745	NC_007005	ACT	2	6	183821	183826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3746	NC_007005	CCT	2	6	183879	183884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3747	NC_007005	CCG	2	6	183971	183976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043439
3748	NC_007005	GTTG	2	8	184020	184027	0 %	50 %	50 %	0 %	66043439
3749	NC_007005	TCGATC	2	12	184040	184051	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	66043439
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3751	NC_007005	TCC	2	6	184085	184090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043439
3752	NC_007005	GCT	2	6	184155	184160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043439
3753	NC_007005	TGA	2	6	184260	184265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043439
3754	NC_007005	GCA	2	6	184326	184331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043439
3755	NC_007005	CTG	2	6	184530	184535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043439
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3757	NC_007005	CAG	2	6	184639	184644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043439
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3762	NC_007005	ATGG	2	8	184872	184879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3763	NC_007005	GTT	2	6	185026	185031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043440
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3765	NC_007005	CTT	2	6	185068	185073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043440
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3772	NC_007005	GCA	2	6	185926	185931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043441
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3774	NC_007005	CTG	2	6	186105	186110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043441
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3776	NC_007005	CG	3	6	186195	186200	0 %	0 %	50 %	50 %	66043441
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3785	NC_007005	CGT	2	6	186912	186917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043443
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3788	NC_007005	GCCA	2	8	186990	186997	25 %	0 %	25 %	50 %	66043443
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3791	NC_007005	CGA	2	6	187235	187240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043443
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3803	NC_007005	TCG	2	6	187880	187885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3804	NC_007005	TCC	2	6	187963	187968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3805	NC_007005	CG	3	6	187969	187974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3806	NC_007005	CATG	2	8	188014	188021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3808	NC_007005	T	6	6	188076	188081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3809	NC_007005	CTG	2	6	188158	188163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3810	NC_007005	TAA	2	6	188222	188227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3840	NC_007005	GAG	2	6	189640	189645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3861	NC_007005	CCGA	2	8	190483	190490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3862	NC_007005	TC	3	6	190498	190503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3868	NC_007005	CGGCA	2	10	190874	190883	20 %	0 %	40 %	40 %	66043447
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3870	NC_007005	T	7	7	191071	191077	0 %	100 %	0 %	0 %	66043447
3871	NC_007005	CAGCT	2	10	191120	191129	20 %	20 %	20 %	40 %	66043447
3872	NC_007005	CGA	2	6	191167	191172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043447
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3876	NC_007005	GCT	2	6	191410	191415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043447
3877	NC_007005	CAAG	2	8	191473	191480	50 %	0 %	25 %	25 %	66043447
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3884	NC_007005	TCA	2	6	191928	191933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043447
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3979	NC_007005	AGCGC	2	10	197211	197220	20 %	0 %	40 %	40 %	66043454
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3995	NC_007005	TGCA	2	8	197918	197925	25 %	25 %	25 %	25 %	66043455
3996	NC_007005	CCAGCA	2	12	198070	198081	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	66043455
3997	NC_007005	CGG	2	6	198117	198122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043455
3998	NC_007005	GCG	2	6	198205	198210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043455
3999	NC_007005	ACCG	2	8	198230	198237	25 %	0 %	25 %	50 %	66043455
4000	NC_007005	CGC	2	6	198238	198243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043455

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