MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007005	GC	3	6	24156	24161	0 %	0 %	50 %	50 %	66043291
502	NC_007005	GGT	2	6	24271	24276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043291
503	NC_007005	CA	3	6	24319	24324	50 %	0 %	0 %	50 %	66043291
504	NC_007005	CAG	2	6	24352	24357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043291
505	NC_007005	CGA	2	6	24583	24588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043291
506	NC_007005	CTG	2	6	24599	24604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043291
507	NC_007005	CAT	2	6	24670	24675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043291
508	NC_007005	CGA	2	6	24729	24734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_007005	TTG	2	6	24752	24757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007005	TTCGG	2	10	24932	24941	0 %	40 %	40 %	20 %	66043292
511	NC_007005	TCG	2	6	24944	24949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043292
512	NC_007005	CGT	2	6	25013	25018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043292
513	NC_007005	CTGG	2	8	25057	25064	0 %	25 %	50 %	25 %	66043292
514	NC_007005	GAC	2	6	25094	25099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043292
515	NC_007005	CCG	2	6	25139	25144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043292
516	NC_007005	GTC	2	6	25206	25211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043292
517	NC_007005	GC	3	6	25250	25255	0 %	0 %	50 %	50 %	66043292
518	NC_007005	GGC	2	6	25261	25266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043292
519	NC_007005	G	6	6	25340	25345	0 %	0 %	100 %	0 %	66043292
520	NC_007005	CAG	2	6	25391	25396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043292
521	NC_007005	CGC	2	6	25408	25413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043292
522	NC_007005	GCG	2	6	25431	25436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043292
523	NC_007005	CGC	2	6	25462	25467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043292
524	NC_007005	ATC	2	6	25502	25507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043292
525	NC_007005	TGG	2	6	25530	25535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043292
526	NC_007005	CG	3	6	25570	25575	0 %	0 %	50 %	50 %	66043292
527	NC_007005	GCC	2	6	25580	25585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043292
528	NC_007005	TCA	2	6	25624	25629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043292
529	NC_007005	TCA	2	6	25648	25653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043292
530	NC_007005	GCA	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043292
531	NC_007005	ATC	2	6	25776	25781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043292
532	NC_007005	GCT	2	6	25792	25797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043292
533	NC_007005	CGC	2	6	25801	25806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043292
534	NC_007005	GGAC	2	8	25888	25895	25 %	0 %	50 %	25 %	66043292
535	NC_007005	GCC	2	6	25949	25954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_007005	GA	3	6	25966	25971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007005	CAG	2	6	25983	25988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043293
538	NC_007005	CAA	2	6	25999	26004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043293
539	NC_007005	CGGTG	2	10	26025	26034	0 %	20 %	60 %	20 %	66043293
540	NC_007005	CCGA	2	8	26044	26051	25 %	0 %	25 %	50 %	66043293
541	NC_007005	GAA	2	6	26086	26091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043293
542	NC_007005	CTG	2	6	26104	26109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043293
543	NC_007005	CCTGAT	2	12	26139	26150	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	66043293
544	NC_007005	ACA	2	6	26156	26161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043293
545	NC_007005	CCTGG	2	10	26225	26234	0 %	20 %	40 %	40 %	66043293
546	NC_007005	CTGG	2	8	26244	26251	0 %	25 %	50 %	25 %	66043293
547	NC_007005	CTG	2	6	26266	26271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043293
548	NC_007005	GC	3	6	26345	26350	0 %	0 %	50 %	50 %	66043293
549	NC_007005	CGG	2	6	26384	26389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043293
550	NC_007005	CGG	2	6	26457	26462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043293
551	NC_007005	GGGC	2	8	26469	26476	0 %	0 %	75 %	25 %	66043293
552	NC_007005	GC	3	6	26523	26528	0 %	0 %	50 %	50 %	66043293
553	NC_007005	CA	3	6	26544	26549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_007005	GTG	2	6	26597	26602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043294
555	NC_007005	GGC	2	6	26632	26637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043294
556	NC_007005	CTG	2	6	26653	26658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043294
557	NC_007005	CGGG	2	8	26758	26765	0 %	0 %	75 %	25 %	66043294
558	NC_007005	CAC	2	6	26842	26847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043294
559	NC_007005	CA	3	6	26863	26868	50 %	0 %	0 %	50 %	66043294
560	NC_007005	CGT	2	6	26904	26909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043294
561	NC_007005	ACC	2	6	26912	26917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043294
562	NC_007005	GCC	2	6	27052	27057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043294
563	NC_007005	GCG	2	6	27101	27106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043294
564	NC_007005	GCA	2	6	27153	27158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043294
565	NC_007005	GCA	2	6	27246	27251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043294
566	NC_007005	ACC	2	6	27344	27349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043294
567	NC_007005	CAC	3	9	27451	27459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043294
568	NC_007005	TCC	2	6	27514	27519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043294
569	NC_007005	CT	3	6	27553	27558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_007005	CGC	2	6	27632	27637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_007005	TGC	2	6	27676	27681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_007005	CGG	2	6	27839	27844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043295
573	NC_007005	GCG	2	6	27845	27850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043295
574	NC_007005	GCA	2	6	27923	27928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043295
575	NC_007005	GCC	2	6	27933	27938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043295
576	NC_007005	ATCC	2	8	28006	28013	25 %	25 %	0 %	50 %	66043295
577	NC_007005	CTT	2	6	28053	28058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043295
578	NC_007005	AAG	2	6	28070	28075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043295
579	NC_007005	TGG	2	6	28090	28095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043295
580	NC_007005	GC	3	6	28170	28175	0 %	0 %	50 %	50 %	66043295
581	NC_007005	CG	3	6	28259	28264	0 %	0 %	50 %	50 %	66043295
582	NC_007005	GGT	2	6	28270	28275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043295
583	NC_007005	TCA	2	6	28349	28354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043295
584	NC_007005	GCG	3	9	28374	28382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043295
585	NC_007005	GGC	3	9	28386	28394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043295
586	NC_007005	GCA	2	6	28404	28409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043295
587	NC_007005	CGT	2	6	28429	28434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043295
588	NC_007005	GTT	2	6	28476	28481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043295
589	NC_007005	GCC	2	6	28527	28532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043295
590	NC_007005	GAA	2	6	28576	28581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043295
591	NC_007005	GACC	2	8	28605	28612	25 %	0 %	25 %	50 %	66043295
592	NC_007005	CTGG	2	8	28617	28624	0 %	25 %	50 %	25 %	66043295
593	NC_007005	CGT	2	6	28646	28651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043296
594	NC_007005	GC	3	6	28871	28876	0 %	0 %	50 %	50 %	66043296
595	NC_007005	CGA	2	6	28904	28909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043296
596	NC_007005	CTG	2	6	28917	28922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043296
597	NC_007005	GCGGT	2	10	29017	29026	0 %	20 %	60 %	20 %	66043296
598	NC_007005	GC	3	6	29032	29037	0 %	0 %	50 %	50 %	66043296
599	NC_007005	CAG	2	6	29147	29152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043296
600	NC_007005	ATC	2	6	29184	29189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043296
601	NC_007005	ATG	2	6	29274	29279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043296
602	NC_007005	CGGCG	2	10	29324	29333	0 %	0 %	60 %	40 %	66043296
603	NC_007005	CTG	2	6	29385	29390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043296
604	NC_007005	GCG	2	6	29395	29400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043296
605	NC_007005	GCTG	2	8	29444	29451	0 %	25 %	50 %	25 %	66043296
606	NC_007005	CGA	2	6	29627	29632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_007005	CCCTG	2	10	29736	29745	0 %	20 %	20 %	60 %	66043297
608	NC_007005	CCT	2	6	29763	29768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043297
609	NC_007005	CTG	2	6	29809	29814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043297
610	NC_007005	CAC	2	6	29824	29829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043297
611	NC_007005	TGGC	2	8	29870	29877	0 %	25 %	50 %	25 %	66043297
612	NC_007005	GAA	2	6	29881	29886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043297
613	NC_007005	GATC	2	8	29887	29894	25 %	25 %	25 %	25 %	66043297
614	NC_007005	CCT	2	6	29910	29915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043297
615	NC_007005	CG	3	6	29940	29945	0 %	0 %	50 %	50 %	66043297
616	NC_007005	CAG	2	6	30016	30021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043297
617	NC_007005	CGA	2	6	30095	30100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043297
618	NC_007005	CCA	2	6	30102	30107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043297
619	NC_007005	CAG	2	6	30121	30126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043297
620	NC_007005	GGC	2	6	30133	30138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043297
621	NC_007005	CCAC	2	8	30195	30202	25 %	0 %	0 %	75 %	66043297
622	NC_007005	AC	3	6	30213	30218	50 %	0 %	0 %	50 %	66043297
623	NC_007005	GCG	2	6	30225	30230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043297
624	NC_007005	GC	3	6	30232	30237	0 %	0 %	50 %	50 %	66043297
625	NC_007005	GCC	2	6	30257	30262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043297
626	NC_007005	GCAC	2	8	30329	30336	25 %	0 %	25 %	50 %	66043297
627	NC_007005	CTG	2	6	30358	30363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043297
628	NC_007005	AGCG	2	8	30377	30384	25 %	0 %	50 %	25 %	66043297
629	NC_007005	CGG	2	6	30429	30434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043297
630	NC_007005	GCA	2	6	30438	30443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043297
631	NC_007005	GGC	2	6	30485	30490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043297
632	NC_007005	CGA	2	6	30498	30503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043297
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643	NC_007005	CAG	3	9	30883	30891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043297
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750	NC_007005	TGAGC	2	10	36267	36276	20 %	20 %	40 %	20 %	66043302
751	NC_007005	GCG	2	6	36310	36315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_007005	CGC	2	6	36506	36511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
753	NC_007005	GCA	2	6	36525	36530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_007005	AC	3	6	36544	36549	50 %	0 %	0 %	50 %	66043303
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756	NC_007005	GGC	2	6	36610	36615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043303
757	NC_007005	AGCG	2	8	36651	36658	25 %	0 %	50 %	25 %	66043303
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759	NC_007005	CGG	2	6	36719	36724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043303
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761	NC_007005	CCGA	2	8	36737	36744	25 %	0 %	25 %	50 %	66043303
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887	NC_007005	CAGC	2	8	43134	43141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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