MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Photobacterium profundum SS9 chromosome 2

Total Repeats: 1555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006371	CAAAG	2	10	889	898	60 %	0 %	20 %	20 %	54301681
2	NC_006371	GCTGG	2	10	1031	1040	0 %	20 %	60 %	20 %	54301681
3	NC_006371	GATTC	2	10	1327	1336	20 %	40 %	20 %	20 %	54301681
4	NC_006371	AGGCA	2	10	5162	5171	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006371	CTTGC	2	10	5612	5621	0 %	40 %	20 %	40 %	54301683
6	NC_006371	CCATG	2	10	6580	6589	20 %	20 %	20 %	40 %	54301683
7	NC_006371	AAATT	2	10	8471	8480	60 %	40 %	0 %	0 %	54301683
8	NC_006371	AAAAT	2	10	9712	9721	80 %	20 %	0 %	0 %	54301684
9	NC_006371	ATCTT	2	10	14111	14120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006371	AATGG	2	10	14193	14202	40 %	20 %	40 %	0 %	54301689
11	NC_006371	ATTTT	2	10	14848	14857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006371	AATCG	2	10	15401	15410	40 %	20 %	20 %	20 %	54301690
13	NC_006371	ATGAT	2	10	15887	15896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006371	ATTTT	2	10	17046	17055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006371	AAGTG	2	10	18825	18834	40 %	20 %	40 %	0 %	54301693
16	NC_006371	AAGCC	2	10	19921	19930	40 %	0 %	20 %	40 %	54301694
17	NC_006371	GTGAT	2	10	22452	22461	20 %	40 %	40 %	0 %	54301695
18	NC_006371	CATTA	2	10	23959	23968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006371	GTTTT	2	10	31707	31716	0 %	80 %	20 %	0 %	54301703
20	NC_006371	TTTTA	2	10	32548	32557	20 %	80 %	0 %	0 %	54301704
21	NC_006371	TTGAT	2	10	33575	33584	20 %	60 %	20 %	0 %	54301705
22	NC_006371	CGTGA	2	10	33631	33640	20 %	20 %	40 %	20 %	54301705
23	NC_006371	ACACT	2	10	35910	35919	40 %	20 %	0 %	40 %	54301706
24	NC_006371	AAAGA	2	10	36076	36085	80 %	0 %	20 %	0 %	54301706
25	NC_006371	TTTTA	2	10	41177	41186	20 %	80 %	0 %	0 %	54301710
26	NC_006371	TTGGG	2	10	42049	42058	0 %	40 %	60 %	0 %	54301710
27	NC_006371	GGTTG	2	10	45322	45331	0 %	40 %	60 %	0 %	54301713
28	NC_006371	TCAAA	2	10	45894	45903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006371	ATCTT	2	10	46284	46293	20 %	60 %	0 %	20 %	54301714
30	NC_006371	GCTTC	2	10	46315	46324	0 %	40 %	20 %	40 %	54301714
31	NC_006371	ACTGG	2	10	47803	47812	20 %	20 %	40 %	20 %	54301714
32	NC_006371	TAGAT	2	10	49581	49590	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006371	GATAT	2	10	50187	50196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006371	ATGAA	2	10	51504	51513	60 %	20 %	20 %	0 %	54301718
35	NC_006371	GATGT	2	10	55383	55392	20 %	40 %	40 %	0 %	54301723
36	NC_006371	TGATT	2	10	55853	55862	20 %	60 %	20 %	0 %	54301723
37	NC_006371	GGTGC	2	10	57345	57354	0 %	20 %	60 %	20 %	54301725
38	NC_006371	CAGCT	2	10	58733	58742	20 %	20 %	20 %	40 %	54301726
39	NC_006371	GGTCT	2	10	60168	60177	0 %	40 %	40 %	20 %	54301727
40	NC_006371	GCTTG	2	10	60879	60888	0 %	40 %	40 %	20 %	54301728
41	NC_006371	AAGTT	2	10	64488	64497	40 %	40 %	20 %	0 %	54301730
42	NC_006371	CGGTA	2	10	74997	75006	20 %	20 %	40 %	20 %	54301740
43	NC_006371	TTTTG	2	10	79451	79460	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006371	CTTTG	2	10	80619	80628	0 %	60 %	20 %	20 %	54301743
45	NC_006371	GTTTT	2	10	82226	82235	0 %	80 %	20 %	0 %	54301744
46	NC_006371	GTAAG	2	10	83012	83021	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006371	GAGAA	2	10	83517	83526	60 %	0 %	40 %	0 %	54301746
48	NC_006371	ACGCT	2	10	84766	84775	20 %	20 %	20 %	40 %	54301747
49	NC_006371	TATCG	2	10	84907	84916	20 %	40 %	20 %	20 %	54301747
50	NC_006371	CCAAT	2	10	87332	87341	40 %	20 %	0 %	40 %	54301749
51	NC_006371	CCAAA	2	10	88502	88511	60 %	0 %	0 %	40 %	54301750
52	NC_006371	GAACA	2	10	88662	88671	60 %	0 %	20 %	20 %	54301750
53	NC_006371	TTCAC	2	10	89020	89029	20 %	40 %	0 %	40 %	54301750
54	NC_006371	CTTCT	2	10	89616	89625	0 %	60 %	0 %	40 %	54301750
55	NC_006371	GAGTT	2	10	91092	91101	20 %	40 %	40 %	0 %	54301751
56	NC_006371	GTTGA	2	10	91913	91922	20 %	40 %	40 %	0 %	54301752
57	NC_006371	AAGAT	2	10	93299	93308	60 %	20 %	20 %	0 %	54301753
58	NC_006371	ACGGA	2	10	97034	97043	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006371	CATAC	2	10	98759	98768	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_006371	TAATG	2	10	99170	99179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006371	TTGGC	2	10	101539	101548	0 %	40 %	40 %	20 %	54301759
62	NC_006371	AGAGG	2	10	102300	102309	40 %	0 %	60 %	0 %	54301759
63	NC_006371	ATTAA	2	10	103324	103333	60 %	40 %	0 %	0 %	54301759
64	NC_006371	GCATC	2	10	103625	103634	20 %	20 %	20 %	40 %	54301759
65	NC_006371	TGCCT	2	10	105015	105024	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_006371	ATTGT	2	10	106174	106183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006371	ATTGA	2	10	107801	107810	40 %	40 %	20 %	0 %	54301764
68	NC_006371	AAAGC	2	10	110751	110760	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_006371	AGGCA	2	10	112172	112181	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_006371	TAACT	2	10	113698	113707	40 %	40 %	0 %	20 %	54301770
71	NC_006371	TCAAG	2	10	117293	117302	40 %	20 %	20 %	20 %	54301774
72	NC_006371	GATTG	2	10	117374	117383	20 %	40 %	40 %	0 %	54301774
73	NC_006371	TGAAG	2	10	118695	118704	40 %	20 %	40 %	0 %	54301777
74	NC_006371	GAGCT	2	10	118777	118786	20 %	20 %	40 %	20 %	54301777
75	NC_006371	GATAC	2	10	119072	119081	40 %	20 %	20 %	20 %	54301778
76	NC_006371	AATTT	2	10	119786	119795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006371	TGAAA	2	10	119958	119967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006371	ATTGG	2	10	120562	120571	20 %	40 %	40 %	0 %	54301779
79	NC_006371	GTATT	2	10	121526	121535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006371	AACGT	2	10	121862	121871	40 %	20 %	20 %	20 %	54301780
81	NC_006371	TGGTT	2	10	122416	122425	0 %	60 %	40 %	0 %	54301780
82	NC_006371	TGAAG	2	10	123567	123576	40 %	20 %	40 %	0 %	54301780
83	NC_006371	AATAA	2	10	123825	123834	80 %	20 %	0 %	0 %	54301781
84	NC_006371	ATTCT	2	10	128091	128100	20 %	60 %	0 %	20 %	54301784
85	NC_006371	ATGTA	2	10	129948	129957	40 %	40 %	20 %	0 %	54301785
86	NC_006371	CTTGT	2	10	130294	130303	0 %	60 %	20 %	20 %	54301786
87	NC_006371	ATGCA	2	10	131034	131043	40 %	20 %	20 %	20 %	54301787
88	NC_006371	GTGCT	2	10	131948	131957	0 %	40 %	40 %	20 %	54301788
89	NC_006371	AATGT	2	10	134871	134880	40 %	40 %	20 %	0 %	54301790
90	NC_006371	AAACA	2	10	135530	135539	80 %	0 %	0 %	20 %	54301791
91	NC_006371	AGTGG	2	10	137248	137257	20 %	20 %	60 %	0 %	54301792
92	NC_006371	ATTTG	2	10	137639	137648	20 %	60 %	20 %	0 %	54301793
93	NC_006371	CCACG	2	10	138077	138086	20 %	0 %	20 %	60 %	54301793
94	NC_006371	GATGA	2	10	139417	139426	40 %	20 %	40 %	0 %	54301794
95	NC_006371	CAATC	2	10	139810	139819	40 %	20 %	0 %	40 %	54301795
96	NC_006371	CTTCT	2	10	139862	139871	0 %	60 %	0 %	40 %	54301795
97	NC_006371	AATCG	2	10	142034	142043	40 %	20 %	20 %	20 %	54301798
98	NC_006371	TTCTG	2	10	142409	142418	0 %	60 %	20 %	20 %	54301799
99	NC_006371	TGTTT	2	10	142454	142463	0 %	80 %	20 %	0 %	54301799
100	NC_006371	TGTTT	2	10	142948	142957	0 %	80 %	20 %	0 %	54301799
101	NC_006371	TGCCT	2	10	144653	144662	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_006371	ATCTC	2	10	146868	146877	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_006371	ACACA	2	10	149937	149946	60 %	0 %	0 %	40 %	54301807
104	NC_006371	TTTTC	2	10	151574	151583	0 %	80 %	0 %	20 %	54301808
105	NC_006371	AATTA	2	10	152120	152129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006371	TAAAG	2	10	152499	152508	60 %	20 %	20 %	0 %	54301809
107	NC_006371	GTAAT	2	10	152615	152624	40 %	40 %	20 %	0 %	54301809
108	NC_006371	TTAAT	2	10	153531	153540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006371	CGTAT	2	10	155844	155853	20 %	40 %	20 %	20 %	54301814
110	NC_006371	GTAAA	2	10	155873	155882	60 %	20 %	20 %	0 %	54301814
111	NC_006371	GTTGA	2	10	159255	159264	20 %	40 %	40 %	0 %	54301817
112	NC_006371	AGAAA	2	10	162088	162097	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006371	AAAGT	2	10	162376	162385	60 %	20 %	20 %	0 %	54301820
114	NC_006371	TGAAA	2	10	163118	163127	60 %	20 %	20 %	0 %	54301820
115	NC_006371	GTATT	2	10	164681	164690	20 %	60 %	20 %	0 %	54301822
116	NC_006371	TGTGA	2	10	168501	168510	20 %	40 %	40 %	0 %	54301827
117	NC_006371	GGTTG	2	10	168648	168657	0 %	40 %	60 %	0 %	54301827
118	NC_006371	TTGTC	2	10	169547	169556	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_006371	AAATT	2	10	169561	169570	60 %	40 %	0 %	0 %	54301828
120	NC_006371	CATTA	2	10	170684	170693	40 %	40 %	0 %	20 %	54301829
121	NC_006371	CAAAC	2	10	173101	173110	60 %	0 %	0 %	40 %	54301831
122	NC_006371	CATCG	2	10	175788	175797	20 %	20 %	20 %	40 %	54301833
123	NC_006371	CTCTG	2	10	176241	176250	0 %	40 %	20 %	40 %	54301833
124	NC_006371	GGTTG	2	10	176334	176343	0 %	40 %	60 %	0 %	54301833
125	NC_006371	CCATG	2	10	176616	176625	20 %	20 %	20 %	40 %	54301833
126	NC_006371	GTTCA	2	10	177826	177835	20 %	40 %	20 %	20 %	54301834
127	NC_006371	TGAAA	2	10	179758	179767	60 %	20 %	20 %	0 %	54301835
128	NC_006371	AGATC	2	10	181083	181092	40 %	20 %	20 %	20 %	54301836
129	NC_006371	GAAGC	2	10	181273	181282	40 %	0 %	40 %	20 %	54301836
130	NC_006371	CTGTT	2	10	182241	182250	0 %	60 %	20 %	20 %	161936352
131	NC_006371	TTTTC	2	10	182808	182817	0 %	80 %	0 %	20 %	54301838
132	NC_006371	CAAGT	2	10	184176	184185	40 %	20 %	20 %	20 %	54301839
133	NC_006371	GGGCA	2	10	185317	185326	20 %	0 %	60 %	20 %	54301841
134	NC_006371	GTTTC	2	10	185954	185963	0 %	60 %	20 %	20 %	54301842
135	NC_006371	CCAGC	3	15	189729	189743	20 %	0 %	20 %	60 %	54301848
136	NC_006371	CATTC	2	10	190310	190319	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_006371	GTTGA	2	10	190538	190547	20 %	40 %	40 %	0 %	54301849
138	NC_006371	TAGCT	2	10	191566	191575	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_006371	AGAGT	2	10	192531	192540	40 %	20 %	40 %	0 %	54301851
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272	NC_006371	TCTCA	2	10	404512	404521	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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406	NC_006371	TTATC	2	10	599197	599206	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
407	NC_006371	TAATT	2	10	599266	599275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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