MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005042	CTT	2	6	19756	19761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239469
502	NC_005042	ATC	2	6	19783	19788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239469
503	NC_005042	GAC	2	6	19826	19831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239469
504	NC_005042	AG	4	8	19879	19886	50 %	0 %	50 %	0 %	33239469
505	NC_005042	CAA	2	6	19956	19961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239469
506	NC_005042	TGG	2	6	20095	20100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239469
507	NC_005042	A	7	7	20122	20128	100 %	0 %	0 %	0 %	33239469
508	NC_005042	GGC	2	6	20207	20212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33239469
509	NC_005042	T	7	7	20232	20238	0 %	100 %	0 %	0 %	33239469
510	NC_005042	CGCT	2	8	20254	20261	0 %	25 %	25 %	50 %	33239469
511	NC_005042	ATTC	2	8	20282	20289	25 %	50 %	0 %	25 %	33239469
512	NC_005042	ATA	2	6	20412	20417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239469
513	NC_005042	GAT	2	6	20501	20506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239469
514	NC_005042	A	6	6	20508	20513	100 %	0 %	0 %	0 %	33239469
515	NC_005042	TAT	2	6	20514	20519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239469
516	NC_005042	TAT	2	6	20537	20542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239469
517	NC_005042	CAT	3	9	20564	20572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239469
518	NC_005042	TAG	2	6	20587	20592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239469
519	NC_005042	ATT	2	6	20593	20598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239469
520	NC_005042	TGA	2	6	20615	20620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239469
521	NC_005042	AATT	2	8	20655	20662	50 %	50 %	0 %	0 %	33239470
522	NC_005042	AGAT	2	8	20714	20721	50 %	25 %	25 %	0 %	33239470
523	NC_005042	AGA	2	6	20739	20744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239470
524	NC_005042	TC	3	6	20751	20756	0 %	50 %	0 %	50 %	33239470
525	NC_005042	ATA	2	6	20777	20782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239470
526	NC_005042	AAT	2	6	20787	20792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239470
527	NC_005042	GAA	2	6	20797	20802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239470
528	NC_005042	GATTA	2	10	20811	20820	40 %	40 %	20 %	0 %	33239470
529	NC_005042	TAA	2	6	20845	20850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239470
530	NC_005042	ATT	2	6	20889	20894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239471
531	NC_005042	AATT	2	8	20914	20921	50 %	50 %	0 %	0 %	33239471
532	NC_005042	A	7	7	20942	20948	100 %	0 %	0 %	0 %	33239471
533	NC_005042	AAG	2	6	20983	20988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239471
534	NC_005042	ATTG	2	8	21047	21054	25 %	50 %	25 %	0 %	33239471
535	NC_005042	TTG	2	6	21081	21086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239471
536	NC_005042	A	6	6	21094	21099	100 %	0 %	0 %	0 %	33239471
537	NC_005042	TTA	2	6	21102	21107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239471
538	NC_005042	TCC	2	6	21112	21117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239471
539	NC_005042	TTA	2	6	21138	21143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239471
540	NC_005042	GTA	2	6	21146	21151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239471
541	NC_005042	TGA	2	6	21198	21203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239471
542	NC_005042	GAA	2	6	21209	21214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239471
543	NC_005042	TGA	2	6	21259	21264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239471
544	NC_005042	CCAATT	2	12	21314	21325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239471
545	NC_005042	GGAA	2	8	21340	21347	50 %	0 %	50 %	0 %	33239471
546	NC_005042	AGT	2	6	21419	21424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239471
547	NC_005042	TTAA	2	8	21425	21432	50 %	50 %	0 %	0 %	33239471
548	NC_005042	TTA	2	6	21437	21442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239471
549	NC_005042	A	6	6	21476	21481	100 %	0 %	0 %	0 %	33239471
550	NC_005042	T	6	6	21519	21524	0 %	100 %	0 %	0 %	33239471
551	NC_005042	TATT	2	8	21526	21533	25 %	75 %	0 %	0 %	33239471
552	NC_005042	TAA	2	6	21565	21570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239471
553	NC_005042	TTA	2	6	21632	21637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239471
554	NC_005042	A	6	6	21641	21646	100 %	0 %	0 %	0 %	33239471
555	NC_005042	ATC	2	6	21753	21758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239471
556	NC_005042	AGATTG	2	12	21772	21783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239472
557	NC_005042	C	6	6	21786	21791	0 %	0 %	0 %	100 %	33239472
558	NC_005042	GCT	2	6	21865	21870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239472
559	NC_005042	TCT	2	6	21880	21885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239472
560	NC_005042	GTT	2	6	21926	21931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239472
561	NC_005042	GTC	2	6	21990	21995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239472
562	NC_005042	TTC	2	6	21999	22004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239472
563	NC_005042	TTG	2	6	22032	22037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239472
564	NC_005042	T	6	6	22041	22046	0 %	100 %	0 %	0 %	33239472
565	NC_005042	T	6	6	22176	22181	0 %	100 %	0 %	0 %	33239473
566	NC_005042	T	7	7	22189	22195	0 %	100 %	0 %	0 %	33239473
567	NC_005042	TGCA	2	8	22260	22267	25 %	25 %	25 %	25 %	33239473
568	NC_005042	CTC	2	6	22283	22288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239473
569	NC_005042	TTC	2	6	22314	22319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239473
570	NC_005042	GAT	2	6	22320	22325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239473
571	NC_005042	TAGG	2	8	22373	22380	25 %	25 %	50 %	0 %	33239473
572	NC_005042	TGTT	2	8	22418	22425	0 %	75 %	25 %	0 %	33239473
573	NC_005042	CTT	3	9	22436	22444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239473
574	NC_005042	CTTTT	2	10	22491	22500	0 %	80 %	0 %	20 %	33239473
575	NC_005042	TTCT	2	8	22533	22540	0 %	75 %	0 %	25 %	33239473
576	NC_005042	AT	4	8	22551	22558	50 %	50 %	0 %	0 %	33239473
577	NC_005042	CAG	2	6	22601	22606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239473
578	NC_005042	CCA	2	6	22645	22650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239473
579	NC_005042	CAA	2	6	22748	22753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239473
580	NC_005042	GTT	2	6	22764	22769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239473
581	NC_005042	CATA	2	8	22794	22801	50 %	25 %	0 %	25 %	33239473
582	NC_005042	TAT	2	6	22854	22859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239473
583	NC_005042	TTTC	2	8	22873	22880	0 %	75 %	0 %	25 %	33239473
584	NC_005042	ATT	2	6	22903	22908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239473
585	NC_005042	TCC	2	6	22947	22952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239473
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588	NC_005042	TATTT	2	10	23018	23027	20 %	80 %	0 %	0 %	33239474
589	NC_005042	T	7	7	23025	23031	0 %	100 %	0 %	0 %	33239474
590	NC_005042	ATAA	2	8	23072	23079	75 %	25 %	0 %	0 %	33239474
591	NC_005042	AAG	2	6	23080	23085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239474
592	NC_005042	TAA	2	6	23109	23114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239474
593	NC_005042	ATT	2	6	23164	23169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239474
594	NC_005042	TA	3	6	23232	23237	50 %	50 %	0 %	0 %	33239474
595	NC_005042	TTA	2	6	23289	23294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239474
596	NC_005042	AAC	2	6	23332	23337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239474
597	NC_005042	T	7	7	23367	23373	0 %	100 %	0 %	0 %	33239474
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599	NC_005042	GAT	2	6	23424	23429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239474
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601	NC_005042	TGCC	2	8	23450	23457	0 %	25 %	25 %	50 %	33239474
602	NC_005042	TCT	2	6	23482	23487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239474
603	NC_005042	TGC	2	6	23554	23559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239474
604	NC_005042	TAT	2	6	23574	23579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239474
605	NC_005042	ATC	2	6	23614	23619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239474
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609	NC_005042	T	7	7	23781	23787	0 %	100 %	0 %	0 %	33239474
610	NC_005042	T	6	6	23792	23797	0 %	100 %	0 %	0 %	33239474
611	NC_005042	T	6	6	23803	23808	0 %	100 %	0 %	0 %	33239474
612	NC_005042	ATTA	2	8	23815	23822	50 %	50 %	0 %	0 %	33239474
613	NC_005042	TAA	2	6	23840	23845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239474
614	NC_005042	GTAA	2	8	23870	23877	50 %	25 %	25 %	0 %	33239474
615	NC_005042	CAT	2	6	23889	23894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239474
616	NC_005042	TAT	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239474
617	NC_005042	ACC	2	6	23986	23991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239474
618	NC_005042	ATT	2	6	23993	23998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239474
619	NC_005042	TTG	2	6	24030	24035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239474
620	NC_005042	ATT	2	6	24038	24043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239474
621	NC_005042	GTT	2	6	24053	24058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239474
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623	NC_005042	TAA	2	6	24099	24104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239474
624	NC_005042	T	7	7	24143	24149	0 %	100 %	0 %	0 %	33239474
625	NC_005042	CTT	2	6	24156	24161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239474
626	NC_005042	AAT	2	6	24202	24207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239474
627	NC_005042	AT	3	6	24267	24272	50 %	50 %	0 %	0 %	33239474
628	NC_005042	ATT	2	6	24292	24297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239474
629	NC_005042	GATG	2	8	24298	24305	25 %	25 %	50 %	0 %	33239474
630	NC_005042	TTG	2	6	24308	24313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239474
631	NC_005042	ACC	2	6	24382	24387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239474
632	NC_005042	CTA	2	6	24442	24447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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636	NC_005042	T	6	6	24527	24532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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765	NC_005042	GAAT	2	8	30183	30190	50 %	25 %	25 %	0 %	33239482
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772	NC_005042	T	8	8	30596	30603	0 %	100 %	0 %	0 %	33239482
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893	NC_005042	A	6	6	35412	35417	100 %	0 %	0 %	0 %	33239489
894	NC_005042	TCT	2	6	35450	35455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239489
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