MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004578	CAG	2	6	182467	182472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867402
3502	NC_004578	ACCGG	2	10	182477	182486	20 %	0 %	40 %	40 %	28867402
3503	NC_004578	TGA	2	6	182542	182547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_004578	GCC	2	6	182580	182585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_004578	TTG	2	6	182629	182634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_004578	CGA	2	6	182698	182703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_004578	GAAG	2	8	182724	182731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_004578	ACC	2	6	182854	182859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867403
3509	NC_004578	GAT	2	6	183118	183123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_004578	GT	3	6	183128	183133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_004578	T	6	6	183149	183154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_004578	TAG	2	6	183169	183174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_004578	GGT	2	6	183184	183189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_004578	A	6	6	183207	183212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_004578	AAACT	2	10	183261	183270	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3516	NC_004578	TGA	2	6	183278	183283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_004578	CATT	2	8	183287	183294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_004578	TAT	2	6	183313	183318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_004578	ACG	2	6	183404	183409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_004578	TGA	2	6	183456	183461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_004578	A	6	6	183495	183500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_004578	TGA	2	6	183529	183534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_004578	TTA	2	6	183634	183639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_004578	AT	3	6	183697	183702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_004578	GGT	2	6	183704	183709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004578	CCT	2	6	183718	183723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_004578	TAT	2	6	183794	183799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_004578	GCG	2	6	183816	183821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_004578	GCTC	2	8	183913	183920	0 %	25 %	25 %	50 %	28867404
3530	NC_004578	GCCA	2	8	183921	183928	25 %	0 %	25 %	50 %	28867404
3531	NC_004578	CTG	2	6	183938	183943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3532	NC_004578	CCG	2	6	183956	183961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867404
3533	NC_004578	GGC	2	6	184021	184026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867404
3534	NC_004578	GAG	2	6	184043	184048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867404
3535	NC_004578	GTC	2	6	184049	184054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3536	NC_004578	CCG	2	6	184089	184094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867404
3537	NC_004578	GGC	2	6	184097	184102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867404
3538	NC_004578	CGGGGG	2	12	184141	184152	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	28867404
3539	NC_004578	GTT	2	6	184199	184204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867404
3540	NC_004578	GCA	2	6	184225	184230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3541	NC_004578	CGT	2	6	184249	184254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3542	NC_004578	GTG	2	6	184261	184266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867404
3543	NC_004578	CAG	2	6	184283	184288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3544	NC_004578	CTT	2	6	184309	184314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867404
3545	NC_004578	CAGC	2	8	184322	184329	25 %	0 %	25 %	50 %	28867404
3546	NC_004578	GC	3	6	184386	184391	0 %	0 %	50 %	50 %	28867404
3547	NC_004578	CGCT	2	8	184407	184414	0 %	25 %	25 %	50 %	28867404
3548	NC_004578	GGC	2	6	184484	184489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867404
3549	NC_004578	TGC	2	6	184527	184532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3550	NC_004578	GCCT	2	8	184574	184581	0 %	25 %	25 %	50 %	28867404
3551	NC_004578	GTT	2	6	184660	184665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867404
3552	NC_004578	CTG	2	6	184682	184687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3553	NC_004578	GCA	2	6	184768	184773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867404
3554	NC_004578	TGC	2	6	184830	184835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_004578	TCA	2	6	184944	184949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867405
3556	NC_004578	GCC	2	6	185019	185024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867405
3557	NC_004578	TGC	2	6	185026	185031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867405
3558	NC_004578	GTG	2	6	185039	185044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867405
3559	NC_004578	GC	3	6	185076	185081	0 %	0 %	50 %	50 %	28867405
3560	NC_004578	CGG	2	6	185125	185130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867405
3561	NC_004578	CGG	2	6	185142	185147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867405
3562	NC_004578	TGCG	2	8	185184	185191	0 %	25 %	50 %	25 %	28867405
3563	NC_004578	GGTC	2	8	185301	185308	0 %	25 %	50 %	25 %	28867405
3564	NC_004578	GGCC	2	8	185368	185375	0 %	0 %	50 %	50 %	28867405
3565	NC_004578	CGTG	2	8	185376	185383	0 %	25 %	50 %	25 %	28867405
3566	NC_004578	ACCA	2	8	185387	185394	50 %	0 %	0 %	50 %	28867405
3567	NC_004578	CAG	2	6	185429	185434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867405
3568	NC_004578	CGA	3	9	185548	185556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867405
3569	NC_004578	CGC	2	6	185571	185576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867405
3570	NC_004578	GCT	2	6	185614	185619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867405
3571	NC_004578	ACAA	2	8	185654	185661	75 %	0 %	0 %	25 %	28867405
3572	NC_004578	GC	3	6	185672	185677	0 %	0 %	50 %	50 %	28867405
3573	NC_004578	TGA	2	6	185740	185745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867405
3574	NC_004578	GAC	2	6	185759	185764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867405
3575	NC_004578	GTG	2	6	185771	185776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867405
3576	NC_004578	TGG	2	6	185862	185867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867405
3577	NC_004578	TGA	3	9	186075	186083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867405
3578	NC_004578	TGT	2	6	186132	186137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867405
3579	NC_004578	GAA	2	6	186145	186150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867405
3580	NC_004578	GCCA	2	8	186269	186276	25 %	0 %	25 %	50 %	28867405
3581	NC_004578	CAG	2	6	186359	186364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867405
3582	NC_004578	CGA	2	6	186388	186393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867405
3583	NC_004578	A	6	6	186441	186446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_004578	GCGGTC	2	12	186488	186499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28867406
3585	NC_004578	CGC	2	6	186517	186522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867406
3586	NC_004578	GCAG	2	8	186523	186530	25 %	0 %	50 %	25 %	28867406
3587	NC_004578	GCA	2	6	186543	186548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867406
3588	NC_004578	GCC	2	6	186584	186589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867406
3589	NC_004578	GTG	2	6	186608	186613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867406
3590	NC_004578	GCA	2	6	186724	186729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867406
3591	NC_004578	GTGAC	2	10	186759	186768	20 %	20 %	40 %	20 %	28867406
3592	NC_004578	GC	3	6	186909	186914	0 %	0 %	50 %	50 %	28867406
3593	NC_004578	ATC	2	6	186938	186943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867406
3594	NC_004578	AAG	2	6	186944	186949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867406
3595	NC_004578	TGG	2	6	186978	186983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867406
3596	NC_004578	GAA	3	9	187027	187035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867406
3597	NC_004578	GCG	2	6	187110	187115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867406
3598	NC_004578	GCT	2	6	187195	187200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867406
3599	NC_004578	CAT	2	6	187237	187242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867406
3600	NC_004578	CAA	2	6	187255	187260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867406
3601	NC_004578	GCC	2	6	187280	187285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867406
3602	NC_004578	GGC	2	6	187366	187371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867406
3603	NC_004578	ACC	2	6	187511	187516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867407
3604	NC_004578	GCC	2	6	187628	187633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867407
3605	NC_004578	GGA	2	6	187706	187711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867407
3606	NC_004578	GTT	2	6	187734	187739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867407
3607	NC_004578	AAC	2	6	187779	187784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867407
3608	NC_004578	A	6	6	187785	187790	100 %	0 %	0 %	0 %	28867407
3609	NC_004578	TCGC	2	8	187878	187885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_004578	ATCC	2	8	187924	187931	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_004578	GCA	2	6	187996	188001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867408
3612	NC_004578	TGG	2	6	188031	188036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867408
3613	NC_004578	CGC	2	6	188119	188124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867408
3614	NC_004578	CGG	2	6	188187	188192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867408
3615	NC_004578	TGTCAG	2	12	188212	188223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28867408
3616	NC_004578	TGCCG	2	10	188230	188239	0 %	20 %	40 %	40 %	28867408
3617	NC_004578	GCCA	2	8	188240	188247	25 %	0 %	25 %	50 %	28867408
3618	NC_004578	CAT	2	6	188254	188259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867408
3619	NC_004578	CTG	3	9	188267	188275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867408
3620	NC_004578	GTT	3	9	188299	188307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867408
3621	NC_004578	GAT	2	6	188311	188316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867408
3622	NC_004578	GC	3	6	188325	188330	0 %	0 %	50 %	50 %	28867408
3623	NC_004578	TTTCG	2	10	188338	188347	0 %	60 %	20 %	20 %	28867408
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3625	NC_004578	CGT	2	6	188383	188388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867408
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3874	NC_004578	CTA	2	6	201265	201270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867419
3875	NC_004578	CGG	2	6	201304	201309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867419
3876	NC_004578	ATC	2	6	201331	201336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867420
3877	NC_004578	GGCG	2	8	201381	201388	0 %	0 %	75 %	25 %	28867420
3878	NC_004578	CGG	2	6	201488	201493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867420
3879	NC_004578	TGC	2	6	201494	201499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867420
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3881	NC_004578	CGA	2	6	201513	201518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867420
3882	NC_004578	CAG	2	6	201543	201548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867420
3883	NC_004578	CGA	2	6	201549	201554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867420
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3886	NC_004578	GCG	2	6	201628	201633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867420
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3889	NC_004578	AAGGC	2	10	201770	201779	40 %	0 %	40 %	20 %	28867420
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3913	NC_004578	TCGG	2	8	202736	202743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3914	NC_004578	TCG	2	6	202750	202755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3923	NC_004578	GCCGA	2	10	203186	203195	20 %	0 %	40 %	40 %	28867421
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3969	NC_004578	GCG	2	6	205228	205233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3970	NC_004578	CGCAT	2	10	205237	205246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3978	NC_004578	GCTC	2	8	205988	205995	0 %	25 %	25 %	50 %	28867422
3979	NC_004578	CG	3	6	206036	206041	0 %	0 %	50 %	50 %	28867422
3980	NC_004578	GCA	2	6	206108	206113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867422
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3982	NC_004578	CGG	2	6	206346	206351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867423
3983	NC_004578	GCCA	2	8	206444	206451	25 %	0 %	25 %	50 %	28867423
3984	NC_004578	CTTGAG	2	12	206476	206487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28867423
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3988	NC_004578	GC	3	6	206977	206982	0 %	0 %	50 %	50 %	28867424
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3991	NC_004578	GCTC	2	8	207138	207145	0 %	25 %	25 %	50 %	28867424
3992	NC_004578	CTGGG	2	10	207230	207239	0 %	20 %	60 %	20 %	28867424
3993	NC_004578	CAG	2	6	207284	207289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867424
3994	NC_004578	CGG	2	6	207292	207297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867424
3995	NC_004578	CAG	2	6	207359	207364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867424
3996	NC_004578	CCA	2	6	207436	207441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867424
3997	NC_004578	GAGCTG	2	12	207542	207553	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	28867424
3998	NC_004578	CTG	2	6	207602	207607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867424
3999	NC_004578	CG	3	6	207617	207622	0 %	0 %	50 %	50 %	28867424
4000	NC_004578	CG	3	6	207634	207639	0 %	0 %	50 %	50 %	28867424

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