MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004578	TA	3	6	82435	82440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_004578	TCA	2	6	82453	82458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_004578	CAG	2	6	82474	82479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_004578	CGC	2	6	82510	82515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867301
1505	NC_004578	TCAA	2	8	82602	82609	50 %	25 %	0 %	25 %	28867301
1506	NC_004578	CCT	2	6	82687	82692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867301
1507	NC_004578	GCA	2	6	82696	82701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867301
1508	NC_004578	GC	3	6	82728	82733	0 %	0 %	50 %	50 %	28867301
1509	NC_004578	ACG	3	9	82860	82868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867301
1510	NC_004578	TCA	2	6	82911	82916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867301
1511	NC_004578	CGG	2	6	82923	82928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867301
1512	NC_004578	CG	3	6	82995	83000	0 %	0 %	50 %	50 %	28867301
1513	NC_004578	GAC	2	6	83017	83022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867301
1514	NC_004578	GAGAG	2	10	83029	83038	40 %	0 %	60 %	0 %	28867301
1515	NC_004578	CAAA	2	8	83064	83071	75 %	0 %	0 %	25 %	28867301
1516	NC_004578	ATC	2	6	83098	83103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867301
1517	NC_004578	AGC	2	6	83179	83184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867301
1518	NC_004578	AAG	2	6	83224	83229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867301
1519	NC_004578	CG	3	6	83249	83254	0 %	0 %	50 %	50 %	28867301
1520	NC_004578	AGC	2	6	83257	83262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867301
1521	NC_004578	AAG	2	6	83313	83318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867301
1522	NC_004578	GGC	2	6	83379	83384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_004578	GCA	2	6	83458	83463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_004578	TGC	2	6	83557	83562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867302
1525	NC_004578	CAG	2	6	83585	83590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867302
1526	NC_004578	CGC	2	6	83591	83596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867302
1527	NC_004578	ATGCAC	2	12	83604	83615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28867302
1528	NC_004578	TGG	2	6	83646	83651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867302
1529	NC_004578	CAG	2	6	83681	83686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867302
1530	NC_004578	CGA	2	6	83731	83736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867302
1531	NC_004578	GTA	2	6	83810	83815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867302
1532	NC_004578	GAA	2	6	83834	83839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867302
1533	NC_004578	TGA	2	6	83866	83871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867302
1534	NC_004578	CAG	2	6	83909	83914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867302
1535	NC_004578	CATCG	2	10	83924	83933	20 %	20 %	20 %	40 %	28867302
1536	NC_004578	TGCCGG	2	12	83938	83949	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28867302
1537	NC_004578	CGC	2	6	83972	83977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867302
1538	NC_004578	ACC	2	6	83991	83996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867302
1539	NC_004578	TGA	2	6	84058	84063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867302
1540	NC_004578	CGG	2	6	84177	84182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867302
1541	NC_004578	ATC	2	6	84327	84332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867302
1542	NC_004578	GCC	2	6	84389	84394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867302
1543	NC_004578	TCA	2	6	84409	84414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867302
1544	NC_004578	GCA	2	6	84481	84486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867302
1545	NC_004578	GGC	2	6	84488	84493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867302
1546	NC_004578	GGT	2	6	84509	84514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867302
1547	NC_004578	ACC	2	6	84537	84542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867302
1548	NC_004578	ACCG	2	8	84560	84567	25 %	0 %	25 %	50 %	28867302
1549	NC_004578	ATC	2	6	84639	84644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867302
1550	NC_004578	CAT	2	6	84713	84718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867302
1551	NC_004578	GCC	2	6	84740	84745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867302
1552	NC_004578	GAT	2	6	84758	84763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867302
1553	NC_004578	ATGAA	2	10	84894	84903	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_004578	TCAGC	2	10	84908	84917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1555	NC_004578	AGCA	2	8	84968	84975	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_004578	ATT	2	6	84987	84992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_004578	GTT	2	6	84993	84998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_004578	CTG	2	6	85254	85259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867303
1559	NC_004578	CGT	2	6	85278	85283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867303
1560	NC_004578	CTG	2	6	85349	85354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867303
1561	NC_004578	TGCG	2	8	85360	85367	0 %	25 %	50 %	25 %	28867303
1562	NC_004578	GCG	2	6	85385	85390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867303
1563	NC_004578	CGAA	2	8	85421	85428	50 %	0 %	25 %	25 %	28867303
1564	NC_004578	GCCGT	2	10	85468	85477	0 %	20 %	40 %	40 %	28867303
1565	NC_004578	AAC	2	6	85634	85639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_004578	CGT	2	6	85682	85687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_004578	GTG	2	6	85746	85751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_004578	CAG	2	6	85770	85775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_004578	CCA	2	6	85777	85782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_004578	TACT	2	8	85785	85792	25 %	50 %	0 %	25 %	28867304
1571	NC_004578	GCA	2	6	85813	85818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1572	NC_004578	T	6	6	85838	85843	0 %	100 %	0 %	0 %	28867304
1573	NC_004578	GTCG	2	8	85879	85886	0 %	25 %	50 %	25 %	28867304
1574	NC_004578	CCGGC	2	10	85912	85921	0 %	0 %	40 %	60 %	28867304
1575	NC_004578	AGCGC	2	10	86014	86023	20 %	0 %	40 %	40 %	28867304
1576	NC_004578	GCG	2	6	86167	86172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867304
1577	NC_004578	CAG	3	9	86186	86194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1578	NC_004578	ACC	2	6	86234	86239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867304
1579	NC_004578	GC	3	6	86253	86258	0 %	0 %	50 %	50 %	28867304
1580	NC_004578	TGC	2	6	86307	86312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1581	NC_004578	TGA	2	6	86389	86394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867304
1582	NC_004578	GTA	2	6	86459	86464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867304
1583	NC_004578	GCC	2	6	86472	86477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867304
1584	NC_004578	GAC	2	6	86483	86488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1585	NC_004578	GCC	2	6	86493	86498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867304
1586	NC_004578	GTC	2	6	86531	86536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1587	NC_004578	TGA	2	6	86566	86571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867304
1588	NC_004578	TCT	2	6	86572	86577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867304
1589	NC_004578	GCG	2	6	86593	86598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867304
1590	NC_004578	GCT	2	6	86623	86628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1591	NC_004578	GCG	2	6	86633	86638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867304
1592	NC_004578	GC	3	6	86649	86654	0 %	0 %	50 %	50 %	28867304
1593	NC_004578	ATC	3	9	86678	86686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867304
1594	NC_004578	GGAT	2	8	86703	86710	25 %	25 %	50 %	0 %	28867304
1595	NC_004578	CTG	2	6	86775	86780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1596	NC_004578	CAG	3	9	86786	86794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1597	NC_004578	GCA	2	6	86833	86838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1598	NC_004578	TCG	2	6	86844	86849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1599	NC_004578	GC	3	6	86918	86923	0 %	0 %	50 %	50 %	28867304
1600	NC_004578	CAGT	2	8	86944	86951	25 %	25 %	25 %	25 %	28867304
1601	NC_004578	GC	3	6	87059	87064	0 %	0 %	50 %	50 %	28867304
1602	NC_004578	GTC	2	6	87080	87085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867304
1603	NC_004578	T	6	6	87204	87209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_004578	CTG	2	6	87283	87288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867305
1605	NC_004578	AGC	2	6	87344	87349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867305
1606	NC_004578	CTGCG	2	10	87352	87361	0 %	20 %	40 %	40 %	28867305
1607	NC_004578	GCA	2	6	87417	87422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867305
1608	NC_004578	GAT	2	6	87484	87489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867305
1609	NC_004578	ATG	2	6	87512	87517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867305
1610	NC_004578	GCC	2	6	87528	87533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867305
1611	NC_004578	TGAC	2	8	87572	87579	25 %	25 %	25 %	25 %	28867305
1612	NC_004578	GAT	2	6	87649	87654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867305
1613	NC_004578	CCA	2	6	87705	87710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867305
1614	NC_004578	GC	3	6	87720	87725	0 %	0 %	50 %	50 %	28867305
1615	NC_004578	TTC	2	6	87820	87825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867305
1616	NC_004578	CGT	2	6	87829	87834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867305
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1618	NC_004578	TTC	2	6	87856	87861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867305
1619	NC_004578	GGC	2	6	87913	87918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867305
1620	NC_004578	CGA	2	6	87930	87935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867305
1621	NC_004578	GGC	3	9	87942	87950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867305
1622	NC_004578	GGC	2	6	87989	87994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867305
1623	NC_004578	TCG	2	6	87998	88003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867305
1624	NC_004578	GCC	2	6	88096	88101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867305
1625	NC_004578	CTT	2	6	88108	88113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867305
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